seq1 = pF1KSDA0632.tfa, 2100 bp
seq2 = pF1KSDA0632/gi568815591r_99319970.tfa (gi568815591r:99319970_99535242), 215273 bp

>pF1KSDA0632 2100
>gi568815591r:99319970_99535242 (Chr7)

(complement)

1-453  (100001-100453)   100% ->
454-594  (101825-101965)   100% ->
595-813  (105437-105655)   100% ->
814-915  (106039-106140)   100% ->
916-1737  (109627-110448)   100% ->
1738-1920  (111286-111468)   100% ->
1921-2100  (115094-115273)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTTCGTGAGACTCGCTCGACTGTTCGCCAGGGCCCGCCCCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTTCGTGAGACTCGCTCGACTGTTCGCCAGGGCCCGCCCCATGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTGTTCATCCTGCAACACCTGGACCCCTGTAGAGCCAGGTGGGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTGTTCATCCTGCAACACCTGGACCCCTGTAGAGCCAGGTGGGCAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGGGAGGGGCTGATGCGGCCAATGTGGGCGCCCTTCAGCAGCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGGGAGGGGCTGATGCGGCCAATGTGGGCGCCCTTCAGCAGCTCCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTCAGCTGCCCCTCGGCCAGGAGCGTCAGGAAAACACGGGCAGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTCAGCTGCCCCTCGGCCAGGAGCGTCAGGAAAACACGGGCAGCCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCTGACCCGAGCCACTCCAACTCCACGGCCACGCAGGAAGAAGACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCTGACCCGAGCCACTCCAACTCCACGGCCACGCAGGAAGAAGACGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGGAGGAGAGTTTTGGGACCCTCTCTGACAAATACTCCTCCCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGGAGGAGAGTTTTGGGACCCTCTCTGACAAATACTCCTCCCGGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTATTCCGCAAATCCGCAGCCCAGTTCCATAACCTGCGGTTTGGGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTATTCCGCAAATCCGCAGCCCAGTTCCATAACCTGCGGTTTGGGGAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGAGATGAGCAAATGGAACCGGAGCCCAAATTATGGCGAGGCCGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGAGATGAGCAAATGGAACCGGAGCCCAAATTATGGCGAGGCCGGAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACACCCCGTACTGGTACTTCTTGCAGTGCAAACACCTGATCAAGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACACCCCGTACTGGTACTTCTTGCAGTGCAAACACCTGATCAAGGAAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAG         CTGGTTGAAGCCCTGGACCTGTTTGAGAGGCAGATGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGGTA...CAGCTGGTTGAAGCCCTGGACCTGTTTGAGAGGCAGATGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAAGGAGGAGCGATTGCAGCCCATGGAGAGCAACTACACGGTGCTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 GAAGGAGGAGCGATTGCAGCCCATGGAGAGCAACTACACGGTGCTGATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGGCTGCGGGCGGGTTGGCTACCTGAAGAAGGCCTTCAACCTCTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101913 GGGGCTGCGGGCGGGTTGGCTACCTGAAGAAGGCCTTCAACCTCTACAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAG         ATGAAAAAGCGGGACCTGGAGCCCTCGGACGCCACCTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101963 CAGGTG...CAGATGAAAAAGCGGGACCTGGAGCCCTCGGACGCCACCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CACGGCCCTGTTCAACGTCTGTGCCGAGTCCCCCTGGAAGGACTCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105475 CACGGCCCTGTTCAACGTCTGTGCCGAGTCCCCCTGGAAGGACTCAGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TACAGAGCGCCCTGAAGCTCCGGCAGCAGCTGCAGGCCAAAAACTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105525 TACAGAGCGCCCTGAAGCTCCGGCAGCAGCTGCAGGCCAAAAACTTCGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTCAACTTGAAAACATACCACGCGCTGCTGAAGATGGCTGCCAAGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105575 CTCAACTTGAAAACATACCACGCGCTGCTGAAGATGGCTGCCAAGTGCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGACCTTAGGATGTGCCTCGATGTGTTCAAG         GAAATCATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 105625 AGACCTTAGGATGTGCCTCGATGTGTTCAAGGTG...CAGGAAATCATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACAAAGGGCACGTGGTCACAGAGGAGACCTTCAGTTTCCTGCTCATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106049 ACAAAGGGCACGTGGTCACAGAGGAGACCTTCAGTTTCCTGCTCATGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TGCATCCAAGACAAGAAGACAGGCTTCCGGTACGCCCTCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 106099 TGCATCCAAGACAAGAAGACAGGCTTCCGGTACGCCCTCCAGGTA...