seq1 = pF1KSDA0422.tfa, 3345 bp
seq2 = pF1KSDA0422/gi568815586r_48668594.tfa (gi568815586r:48668594_48883434), 214841 bp
>pF1KSDA0422 3345
>gi568815586r:48668594_48883434 (Chr12)
(complement)
1-864 (100001-100864) 100% ->
865-1014 (105178-105327) 100% ->
1015-1136 (105699-105820) 100% ->
1137-1248 (105914-106025) 100% ->
1249-1376 (106204-106331) 100% ->
1377-1535 (106849-107007) 100% ->
1536-1677 (107085-107226) 100% ->
1678-1806 (107344-107472) 100% ->
1807-1832 (107737-107762) 100% ->
1833-1980 (107985-108132) 100% ->
1981-2078 (108381-108478) 100% ->
2079-2166 (108657-108744) 100% ->
2167-2283 (108917-109033) 100% ->
2284-2462 (109788-109966) 100% ->
2463-2498 (110892-110927) 100% ->
2499-2628 (111011-111140) 100% ->
2629-2892 (111462-111725) 100% ->
2893-3097 (112465-112669) 100% ->
3098-3222 (114374-114498) 100% ->
3223-3345 (114719-114841) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCATGGTTTAGTGGCCTCCTGGTCCCTAAAGTGGATGAACGGAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCATGGTTTAGTGGCCTCCTGGTCCCTAAAGTGGATGAACGGAAAAC
50 . : . : . : . : . :
51 AGCCTGGGGTGAACGCAATGGGCAGAAGCGTTCGCGGCGCCGTGGCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 AGCCTGGGGTGAACGCAATGGGCAGAAGCGTTCGCGGCGCCGTGGCACTC
100 . : . : . : . : . :
101 GGGCAGGTGGCTTCTGCACGCCCCGCTATATGAGCTGCCTCCGGGATGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 GGGCAGGTGGCTTCTGCACGCCCCGCTATATGAGCTGCCTCCGGGATGCA
150 . : . : . : . : . :
151 GAGCCACCCAGCCCCACCCCTGCGGGCCCCCCTCGGTGCCCCTGGCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GAGCCACCCAGCCCCACCCCTGCGGGCCCCCCTCGGTGCCCCTGGCAGGA
200 . : . : . : . : . :
201 TGACGCCTTCATCCGGAGGGGCGGCCCAGGCAAGGGCAAGGAGCTGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TGACGCCTTCATCCGGAGGGGCGGCCCAGGCAAGGGCAAGGAGCTGGGGC
250 . : . : . : . : . :
251 TGCGGGCAGTGGCCCTGGGCTTCGAGGATACCGAGGTGACAACGACAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 TGCGGGCAGTGGCCCTGGGCTTCGAGGATACCGAGGTGACAACGACAGCG
300 . : . : . : . : . :
301 GGCGGGACGGCTGAGGTGGCGCCCGACGCGGTGCCCAGGAGTGGGCGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GGCGGGACGGCTGAGGTGGCGCCCGACGCGGTGCCCAGGAGTGGGCGATC
350 . : . : . : . : . :
351 CTGCTGGCGCCGTCTGGTGCAGGTGTTCCAGTCGAAGCAGTTCCGTTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 CTGCTGGCGCCGTCTGGTGCAGGTGTTCCAGTCGAAGCAGTTCCGTTCGG
400 . : . : . : . : . :
401 CCAAGCTGGAGCGCCTGTACCAGCGGTACTTCTTCCAGATGAACCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CCAAGCTGGAGCGCCTGTACCAGCGGTACTTCTTCCAGATGAACCAGAGC
450 . : . : . : . : . :
451 AGCCTGACGCTGCTGATGGCGGTGCTGGTGCTGCTCACAGCGGTGCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 AGCCTGACGCTGCTGATGGCGGTGCTGGTGCTGCTCACAGCGGTGCTGCT
500 . : . : . : . : . :
501 GGCTTTCCACGCCGCACCCGCCCGCCCTCAGCCTGCCTATGTGGCACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 GGCTTTCCACGCCGCACCCGCCCGCCCTCAGCCTGCCTATGTGGCACTGT
