Result of SIM4 for
pF1KSDA0576
seq1 = pF1KSDA0576.tfa, 3183 bp
seq2 = pF1KSDA0576/gi568815592f_56947311.tfa (gi568815592f:56947311_57268466), 321156 bp
>pF1KSDA0576 3183
>gi568815592f:56947311_57268466 (Chr6)
1-21 (142944-142964) 100% ->
22-105 (143501-143584) 100% ->
106-186 (151751-151831) 100% ->
187-312 (177424-177549) 100% ->
313-424 (181419-181530) 100% ->
425-575 (185732-185882) 100% ->
576-702 (187434-187560) 100% ->
703-856 (193992-194145) 100% ->
857-1004 (194638-194785) 100% ->
1005-2608 (199780-201383) 100% ->
2609-2752 (203409-203552) 100% ->
2753-2883 (204911-205041) 100% ->
2884-3070 (206551-206737) 100% ->
3071-3139 (213774-213842) 100% ->
3140-3183 (221113-221156) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGAGACCCGGGGTCGGAG ATAATAGAATCTGTCCCTCC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
142944 ATGGGAGACCCGGGGTCGGAGGTG...TAGATAATAGAATCTGTCCCTCC
50 . : . : . : . : . :
42 AGCTGGCCCTGAGGCATCTGAGTCAACAACGGATGAAAATGAAGACGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143521 AGCTGGCCCTGAGGCATCTGAGTCAACAACGGATGAAAATGAAGACGACA
100 . : . : . : . : . :
92 TTCAGTTTGTCAGT GAAGGACCATTACGACCTGTTCTTGAA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
143571 TTCAGTTTGTCAGTGTA...TAGGAAGGACCATTACGACCTGTTCTTGAA
150 . : . : . : . : . :
133 TACATTGATCTGGTCAGCAGTGATGATGAAGAGCCTAGCACCTCTTATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151778 TACATTGATCTGGTCAGCAGTGATGATGAAGAGCCTAGCACCTCTTATAC
200 . : . : . : . : . :
183 TGAT GAGAATATTAAACGTAAAGACCATATTGATTATCAGA
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151828 TGATGTA...TAGGAGAATATTAAACGTAAAGACCATATTGATTATCAGA
250 . : . : . : . : . :
224 AGGATAAAGTTGCTTTAACTCTGGCTCGTCTAGCCCGCCATGTTGAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177461 AGGATAAAGTTGCTTTAACTCTGGCTCGTCTAGCCCGCCATGTTGAAGTG
300 . : . : . : . : . :
274 GAGAAACAGCAGAAAGAAGAGAAGAATAGAGCATTCAGA GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
177511 GAGAAACAGCAGAAAGAAGAGAAGAATAGAGCATTCAGAGTA...CAGGA
350 . : . : . : . : . :
315 AAAAATTGATTTTCAGCATGCTCATGGGTTACAAGAATTGGAATTTATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181421 AAAAATTGATTTTCAGCATGCTCATGGGTTACAAGAATTGGAATTTATTC
400 . : . : . : . : . :
365 GAGGACATTCTGATACAGAAGCAGCAAGACTGTGTGTGGACCAGTGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181471 GAGGACATTCTGATACAGAAGCAGCAAGACTGTGTGTGGACCAGTGGCTA
450 . : . : . : . : . :
415 AAAATGCCAG GACTCAAAACAGGCACAATTAATTGTGGAAC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
181521 AAAATGCCAGGTA...CAGGACTCAAAACAGGCACAATTAATTGTGGAAC
500 . : . : . : . : . :
456 AAAAAGTTCATTCCGAAGAGGAGGCCACACGTGGGTGTCTGGGAAACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185763 AAAAAGTTCATTCCGAAGAGGAGGCCACACGTGGGTGTCTGGGAAACCAA
550 . : . : . : . : . :
506 TTTTATGTCCTATAATGCACTGTAACAAGGAGTTTGACAATGGGCACCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
185813 TTTTATGTCCTATAATGCACTGTAACAAGGAGTTTGACAATGGGCACCTT
600 . : . : . : . : . :
556 CTCTTAGGACATTTGAAAAG GTTCGATCACTCTCCATGTGA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
185863 CTCTTAGGACATTTGAAAAGGTA...TAGGTTCGATCACTCTCCATGTGA
650 . : . : . : . : . :
597 TCCAACAATTACACTACATGGACCTTTCTTCAGCTCCTTTGCTTGTGTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187455 TCCAACAATTACACTACATGGACCTTTCTTCAGCTCCTTTGCTTGTGTAG
