seq1 = pF1KSDA0615.tfa, 2688 bp
seq2 = pF1KSDA0615/gi568815582r_48442907.tfa (gi568815582r:48442907_48709972), 267066 bp

>pF1KSDA0615 2688
>gi568815582r:48442907_48709972 (Chr16)

(complement)

1-198  (100001-100198)   99% ->
199-1889  (147529-149219)   100% ->
1890-2020  (156304-156434)   100% ->
2021-2117  (158491-158587)   100% ->
2118-2225  (161859-161966)   100% ->
2226-2333  (163719-163826)   100% ->
2334-2688  (166712-167066)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCCGGGCGGTGCTGGACGAGTTCACTGCGCCAGCTGAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCCGGGCGGTGCTGGACGAGTTCACTGCGCCAGCTGAGAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCTGCTGGAGCAGAGCCGCGGCCGTATCGAGGGCCTGTTTGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCTGCTGGAGCAGAGCCGCGGCCGTATCGAGGGCCTGTTTGGCGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTAGCCGTGCTCGGCGCGCTAGGGGCTGAGGAGCCGCTGCCCGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTAGCCGTGCTCGGCGCGCTAGGGGCTGAGGAGCCGCTGCCCGCGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTGGCTGCAGCTCTGCGGGGCGCAGGAGGCGGAGCACAGCGCCAAG  
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||>>
 100151 ATCTGGCTGCAGCTCTGCGGGGCGCAGGAGGCGGTGCACAGCGCCAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        GAATATATTAAAGGAATCTGTGAACCTGAACTAGAAGAAAGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 G...CAGGAATATATTAAAGGAATCTGTGAACCTGAACTAGAAGAAAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATGTTACCCCAAGGACATGCACTGCATTTTTGTTGGGGCAGAGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147572 AATGTTACCCCAAGGACATGCACTGCATTTTTGTTGGGGCAGAGAGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTTCTGAAAAGCTTGATTCAGGATACTTGTGCTGACCTCTGCATTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147622 TTTCTGAAAAGCTTGATTCAGGATACTTGTGCTGACCTCTGCATTCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATTGGCCTTCTTGGCATCAGAGGAAGTGCTGAGGCTGTGGTCATGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147672 CATTGGCCTTCTTGGCATCAGAGGAAGTGCTGAGGCTGTGGTCATGGCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAGTCACATTCAACAATTTGTAAAGCTCTTTGAAAATAAAGAGAACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147722 GGAGTCACATTCAACAATTTGTAAAGCTCTTTGAAAATAAAGAGAACCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCAGTAGTCAGAAAGAATCAGAGGTGAAAAGGGAATTCAAACAATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147772 CCCAGTAGTCAGAAAGAATCAGAGGTGAAAAGGGAATTCAAACAATTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGAAGCCCATGCAGACAATTACACAATGGATTTGTTGATTTTGCCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147822 TGAAGCCCATGCAGACAATTACACAATGGATTTGTTGATTTTGCCCACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCTTGAAAAAAGAACTTTTGACACTCACACAAGGTGAGGAGAATCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147872 CCTTGAAAAAAGAACTTTTGACACTCACACAAGGTGAGGAGAATCTCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAAACAGGAGATGATGAGGTTATTGAAATGAGAGATTCTCAACAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147922 GAAACAGGAGATGATGAGGTTATTGAAATGAGAGATTCTCAACAAACAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GTTTACACAGAATGCTGCCACAGGGCTGAATATTTCTAGAGATGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147972 GTTTACACAGAATGCTGCCACAGGGCTGAATATTTCTAGAGATGAAACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTTTGCAGGAAGAGGCAAGAAATAAAGCTGGGACTCCTGTTTCTGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148022 TTTTGCAGGAAGAGGCAAGAAATAAAGCTGGGACTCCTGTTTCTGAGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACAAAACAAATGGACACAGTCCTTTCTAGCTCACCAGATGTGCTTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148072 ACAAAACAAATGGACACAGTCCTTTCTAGCTCACCAGATGTGCTTTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCCAATAAATGGTCTAACCCCAGATGAAGAGGCACTTTCCAATGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148122 TCCAATAAATGGTCTAACCCCAGATGAAGAGGCACTTTCCAATGAGAGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TTTGTCAGAAAAGGAGATTTTCTGATTCTGAAGAAAGGCATACGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148172 TTTGTCAGAAAAGGAGATTTTCTGATTCTGAAGAAAGGCATACGAAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CAGTTTTCTTTGGAAAATGTTCAGGAGGGGGAGATTTTACACGATGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148222 CAGTTTTCTTTGGAAAATGTTCAGGAGGGGGAGATTTTACACGATGCTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GACATTGGCTGGAAATGTAATAGCTGACCTATCTGATTCTTCTGCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148272 GACATTGGCTGGAAATGTAATAGCTGACCTATCTGATTCTTCTGCTGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTGAAAATTTAAGTCCAGATATAAAAGAAACTACTGAGGAAATGGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148322 CTGAAAATTTAAGTCCAGATATAAAAGAAACTACTGAGGAAATGGAATAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AACATCCTCGTAAACTTTTTTAAAACCATGGGCTACTCCCAAGAAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148372 AACATCCTCGTAAACTTTTTTAAAACCATGGGCTACTCCCAAGAAATTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGAAAAGGTCATTAAGGTGTATGGACCATCTACTGAACCATTATTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148422 TGAAAAGGTCATTAAGGTGTATGGACCATCTACTGAACCATTATTGCTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TAGAGGAAATTGAAAAAGAAAATAAAAGATTCCAAGAAGACAGAGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148472 TAGAGGAAATTGAAAAAGAAAATAAAAGATTCCAAGAAGACAGAGAATTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TCAGCTGGTACAGTGTATCCAGAGACCAACAAAACCAAAAATAAAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148522 TCAGCTGGTACAGTGTATCCAGAGACCAACAAAACCAAAAATAAAGGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TTATAGCAGCACAAATGAGCTTACAACTGATTCCACTCCAAAGAAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148572 TTATAGCAGCACAAATGAGCTTACAACTGATTCCACTCCAAAGAAAACAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 AGGCTCACACACAGCAAAATATGGTAGAAAAATTTTCTCAGTTACCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148622 AGGCTCACACACAGCAAAATATGGTAGAAAAATTTTCTCAGTTACCATTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AAAGTGGAAGCTAAACCATGTACCTCAAATTGTAGAATTAATACTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148672 AAAGTGGAAGCTAAACCATGTACCTCAAATTGTAGAATTAATACTTTCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AACAGTGCCAATAGAACAGAAACATGAAGTCTGGGGTTCAAACCAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148722 AACAGTGCCAATAGAACAGAAACATGAAGTCTGGGGTTCAAACCAGAACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 ACATTTGTAACACAGACCCTGAAACTGATGGCCTTTCACCTTCTGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148772 ACATTTGTAACACAGACCCTGAAACTGATGGCCTTTCACCTTCTGTTGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 TCTCCAAGTCCCAAAGAAGTCAATTTTGTTTCAAGGGGAGCTTCAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148822 TCTCCAAGTCCCAAAGAAGTCAATTTTGTTTCAAGGGGAGCTTCAAGTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CCAGCCCAGAGTTCCACTTTTTCCTGAAAATGGTTTACACCAGCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148872 CCAGCCCAGAGTTCCACTTTTTCCTGAAAATGGTTTACACCAGCAGCCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AACCCTTGCTTCCAAATAATATGAAATCTGCCTGTGAAAAACGTTTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148922 AACCCTTGCTTCCAAATAATATGAAATCTGCCTGTGAAAAACGTTTAGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 TGTTGTAGTTCTCCTCATTCTAAGCCAAATTGCTCAACCCTTTCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148972 TGTTGTAGTTCTCCTCATTCTAAGCCAAATTGCTCAACCCTTTCTCCACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 AATGCCACTGCCCCAGCTGTTACCTTCGGTTACTGATGCAAGGTCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149022 AATGCCACTGCCCCAGCTGTTACCTTCGGTTACTGATGCAAGGTCGGCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 GACCTTCTGATCATATTGATTCCTCAGTTACTGGGGTTCAAAGGTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149072 GACCTTCTGATCATATTGATTCCTCAGTTACTGGGGTTCAAAGGTTTCGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GATACTCTAAAAATACCCTACAAGCTGGAATTAAAAAATGAACCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149122 