seq1 = pF1KSDA0557.tfa, 1440 bp
seq2 = pF1KSDA0557/gi568815582r_4652379.tfa (gi568815582r:4652379_4865978), 213600 bp

>pF1KSDA0557 1440
>gi568815582r:4652379_4865978 (Chr16)

(complement)

1-414  (100001-100414)   99% ->
415-598  (103223-103406)   100% ->
599-663  (103644-103708)   100% ->
664-760  (105391-105487)   100% ->
761-1440  (112921-113600)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACTGTCCCTGGCCTCCAGCCCCTGCCAACCTTGGAGCAGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACTGTCCCTGGCCTCCAGCCCCTGCCAACCTTGGAGCAGGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAACAGGAAGAGATCCTGATTGTGAAGGTGGAGGAGGACTTCTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAACAGGAAGAGATCCTGATTGTGAAGGTGGAGGAGGACTTCTGCTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAGGAGCCCTCCGTGGAGACGGAGGACCCCAGCCCTGAGACTTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAGGAGCCCTCCGTGGAGACGGAGGACCCCAGCCCTGAGACTTTCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTCTTCCGGCTCTTCTGCTACCAGGAGGTGGCTGGGCCCCGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTCTTCCGGCTCTTCTGCTACCAGGAGGTGGCTGGGCCCCGGGAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGAGCCGCCTCTGGGAGCTGTGCTGCCGCTGGCTGCGGCCGGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGAGCCGCCTCTGGGAGCTGTGCTGCCGCTGGCTGCGGCCGGAGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCACCAAGGAGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCACCAAGGAGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCTGCCGGGGGAGATCCAGGCTCGGGTACGCGAGCAGCAGCCGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCTGCCGGGGGAGATCCAGGCTCGGGTACGCGAGCAGCAGCCGGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGTGAGGAGGCCGTGGTCCTCGTGGAAGGGCTGCAGCGGAAGCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGTGAGGAGGCCGTGGTCCTTGTGGAAGGGCTGCAGCGGAAGCCCAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACACAGGCAGCGG         GGCTCAGAGCTGCTTTCTGATGACGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACACAGGCAGCGGGTG...CAGGGCTCAGAGCTGCTTTCTGATGACGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTGCCCCTCGGGATAGGGGGACAGTTCTTAAAACACCAGGCAGAGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103250 GTGCCCCTCGGGATAGGGGGACAGTTCTTAAAACACCAGGCAGAGGCTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCAGAGGATCTGTCCCTGGAGGAAGAGGCTCGATTCTCCAGCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103300 GCCAGAGGATCTGTCCCTGGAGGAAGAGGCTCGATTCTCCAGCCAGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCCCAGCCCAGCTGAGCCACAGGCCACAGAGGGGCCCGCTGTTGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103350 CCCCAGCCCAGCTGAGCCACAGGCCACAGAGGGGCCCGCTGTTGTGGCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAGAGAG         GCCCTCCAGCTCCCCGGCATCAGGAGATGGCGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103400 GAGAGAGGTG...CAGGCCCTCCAGCTCCCCGGCATCAGGAGATGGCGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGCCTCGCCCTTCCTTTCGGCCTGGTCCCAG         GTGCCCGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103678 AGCCTCGCCCTTCCTTTCGGCCTGGTCCCAGGTG...CAGGTGCCCGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACTTGGAGGACGTGGCTGTATACCTTTCTGGGGAGGAGCCAAGATGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 ACTTGGAGGACGTGGCTGTATACCTTTCTGGGGAGGAGCCAAGATGCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACCCAGCTCAGCGGGACGCGCCGCTGGAGAATGAAG         GACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105451 GACCCAGCTCAGCGGGACGCGCCGCTGGAGAATGAAGGTA...CAGGACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGGGATCCAGTTGGAGGACGGCGGTGATGGCAGGGAGGATGCCCCGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112925 TGGGATCCAGTTGGAGGACGGCGGTGATGGCAGGGAGGATGCCCCGTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GAATGGAGTGGTACCGAGTGCTCTCGGCACGATGCCAGGGGCCTGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112975 GAATGGAGTGGTACCGAGTGCTCTCGGCACGATGCCAGGGGCCTGGCCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCGCTCCCAGGTCAGAGGCCAGCCCCAGTCAGGGGCTTGGTCAGGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113025 CCGCTCCCAGGTCAGAGGCCAGCCCCAGTCAGGGGCTTGGTCAGGCCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCAGCCAAGAGGCGGCCCCCCACCAGGAAGACGGGCTTCCCATGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113075 TCAGCCAAGAGGCGGCCCCCCACCAGGAAGACGGGCTTCCCATGGGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACAAGCCGTACACCTGCCCCGAATGTGGCAAAGGCTTCAGCAAGACGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113125 ACAAGCCGTACACCTGCCCCGAATGTGGCAAAGGCTTCAGCAAGACGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CACTTGACCAAGCACCAGCGCACACACACGGGCGAGCGGCCTTACAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113175 CACTTGACCAAGCACCAGCGCACACACACGGGCGAGCGGCCTTACAAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCTAGTCTGTGGGAAGGGCTTTAGCGACCGCTCCAACTTCAGCACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113225 CCTAGTCTGTGGGAAGGGCTTTAGCGACCGCTCCAACTTCAGCACGCACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AGAGGGTGCACACAGGCGAGAAGCCCTACCCGTGCCCCGAGTGTGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113275 AGAGGGTGCACACAGGCGAGAAGCCCTACCCGTGCCCCGAGTGTGGGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CGCTTCAGCCAGAGCTCCAGCCTGGTCATCCACCGCAGGACACACAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113325 CGCTTCAGCCAGAGCTCCAGCCTGGTCATCCACCGCAGGACACACAGCGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGAGCGGCCCTATGCCTGCACCCAGTGCGGGAAGCGCTTCAACAACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113375 GGAGCGGCCCTATGCCTGCACCCAGTGCGGGAAGCGCTTCAACAACAGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CGCACTTCAGCGCCCACCGCCGGACGCACACAGGTGAGAAGCCCTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113425 CGCACTTCAGCGCCCACCGCCGGACGCACACAGGTGAGAAGCCCTACACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TGCCCGGCCTGTGGCCGGGGCTTCCGCCGGGGCACCGACCTGCACAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113475 TGCCCGGCCTGTGGCCGGGGCTTCCGCCGGGGCACCGACCTGCACAAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CCAGCGGACCCACATGGGGGCAGGCTCCTTGCCGACGCTCCAGCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113525 CCAGCGGACCCACATGGGGGCAGGCTCCTTGCCGACGCTCCAGCCGGTGG

   1450     .    :    .    :    .
   1415 CTCCTGGAGGCCCCGGTGCAAAAGCC
        ||||||||||||||||||| ||||||
 113575 CTCCTGGAGGCCCCGGTGCCAAAGCC