550 . : . : . : . : . :
551 TGGCCTGTGCCGCCGCCCTGTTCGTGGGGCTCATGGTGGTGTGTAACCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TGGCCTGTGCCGCCGCCCTGTTCGTGGGGCTCATGGTGGTGTGTAACCGG
600 . : . : . : . : . :
601 CATAGCTTCCGCCAGGACTCCATGTGGGTGGTGAGCTACGTGGTGCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CATAGCTTCCGCCAGGACTCCATGTGGGTGGTGAGCTACGTGGTGCTGGG
650 . : . : . : . : . :
651 CATCCTGGCGGCAGTGCAGGTCGGGGGCGCTCTCGCAGCAGACCCGCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 CATCCTGGCGGCAGTGCAGGTCGGGGGCGCTCTCGCAGCAGACCCGCGCA
700 . : . : . : . : . :
701 GCCCCTCTGCGGGCCTCTGGTGCCCTGTGTTCTTTGTCTACATCGCCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 GCCCCTCTGCGGGCCTCTGGTGCCCTGTGTTCTTTGTCTACATCGCCTAC
750 . : . : . : . : . :
751 ACGCTCCTCCCCATCCGCATGCGGGCTGCCGTCCTCAGCGGCCTGGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 ACGCTCCTCCCCATCCGCATGCGGGCTGCCGTCCTCAGCGGCCTGGGCCT
800 . : . : . : . : . :
801 CTCCACCTTGCATTTGATCTTGGCCTGGCAACTTAACCGTGGTGATGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CTCCACCTTGCATTTGATCTTGGCCTGGCAACTTAACCGTGGTGATGCCT
850 . : . : . : . : . :
851 TCCTCTGGAAGCAG CTCGGTGCCAATGTGCTGCTGTTCCTC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
100851 TCCTCTGGAAGCAGGTA...CAGCTCGGTGCCAATGTGCTGCTGTTCCTC
900 . : . : . : . : . :
892 TGCACCAACGTCATTGGCATCTGCACACACTATCCAGCAGAGGTGTCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105205 TGCACCAACGTCATTGGCATCTGCACACACTATCCAGCAGAGGTGTCTCA
950 . : . : . : . : . :
942 GCGCCAGGCCTTTCAGGAGACCCGCGGTTACATCCAGGCCCGGCTCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105255 GCGCCAGGCCTTTCAGGAGACCCGCGGTTACATCCAGGCCCGGCTCCACC
1000 . : . : . : . : . :
992 TGCAGCATGAGAATCGGCAGCAG GAGCGGCTGCTGCTGTCG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
105305 TGCAGCATGAGAATCGGCAGCAGGTG...TAGGAGCGGCTGCTGCTGTCG
1050 . : . : . : . : . :
1033 GTATTGCCCCAGCACGTTGCCATGGAGATGAAAGAAGACATCAACACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105717 GTATTGCCCCAGCACGTTGCCATGGAGATGAAAGAAGACATCAACACAAA
1100 . : . : . : . : . :
1083 AAAAGAAGACATGATGTTCCACAAGATCTACATACAGAAGCATGACAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105767 AAAAGAAGACATGATGTTCCACAAGATCTACATACAGAAGCATGACAATG
1150 . : . : . : . : . :
1133 TCAG CATCCTGTTTGCAGACATTGAGGGCTTCACCAGCCTG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105817 TCAGGTA...CAGCATCCTGTTTGCAGACATTGAGGGCTTCACCAGCCTG
1200 . : . : . : . : . :
1174 GCATCCCAGTGCACTGCGCAGGAGCTGGTCATGACCCTGAATGAGCTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105951 GCATCCCAGTGCACTGCGCAGGAGCTGGTCATGACCCTGAATGAGCTCTT
1250 . : . : . : . : . :
1224 TGCCCGGTTTGACAAGCTGGCTGCG GAGAATCACTGCCTGA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
