seq1 = pF1KSDA0526.tfa, 1686 bp
seq2 = pF1KSDA0526/gi568815584r_77412287.tfa (gi568815584r:77412287_77716579), 304293 bp

>pF1KSDA0526 1686
>gi568815584r:77412287_77716579 (Chr14)

(complement)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-327  (119200-119394)   100% ->
328-482  (137471-137625)   100% ->
483-631  (139665-139813)   100% ->
632-756  (146072-146196)   100% ->
757-850  (154091-154184)   98% ->
851-956  (159434-159539)   100% ->
957-1176  (161061-161280)   100% ->
1177-1303  (164358-164484)   100% ->
1304-1439  (194999-195134)   100% ->
1440-1569  (198413-198542)   100% ->
1570-1686  (204177-204293)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGCCGGAGCCCGGAGGCTGCTGCTGCCGCCGCACGGTGCGGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGCCGGAGCCCGGAGGCTGCTGCTGCCGCCGCACGGTGCGGGCGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCTGCGTGGCGAACGGGGAAGTACGGAACGGGTACGTGAGGAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCTGCGTGGCGAACGGGGAAGTACGGAACGGGTACGTGAGGAGCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCAGCCGCAGCCGCAGCCGCCGCCGGCCAG         ATCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 CTGCAGCCGCAGCCGCAGCCGCCGCCGGCCAGGTA...TAGATCCATCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTACACAAAATGGAGGACTATATAAAAGACCGTTTAATGAAGCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119209 GTTACACAAAATGGAGGACTATATAAAAGACCGTTTAATGAAGCTTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAACACCAATGCTGGTTGCTGTGCTCACGTATGTGGGGTATGGCGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119259 AGAAACACCAATGCTGGTTGCTGTGCTCACGTATGTGGGGTATGGCGTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACCCTCTTTGGATATCTTCGAGATTTCTTGAGGTATTGGAGAATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119309 TCACCCTCTTTGGATATCTTCGAGATTTCTTGAGGTATTGGAGAATTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGTGTCACCATGCAACAGAAAGAGAAGAACAAAAG         GACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 119359 AAGTGTCACCATGCAACAGAAAGAGAAGAACAAAAGGTA...CAGGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGTCATTGTATCAAGATTTTGAAAACTTTTATACAAGGAATCTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137476 TGTGTCATTGTATCAAGATTTTGAAAACTTTTATACAAGGAATCTGTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAGGATAAGAGACAACTGGAATCGGCCAATCTGTAGTGTGCCTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137526 TGAGGATAAGAGACAACTGGAATCGGCCAATCTGTAGTGTGCCTGGAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGGGTGGACATCATGGAGAGACAGTCTCATGATTATAACTGGTCCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137576 AGGGTGGACATCATGGAGAGACAGTCTCATGATTATAACTGGTCCTTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483          GTATACAGGGAATATAATAAAGGGTGTTATAAACATGGGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137626 GTG...CAGGTATACAGGGAATATAATAAAGGGTGTTATAAACATGGGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCTACAACTATCTTGGATTTGCACGGAATACTGGATCATGTCAAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139706 CCTACAACTATCTTGGATTTGCACGGAATACTGGATCATGTCAAGAAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCGCCAAAGTCCTTGAGGAGTATGGAGCTGGAGTGTGCAGTACTCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139756 GCCGCCAAAGTCCTTGAGGAGTATGGAGCTGGAGTGTGCAGTACTCGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAAATTG         GAAACCTGGACAAGCATGAAGAACTAGAGGAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 139806 GGAAATTGGTA...CAGGAAACCTGGACAAGCATGAAGAACTAGAGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTGTAGCAAGGTTCTTAGGAGTAGAAGCTGCTATGGCGTATGGCATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146105 TTGTAGCAAGGTTCTTAGGAGTAGAAGCTGCTATGGCGTATGGCATGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTGCAACGAATTCAATGAACATTCCTGCTCTTGTTGGCAAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 146155 TTTGCAACGAATTCAATGAACATTCCTGCTCTTGTTGGCAAAGTA...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    757  GGTTGCCTGATTCTGAGTGATGAACTGAACCATGCATCACTGGTTCTGG
        >||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 154090 GGGTTGCCTGATTCTGAGTGATGAACTGAATCATGCATCACTGGTTCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAGCCAGACTGTCAGGAGCAACCATTAGAATCTTCAAACACAACA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 154140 GAGCCAGACTGTCAGGAGCAACCATTAGAATCTTCAAACACAACAGTG..