700 . : . : . : . : . :
647 TATGTTATAAAAAATTTGTTACTCAACAACAATATAGAGATCACCTTTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
187505 TATGTTATAAAAAATTTGTTACTCAACAACAATATAGAGATCACCTTTTT
750 . : . : . : . : . :
697 GATAAG GAAGCCACAGATGATGGACATAACAACAACCTTCT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
187555 GATAAGGTA...TAGGAAGCCACAGATGATGGACATAACAACAACCTTCT
800 . : . : . : . : . :
738 TCCTCAGATTATTCAGTGTTTTGCATGTCCAAATTGCTTCCTTCTTTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
194027 TCCTCAGATTATTCAGTGTTTTGCATGTCCAAATTGCTTCCTTCTTTTTA
850 . : . : . : . : . :
788 GCAGAAAGGAGGAGTGTTCAAAGCATATGTCTGGAAAGAATCATTTCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
194077 GCAGAAAGGAGGAGTGTTCAAAGCATATGTCTGGAAAGAATCATTTCCAT
900 . : . : . : . : . :
838 CAGAGTTTCAAACTGGGTG ATAACAAAGGAATTGCACATCC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
194127 CAGAGTTTCAAACTGGGTGGTA...CAGATAACAAAGGAATTGCACATCC
950 . : . : . : . : . :
879 AATATCTTTCCCATCTTTTGCAAAGAAACTTTTGATCTCTCTGTGCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
194660 AATATCTTTCCCATCTTTTGCAAAGAAACTTTTGATCTCTCTGTGCAAAG
1000 . : . : . : . : . :
929 ATGTTCCCTTTCAAGTTAAGTGTGTGGCCTGCCACAAGACACTGCGTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
194710 ATGTTCCCTTTCAAGTTAAGTGTGTGGCCTGCCACAAGACACTGCGTTCC
1050 . : . : . : . : . :
979 CACATGGAGCTCACTGCCCATTTCAG AGTTCATTGTCGAAA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
194760 CACATGGAGCTCACTGCCCATTTCAGGTT...TAGAGTTCATTGTCGAAA
1100 . : . : . : . : . :
1020 TGCTGGACCTGTAGCTGTAGCTGAGAAGAGCATTACCCAGGTTGCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199795 TGCTGGACCTGTAGCTGTAGCTGAGAAGAGCATTACCCAGGTTGCAGAGA
1150 . : . : . : . : . :
1070 AATTCATATTAAGAGGTTATTGTCCAGATTGCAATCAAGTCTTTGTGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199845 AATTCATATTAAGAGGTTATTGTCCAGATTGCAATCAAGTCTTTGTGGAT
1200 . : . : . : . : . :
1120 GAAACCAGCACCCAAAATCATAAGCAGAATTCAGGACACAAAGTCCGAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199895 GAAACCAGCACCCAAAATCATAAGCAGAATTCAGGACACAAAGTCCGAGT
1250 . : . : . : . : . :
1170 CATTAACTCAGTGGAAGAATCAGTCTTACTCTATTGCCACAGCAGCGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199945 CATTAACTCAGTGGAAGAATCAGTCTTACTCTATTGCCACAGCAGCGAAG
1300 . : . : . : . : . :
1220 GGAACAAGGATCCTTCTTCTGACTTGCATTTATTGTTGGATCAATCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
199995 GGAACAAGGATCCTTCTTCTGACTTGCATTTATTGTTGGATCAATCAAAA
1350 . : . : . : . : . :
1270 TTTTCATCACTTAAAAGAACCATGTCTATTAAAGAATCTAGCTCACTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200045 TTTTCATCACTTAAAAGAACCATGTCTATTAAAGAATCTAGCTCACTGGA
1400 . : . : . : . : . :
1320 GTGCATTGCCATTCCAAAAAAGAAGATGAATTTAAAAGATAAAAGCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200095 GTGCATTGCCATTCCAAAAAAGAAGATGAATTTAAAAGATAAAAGCCATG
1450 . : . : . : . : . :
1370 AAGGTGTTGCTTGTGTCCAGAAAGAAAAATCAGTAGTTAAAACCTGGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200145 AAGGTGTTGCTTGTGTCCAGAAAGAAAAATCAGTAGTTAAAACCTGGTTC
1500 . : . : . : . : . :
1420 TGTGAATGCAATCAGCGATTCCCAAGTGAAGATGCAGTAGAAAAGCATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200195 TGTGAATGCAATCAGCGATTCCCAAGTGAAGATGCAGTAGAAAAGCATGT
1550 . : . : . : . : . :