106001 TGCCCGGTTTGACAAGCTGGCTGCGGTG...CAGGAGAATCACTGCCTGA
1300 . : . : . : . : . :
1265 GGATCAAGATCTTGGGGGACTGTTACTACTGTGTGTCAGGGCTGCCGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106220 GGATCAAGATCTTGGGGGACTGTTACTACTGTGTGTCAGGGCTGCCGGAG
1350 . : . : . : . : . :
1315 GCCCGGGCCGACCATGCCCACTGCTGTGTGGAGATGGGGGTAGACATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106270 GCCCGGGCCGACCATGCCCACTGCTGTGTGGAGATGGGGGTAGACATGAT
1400 . : . : . : . : . :
1365 TGAGGCCATCTC GCTGGTACGTGAGGTGACAGGTGTGAATG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
106320 TGAGGCCATCTCGTA...CAGGCTGGTACGTGAGGTGACAGGTGTGAATG
1450 . : . : . : . : . :
1406 TGAACATGCGCGTGGGCATCCACAGCGGGCGCGTGCACTGCGGCGTCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106878 TGAACATGCGCGTGGGCATCCACAGCGGGCGCGTGCACTGCGGCGTCCTT
1500 . : . : . : . : . :
1456 GGCTTGCGGAAATGGCAGTTCGATGTGTGGTCCAATGATGTGACCCTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106928 GGCTTGCGGAAATGGCAGTTCGATGTGTGGTCCAATGATGTGACCCTGGC
1550 . : . : . : . : . :
1506 CAACCACATGGAGGCAGGAGGCCGGGCTGG CCGCATCCACA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
106978 CAACCACATGGAGGCAGGAGGCCGGGCTGGGTG...CAGCCGCATCCACA
1600 . : . : . : . : . :
1547 TCACTCGGGCAACACTGCAGTACCTGAACGGGGACTACGAGGTGGAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107096 TCACTCGGGCAACACTGCAGTACCTGAACGGGGACTACGAGGTGGAGCCA
1650 . : . : . : . : . :
1597 GGCCGTGGTGGCGAGCGCAACGCGTACCTCAAGGAGCAGCACATTGAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107146 GGCCGTGGTGGCGAGCGCAACGCGTACCTCAAGGAGCAGCACATTGAGAC
1700 . : . : . : . : . :
1647 TTTCCTCATCCTGGGCGCCAGCCAGAAACGG AAAGAGGAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
107196 TTTCCTCATCCTGGGCGCCAGCCAGAAACGGGTC...CAGAAAGAGGAGA
1750 . : . : . : . : . :
1688 AGGCCATGCTGGCCAAGCTGCAGCGGACTCGGGCCAACTCCATGGAAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107354 AGGCCATGCTGGCCAAGCTGCAGCGGACTCGGGCCAACTCCATGGAAGGG
1800 . : . : . : . : . :
1738 CTGATGCCGCGCTGGGTTCCTGATCGTGCCTTCTCCCGGACCAAGGACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107404 CTGATGCCGCGCTGGGTTCCTGATCGTGCCTTCTCCCGGACCAAGGACTC
1850 . : . : . : . : . :
1788 CAAGGCCTTCCGCCAGATG GGCATTGATGATTCCAGCAAAG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
107454 CAAGGCCTTCCGCCAGATGGTG...CAGGGCATTGATGATTCCAGCAAAG
1900 . : . : . : . : . :
1829 ACAA CCGGGGCACCCAAGATGCCCTGAACCCTGAGGATGAG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107759 ACAAGTA...CAGCCGGGGCACCCAAGATGCCCTGAACCCTGAGGATGAG
1950 . : . : . : . : . :
1870 GTGGATGAGTTCCTGAGCCGTGCCATCGATGCCCGCAGCATTGATCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108022 GTGGATGAGTTCCTGAGCCGTGCCATCGATGCCCGCAGCATTGATCAGCT
2000 . : . : . : . : . :
1920 GCGGAAGGACCATGTGCGCCGGTTTCTGCTCACCTTCCAGAGAGAGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108072 GCGGAAGGACCATGTGCGCCGGTTTCTGCTCACCTTCCAGAGAGAGGATC
