seq1 = pF1KSDA0352.tfa, 2136 bp
seq2 = pF1KSDA0352/gi568815586r_56902782.tfa (gi568815586r:56902782_57104917), 202136 bp

>pF1KSDA0352 2136
>gi568815586r:56902782_57104917 (Chr12)

(complement)

1-2136  (100001-102136)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCATGAGGATCAAACTGCAAAGCACCAACCACCCCAACAACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCATGAGGATCAAACTGCAAAGCACCAACCACCCCAACAACCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGGAACTCAACAAGTGCCGGCTCTCAGAGACCATGTGCGACGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGGAACTCAACAAGTGCCGGCTCTCAGAGACCATGTGCGACGTCACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGTGGTGGGGAGCCGCTCCTTCCCGGCCCACAAGGCTGTGCTGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGTGGTGGGGAGCCGCTCCTTCCCGGCCCACAAGGCTGTGCTGGCCTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGCTGGCTACTTCCAGAACCTCTTCCTGAATACTGGGCTTGATGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGCTGGCTACTTCCAGAACCTCTTCCTGAATACTGGGCTTGATGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGGACCTATGTGGTGGACTTCATCACCCCTGCCAACTTTGAGAAGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGACCTATGTGGTGGACTTCATCACCCCTGCCAACTTTGAGAAGGTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAGCTTTGTCTACACTTCAGAACTCTTCACAGACCTGATCAATGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAGCTTTGTCTACACTTCAGAACTCTTCACAGACCTGATCAATGTTGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCATCTACGAGGTAGCTGAGCGTTTGGGTATGGAGGACCTCCTCCAGGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCATCTACGAGGTAGCTGAGCGTCTGGGTATGGAGGACCTCCTCCAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGTCACTCTACCTTTCCTGATCTGGAGAGCACTGCCAGGGCCAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGTCACTCTACCTTTCCTGATCTGGAGAGCACTGCCAGGGCCAAGCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGACCAGCACCAGTGAGAGCCACTCTGGTACCCTGAGTTGTCCTTCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGACCAGCACCAGTGAGAGCCACTCTGGTACCCTGAGTTGTCCTTCGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAACCTGCCCATCCCCTTGGAGAACTCCGAGGTGGTGGGGACTACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAACCTGCCCATCCCCTTGGAGAACTCCGAGGTGGTGGGGACTACCTTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCTGATAGAAACTATGTGTTGCCCAGTGATGCTGGAGGGAGCTATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCTGATAGAAACTATGTGTTGCCCAGTGATGCTGGAGGGAGCTATAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGAAGAGAAGAATGTTGCCAGTGACGCTAACCATAGCCTGCATCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGAAGAGAAGAATGTTGCCAGTGACGCTAACCATAGCCTGCATCTGCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAACCGCCCCCACCACCGCCAAAGACAGAAGACCATGACACCCCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAACCGCCCCCACCACCGCCAAAGACAGAAGACCATGACACCCCTGCTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTCACGTCCATTCCTAGCATGATGACCCAGCCACTCCTAGGCACTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTCACGTCCATTCCTAGCATGATGACCCAGCCACTCCTAGGCACTGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCACGGGCATCCAGACCAGCACGAGCTCCTGCCAGCCATACAAAGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCACGGGCATCCAGACCAGCACGAGCTCCTGCCAGCCATACAAAGTTCAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCAATGGAGACTTCAGTAAAAACAGCTTCCTCACCCCTGACAATGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGCAATGGAGACTTCAGTAAAAACAGCTTCCTCACCCCTGACAATGCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGACATTACCACTGGGACCAACTCCTGTCTGAGCAATAGTGAGCACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGACATTACCACTGGGACCAACTCCTGTCTGAGCAATAGTGAGCACTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGATCCTGGCTTTGGGCAGATGGATGAGCTCCAGCTCGAGGACCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGATCCTGGCTTTGGGCAGATGGATGAGCTCCAGCTCGAGGACCTGGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATGATGACTTGCAGTTTGAAGACCCTGCTGAGGATATAGGCACAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GATGATGACTTGCAGTTTGAAGACCCTGCTGAGGATATAGGCACAACTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGGTGATTGAGCTGAGTGATGACAGTGAGGATGAGTTGGCTTTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGGTGATTGAGCTGAGTGATGACAGTGAGGATGAGTTGGCTTTTGGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGAATGACAATCGGGAGAATAAGGCCATGCCCTGCCAGGTGTGCAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAATGACAATCGGGAGAATAAGGCCATGCCCTGCCAGGTGTGCAAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTTCTAGAGCCCAACATTCAACTGATCCGGCAGCATGCTCGGGACCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTTCTAGAGCCCAACATTCAACTGATCCGGCAGCATGCTCGGGACCATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGACCTGCTGACGGGCAACTGCAAGGTCTGCGAGACCCACTTCCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGACCTGCTGACGGGCAACTGCAAGGTCTGCGAGACCCACTTCCAGGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GAAACTCCCGGGTAACTCATGTCCTGTCCCACATTGGTATTTTCCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GAAACTCCCGGGTAACTCATGTCCTGTCCCACATTGGTATTTTCCTTTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TCCTGCGACATGTGTGAAACTAAGTTCTTTACCCAGTGGCAGCTGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TCCTGCGACATGTGTGAAACTAAGTTCTTTACCCAGTGGCAGCTGACCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TCACCGACGGGATGGAATATTTGAGAACAACATCATTGTCCACCCCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TCACCGACGGGATGGAATATTTGAGAACAACATCATTGTCCACCCCAACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ATCCCCTGCCAGGGAAGCTGGGTCTCTTTTCAGGGGCAGCCTCCCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ATCCCCTGCCAGGGAAGCTGGGTCTCTTTTCAGGGGCAGCCTCCCCAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTGAAATGCGCTGCCTGTGGGAAAGTATTGGCCAAAGATTTCCATGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CTGAAATGCGCTGCCTGTGGGAAAGTATTGGCCAAAGATTTCCATGTGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCGGGGCCACATCCTTGACCATCTAAACTTGAAGGGCCAGGCCTGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCGGGGCCACATCCTTGACCATCTAAACTTGAAGGGCCAGGCCTGCAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCTGCGACCAGCGTCACCTTAACCTCTGCAGCCTCATGTGGCACACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCTGCGACCAGCGTCACCTTAACCTCTGCAGCCTCATGTGGCACACGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TCCCATCTCGGCATCTCAGTCTTCTCCTGTTCTGTCTGTGCGAACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TCCCATCTCGGCATCTCAGTCTTCTCCTGTTCTGTCTGTGCGAACAGCTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TGTGGACTGGCATCTTCTAGAGAAGCACATGGCTGTGCACCAAAGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TGTGGACTGGCATCTTCTAGAGAAGCACATGGCTGTGCACCAAAGTCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AAGACGCCCTCTTCCACTGCCGCTTGTGCAGCCAGAGCTTCAAGTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AAGACGCCCTCTTCCACTGCCGCTTGTGCAGCCAGAGCTTCAAGTCAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GCTGCCTATCGCTACCACGTCAGCCAGCACAAATGCAACAGTGGCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GCTGCCTATCGCTACCACGTCAGCCAGCACAAATGCAACAGTGGCCTTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TGCACGGCCTGGTTTTGGGCTGCAGCACCCAGCTCTCCAGAAGCGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TGCACGGCCTGGTTTTGGGCTGCAGCACCCAGCTCTCCAGAAGCGGAAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TGCCAGCAGAGGAGTTTCTGGGTGAAGAGCTGGCGCTGCAGGGCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TGCCAGCAGAGGAGTTTCTGGGTGAAGAGCTGGCGCTGCAGGGCCAACCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GGGAACAGCAAGTATAGCTGCAAGGTCTGTGGCAAAAGATTTGCCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GGGAACAGCAAGTATAGCTGCAAGGTCTGTGGCAAAAGATTTGCCCACAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AAGCGAATTCAACTACCACCGGCGGATCCACACGGGGGAGAAGCCATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AAGCGAATTCAACTACCACCGGCGGATCCACACGGGGGAGAAGCCATACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 AATGTAAGGTGTGCCACAAGTTCTTTCGAGGCCGCTCGACCATCAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 AATGTAAGGTGTGCCACAAGTTCTTTCGAGGCCGCTCGACCATCAAGTGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CACCTAAAGACACACTCGGGGGCCCTCATGTACCGCTGCACAGTCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CACCTAAAGACACACTCGGGGGCCCTCATGTACCGCTGCACAGTCTGTGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GCACTACAGTTCCACCCTTAACCTCATGAGCAAACATGTTGGTGTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GCACTACAGTTCCACCCTTAACCTCATGAGCAAACATGTTGGTGTGCACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AAGGCAGCCTCCCCCCTGACTTCACCATCGAGCAGACCTTCATGTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AAGGCAGCCTCCCCCCTGACTTCACCATCGAGCAGACCTTCATGTACATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .
   2101 ATCCATTCCAAAGAGGCGGATAAGAACCCGGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 ATCCATTCCAAAGAGGCGGATAAGAACCCGGACAGT