1470 TTTCTCAGCAAACACAATGGGTTATAAATGTGTGGTCTGTGGAAAGGTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200245 TTTCTCAGCAAACACAATGGGTTATAAATGTGTGGTCTGTGGAAAGGTAT
1600 . : . : . : . : . :
1520 GTGATGATTCAGGGGTCATTCGTTTACACATGAGCCGGATTCACGGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200295 GTGATGATTCAGGGGTCATTCGTTTACACATGAGCCGGATTCACGGAGGG
1650 . : . : . : . : . :
1570 GCACATTTAAATAACTTTCTTTTCTGGTGTCGGACATGCAAAAAGGAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200345 GCACATTTAAATAACTTTCTTTTCTGGTGTCGGACATGCAAAAAGGAGTT
1700 . : . : . : . : . :
1620 AACAAGGAAAGATACTATCATGGCACATGTGACTGAATTTCATAATGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200395 AACAAGGAAAGATACTATCATGGCACATGTGACTGAATTTCATAATGGAC
1750 . : . : . : . : . :
1670 ACAGATATTTTTATGAGATGGATGAGGTAGAAGGTGAAACTTTGCCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200445 ACAGATATTTTTATGAGATGGATGAGGTAGAAGGTGAAACTTTGCCATCA
1800 . : . : . : . : . :
1720 TCCTCTACAACATTGGATAATTTGACTGCTAACAAGCCTTCATCAGCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200495 TCCTCTACAACATTGGATAATTTGACTGCTAACAAGCCTTCATCAGCTAT
1850 . : . : . : . : . :
1770 TACTGTTATTGATCATTCCCCGGCAAATAGTTCTCCGAGGGGTAAATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200545 TACTGTTATTGATCATTCCCCGGCAAATAGTTCTCCGAGGGGTAAATGGC
1900 . : . : . : . : . :
1820 AATGCCGGATTTGTGAAGATATGTTTGATTCCCAGGAATATGTAAAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200595 AATGCCGGATTTGTGAAGATATGTTTGATTCCCAGGAATATGTAAAACAG
1950 . : . : . : . : . :
1870 CACTGCATGTCTTTGGCAAGCCACAAGTTTCATAGATACAGCTGTGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200645 CACTGCATGTCTTTGGCAAGCCACAAGTTTCATAGATACAGCTGTGCTCA
2000 . : . : . : . : . :
1920 CTGCAGAAAGCCTTTTCATAAGATAGAAACATTGTACCGACATTGCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200695 CTGCAGAAAGCCTTTTCATAAGATAGAAACATTGTACCGACATTGCCAAG
2050 . : . : . : . : . :
1970 ATGAGCATGACAATGAGATAAAGATTAAATACTTCTGTGGGCTTTGTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200745 ATGAGCATGACAATGAGATAAAGATTAAATACTTCTGTGGGCTTTGTGAT
2100 . : . : . : . : . :
2020 CTTATCTTTAATGTGGAAGAAGCATTTCTGAGTCATTATGAGGAGCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200795 CTTATCTTTAATGTGGAAGAAGCATTTCTGAGTCATTATGAGGAGCACCA
2150 . : . : . : . : . :
2070 CAGCATAGATTATGTATTTGTGTCAGAAAAAACTGAAACTTCAATTAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200845 CAGCATAGATTATGTATTTGTGTCAGAAAAAACTGAAACTTCAATTAAAA
2200 . : . : . : . : . :
2120 CCGAAGATGATTTTCCAGTAATAGAGACCAGTAACCAGTTAACTTGTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200895 CCGAAGATGATTTTCCAGTAATAGAGACCAGTAACCAGTTAACTTGTGGT
2250 . : . : . : . : . :
2170 TGCCGTGAGAGTTACATCTGTAAAGTCAACAGAAAAGAAGATTATAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200945 TGCCGTGAGAGTTACATCTGTAAAGTCAACAGAAAAGAAGATTATAGCAG
2300 . : . : . : . : . :
2220 ATGTCTCCAAATCATGCTGGATAAAGGAAAACTGTGGTTTCGCTGCAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200995 ATGTCTCCAAATCATGCTGGATAAAGGAAAACTGTGGTTTCGCTGCAGTT
2350 . : . : . : . : . :
2270 TATGTTCGGCAACAGCACAGAATTTAACCGACATGAACACTCATATCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201045 TATGTTCGGCAACAGCACAGAATTTAACCGACATGAACACTCATATCCAT
2400 . : . : . : . : . :
2320 CAAGTGCACAAAGAAAAGAGTGATGAGGAGGAGCAGCAGTATGTAATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201095 CAAGTGCACAAAGAAAAGAGTGATGAGGAGGAGCAGCAGTATGTAATCAA
