seq1 = pF1KSDA0617.tfa, 2304 bp
seq2 = pF1KSDA0617/gi568815596r_224374248.tfa (gi568815596r:224374248_224685009), 310762 bp

>pF1KSDA0617 2304
>gi568815596r:224374248_224685009 (Chr2)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-264  (127154-127351)   100% ->
265-378  (149369-149482)   100% ->
379-539  (170238-170398)   100% ->
540-654  (171372-171486)   100% ->
655-883  (173428-173656)   100% ->
884-1029  (178007-178152)   100% ->
1030-1206  (178878-179054)   100% ->
1207-1377  (181188-181358)   100% ->
1378-1485  (181938-182045)   100% ->
1486-1610  (184523-184647)   100% ->
1611-1707  (187161-187257)   100% ->
1708-1842  (189044-189178)   100% ->
1843-2029  (202932-203118)   100% ->
2030-2175  (206665-206810)   100% ->
2176-2304  (210634-210762)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAATCTGAGCAAAGGCACGGGCAGCCGGAAGGACACCAAGATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAATCTGAGCAAAGGCACGGGCAGCCGGAAGGACACCAAGATGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCCGGGCCTTTCCG         ATGACCATGGATGAAAAATATGTAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCCGGGCCTTTCCGGTG...CAGATGACCATGGATGAAAAATATGTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACAGCATTTGGGACCTTCTGAAAAATGCAATTCAAGAAATCCAGCGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127179 ACAGCATTTGGGACCTTCTGAAAAATGCAATTCAAGAAATCCAGCGTAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AATAACAGTGGTCTTAGTTTTGAGGAGCTCTATAGAAATGCATATACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127229 AATAACAGTGGTCTTAGTTTTGAGGAGCTCTATAGAAATGCATATACAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTTTTGCATAAACATGGAGAAAAGCTCTACACTGGACTAAGAGAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127279 GGTTTTGCATAAACATGGAGAAAAGCTCTACACTGGACTAAGAGAAGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTACCGAACATCTCATAAATAAG         GTGCGAGAAGATGTACTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 127329 TTACCGAACATCTCATAAATAAGGTA...TAGGTGCGAGAAGATGTACTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATTCATTGAATAACAACTTTCTTCAAACGCTAAATCAAGCTTGGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149387 AATTCATTGAATAACAACTTTCTTCAAACGCTAAATCAAGCTTGGAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCATCAAACAGCTATGGTGATGATTAGAGACATACTAATGTACATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 149437 TCATCAAACAGCTATGGTGATGATTAGAGACATACTAATGTACATGGTA.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    379      GACCGTGTGTATGTACAACAAAATAATGTGGAGAACGTCTACAAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149487 ..TAGGACCGTGTGTATGTACAACAAAATAATGTGGAGAACGTCTACAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTGGGATTAATTATTTTTCGAGATCAAGTTGTACGTTATGGGTGTATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170283 TTGGGATTAATTATTTTTCGAGATCAAGTTGTACGTTATGGGTGTATTAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGATCATCTACGGCAAACTCTATTGGATATGATTGCAAGAGAGCGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170333 GGATCATCTACGGCAAACTCTATTGGATATGATTGCAAGAGAGCGGAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAGAAGTCGTAGACAG         AGGCGCAATAAGAAATGCTTGCCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 170383 GAGAAGTCGTAGACAGGTA...CAGAGGCGCAATAAGAAATGCTTGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGTTAATGATTTTAGGTCTCGAAGGAAGATCAGTCTATGAAGAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171397 ATGTTAATGATTTTAGGTCTCGAAGGAAGATCAGTCTATGAAGAAGATTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAGGCTCCTTTTTTGGAAATGTCTGCAGAATTTTTTCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 171447 TGAGGCTCCTTTTTTGGAAATGTCTGCAGAATTTTTTCAGGTA...CAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAAAGCCAGAAATTTTTAGCAGAAAATAGTGCTTCAGTATATATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173429 TGGAAAGCCAGAAATTTTTAGCAGAAAATAGTGCTTCAGTATATATAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAGTAGAAGCTAGAATTAATGAAGAAATAGAACGAGTGATGCACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173479 AAAGTAGAAGCTAGAATTAATGAAGAAATAGAACGAGTGATGCACTGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGACAAATCAACGGAAGAACCAATTGTAAAGGTGGTTGAAAGGGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173529 TGACAAATCAACGGAAGAACCAATTGTAAAGGTGGTTGAAAGGGAACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTTCCAAGCACATGAAGACTATAGTAGAAATGGAGAATTCTGGGCTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173579 TTTCCAAGCACATGAAGACTATAGTAGAAATGGAGAATTCTGGGCTAGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CATATGTTGAAAAATGGAAAGACAGAAG         ACCTTGGTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 173629 CATATGTTGAAAAATGGAAAGACAGAAGGTA...TAGACCTTGGTTGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GTACAAGTTATTTAGTCGTGTGCCAAATGGTTTGAAAACAATGTGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178020 GTACAAGTTATTTAGTCGTGTGCCAAATGGTTTGAAAACAATGTGTGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTATGAGTTCCTATTTGAGGGAGCAAGGTAAAGCTCTTGTTTCTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178070 GTATGAGTTCCTATTTGAGGGAGCAAGGTAAAGCTCTTGTTTCTGAAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGAGAAGGAAAGAATCCTGTTGACTATATCCAG         GGCTTATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 178120 GGAGAAGGAAAGAATCCTGTTGACTATATCCAGGTA...AAGGGCTTATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGATCTGAAGAGTAGGTTCGATCGCTTCCTCCTGGAATCATTCAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178886 