seq1 = pF1KSDA0585.tfa, 1242 bp
seq2 = pF1KSDA0585/gi568815581r_76618732.tfa (gi568815581r:76618732_76826475), 207744 bp

>pF1KSDA0585 1242
>gi568815581r:76618732_76826475 (Chr17)

(complement)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-518  (100621-101009)   100% ->
519-805  (102418-102704)   100% ->
806-941  (104543-104678)   100% ->
942-1080  (105978-106116)   100% ->
1081-1208  (107616-107743)   100% ->
1209-1242  (109754-109787)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCACAAGAGCAAGAAGCGCATCCGCGAGGCCAAGCGGAGTGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCACAAGAGCAAGAAGCGCATCCGCGAGGCCAAGCGGAGTGCGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGAGCTCAAGGACTCGCTGGATTGGACCCGGCACAACTACTACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGGAGCTCAAGGACTCGCTGGATTGGACCCGGCACAACTACTACGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCTCGCTGAGCCCGGCGGCCGTGGCG         GATAACGTGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 GCTTCTCGCTGAGCCCGGCGGCCGTGGCGGTG...CAGGATAACGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGGCAGATGCTTTACAGCTGTCTGTGGAAGAATTTGTGGAGCGGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100633 AGGGCAGATGCTTTACAGCTGTCTGTGGAAGAATTTGTGGAGCGGTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGACCTTACAAGCCCGTGGTTTTGTTGAATGCGCAAGAGGGCTGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100683 AAGACCTTACAAGCCCGTGGTTTTGTTGAATGCGCAAGAGGGCTGGTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGCAGGAGAAATGGACTCTGGAGCGCCTAAAAAGGAAATATCGGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100733 CGCAGGAGAAATGGACTCTGGAGCGCCTAAAAAGGAAATATCGGAACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGTTCAAGTGTGGTGAGGATAACGATGGCTACTCAGTGAAGATGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100783 AAGTTCAAGTGTGGTGAGGATAACGATGGCTACTCAGTGAAGATGAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAATACTACATCGAGTACATGGAGAGCACTCGAGATGATAGTCCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100833 GAAATACTACATCGAGTACATGGAGAGCACTCGAGATGATAGTCCCCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACATCTTTGACAGCAGCTATGGTGAACACCCTAAAAGAAGGAAACTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100883 ACATCTTTGACAGCAGCTATGGTGAACACCCTAAAAGAAGGAAACTTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAGACTACAAGGTGCCAAAGTTTTTCACTGATGACCTTTTCCAGTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100933 GAAGACTACAAGGTGCCAAAGTTTTTCACTGATGACCTTTTCCAGTATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGGGAGAAGCGCAGGCCCCCTTACAG         GTGGTTTGTGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100983 TGGGGAGAAGCGCAGGCCCCCTTACAGGTA...TAGGTGGTTTGTGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGCCACCACGCTCCGGAACTGGGATTCACATCGACCCTCTGGGAACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102432 GGCCACCACGCTCCGGAACTGGGATTCACATCGACCCTCTGGGAACCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCTGGAATGCCTTAGTTCAGGGCCACAAGCGCTGGTGCCTGTTTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102482 GCCTGGAATGCCTTAGTTCAGGGCCACAAGCGCTGGTGCCTGTTTCCTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAGCACTCCCAGGGAACTCATCAAAGTGACCCGAGACGAAGGAGGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102532 CAGCACTCCCAGGGAACTCATCAAAGTGACCCGAGACGAAGGAGGGAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCAAGACGAAGCTATTACCTGGTTTAATGTTATTTATCCCCGGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102582 AGCAAGACGAAGCTATTACCTGGTTTAATGTTATTTATCCCCGGACACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTTCCAACCTGGCCACCTGAATTCAAACCCCTGGAAATCTTACAAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102632 CTTCCAACCTGGCCACCTGAATTCAAACCCCTGGAAATCTTACAAAAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGGAGAGACTGTCTTTGTACCAG         GAGGCTGGTGGCATGTTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102682 AGGAGAGACTGTCTTTGTACCAGGTA...CAGGAGGCTGGTGGCATGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCCTCAATCTCGACACTACTATCGCCATCACCCAAAATTTTGCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104561 TCCTCAATCTCGACACTACTATCGCCATCACCCAAAATTTTGCCAGCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACCAACTTCCCTGTGGTATGGCACAAGACGGTAAGAGGGAGACCAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104611 ACCAACTTCCCTGTGGTATGGCACAAGACGGTAAGAGGGAGACCAAAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ATCAAGGAAATGGTATAG         GATTTTGAAGCAAGAGCACCCCG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104661 ATCAAGGAAATGGTATAGGTG...CAGGATTTTGAAGCAAGAGCACCCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGTTGGCAGTCCTCGCAGACTCGGTTGACCTTCAGGAGTCCACAGGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106001 AGTTGGCAGTCCTCGCAGACTCGGTTGACCTTCAGGAGTCCACAGGGATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCTTCCGACAGCTCCAGCGACTCTTCCAGCTCCTCCAGCTCCAGTTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106051 GCTTCCGACAGCTCCAGCGACTCTTCCAGCTCCTCCAGCTCCAGTTCGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGACTCCGACTCAGAG         TGCGAGTCTGGATCCGAGGGCGATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 106101 AGACTCCGACTCAGAGGTG...CAGTGCGAGTCTGGATCCGAGGGCGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GGACAGTGCACCGCAGGAAGAAGAGGAGGACGTGCAGCATGGTGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107641 GGACAGTGCACCGCAGGAAGAAGAGGAGGACGTGCAGCATGGTGGGAAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GGGGACACCACCTCCCAGGACGACTGTGTCAGCAAAGAGCGCAGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107691 GGGGACACCACCTCCCAGGACGACTGTGTCAGCAAAGAGCGCAGCTCCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1206 CAG         GATTAGGGACACTTGTGGAGGCCGGGCTCACCCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107741 CAGGTG...CAGGATTAGGGACACTTGTGGAGGCCGGGCTCACCCC