seq1 = pF1KSDA0552.tfa, 2019 bp
seq2 = pF1KSDA0552/gi568815578r_3064457.tfa (gi568815578r:3064457_3267163), 202707 bp

>pF1KSDA0552 2019
>gi568815578r:3064457_3267163 (Chr20)

(complement)

1-459  (100001-100459)   99% ->
460-1323  (100804-101667)   100% ->
1324-2019  (102012-102707)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGCTGGAGACGCTGCCTGTGCGCGCTGACCCAGGGCGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100001 ATGGCGAAGCTGGAGACGCTGCCTGTGCGCGCTGACCCAGGGCGGGATCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCCTGGCCTTTGCCCCACGGCCCTCCGAGCTTGGACCCCCGGACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCCTGGCCTTTGCCCCACGGCCCTCCGAGCTTGGACCCCCGGACCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGGCCATGGGCAGCGTGGGCAGTGGGGTGGCCCATGCCCAGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGGCCATGGGCAGCGTGGGCAGTGGGGTGGCCCATGCCCAGGAGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCATGAAGAGCGTGGGTACCCGCACAGGGGGTGGGGGCAGCCAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCATGAAGAGCGTGGGTACCCGCACAGGGGGTGGGGGCAGCCAGGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCCCTGGCCCCCGAGGCAGTGGCAGTGGGGCCAGCAGGGAGAGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCCCTGGCCCCCGAGGCAGTGGCAGTGGGGCCAGCAGGGAGAGGCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCGCTACCCCTCAGAGGACAAGGGTCTCGCCAACTCCCTCTACCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCGCTACCCCTCAGAGGACAAGGGTCTCGCCAACTCCCTCTACCTCAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGAGCTGCGGGGCAGTGACCACACCGATGTCTGTGGCAACGTGGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGAGCTGCGGGGCAGTGACCACACCGATGTCTGTGGCAACGTGGTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCAGCGGAGGCAGCAGCAGCAGTGGTGGCAGTGACAAAGCCCCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCAGCGGAGGCAGCAGCAGCAGTGGTGGCAGTGACAAAGCCCCACCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTATCGTGAGCCCAGCCACCCACCCAAGCTCCTGGCCACCTCTGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTATCGTGAGCCCAGCCACCCACCCAAGCTCCTGGCCACCTCTGGCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTAGACCAG         TGCTCAGAACCACTAGTTCGGCCGTCGGCCTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTAGACCAGGTC...CAGTGCTCAGAACCACTAGTTCGGCCGTCGGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAAGCCTGTCGTACCCAAGAATTTCCACTCCATGCAGAATTTGTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100836 CAAGCCTGTCGTACCCAAGAATTTCCACTCCATGCAGAATTTGTGCCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGCAGACCAATGGGACTCCTGAGGGACGGCAGGGCCCTGGTGGCCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100886 CGCAGACCAATGGGACTCCTGAGGGACGGCAGGGCCCTGGTGGCCTCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGCGGACTGGACAAGTCTCGGACCATGACTCCAGCGGGTGGGAGTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100936 GGCGGACTGGACAAGTCTCGGACCATGACTCCAGCGGGTGGGAGTGGGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGGCCTCTCAGACTCAGGCCGGAACTCCCTCACAAGCCTGCCCACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100986 TGGCCTCTCAGACTCAGGCCGGAACTCCCTCACAAGCCTGCCCACCTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCTCCAGCTACAGCCAGCACCTGGCACCCCTCAGTGCCTCCACCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 GCTCCAGCTACAGCCAGCACCTGGCACCCCTCAGTGCCTCCACCAGCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATTAACCGCATTGGCACTGCCAGCTATGGTAGTGGTAGTGGCGGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101086 ATTAACCGCATTGGCACTGCCAGCTATGGTAGTGGTAGTGGCGGCAGCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGGTGGGGGGTCGGGCTACCAGGACCTGGGGACCTCCGATAGTGGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101136 CGGTGGGGGGTCGGGCTACCAGGACCTGGGGACCTCCGATAGTGGACGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CCTCCAGCAAGAGTGGGTCGTCGTCATCTATGGGGCGGCCAGGCCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 CCTCCAGCAAGAGTGGGTCGTCGTCATCTATGGGGCGGCCAGGCCACCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGCTCTGGGGAGGGCGGAGGTGGAGGCCTGCCTTTCGCGGCCTGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101236 GGCTCTGGGGAGGGCGGAGGTGGAGGCCTGCCTTTCGCGGCCTGCTCACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCCCTCCCCCAGTGCACTCATCCAGGAGCTGGAGGAGCGGCTGTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101286 