seq1 = pF1KSDA0535.tfa, 3141 bp
seq2 = pF1KSDA0535/gi568815590r_52013201.tfa (gi568815590r:52013201_52314257), 301057 bp

>pF1KSDA0535 3141
>gi568815590r:52013201_52314257 (Chr8)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-86  (102149-102179)   100% ->
87-277  (133946-134136)   100% ->
278-1069  (141675-142466)   100% ->
1070-1204  (147272-147406)   100% ->
1205-1295  (149033-149123)   100% ->
1296-1400  (150168-150272)   100% ->
1401-1594  (152690-152883)   100% ->
1595-1806  (155149-155360)   100% ->
1807-2052  (164281-164526)   100% ->
2053-2168  (171213-171328)   100% ->
2169-2231  (176775-176837)   100% ->
2232-2300  (177600-177668)   100% ->
2301-2363  (180957-181019)   100% ->
2364-2444  (181121-181201)   100% ->
2445-2666  (182079-182300)   100% ->
2667-2755  (188118-188206)   100% ->
2756-2859  (195817-195920)   100% ->
2860-3003  (197840-197983)   100% ->
3004-3141  (200920-201057)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGCAGAGGCTGAAGATAAAACGCTGCGTACTCGCTCTAAAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGCAGAGGCTGAAGATAAAACGCTGCGTACTCGCTCTAAAGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGG         TGCCAATGGATTCACTAATCCAGGAGCTCAG     
        |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100051 CGAGGGTG...CAGTGCCAATGGATTCACTAATCCAGGAGCTCAGGTA..

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     87     TGTTGCCTATGATTGCTCCATGGCAAAGAAGAGAACAGCTGAAGAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102185 .CAGTGTTGCCTATGATTGCTCCATGGCAAAGAAGAGAACAGCTGAAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAGGCTTTGGGGGTTCCAGTCAACAAAAGGAAATCCCTGCTAATGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133992 CAGGCTTTGGGGGTTCCAGTCAACAAAAGGAAATCCCTGCTAATGAAGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCGACACTACAGCCCAAAAGCAGACTGCCAAGAAGACCGCAGTGACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134042 CCGACACTACAGCCCAAAAGCAGACTGCCAAGAAGACCGCAGTGACAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGAGGACGATGGCCCCTTGGAAACACATGGTCACTCTACCGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 134092 CAGAGGACGATGGCCCCTTGGAAACACATGGTCACTCTACCGCAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    278     AGGAAATCATGATAAAACCTATGGATGAAAGTCTTCTTTCAACTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134142 .TAGAGGAAATCATGATAAAACCTATGGATGAAAGTCTTCTTTCAACTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAAGAAAACTCCAGTAGGAAGGAAGACAGATACTCTTGTTATCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141721 ACAAGAAAACTCCAGTAGGAAGGAAGACAGATACTCTTGTTATCAAGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCATGGTCAAGTCTTTAATGCACTTGGGGAAATTTGAAAAAAATGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141771 TCATGGTCAAGTCTTTAATGCACTTGGGGAAATTTGAAAAAAATGTATCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTCAGACTGTAAGTGAAAATTTAAATGACAGTGGCATCCAGTCTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141821 GTTCAGACTGTAAGTGAAAATTTAAATGACAGTGGCATCCAGTCTTTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCAGAGAGCGATGAAGCAGACGAGTGCTTTCTGATTCATTCTGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141871 AGCAGAGAGCGATGAAGCAGACGAGTGCTTTCTGATTCATTCTGATGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAAGAGACAAGATTGATGATTCTCAGCCACCCTTCTGCTCCTCTGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141921 GAAGAGACAAGATTGATGATTCTCAGCCACCCTTCTGCTCCTCTGATGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATGAAAGTAACTCTGAAAGTGCAGAAAATGGCTGGGACAGTGGCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141971 AATGAAAGTAACTCTGAAAGTGCAGAAAATGGCTGGGACAGTGGCTCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTCTCAGAAGAAACCAAACCACCTAGAGTCCCAAAGTATGTTTTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142021 