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    916  GTGTGGCGGCTGATGCTGAGTCTAGGGCTACAGCCGAGCCGGGACAGCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109626 GGTGTGGCGGCTGATGCTGAGTCTAGGGCTACAGCCGAGCCGGGACAGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACAACCTGCTGTTGGTGGCAGCTCGGGACTGTGGCCTAGGGGACCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109676 ACAACCTGCTGTTGGTGGCAGCTCGGGACTGTGGCCTAGGGGACCCCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GTGGCCTCAGAGCTGCTTCTGAAGCCCAGGGAGGAGGCGACTGTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109726 GTGGCCTCAGAGCTGCTTCTGAAGCCCAGGGAGGAGGCGACTGTGCTTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCCCCCAGTGAGCAGGCAGCGGCCAAGGAGGACAGCCCAGGCCAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109776 GCCCCCAGTGAGCAGGCAGCGGCCAAGGAGGACAGCCCAGGCCAAGGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCAACCTCATGTCAGCCATGCTGCATGTGGAGGCCCTGGAGAGGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109826 GCAACCTCATGTCAGCCATGCTGCATGTGGAGGCCCTGGAGAGGCAGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TTTCTGGAACCTTCTCAGGCACTTGGGCCTCCAGAGCCTCCGGAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109876 TTTCTGGAACCTTCTCAGGCACTTGGGCCTCCAGAGCCTCCGGAAGCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 AGTGCCCGGCAAGGCCCAACCAGAGGTGGATACTAAGGCAGAGCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109926 AGTGCCCGGCAAGGCCCAACCAGAGGTGGATACTAAGGCAGAGCCCAGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ACACAGCAGCCCTCACCGCAGTGGCCCTGAAGCCACCTCCCGTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109976 ACACAGCAGCCCTCACCGCAGTGGCCCTGAAGCCACCTCCCGTGGAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GAAGTCAACCTCCTGACCCCCGGGGCCGTTCCCCCTACAGTGGTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110026 GAAGTCAACCTCCTGACCCCCGGGGCCGTTCCCCCTACAGTGGTCTCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TGGAACGGTGACCACCCCAGCTGACCGGCTGGCCTTGATAGGGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110076 TGGAACGGTGACCACCCCAGCTGACCGGCTGGCCTTGATAGGGGGCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AGGGCTTCCTGAGCAAGATGGCAGAGCACAGGCAGCAGCCCGACATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110126 AGGGCTTCCTGAGCAAGATGGCAGAGCACAGGCAGCAGCCCGACATCAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 ACCCTCACGCTACTGGCCGAGGTGGTGGAGTCCGGGAGTCCTGCAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110176 ACCCTCACGCTACTGGCCGAGGTGGTGGAGTCCGGGAGTCCTGCAGAGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CTTGCTGCTGGCCCTCCTGGATGAGCACCAGGTAGAGGCCGACCTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110226 CTTGCTGCTGGCCCTCCTGGATGAGCACCAGGTAGAGGCCGACCTGACAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 TCTTTAACACGCTGGTGAGAAAGAAGAGCAAGCTGGGAGACCTGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110276 TCTTTAACACGCTGGTGAGAAAGAAGAGCAAGCTGGGAGACCTGGAGGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GCCAAGGCGCTGTTGCCGGTCCTGGCAAAGAGGGGCCTCGTCCCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110326 GCCAAGGCGCTGTTGCCGGTCCTGGCAAAGAGGGGCCTCGTCCCCAACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 GCAGACATTCTGCAACCTGGCCATCGGGTGCCACAGGCCGAAGGACGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110376 GCAGACATTCTGCAACCTGGCCATCGGGTGCCACAGGCCGAAGGACGGTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 TACAGCTTCTCACAGACATGAAG         AAGTCCCAGGTGACCCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 110426 TACAGCTTCTCACAGACATGAAGGTG...TAGAAGTCCCAGGTGACCCCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 AACACTCACATCTACAGTGCCCTCATCAACGCGGCCATCAGGAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111304 AACACTCACATCTACAGTGCCCTCATCAACGCGGCCATCAGGAAGCTGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 CTACACCTATCTCATCAGCATCTTGAAGGACATGAAGCAGAACAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111354 CTACACCTATCTCATCAGCATCTTGAAGGACATGAAGCAGAACAGGGTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 CGGTGAACGAAGTGGTCATCCGCCAGCTGGAGTTTGCAGCCCAGTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111404 CGGTGAACGAAGTGGTCATCCGCCAGCTGGAGTTTGCAGCCCAGTACCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 CCCACCTTTGACCGG         TACCAAGGGAAGAACACCTACCTGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111454 CCCACCTTTGACCGGGTG...TAGTACCAAGGGAAGAACACCTACCTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1947 GAAGATTGACGGCTTCCGAGCCTATTACAAGCAGTGGCTGACAGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115120 GAAGATTGACGGCTTCCGAGCCTATTACAAGCAGTGGCTGACAGTGATGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 CCGCAGAGGAAACCCCGCACCCCTGGCAGAAGTTCCGGACCAAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115170 CCGCAGAGGAAACCCCGCACCCCTGGCAGAAGTTCCGGACCAAGCCCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GGGGACCAGGACACCGGCAAGGAGGCTGATGACGGATGTGCCCTTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115220 GGGGACCAGGACACCGGCAAGGAGGCTGATGACGGATGTGCCCTTGGGGG

   2150 
   2097 CAGG
        ||||
 115270 CAGG