2050 . : . : . : . : . :
1970 TTGAGAAGAAG TACTCCCGGAAGGTGGATCCCCGCTTCGGA
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
108122 TTGAGAAGAAGGTT...CAGTACTCCCGGAAGGTGGATCCCCGCTTCGGA
2100 . : . : . : . : . :
2011 GCCTACGTTGCCTGTGCCCTGTTGGTCTTCTGCTTCATCTGCTTCATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108411 GCCTACGTTGCCTGTGCCCTGTTGGTCTTCTGCTTCATCTGCTTCATCCA
2150 . : . : . : . : . :
2061 GCTTCTCATCTTCCCACA CTCCACCCTGATGCTTGGGATCT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
108461 GCTTCTCATCTTCCCACAGTG...CAGCTCCACCCTGATGCTTGGGATCT
2200 . : . : . : . : . :
2102 ATGCCAGCATCTTCCTGCTGCTGCTAATCACCGTGCTGATCTGTGCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108680 ATGCCAGCATCTTCCTGCTGCTGCTAATCACCGTGCTGATCTGTGCTGTG
2250 . : . : . : . : . :
2152 TACTCCTGTGGTTCT CTGTTCCCTAAGGCCCTGCAACGTCT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
108730 TACTCCTGTGGTTCTGTA...TAGCTGTTCCCTAAGGCCCTGCAACGTCT
2300 . : . : . : . : . :
2193 GTCCCGCAGCATTGTCCGCTCACGGGCACATAGCACCGCAGTTGGCATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108943 GTCCCGCAGCATTGTCCGCTCACGGGCACATAGCACCGCAGTTGGCATCT
2350 . : . : . : . : . :
2243 TTTCCGTCCTGCTTGTGTTTACTTCTGCCATTGCCAACATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
108993 TTTCCGTCCTGCTTGTGTTTACTTCTGCCATTGCCAACATGGTA...CAG
2400 . : . : . : . : . :
2284 TACTTCATCGGGAACATGCTGCTGAGTCTCTTGGCCAGCTCTGTCTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109788 TACTTCATCGGGAACATGCTGCTGAGTCTCTTGGCCAGCTCTGTCTTCCT
2450 . : . : . : . : . :
2334 GCACATCAGCAGCATCGGGAAGTTGGCCATGATCTTTGTCTTGGGGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109838 GCACATCAGCAGCATCGGGAAGTTGGCCATGATCTTTGTCTTGGGGCTCA
2500 . : . : . : . : . :
2384 TCTATTTGGTGCTGCTTCTGCTGGGTCCCCCAGCCACCATCTTTGACAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109888 TCTATTTGGTGCTGCTTCTGCTGGGTCCCCCAGCCACCATCTTTGACAAC
2550 . : . : . : . : . :
2434 TATGACCTACTGCTTGGCGTCCATGGCTT GGCTTCTTCCAA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
109938 TATGACCTACTGCTTGGCGTCCATGGCTTGTG...CAGGGCTTCTTCCAA
2600 . : . : . : . : . :
2475 TGAGACCTTTGATGGGCTGGACTG TCCAGCTGCAGGGAGGG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
110904 TGAGACCTTTGATGGGCTGGACTGGTA...TAGTCCAGCTGCAGGGAGGG
2650 . : . : . : . : . :
2516 TGGCCCTCAAATATATGACCCCTGTGATTCTGCTGGTGTTTGCGCTGGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111028 TGGCCCTCAAATATATGACCCCTGTGATTCTGCTGGTGTTTGCGCTGGCG
2700 . : . : . : . : . :
2566 CTGTATCTGCATGCTCAGCAGGTGGAGTCGACTGCCCGCCTAGACTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111078 CTGTATCTGCATGCTCAGCAGGTGGAGTCGACTGCCCGCCTAGACTTCCT
2750 . : . : . : . : . :
2616 CTGGAAACTACAG GCAACAGGGGAGAAGGAGGAGATGGAGG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