CTTCTCAGAAGAAACCAAACCACCTAGAGTCCCAAAGTATGTTTTAACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATCATAAAAAAGACCTATTGGAAGTTCCTGAAATAAAAACTGAAGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142071 ATCATAAAAAAGACCTATTGGAAGTTCCTGAAATAAAAACTGAAGGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAATTTATCCCTTGTGAGAACAGGTGTGATTCTGAAACAGAAAGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142121 AAATTTATCCCTTGTGAGAACAGGTGTGATTCTGAAACAGAAAGGAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCGCAGAATGCTCTCGCAGAACCCCTGGATGGCAATGCCCAGCCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142171 CCCGCAGAATGCTCTCGCAGAACCCCTGGATGGCAATGCCCAGCCCTCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCCCTGACGTTGAGGAGGAAGATAGCGAGAGCCTGGCAGTAATGACGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142221 TCCCTGACGTTGAGGAGGAAGATAGCGAGAGCCTGGCAGTAATGACGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAGGGTAGTGACCTGGAAAAGGCCAAGGGGAATTTAAGTTTGCTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142271 GAGGGTAGTGACCTGGAAAAGGCCAAGGGGAATTTAAGTTTGCTGGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGCAATTGCTCTGCAGGCTGAGCGAGGTTGTGTTTTCCATAACACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142321 GGCAATTGCTCTGCAGGCTGAGCGAGGTTGTGTTTTCCATAACACCTACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AAGAGCTGGATAGGTTCCTGCTGGAGCACCTAGCAGGGGAAAGGAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142371 AAGAGCTGGATAGGTTCCTGCTGGAGCACCTAGCAGGGGAAAGGAGGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ACCAAAGTTATCGACATGGGTGGAAGACAAATCTTTAACAATAAAC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 142421 ACCAAAGTTATCGACATGGGTGGAAGACAAATCTTTAACAATAAACGTA.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070      ATTCACCAAGGCCTGAAAAGAGGGAGACCAAGTGCCCGATCCCTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142471 ..TAGATTCACCAAGGCCTGAAAAGAGGGAGACCAAGTGCCCGATCCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GATGTGATGGCACGGGACACGTGACAGGGCTCTACCCGCACCACCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147317 GATGTGATGGCACGGGACACGTGACAGGGCTCTACCCGCACCACCGCAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTTTCGGGGTGCCCCCACAAAGTGCGGGTTCCCCTGGAAA         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 147367 CTTTCGGGGTGCCCCCACAAAGTGCGGGTTCCCCTGGAAAGTG...TAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCTTGCCATGCATGAAAATGTGCTCAAGTGTCCCACGCCGGGATGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149034 TCTTGCCATGCATGAAAATGTGCTCAAGTGTCCCACGCCGGGATGCACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GAAGGGGTCATGTGAACAGCAACCGCAACACCCACAGGAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 149084 GAAGGGGTCATGTGAACAGCAACCGCAACACCCACAGGAGGTA...CAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CTTTCTGGTTGTCCAATTGCTGCAGCTGAAAAATTGGCAATGTCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150169 CTTTCTGGTTGTCCAATTGCTGCAGCTGAAAAATTGGCAATGTCCCAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TAAAAATCAGCTTGATTCTCCCCAAACTGGGCAGTGTCCTGACCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150219 TAAAAATCAGCTTGATTCTCCCCAAACTGGGCAGTGTCCTGACCAGGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ACAG         GACAAGTTTGGTGAAGCAAATTGAATTCAATTTCCCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150269 ACAGGTA...CAGGACAAGTTTGGTGAAGCAAATTGAATTCAATTTCCCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TCACAAGCCATCACCTCTCCCAGAGCCACAGTGTCAAAAGAACAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152727 