GGATCTGAAGAGTAGGTTCGATCGCTTCCTCCTGGAATCATTCAACAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACCGTCTCTTTAAACAAACTATTGCGGGTGACTTTGAGTATTTTCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178936 ACCGTCTCTTTAAACAAACTATTGCGGGTGACTTTGAGTATTTTCTCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTCAACTCCAGGTCTCCTGAATACCTCTCATTATTTATTGATGATAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178986 CTCAACTCCAGGTCTCCTGAATACCTCTCATTATTTATTGATGATAAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAAAAAGGGAGTCAAAGGG         CTAACAGAACAAGAAGTAGAAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 179036 GAAAAAGGGAGTCAAAGGGGTA...CAGCTAACAGAACAAGAAGTAGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CAATATTGGATAAAGCAATGGTCCTTTTTAGGTTTATGCAAGAAAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181210 CAATATTGGATAAAGCAATGGTCCTTTTTAGGTTTATGCAAGAAAAAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTATTTGAACGTTATTATAAACAACACTTGGCAAGGAGACTTCTCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181260 GTATTTGAACGTTATTATAAACAACACTTGGCAAGGAGACTTCTCACAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TAAAAGTGTTTCTGATGACTCTGAAAAAAACATGATATCTAAGTTAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 181310 TAAAAGTGTTTCTGATGACTCTGAAAAAAACATGATATCTAAGTTAAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1378         ACTGAATGTGGATGTCAGTTCACGTCAAAACTGGAAGGAATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181360 TA...CAGACTGAATGTGGATGTCAGTTCACGTCAAAACTGGAAGGAATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TTTAGGGATATGAGCATCTCAAACACAACGATGGATGAATTCAGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181980 TTTAGGGATATGAGCATCTCAAACACAACGATGGATGAATTCAGGCAACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCTACAGGCAACTGGT         GTATCTTTAGGTGGTGTTGATCTTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 182030 TCTACAGGCAACTGGTGTA...TAGGTATCTTTAGGTGGTGTTGATCTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGTCCGGGTGCTCACGACAGGATATTGGCCCACTCAGTCAGCCACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184548 CAGTCCGGGTGCTCACGACAGGATATTGGCCCACTCAGTCAGCCACACCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AAGTGCAACATCCCACCAGCACCAAGACATGCTTTTGAGATATTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184598 AAGTGCAACATCCCACCAGCACCAAGACATGCTTTTGAGATATTCAGAAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611          GTTCTACTTAGCCAAACACAGTGGTCGACAGCTCACACTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184648 GTA...AAGGTTCTACTTAGCCAAACACAGTGGTCGACAGCTCACACTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGCATCATATGGGTTCTGCAGATCTCAATGCCACATTTTATGGACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187202 AGCATCATATGGGTTCTGCAGATCTCAATGCCACATTTTATGGACCAGTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AAAAAG         GAAGATGGATCTGAAGTTGGTGTTGGAGGTGCACA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187252 AAAAAGGTA...CAGGAAGATGGATCTGAAGTTGGTGTTGGAGGTGCACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AGTAACTGGCTCTAATACACGGAAGCACATATTGCAAGTTTCCACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189079 AGTAACTGGCTCTAATACACGGAAGCACATATTGCAAGTTTCCACTTTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGATGACCATATTAATGCTCTTTAATAATAGAGAAAAATACACATTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189129 AGATGACCATATTAATGCTCTTTAATAATAGAGAAAAATACACATTTGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843          GAAATTCAGCAAGAGACAGATATCCCTGAAAGAGAGCTTGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189179 GTA...CAGGAAATTCAGCAAGAGACAGATATCCCTGAAAGAGAGCTTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TAGAGCCCTACAGTCCCTCGCCTGTGGTAAACCAACACAGCGGGTTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202973 TAGAGCCCTACAGTCCCTCGCCTGTGGTAAACCAACACAGCGGGTTCTTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CAAAAGAACCCAAATCAAAGGAAATAGAAAATGGTCATATATTTACAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203023 CAAAAGAACCCAAATCAAAGGAAATAGAAAATGGTCATATATTTACAGTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AATGATCAATTCACATCCAAACTACACAGAGTCAAGATTCAAACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 203073 AATGATCAATTCACATCCAAACTACACAGAGTCAAGATTCAAACAGGTA.

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030      TTGCTGCCAAACAAGGTGAATCCGACCCAGAGAGGAAAGAAACAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203123 ..TAGTTGCTGCCAAACAAGGTGAATCCGACCCAGAGAGGAAAGAAACAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GGCAGAAAGTAGACGACGACAGAAAACATGAGATAGAAGCTGCTATAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206710 GGCAGAAAGTAGACGACGACAGAAAACATGAGATAGAAGCTGCTATAGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CGGATAATGAAATCTAGAAAGAAGATGCAGCACAATGTTCTAGTAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206760 CGGATAATGAAATCTAGAAAGAAGATGCAGCACAATGTTCTAGTAGCGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 G         GTAACTCAGCAGTTGAAGGCGCGATTCTTACCAAGTCCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206810 GGTG...TAGGTAACTCAGCAGTTGAAGGCGCGATTCTTACCAAGTCCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TTGTTATTAAGAAACGTATTGAAGGACTTATTGAGAGAGAATATTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210674 TTGTTATTAAGAAACGTATTGAAGGACTTATTGAGAGAGAATATTTGGCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .
   2266 CGAACACCTGAGGATCGCAAAGTATACACATATGTAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210724 CGAACACCTGAGGATCGCAAAGTATACACATATGTAGCA