GCCCTCCCCCAGTGCACTCATCCAGGAGCTGGAGGAGCGGCTGTGGGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGGAGCAGGAGGTGGCAGCTCTGCGGCGCAGCCTGGAGCAGAGCGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 AGGAGCAGGAGGTGGCAGCTCTGCGGCGCAGCCTGGAGCAGAGCGAGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GCTGTGGCCCAGGTACTGGAGGAGCGGCAGAAGGCGTGGGAGCGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 GCTGTGGCCCAGGTACTGGAGGAGCGGCAGAAGGCGTGGGAGCGGGAGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGCCGAGCTGCGGCAGGGCTGCAGCGGGAAGCTACAGCAGGTGGCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101436 GGCCGAGCTGCGGCAGGGCTGCAGCGGGAAGCTACAGCAGGTGGCCCGAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GTGCCCAGCGCGCCCAGCAGGGCCTACAGCTGCAGGTGTTGCGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101486 GTGCCCAGCGCGCCCAGCAGGGCCTACAGCTGCAGGTGTTGCGGCTGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CAGGACAAGAAGCAGCTGCAGGAGGAGGCGGCCCGGCTGATGCGGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101536 CAGGACAAGAAGCAGCTGCAGGAGGAGGCGGCCCGGCTGATGCGGCAGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GGAAGAGCTGGAGGACAAGGTGGCCGCCTGCCAGAAGGAGCAGGCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101586 GGAAGAGCTGGAGGACAAGGTGGCCGCCTGCCAGAAGGAGCAGGCCGACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TCCTGCCCCGGATAGAGGAAACTAAGTGGGAG         GTGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101636 TCCTGCCCCGGATAGAGGAAACTAAGTGGGAGGTG...CAGGTGTGCCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AAGGCTGGCGAGATCTCCCTCCTGAAGCAGCAGCTGAAGGACTCGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102021 AAGGCTGGCGAGATCTCCCTCCTGAAGCAGCAGCTGAAGGACTCGCAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GGATGTGTCGCAGAAGTTGAGTGAGATCGTGGGACTGCGCTCGCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102071 GGATGTGTCGCAGAAGTTGAGTGAGATCGTGGGACTGCGCTCGCAGCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GGGAGGGCCGGGCTTCGCTGCGGGAGAAGGAGGAGCAGCTGCTCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102121 GGGAGGGCCGGGCTTCGCTGCGGGAGAAGGAGGAGCAGCTGCTCAGCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CGGGACTCCTTCAGCAGCAAGCAGGCCAGCCTGGAGCTGGGCGAAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102171 CGGGACTCCTTCAGCAGCAAGCAGGCCAGCCTGGAGCTGGGCGAAGGCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GCTGCCTGCCGCCTGCCTCAAGCCGGCGCTGACCCCCGTGGACCCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102221 GCTGCCTGCCGCCTGCCTCAAGCCGGCGCTGACCCCCGTGGACCCGGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 AGCCACAGGATGCTCTGGCCACCTGCGAGAGCGACGAGGCTAAGATGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102271 AGCCACAGGATGCTCTGGCCACCTGCGAGAGCGACGAGGCTAAGATGCGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CGTCAGGCCGGGGTGGCCGCTGCCGCCTCCTTGGTTTCCGTGGACGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102321 CGTCAGGCCGGGGTGGCCGCTGCCGCCTCCTTGGTTTCCGTGGACGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GGCGGAGGCTGGCGGGGAGAGCGGGACGCGGGCCCTGCGGCGGGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102371 GGCGGAGGCTGGCGGGGAGAGCGGGACGCGGGCCCTGCGGCGGGAGGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 GGCGGCTGCAGGCCGAGCTGGCGGCTGAGCGGCGGGCCCGGGAGCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102421 GGCGGCTGCAGGCCGAGCTGGCGGCTGAGCGGCGGGCCCGGGAGCGCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 GGTGCCAGCTTCGCCGAGGAGCGCCGCGTGTGGCTGGAGGAGAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102471 GGTGCCAGCTTCGCCGAGGAGCGCCGCGTGTGGCTGGAGGAGAAGGAGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 GGTGATCGAGTACCAGAAGCAGCTGCAGCTGAGCTACGTGGAGATGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102521 GGTGATCGAGTACCAGAAGCAGCTGCAGCTGAGCTACGTGGAGATGTACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 AGCGCAACCAGCAGCTGGAGCGCAGGCTGCGGGAGCGCGGGGCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102571 AGCGCAACCAGCAGCTGGAGCGCAGGCTGCGGGAGCGCGGGGCCGCAGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 GGTGCAAGCACGCCCACTCCCCAGCATGGCGAGGAGAAGAAGGCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102621 GGTGCAAGCACGCCCACTCCCCAGCATGGCGAGGAGAAGAAGGCCTGGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .
   1983 CCCCTCCCGCCTCGAGCGCATTGAGTCCACAGAAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102671 CCCCTCCCGCCTCGAGCGCATTGAGTCCACAGAAATC