TCACAAGCCATCACCTCTCCCAGAGCCACAGTGTCAAAAGAACAAGAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GTTTGGAAAAGTACCATTTGATTATGCCAGTTTTGATGCCCAAGTTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152777 GTTTGGAAAAGTACCATTTGATTATGCCAGTTTTGATGCCCAAGTTTTCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GTAAACGCCCTCTCATACAAACAGTGCAAGGACGAAAAACACCACCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152827 GTAAACGCCCTCTCATACAAACAGTGCAAGGACGAAAAACACCACCATTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CCTGAAT         CAAAGCATTTTCCAAATCCAGTGAAATTTCCTAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152877 CCTGAATGTA...CAGCAAAGCATTTTCCAAATCCAGTGAAATTTCCTAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TCGACTGCCTAGTGCAGGCGCCCACACCCAGAGCCCTGGCCGTGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155183 TCGACTGCCTAGTGCAGGCGCCCACACCCAGAGCCCTGGCCGTGCCAGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 CTTATAGCTACGGTCAATGTAGTGAAGACACCCACATAGCAGCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155233 CTTATAGCTACGGTCAATGTAGTGAAGACACCCACATAGCAGCAGCTGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GCCATCCTGAACCTTTCCACCCGCTGCAGGGAAGCCACAGACATCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155283 GCCATCCTGAACCTTTCCACCCGCTGCAGGGAAGCCACAGACATCCTCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CAACAAGCCACAGAGTCTGCATGCCAAG         GGAGCCGAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 155333 CAACAAGCCACAGAGTCTGCATGCCAAGGTA...CAGGGAGCCGAAATAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AAGTGGATGAAAATGGCACATTGGACTTAAGCATGAAAAAAAATCGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164294 AAGTGGATGAAAATGGCACATTGGACTTAAGCATGAAAAAAAATCGAATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 CTGGACAAGTCTGCACCCCTAACTTCCTCTAACACTTCTATTCCAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164344 CTGGACAAGTCTGCACCCCTAACTTCCTCTAACACTTCTATTCCAACTCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 TTCCTCTTCCCCATTCAAAACAAGCAGCATTCTGGTCAATGCAGCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164394 TTCCTCTTCCCCATTCAAAACAAGCAGCATTCTGGTCAATGCAGCATTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 ATCAGGCTCTTTGTGACCAAGAGGGCTGGGACACTCCTATCAACTATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164444 ATCAGGCTCTTTGTGACCAAGAGGGCTGGGACACTCCTATCAACTATAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 AAAACTCACGGGAAGACAGAGGAGGAGAAAGAG         AAAGACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 164494 AAAACTCACGGGAAGACAGAGGAGGAGAAAGAGGTA...CAGAAAGACCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 AGTGAGCTCTCTAGAAAATTTAGAGGAAAAAAAGTTTCCTGGAGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171221 AGTGAGCTCTCTAGAAAATTTAGAGGAAAAAAAGTTTCCTGGAGAGGCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CTATACCAAGCCCTAAACCCAAGCTTCATGCAAGAGATCTCAAAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171271 CTATACCAAGCCCTAAACCCAAGCTTCATGCAAGAGATCTCAAAAAGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 CTAATCAC         CTGTCCAACACCAGGATGTGATGGAAGTGGCCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 171321 CTAATCACGTA...CAGCTGTCCAACACCAGGATGTGATGGAAGTGGCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 CGTGACAGGAAACTATGCATCTCATCGCAG         TGTTTCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 176808 CGTGACAGGAAACTATGCATCTCATCGCAGGTA...TAGTGTTTCTGGAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GTCCTTTAGCAGATAAGACTCTAAAATCCCTCATGGCTGCCAACTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177611 GTCCTTTAGCAGATAAGACTCTAAAATCCCTCATGGCTGCCAACTCTCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 GAGCTTAA         GTGTCCAACCCCAGGCTGCGATGGCTCGGGGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 177661 