111128 CTGGAAACTACAGGTG...CAGGCAACAGGGGAGAAGGAGGAGATGGAGG
2800 . : . : . : . : . :
2657 AGCTACAGGCATACAACCGGAGGCTGCTGCATAACATTCTGCCCAAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111490 AGCTACAGGCATACAACCGGAGGCTGCTGCATAACATTCTGCCCAAGGAC
2850 . : . : . : . : . :
2707 GTGGCGGCCCACTTCCTGGCCCGGGAGCGCCGCAATGATGAACTCTACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111540 GTGGCGGCCCACTTCCTGGCCCGGGAGCGCCGCAATGATGAACTCTACTA
2900 . : . : . : . : . :
2757 TCAGTCGTGTGAGTGTGTGGCTGTTATGTTTGCCTCCATTGCCAACTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111590 TCAGTCGTGTGAGTGTGTGGCTGTTATGTTTGCCTCCATTGCCAACTTCT
2950 . : . : . : . : . :
2807 CTGAGTTCTATGTGGAGCTGGAGGCAAACAATGAGGGTGTCGAGTGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111640 CTGAGTTCTATGTGGAGCTGGAGGCAAACAATGAGGGTGTCGAGTGCCTG
3000 . : . : . : . : . :
2857 CGGCTGCTCAACGAGATCATCGCTGACTTTGATGAG ATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
111690 CGGCTGCTCAACGAGATCATCGCTGACTTTGATGAGGTA...CAGATTAT
3050 . : . : . : . : . :
2898 CAGCGAGGAGCGGTTCCGGCAGCTGGAAAAGATCAAGACGATTGGTAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112470 CAGCGAGGAGCGGTTCCGGCAGCTGGAAAAGATCAAGACGATTGGTAGCA
3100 . : . : . : . : . :
2948 CCTACATGGCTGCCTCAGGGCTGAACGCCAGCACCTACGATCAGGTGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112520 CCTACATGGCTGCCTCAGGGCTGAACGCCAGCACCTACGATCAGGTGGGC
3150 . : . : . : . : . :
2998 CGCTCCCACATCACTGCCCTGGCTGACTACGCCATGCGGCTCATGGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112570 CGCTCCCACATCACTGCCCTGGCTGACTACGCCATGCGGCTCATGGAGCA
3200 . : . : . : . : . :
3048 GATGAAGCACATCAATGAGCACTCCTTCAACAATTTCCAGATGAAGATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112620 GATGAAGCACATCAATGAGCACTCCTTCAACAATTTCCAGATGAAGATTG
3250 . : . : . : . : . :
3098 GGCTGAACATGGGCCCAGTCGTGGCAGGTGTCATCGGGGCT
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112670 GTA...CAGGGCTGAACATGGGCCCAGTCGTGGCAGGTGTCATCGGGGCT
3300 . : . : . : . : . :
3139 CGGAAGCCACAGTATGACATCTGGGGGAACACAGTGAATGTCTCTAGTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114415 CGGAAGCCACAGTATGACATCTGGGGGAACACAGTGAATGTCTCTAGTCG
3350 . : . : . : . : . :
3189 TATGGACAGCACGGGGGTCCCCGACCGAATCCAG GTGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
114465 TATGGACAGCACGGGGGTCCCCGACCGAATCCAGGTG...CAGGTGACCA
3400 . : . : . : . : . :
3230 CGGACCTGTACCAGGTTCTAGCTGCCAAGGGCTACCAGCTGGAGTGTCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114726 CGGACCTGTACCAGGTTCTAGCTGCCAAGGGCTACCAGCTGGAGTGTCGA
3450 . : . : . : . : . :
3280 GGGGTGGTCAAGGTGAAGGGCAAGGGGGAGATGACCACCTACTTCCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114776 GGGGTGGTCAAGGTGAAGGGCAAGGGGGAGATGACCACCTACTTCCTCAA
3500 . : .
3330 TGGGGGCCCCAGCAGT
||||||||||||||||
114826 TGGGGGCCCCAGCAGT