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seq2 = pF1KSDA0588/gi568815593f_141330760.tfa (gi568815593f:141330760_141611170), 280411 bp

>pF1KSDA0588 2796
>gi568815593f:141330760_141611170 (Chr5)

1-2424  (100001-102424)   100% ->
2425-2483  (164048-164106)   100% ->
2484-2572  (174634-174722)   98% ->
2573-2796  (180188-180411)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTCCTGCGCGACTGCACCGGGACTACAAAGGGCTTGTCCTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTCCTGCGCGACTGCACCGGGACTACAAAGGGCTTGTCCTGCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATCCTCCTGGGGACTCTGTGGGAGACCGGATGCACCCAGATACGCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATCCTCCTGGGGACTCTGTGGGAGACCGGATGCACCCAGATACGCTATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGTTCCGGAAGAGCTGGAGAAAGGCTCTAGGGTGGGCGACATCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGTTCCGGAAGAGCTGGAGAAAGGCTCTAGGGTGGGCGACATCTCCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCTGGGGCTGGAGCCCCGGGAGCTCGCGGAGCGCGGAGTCCGCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCTGGGGCTGGAGCCCCGGGAGCTCGCGGAGCGCGGAGTCCGCATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCAGAGGTAGGACGCAGCTTTTCGCCCTGAATCCGCGCAGCGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCAGAGGTAGGACGCAGCTTTTCGCCCTGAATCCGCGCAGCGGCAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCACGGCGGGCAGGATAGACCGGGAGGAGCTCTGTATGGGGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCACGGCGGGCAGGATAGACCGGGAGGAGCTCTGTATGGGGGCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGTGTCAATTAAATCTAGACATTCTGATGGAGGATAAAGTGAAAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGTGTCAATTAAATCTAGACATTCTGATGGAGGATAAAGTGAAAATATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGAGTAGAAGTAGAAGTAAGGGACATTAACGACAATGCGCCTTACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGAGTAGAAGTAGAAGTAAGGGACATTAACGACAATGCGCCTTACTTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGAAAGTGAATTAGAAATAAAAATTAGTGAAAATGCAGCCACTGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGAAAGTGAATTAGAAATAAAAATTAGTGAAAATGCAGCCACTGAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGGTTCCCTCTACCCCACGCCTGGGATCCGGATATCGGGAAGAACTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGGTTCCCTCTACCCCACGCCTGGGATCCGGATATCGGGAAGAACTCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCAGAGCTACGAGCTCAGCCCGAACACTCACTTCTCCCTCATCGTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAGAGCTACGAGCTCAGCCCGAACACTCACTTCTCCCTCATCGTGCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGGAGCCGACGGTAGTAAGTACCCCGAATTGGTGCTGAAACGCGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGGAGCCGACGGTAGTAAGTACCCCGAATTGGTGCTGAAACGCGCCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACCGCGAAGAAAAGGCTGCTCACCACCTGGTCCTTACGGCCTCCGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACCGCGAAGAAAAGGCTGCTCACCACCTGGTCCTTACGGCCTCCGACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGCGACCCGGTGCGCACAGGCACCGCGCGCATCCGCGTGATGGTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGCGACCCGGTGCGCACAGGCACCGCGCGCATCCGCGTGATGGTTCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGCGAACGACAACGCACCAGCGTTTGCTCAGCCCGAGTACCGCGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGCGAACGACAACGCACCAGCGTTTGCTCAGCCCGAGTACCGCGCGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTCCGGAGAATCTGGCCTTGGGCACGCAGCTGCTTGTAGTCAACGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTCCGGAGAATCTGGCCTTGGGCACGCAGCTGCTTGTAGTCAACGCTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGACCCTGACGAAGGAGTCAATGCGGAAGTGAGGTATTCCTTCCGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGACCCTGACGAAGGAGTCAATGCGGAAGTGAGGTATTCCTTCCGGTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGACGACAAGGCGGCCCAAGTTTTCAAACTAGATTGTAATTCAGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGACGACAAGGCGGCCCAAGTTTTCAAACTAGATTGTAATTCAGGGACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATATCAACAATAGGGGAGTTGGACCACGAGGAGTCAGGATTCTACCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATATCAACAATAGGGGAGTTGGACCACGAGGAGTCAGGATTCTACCAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAAGTGCAAGCAATGGATAATGCAGGATATTCTGCGCGAGCCAAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAAGTGCAAGCAATGGATAATGCAGGATATTCTGCGCGAGCCAAAGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGATCACTGTTCTGGACGTGAACGACAATGCCCCAGAAGTGGTCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGATCACTGTTCTGGACGTGAACGACAATGCCCCAGAAGTGGTCCTCACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCTCTCGCCAGCTCGGTTCCCGAAAACTCTCCCAGAGGGACATTAATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCTCTCGCCAGCTCGGTTCCCGAAAACTCTCCCAGAGGGACATTAATTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCTTTTAAATGTAAATGACCAAGATTCTGAGGAAAACGGACAGGTGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCTTTTAAATGTAAATGACCAAGATTCTGAGGAAAACGGACAGGTGATCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTTTCATCCAAGGAAATCTGCCCTTTAAATTAGAAAAATCTTACGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTTTCATCCAAGGAAATCTGCCCTTTAAATTAGAAAAATCTTACGGAAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TACTATAGTTTAGTCACAGACATAGTCTTGGATAGGGAACAGGTTCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TACTATAGTTTAGTCACAGACATAGTCTTGGATAGGGAACAGGTTCCTAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTACAACATCACAGTGACCGCCACTGACCGGGGAACCCCGCCCCTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTACAACATCACAGTGACCGCCACTGACCGGGGAACCCCGCCCCTATCCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CGGAAACTCATATCTCGCTGAACGTGGCAGACACCAACGACAACCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CGGAAACTCATATCTCGCTGAACGTGGCAGACACCAACGACAACCCGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GTCTTCCCTCAGGCCTCCTATTCCGCTTATATCCCAGAGAACAATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GTCTTCCCTCAGGCCTCCTATTCCGCTTATATCCCAGAGAACAATCCCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AGGAGTTTCCCTCGTCTCTGTGACCGCCCACGACCCCGACTGTGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AGGAGTTTCCCTCGTCTCTGTGACCGCCCACGACCCCGACTGTGAAGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACGCCCAGATCACTTATTCCCTGGCTGAGAACACCATCCAAGGGGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACGCCCAGATCACTTATTCCCTGGCTGAGAACACCATCCAAGGGGCAAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTATCGTCCTACGTGTCCATCAACTCCGACACTGGGGTACTGTATGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTATCGTCCTACGTGTCCATCAACTCCGACACTGGGGTACTGTATGCGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GAGCTCCTTCGACTACGAGCAGTTCCGAGACTTGCAAGTGAAAGTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GAGCTCCTTCGACTACGAGCAGTTCCGAGACTTGCAAGTGAAAGTGATGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CGCGGGACAACGGGCACCCGCCCCTCAGCAGCAACGTGTCGTTGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CGCGGGACAACGGGCACCCGCCCCTCAGCAGCAACGTGTCGTTGAGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTCGTGCTGGACCAGAACGACAATGCGCCCGAGATCCTGTACCCCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTCGTGCTGGACCAGAACGACAATGCGCCCGAGATCCTGTACCCCGCCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CCCCACGGACGGTTCCACTGGCGTGGAGCTGGCTCCCCGCTCCGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCCCACGGACGGTTCCACTGGCGTGGAGCTGGCTCCCCGCTCCGCAGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CCGGCTACCTGGTGACCAAGGTGGTGGCGGTGGACAGAGACTCCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CCGGCTACCTGGTGACCAAGGTGGTGGCGGTGGACAGAGACTCCGGCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AACGCCTGGCTGTCCTACCGTCTGCTCAAGGCCAGCGAGCCGGGACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AACGCCTGGCTGTCCTACCGTCTGCTCAAGGCCAGCGAGCCGGGACTCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CTCGGTGGGTCTGCACACGGGCGAGGTGCGCACGGCGCGAGCCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CTCGGTGGGTCTGCACACGGGCGAGGTGCGCACGGCGCGAGCCCTGCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ACAGAGACGCGCTCAAGCAGAGCCTCGTAGTGGCCGTCCAGGACCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ACAGAGACGCGCTCAAGCAGAGCCTCGTAGTGGCCGTCCAGGACCACGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CAGCCCCCTCTCTCCGCCACTGTCACGCTCACCGTGGCCGTGGCCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CAGCCCCCTCTCTCCGCCACTGTCACGCTCACCGTGGCCGTGGCCGACAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CATCCCCCAAGTCCTGGCGGACCTCGGCAGCCTCGAGTCTCCAGCTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CATCCCCCAAGTCCTGGCGGACCTCGGCAGCCTCGAGTCTCCAGCTAACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 CTGAAACCTCAGACCTCACTCTGTACCTGGTGGTAGCGGTGGCCGCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 CTGAAACCTCAGACCTCACTCTGTACCTGGTGGTAGCGGTGGCCGCGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 TCCTGCGTCTTCCTGGCCTTCGTCATCTTGCTGCTGGCGCTCAGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 TCCTGCGTCTTCCTGGCCTTCGTCATCTTGCTGCTGGCGCTCAGGCTGCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 GCGCTGGCACAAGTCACGCCTGCTGCAGGCTTCAGGAGGCGGCTTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 GCGCTGGCACAAGTCACGCCTGCTGCAGGCTTCAGGAGGCGGCTTGACAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 GAGCGCCGGCGTCGCACTTTGTGGGCGTGGACGGGGTGCAGGCTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 GAGCGCCGGCGTCGCACTTTGTGGGCGTGGACGGGGTGCAGGCTTTCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 CAGACCTATTCCCACGAGGTTTCCCTCACCACGGACTCGCGGAAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CAGACCTATTCCCACGAGGTTTCCCTCACCACGGACTCGCGGAAGAGTCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CCTGATCTTCCCCCAGCCCAACTATGCAGACATGCTCGTCAGCCAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CCTGATCTTCCCCCAGCCCAACTATGCAGACATGCTCGTCAGCCAGGAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 GCTTTGAAAAAAGCGAGCCCCTTTTGCTGTCAGGTGATTCGGTATTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 GCTTTGAAAAAAGCGAGCCCCTTTTGCTGTCAGGTGATTCGGTATTTTCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 AAAGACAGTCATGGGTTAATTGAG         CAAGCCCCGCCCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102401 AAAGACAGTCATGGGTTAATTGAGGTG...CAGCAAGCCCCGCCCAACAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 GGACTGGCGTTTCTCTCAGGCCCAGAGACCCGGCACCAGCGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 164065 GGACTGGCGTTTCTCTCAGGCCCAGAGACCCGGCACCAGCGGGTA...CA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484  CTCCCAAAATGGCGATGACACCGGCACCTGGCCCAACAACCAGTTTGAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174633 GCTCCCAAAATGGCGATGACACCGGCACCTGGCCCAACAACCAGTTTGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2533 ACAGAAATGCTGCAAGCCATGATCTTGGCGTCCGCCAGTG         A
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 174683 ACAGAGATGCTGCAAGCCATGATCTTGGCGTCCGCCAGTGGTA...CAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2574 AGCTGCTGATGGGAGCTCCACCCTGGGAGGGGGTGCCGGCACCATGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180189 AGCTGCTGATGGGAGCTCCACCCTGGGAGGGGGTGCCGGCACCATGGGAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2624 TGAGCGCCCGCTACGGACCCCAGTTCACCCTGCAGCACGTGCCCGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180239 TGAGCGCCCGCTACGGACCCCAGTTCACCCTGCAGCACGTGCCCGACTAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2674 CGCCAGAATGTCTACATCCCAGGCAGCAATGCCACACTGACCAACGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180289 CGCCAGAATGTCTACATCCCAGGCAGCAATGCCACACTGACCAACGCAGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2724 TGGCAAGCGGGATGGCAAGGCCCCAGCAGGTGGCAATGGCAACAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180339 TGGCAAGCGGGATGGCAAGGCCCCAGCAGGTGGCAATGGCAACAAGAAGA

   2800     .    :    .    :
   2774 AGTCGGGCAAGAAGGAGAAGAAG
        |||||||||||||||||||||||
 180389 AGTCGGGCAAGAAGGAGAAGAAG