2450 . : . : . : . : . :
2370 GTGTGGCACCTGCACCAAAGCATTTCATGATCCTGAGAGTGCACAGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201145 GTGTGGCACCTGCACCAAAGCATTTCATGATCCTGAGAGTGCACAGCAGC
2500 . : . : . : . : . :
2420 ATTTCCATAGAAAACATTGCTTCTTACAGAAACCCAGTGTGGCTCATTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201195 ATTTCCATAGAAAACATTGCTTCTTACAGAAACCCAGTGTGGCTCATTTT
2550 . : . : . : . : . :
2470 GGATCTGAAAAATCAAACCTGTACAAGTTTACTGCTAGTGCCTCACATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201245 GGATCTGAAAAATCAAACCTGTACAAGTTTACTGCTAGTGCCTCACATAC
2600 . : . : . : . : . :
2520 AGAGAGAAAACTGAAACAGGCAATAAACTATTCAAAAAGTTTAGACATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201295 AGAGAGAAAACTGAAACAGGCAATAAACTATTCAAAAAGTTTAGACATGG
2650 . : . : . : . : . :
2570 AGAAAGGAGTTGAGAATGACCTAAGCTATCAGAATATAG AG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
201345 AGAAAGGAGTTGAGAATGACCTAAGCTATCAGAATATAGGTA...CAGAG
2700 . : . : . : . : . :
2611 GAAGAAATTGTTGAGCTTCCAGATTTGGATTACCTGCGAACCATGACTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203411 GAAGAAATTGTTGAGCTTCCAGATTTGGATTACCTGCGAACCATGACTCA
2750 . : . : . : . : . :
2661 TATAGTCTTTGTAGATTTTGATAACTGGTCAAACTTTTTTGGTCATCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
203461 TATAGTCTTTGTAGATTTTGATAACTGGTCAAACTTTTTTGGTCATCTAC
2800 . : . : . : . : . :
2711 CAGGGCATCTAAACCAAGGAACATTTATTTGGGGCTTTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
203511 CAGGGCATCTAAACCAAGGAACATTTATTTGGGGCTTTCAAGGTA...TA
2850 . : . : . : . : . :
2753 GAGGAAACACCAATTGGAAGCCTCCGCTCAACTGTAAGATTTATAACTA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
204910 GGAGGAAACACCAATTGGAAGCCTCCGCTCAACTGTAAGATTTATAACTA
2900 . : . : . : . : . :
2802 CCTGAACAGGATTGGATGCTTCTTCCTTCATCCTCGCTGTAGTAAAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
204960 CCTGAACAGGATTGGATGCTTCTTCCTTCATCCTCGCTGTAGTAAAAGAA
2950 . : . : . : . : . :
2852 AAGATGCTGCTGATTTTGCCATATGTATGCAT GCTGGCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
205010 AAGATGCTGCTGATTTTGCCATATGTATGCATGTG...TAGGCTGGCCGT
3000 . : . : . : . : . :
2893 CTAGATGAACAACTACCCAAGCAAATTCCTTTCACCATCCTCTCAGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
206560 CTAGATGAACAACTACCCAAGCAAATTCCTTTCACCATCCTCTCAGGAGA
3050 . : . : . : . : . :
2943 TCAAGGTTTTCTGGAGCTAGAGAATCAATTTAAGAAGACTCAGAGGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
206610 TCAAGGTTTTCTGGAGCTAGAGAATCAATTTAAGAAGACTCAGAGGCCAG
3100 . : . : . : . : . :
2993 CTCATATACTAAACCCTCACCACTTAGAGGGAGATATGATGTGTGCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
206660 CTCATATACTAAACCCTCACCACTTAGAGGGAGATATGATGTGTGCCTTG
3150 . : . : . : . : . :
3043 TTAAATAGCATATCTGATACCACCAAAG AATGTGACAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
206710 TTAAATAGCATATCTGATACCACCAAAGGTA...CAGAATGTGACAGTGA
3200 . : . : . : . : . :
3084 TGATAACATGGGTGCCAAAAATACTTCAATAGGAGAAGAATTTATATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213787 TGATAACATGGGTGCCAAAAATACTTCAATAGGAGAAGAATTTATATCCA
3250 . : . : . : . : . :
3134 CAGAAG ATGTGGAATTAGAAGAAGCTATTAGAAGAAGTCTT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
213837 CAGAAGGTA...CAGATGTGGAATTAGAAGAAGCTATTAGAAGAAGTCTT
3300 .
3175 GAGGAAATG
|||||||||
221148 GAGGAAATG