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851     ATATGCAAAGCCTAGAGAAGCTATTGAAAGATGCCATTGTTTATGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154190 .TAGATATGCAAAGCCTAGAGAAGCTATTGAAAGATGCCATTGTTTATGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCAGCCTCGGACACGAAGGCCCTGGAAGAAAATTCTCATCCTTGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159480 TCAGCCTCGGACACGAAGGCCCTGGAAGAAAATTCTCATCCTTGTGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAATATATAG         CATGGAGGGATCTATTGTTCGTCTTCCTGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 159530 GAATATATAGGTA...CAGCATGGAGGGATCTATTGTTCGTCTTCCTGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTGATTGCCCTCAAGAAGAAATACAAGGCATACTTGTATCTGGATGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161092 GTGATTGCCCTCAAGAAGAAATACAAGGCATACTTGTATCTGGATGAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCACAGCATTGGCGCCCTGGGCCCCACAGGCCGGGGTGTGGTGGAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161142 TCACAGCATTGGCGCCCTGGGCCCCACAGGCCGGGGTGTGGTGGAGTACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTGGCCTGGATCCCGAGGATGTGGATGTTATGATGGGAACGTTCACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161192 TTGGCCTGGATCCCGAGGATGTGGATGTTATGATGGGAACGTTCACAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGTTTTGGTGCTTCTGGAGGATATATTGGAGGCAAGAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 161242 AGTTTTGGTGCTTCTGGAGGATATATTGGAGGCAAGAAGGTA...CAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCTGATAGACTACCTGCGAACACATTCTCATAGTGCAGTGTATGCCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164360 GCTGATAGACTACCTGCGAACACATTCTCATAGTGCAGTGTATGCCACGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CATTGTCACCTCCTGTAGTGGAGCAGATCATCACCTCCATGAAGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164410 CATTGTCACCTCCTGTAGTGGAGCAGATCATCACCTCCATGAAGTGCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATGGGGCAGGATGGCACCAGCCTTG         GTAAAGAGTGTGTACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 164460 ATGGGGCAGGATGGCACCAGCCTTGGTA...CAGGTAAAGAGTGTGTACA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACAGTTAGCTGAAAACACCAGGTATTTCAGGAGACGCCTGAAAGAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195015 ACAGTTAGCTGAAAACACCAGGTATTTCAGGAGACGCCTGAAAGAGATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GCTTCATCATCTATGGAAATGAAGACTCTCCAGTAGTGCCTTTGATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195065 GCTTCATCATCTATGGAAATGAAGACTCTCCAGTAGTGCCTTTGATGCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TACATGCCTGCCAAAATTGG         CGCCTTTGGACGGGAGATGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 195115 TACATGCCTGCCAAAATTGGGTA...CAGCGCCTTTGGACGGGAGATGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GAAGCGGAACATCGGTGTCGTTGTGGTTGGATTTCCTGCCACCCCAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198434 GAAGCGGAACATCGGTGTCGTTGTGGTTGGATTTCCTGCCACCCCAATTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTGAGTCCAGAGCCAGGTTTTGCCTGTCAGCAGCTCATACCAAAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198484 TTGAGTCCAGAGCCAGGTTTTGCCTGTCAGCAGCTCATACCAAAGAAATA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CTTGATACT         GCTTTAAAGGAGATAGATGAAGTTGGGGACCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 198534 CTTGATACTGTA...TAGGCTTTAAAGGAGATAGATGAAGTTGGGGACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ATTGCAGCTGAAGTATTCCCGTCATCGGTTGGTACCTCTACTGGACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204209 ATTGCAGCTGAAGTATTCCCGTCATCGGTTGGTACCTCTACTGGACAGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .
   1652 CCTTTGACGAGACGACGTATGAAGAAACAGAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204259 CCTTTGACGAGACGACGTATGAAGAAACAGAAGAC