GATACTCTAAAAATACCCTACAAGCTGGAATTAAAAAATGAACCAGGGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 AACGGATTTGAAACACATTGTTATAGATGGGAGCAATGTTGCAATTAC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 149172 AACGGATTTGAAACACATTGTTATAGATGGGAGCAATGTTGCAATTACGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1890        CCATGGTCTGAAAAAGTTCTTTTCTTGTCGTGGAATTGCAATT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149222 A...TAGCCATGGTCTGAAAAAGTTCTTTTCTTGTCGTGGAATTGCAATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 GCAGTTGAATATTTTTGGAAGCTTGGCAACAGAAACATCACTGTATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156347 GCAGTTGAATATTTTTGGAAGCTTGGCAACAGAAACATCACTGTATTTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1983 CCCTCAGTGGAGAACAAGGCGTGATCCTAATGTCACAG         AAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 156397 CCCTCAGTGGAGAACAAGGCGTGATCCTAATGTCACAGGTG...CAGAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 AGCACTTCTTAACCCAGCTCCAGGAGCTCGGAATATTATCTTTAACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158494 AGCACTTCTTAACCCAGCTCCAGGAGCTCGGAATATTATCTTTAACTCCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 GCCCGGATGGTCTTTGGAGAAAGAATTGCTTCTCATGATGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 158544 GCCCGGATGGTCTTTGGAGAAAGAATTGCTTCTCATGATGACAGGTA...

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2118    GTTTCTACTACACTTAGCGGACAAAACTGGTGGCATAATTGTGACAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161856 TAGGTTTCTACTACACTTAGCGGACAAAACTGGTGGCATAATTGTGACAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2165 ATGATAATTTCAGAGAATTTGTGAATGAGTCAGTCTCTTGGAGAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161906 ATGATAATTTCAGAGAATTTGTGAATGAGTCAGTCTCTTGGAGAGAAATT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2215 ATTACAAAAAG         GCTGCTGCAGTACACGTTCGTGGGGGACAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 161956 ATTACAAAAAGGTA...TAGGCTGCTGCAGTACACGTTCGTGGGGGACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 ATTTATGGTTCCCGATGATCCTCTGGGAAGAAGTGGACCTCGATTAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163749 ATTTATGGTTCCCGATGATCCTCTGGGAAGAAGTGGACCTCGATTAGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2306 AGTTTCTTCAGAAGGAAGTCTGTCTTAG         AGATATGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 163799 AGTTTCTTCAGAAGGAAGTCTGTCTTAGGTA...CAGAGATATGCAGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2347 CTACTCAGTGCCCTGCCAAATGTGGGCATGTTTGACCCCAGCTTCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166725 CTACTCAGTGCCCTGCCAAATGTGGGCATGTTTGACCCCAGCTTCAGAGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2397 CCCTGGCACCCAGGCAGCCAGCACCAGCCACCAGCCTCCGACCCGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166775 CCCTGGCACCCAGGCAGCCAGCACCAGCCACCAGCCTCCGACCCGGATTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2447 AGGGAGCCCCTTCAAGCCACTGGCTCCCTCAGCAGCCCCACTTCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166825 AGGGAGCCCCTTCAAGCCACTGGCTCCCTCAGCAGCCCCACTTCCCACTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2497 CTGCCAGCCCTCCCCAGTCTCCAGCAGAACCTGCCCATGCCAGCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166875 CTGCCAGCCCTCCCCAGTCTCCAGCAGAACCTGCCCATGCCAGCTCAGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2547 ATCTTCTGCAGAAACCAACGAGCTGAGGGAAGCCCTTCTGAAGATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166925 ATCTTCTGCAGAAACCAACGAGCTGAGGGAAGCCCTTCTGAAGATCTTCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2597 CTGACTCAGAGCAAAGACTGAAAATAGACCAGATCTTGGTGGCCCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166975 CTGACTCAGAGCAAAGACTGAAAATAGACCAGATCTTGGTGGCCCACCCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :
   2647 TACATGAAAGATCTAAATGCGCTTTCTGCCATGGTGTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167025 TACATGAAAGATCTAAATGCGCTTTCTGCCATGGTGTTGGAT