GAGCTTAAGTA...CAGGTGTCCAACCCCAGGCTGCGATGGCTCGGGGCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 CGTGACTGGAAACTATGCTTCCCACAGAAG         CTTGTCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 180990 CGTGACTGGAAACTATGCTTCCCACAGAAGGTA...CAGCTTGTCCGGAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 GCCCTCGTGCAAGGAAAGGTGGTGTCAAAATGACCCCTACCAAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181132 GCCCTCGTGCAAGGAAAGGTGGTGTCAAAATGACCCCTACCAAGGAAGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 AAAGAAGACCCTGAACTGAA         ATGTCCTGTGATAGGGTGTGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 181182 AAAGAAGACCCTGAACTGAAGTA...TAGATGTCCTGTGATAGGGTGTGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 TGGCCAAGGTCACATATCAGGTAAATACACATCACACCGCACAGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182100 TGGCCAAGGTCACATATCAGGTAAATACACATCACACCGCACAGCTTCTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 GCTGTCCTCTGGCTGCCAAGAGACAGAAGGAGAATCCTCTCAATGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182150 GCTGTCCTCTGGCTGCCAAGAGACAGAAGGAGAATCCTCTCAATGGAGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 TCCCTCTCCTGGAAACTGAACAAACAAGAGCTACCACATTGTCCCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182200 TCCCTCTCCTGGAAACTGAACAAACAAGAGCTACCACATTGTCCCTTGCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 AGGCTGCAATGGGCTGGGCCATGTAAATAATGTTTTTGTCACCCACCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182250 AGGCTGCAATGGGCTGGGCCATGTAAATAATGTTTTTGTCACCCACCGAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 G         CTTATCTGGATGTCCTCTCAATGCACAAGTTATCAAAAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182300 GGTA...CAGCTTATCTGGATGTCCTCTCAATGCACAAGTTATCAAAAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 GGCAAGGTTTCTGAAGAACTCATGACCATCAAGCTCAAAGCAACTGGGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 188158 GGCAAGGTTTCTGAAGAACTCATGACCATCAAGCTCAAAGCAACTGGGGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2756         GAATAGAGAGTGATGAAGAAATTAGGCATTTGGATGAAGAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188208 TA...CAGGAATAGAGAGTGATGAAGAAATTAGGCATTTGGATGAAGAAA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 TAAAGGAACTGAATGAATCCAACCTTAAAATTGAAGCAGATATGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195859 TAAAGGAACTGAATGAATCCAACCTTAAAATTGAAGCAGATATGATGAAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 CTTCAGACCCAG         ATCACATCTATGGAGAGCAACTTAAAGAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 195909 CTTCAGACCCAGGTA...TAGATCACATCTATGGAGAGCAACTTAAAGAC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 GATAGAGGAGGAGAACAAACTCATAGAACAGAACAATGAAAGTCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197869 GATAGAGGAGGAGAACAAACTCATAGAACAGAACAATGAAAGTCTGCTGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 AAGAGCTGGCAGGTCTAAGCCAAGCTCTCATTTCAAGCCTTGCTGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197919 AAGAGCTGGCAGGTCTAAGCCAAGCTCTCATTTCAAGCCTTGCTGACATC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2989 CAGCTTCCACAGATG         GGACCTATCAGTGAGCAGAATTTTGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 197969 CAGCTTCCACAGATGGTA...TAGGGACCTATCAGTGAGCAGAATTTTGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 AGCATATGTAAATACACTCACAGATATGTACAGCAATCTGGAACGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200946 AGCATATGTAAATACACTCACAGATATGTACAGCAATCTGGAACGGGACT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 ATTCCCCGGAATGCAAAGCTCTACTGGAAAGTATCAAACAGGCAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200996 ATTCCCCGGAATGCAAAGCTCTACTGGAAAGTATCAAACAGGCAGTGAAG

   3300     .    :
   3130 GGTATCCATGTG
        ||||||||||||
 201046 GGTATCCATGTG