seq1 = pF1KSDA0547.tfa, 2058 bp
seq2 = pF1KSDA0547/gi568815583r_43228432.tfa (gi568815583r:43228432_43430489), 202058 bp

>pF1KSDA0547 2058
>gi568815583r:43228432_43430489 (Chr15)

(complement)

1-2058  (100001-102058)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCCCCGGAGCCGTGAGCGTCGGGCAGGCGCGGTACAGAACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCCCCGGAGCCGTGAGCGTCGGGCAGGCGCGGTACAGAACACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACAGCAGCGCCCTCAGCAAGCGTTCCCTGGCCGCGCGCGGGTACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACAGCAGCGCCCTCAGCAAGCGTTCCCTGGCCGCGCGCGGGTACGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACCCCTTTGCCGCGTTGCTGGTTCCGGGCGCGGCGCGCCGCGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGACCCCTTTGCCGCGTTGCTGGTTCCGGGCGCGGCGCGCCGCGCACCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCATTCACCGAGGCTACTACGTCCGCGCACGCGCCGTGAGGCACTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCATTCACCGAGGCTACTACGTCCGCGCACGCGCCGTGAGGCACTGCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCGCTTTTTTGGAGCAGATTGGCGCGCCCCAGGCCGCGCTTCGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCGCTTTTTTGGAGCAGATTGGCGCGCCCCAGGCCGCGCTTCGCGCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGATCTTGTCTCTCGGCGCTGGCTTCGACTCGCTCTATTTTCGCTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGATCTTGTCTCTCGGCGCTGGCTTCGACTCGCTCTATTTTCGCTTAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCGCGGGCCGCCTGGCCCGGGCTGCAGTCTGGGAGGTGGATTTTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCGCGGGCCGCCTGGCCCGGGCTGCAGTCTGGGAGGTGGATTTTCCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGGCGCGGCGCAAAGCAGAAAGGATTGGAGAGACGCCAGAGCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGGCGCGGCGCAAAGCAGAAAGGATTGGAGAGACGCCAGAGCTGTGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGTTAACCGGGCCTTTCGAGAGGGGGGAGCCCGCGTCCGCGCTGTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGTTAACCGGGCCTTTCGAGAGGGGGGAGCCCGCGTCCGCGCTGTGCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAGCGCAGACTACTGCATCCTGGGTCTGGACTTGCGGCAGCTCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAGCGCAGACTACTGCATCCTGGGTCTGGACTTGCGGCAGCTCCAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGGAGGAGGCCCTGGGCGCCGCGGGGCTCGACGCAGCCTCACCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGGAGGAGGCCCTGGGCGCCGCGGGGCTCGACGCAGCCTCACCCACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCCTGGCCGAGGCGGTGCTGACCTACCTCGAGCCGGAGAGTGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTCCTGGCCGAGGCGGTGCTGACCTACCTCGAGCCGGAGAGTGCCGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCCTCATCGCCTGGGCAGCCCAGCGTTTTCCTAATGCCCTTTTCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCCTCATCGCCTGGGCAGCCCAGCGTTTTCCTAATGCCCTTTTCGTGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGAGCAGATGAGGCCTCAAGACGCCTTTGGCCAGTTCATGCTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGAGCAGATGAGGCCTCAAGACGCCTTTGGCCAGTTCATGCTGCAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATTTTCGGCAGCTAAACTCCCCCCTGCATGGCCTGGAGCGTTTTCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATTTTCGGCAGCTAAACTCCCCCCTGCATGGCCTGGAGCGTTTTCCTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGAGGCGCAGCGGCGCCGCTTCCTTCAAGCTGGCTGGACCGCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGAGGCGCAGCGGCGCCGCTTCCTTCAAGCTGGCTGGACCGCCTGCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCCGTGGACATAAATGAATTCTATCACTGCTTTCTTCCCGCAGAAGAAC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCCGTGGACATGAATGAATTCTATCACTGCTTTCTTCCCGCAGAAGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCGGCGGGTGGAAAATATTGAACCCTTTGACGAATTTGAGGAGTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCGGCGGGTGGAAAATATTGAACCCTTTGACGAATTTGAGGAGTGGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGAAGTGCGCCCATTATTTCATTCTGGCAGCTTCTAGGGGAGACACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAAGTGCGCCCATTATTTCATTCTGGCAGCTTCTAGGGGAGACACCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTCCCACACCCTAGTGTTTCCATCCTCAGAGGCATTTCCTCGCGTAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTCCCACACCCTAGTGTTTCCATCCTCAGAGGCATTTCCTCGCGTAAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CTGCTTCGCCTTCAGGGGTATTCCCTGCCAGCGTAGTCAGTAGCGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CTGCTTCGCCTTCAGGGGTATTCCCTGCCAGCGTAGTCAGTAGCGAGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGGTCCCAAACCTGAAGAGATATGGCCACGCCTCTGTCTTCTTGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGGTCCCAAACCTGAAGAGATATGGCCACGCCTCTGTCTTCTTGAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGACGTTATTCTCAGTGCAGGAGGATTTGGAGAGCAGGAGGGGCGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AGACGTTATTCTCAGTGCAGGAGGATTTGGAGAGCAGGAGGGGCGGCACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCGAGTGAGCCAGTTTCACTTGCTCTCAAGAGATTGTGACTCTGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCCGAGTGAGCCAGTTTCACTTGCTCTCAAGAGATTGTGACTCTGAATGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAAGGCAGCCAAATAGGCAGTTGTGGGACTGGAGTTCAGTGGGATGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAAGGCAGCCAAATAGGCAGTTGTGGGACTGGAGTTCAGTGGGATGGACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCTTTATCACACCATGACAAGACTCTCAGAGAGTCGGGTTCTGGTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CCTTTATCACACCATGACAAGACTCTCAGAGAGTCGGGTTCTGGTTCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GAGGGAGACTGTCCCCAGTAAGTCCAGCCTTGGGGGTTCTCCAGCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GAGGGAGACTGTCCCCAGTAAGTCCAGCCTTGGGGGTTCTCCAGCTTCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TTTTTTAAGAGTGAGGATAATAACACTGAGGACCTGAAAGTGACAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TTTTTTAAGAGTGAGGATAATAACACTGAGGACCTGAAAGTGACAATAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 AAAGGCTGGCCGAAAGGATGATTCCACTTTGTGTTGTTGGCGGCATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 AAAGGCTGGCCGAAAGGATGATTCCACTTTGTGTTGTTGGCGGCATTCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CAACAGAAGTGTCCTGTCAGAATCAGGAATATTTGTTTGTGTATGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CAACAGAAGTGTCCTGTCAGAATCAGGAATATTTGTTTGTGTATGGGGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CGAAGCGTGGTGGAACCTGTACTAAGTGACTGGCATTTCCTCCATGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CGAAGCGTGGTGGAACCTGTACTAAGTGACTGGCATTTCCTCCATGTAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GACAATGGCTTGGGTCAGGATCCCAGTGGAGGGAGAAGTACCTGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GACAATGGCTTGGGTCAGGATCCCAGTGGAGGGAGAAGTACCTGAAGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GGCATTCTCACAGTGCCTGCACTTGGCAAGGGGGAGCCCTTATTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GGCATTCTCACAGTGCCTGCACTTGGCAAGGGGGAGCCCTTATTGCTGGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GGTCTCGGGGCTTCTGAGGAGCCATTGAACTCTGTGCTCTTTCTGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GGTCTCGGGGCTTCTGAGGAGCCATTGAACTCTGTGCTCTTTCTGAGACC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 AATCTCTTGTGGATTCCTCTGGGAGTCAGTAGACATCCAGCCTCCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 AATCTCTTGTGGATTCCTCTGGGAGTCAGTAGACATCCAGCCTCCCATTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CCCCAAGGTACTCCCACACAGCTCATGTGCTCAATGGAAAGCTGTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CCCCAAGGTACTCCCACACAGCTCATGTGCTCAATGGAAAGCTGTTACTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GTTGGAGGGATCTGGATTCATTCCTCCTCATTTCCTGGAGTGACTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GTTGGAGGGATCTGGATTCATTCCTCCTCATTTCCTGGAGTGACTGTGAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CAATTTGACTACAGGATTGAGCTCTGAGTATCAGATTGACACAACATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CAATTTGACTACAGGATTGAGCTCTGAGTATCAGATTGACACAACATATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TGCCATGGCCATTAATGTTACACAACCATACTAGTATCCTTCTTCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TGCCATGGCCATTAATGTTACACAACCATACTAGTATCCTTCTTCCTGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GAGCAACAGCTCCTGCTCCTTGGAGGTGGTGGGAACTGCTTTTCCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GAGCAACAGCTCCTGCTCCTTGGAGGTGGTGGGAACTGCTTTTCCTTTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TACCTACTTCAACCCCCATACAGTCACATTAGACCTTTCTTCCTTAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 TACCTACTTCAACCCCCATACAGTCACATTAGACCTTTCTTCCTTAAGTG

   2050     .
   2051 CTGGGCAG
        ||||||||
 102051 CTGGGCAG