seq1 = pF1KSDA0331.tfa, 2325 bp
seq2 = pF1KSDA0331/gi568815591r_83267589.tfa (gi568815591r:83267589_83748542), 480954 bp

>pF1KSDA0331 2325
>gi568815591r:83267589_83748542 (Chr7)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-276  (258269-258429)   100% ->
277-336  (279241-279300)   100% ->
337-456  (281942-282061)   100% ->
457-550  (330060-330153)   100% ->
551-670  (340056-340175)   100% ->
671-813  (341304-341446)   100% ->
814-928  (342484-342598)   100% ->
929-998  (343024-343093)   100% ->
999-1143  (345767-345911)   100% ->
1144-1366  (348293-348515)   100% ->
1367-1458  (351814-351905)   100% ->
1459-1500  (354205-354246)   97% ->
1501-1667  (355822-355988)   100% ->
1668-1735  (361493-361560)   100% ->
1736-1875  (363110-363249)   100% ->
1876-2325  (380505-380954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCCGCGGGGCACATTATCACCTTGCTCCTGTGGGGTTACTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCCGCGGGGCACATTATCACCTTGCTCCTGTGGGGTTACTTACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCTTTGGACAGGAGGTCATACAGCTGATACTACCCACCCCCGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCTTTGGACAGGAGGTCATACAGCTGATACTACCCACCCCCGGTTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGTCACATAAAG         AGCTCTTGAATCTGAACAGAACATCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGTCACATAAAGGTA...CAGAGCTCTTGAATCTGAACAGAACATCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATATTTCATAGCCCTTTTGGATTTCTTGATCTCCATACAATGCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258295 ATATTTCATAGCCCTTTTGGATTTCTTGATCTCCATACAATGCTGCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAATATCAAGAGAGGCTCTTCGTGGGAGGCAGGGACCTTGTATATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258345 TGAATATCAAGAGAGGCTCTTCGTGGGAGGCAGGGACCTTGTATATTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAGCTTGGAGAGAATCAGTGACGGCTATAAAGAG         ATACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 258395 TCAGCTTGGAGAGAATCAGTGACGGCTATAAAGAGGTA...TAGATACAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGGCCGAGTACAGCTCTAAAAATGGAAGAATGCATAATGAAGGGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279247 TGGCCGAGTACAGCTCTAAAAATGGAAGAATGCATAATGAAGGGAAAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCG         GGTGAATGTGCAAATTATGTTCGGGTTTTGCATCACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279297 TGCGGTA...TAGGGTGAATGTGCAAATTATGTTCGGGTTTTGCATCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAACAGGACACACCTTCTGACCTGTGGTACTGGAGCTTTTGATCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 281979 ATAACAGGACACACCTTCTGACCTGTGGTACTGGAGCTTTTGATCCAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGTGCCTTCATCAGAGTTGGATATCATTTGGAG         GATCCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 282029 TGTGCCTTCATCAGAGTTGGATATCATTTGGAGGTA...AAGGATCCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTTTCACCTGGAATCACCCAGATCTGAGAGAGGAAGGGGCAGATGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330068 GTTTCACCTGGAATCACCCAGATCTGAGAGAGGAAGGGGCAGATGTCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGACCCCAGCTCCTCCTTCATCTCCACTTTAATTG         GTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 330118 TTGACCCCAGCTCCTCCTTCATCTCCACTTTAATTGGTA...TAGGTAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAATTGTTTGCTGGACTCTACAGTGACTACTGGAGCAGAGACGCTGCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 340061 GAATTGTTTGCTGGACTCTACAGTGACTACTGGAGCAGAGACGCTGCGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTTCCGCAGCATGGGGCGACTGGCCCATATCCGCACTGAGCATGACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 340111 CTTCCGCAGCATGGGGCGACTGGCCCATATCCGCACTGAGCATGACGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCGTCTGTTGAAAG         AACCAAAATTTGTAGGTTCATACATG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 340161 AGCGTCTGTTGAAAGGTA...TAGAACCAAAATTTGTAGGTTCATACATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTCCTGACAATGAAGACAGAGATGACAACAAAGTATATTTCTTTTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 341330 ATTCCTGACAATGAAGACAGAGATGACAACAAAGTATATTTCTTTTTTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAGAAGGCACTGGAGGCAGAAAACAATGCTCACGCAATTTACACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 341380 TGAGAAGGCACTGGAGGCAGAAAACAATGCTCACGCAATTTACACCAGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCGGGCGACTCTGTGTG         AATGATGTAGGAGGGCAGAGAATA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 341430 TCGGGCGACTCTGTGTGGTG...CAGAATGATGTAGGAGGGCAGAGAATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTGGTGAATAAGTGGAGCACTTTCCTAAAAGCGAGACTCGTTTGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 342508 CTGGTGAATAAGTGGAGCACTTTCCTAAAAGCGAGACTCGTTTGCTCAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACCAGGAATGAATGGAATTGACACATATTTTGATGAATTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 342558 ACCAGGAATGAATGGAATTGACACATATTTTGATGAATTAGGTA...CAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGACGTTTTTTTGCTACCTACCAGAGATCATAAGAATCCAGTGATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 343024 AGGACGTTTTTTTGCTACCTACCAGAGATCATAAGAATCCAGTGATATTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GGACTCTTTAACACTACCAG         TAATATTTTTCGAGGGCATGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 343074 GGACTCTTTAACACTACCAGGTG...CAGTAATATTTTTCGAGGGCATGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TATATGTGTCTATCACATGTCTAGCATTCGGGCAGCCTTCAACGGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345788 TATATGTGTCTATCACATGTCTAGCATTCGGGCAGCCTTCAACGGACCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGCACATAAGGAAGGACCTGAATACCACTGGTCAGTCTATGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 345838 ATGCACATAAGGAAGGACCTGAATACCACTGGTCAGTCTATGAAGGAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTCCCTTATCCAAGGCCTGGTTCT         TGTGCCAGCAAAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 345888 GTCCCTTATCCAAGGCCTGGTTCTGTA...CAGTGTGCCAGCAAAGTAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TGGAGGGAGATACGGAACCACCAAGGACTATCCTGATGATGCCATCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348310 TGGAGGGAGATACGGAACCACCAAGGACTATCCTGATGATGCCATCCGAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TTGCAAGAAGTCATCCACTAATGTACCAGGCCATAAAACCTGCCCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348360 TTGCAAGAAGTCATCCACTAATGTACCAGGCCATAAAACCTGCCCATAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAACCAATATTGGTAAAAACAGATGGAAAATATAACCTGAAACAAATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348410 AAACCAATATTGGTAAAAACAGATGGAAAATATAACCTGAAACAAATAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGTAGATCGAGTGGAAGCTGAGGATGGCCAATATGACGTCTTGTTTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348460 AGTAGATCGAGTGGAAGCTGAGGATGGCCAATATGACGTCTTGTTTATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGACAG         ATAATGGAATTGTGCTGAAAGTAATCACAATTTAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 348510 GGACAGGTA...CAGATAATGGAATTGTGCTGAAAGTAATCACAATTTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AACCAAGAAATGGAATCAATGGAAGAAGTAATTCTAGAAGAACTTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 351849 AACCAAGAAATGGAATCAATGGAAGAAGTAATTCTAGAAGAACTTCAGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 ATTCAAG         GATCCAGTTCCTATTATTTCTATGGAGATTTCTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 351899 ATTCAAGGTA...CAGGATCCAGTTCCTATTATTTCTATGGAGATTTCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CAAAACGG         CAACAGCTGTATATTGGATCTGCTTCTGCTGTG
        |||| |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 354239 CAAAGCGGGTA...TAGCAACAGCTGTATATTGGATCTGCTTCTGCTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GCTCAAGTCAGATTCCATCACTGTGACATGTATGGAAGTGCTTGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355855 GCTCAAGTCAGATTCCATCACTGTGACATGTATGGAAGTGCTTGTGCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CTGCTGCCTGGCTCGAGACCCTTACTGTGCCTGGGATGGCATATCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355905 CTGCTGCCTGGCTCGAGACCCTTACTGTGCCTGGGATGGCATATCCTGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CCCGGTATTACCCAACAGGCACACATGCAAAAAG         GCGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 355955 CCCGGTATTACCCAACAGGCACACATGCAAAAAGGTG...CAGGCGTTTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CGGAGACAAGATGTTCGACATGGAAATGCAGCTCAGCAGTGCTTTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 361500 CGGAGACAAGATGTTCGACATGGAAATGCAGCTCAGCAGTGCTTTGGACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 ACAGTTTGTTG         GGGATGCTTTGGATAAGACTGAAGAACATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 361550 ACAGTTTGTTGGTA...TAGGGGATGCTTTGGATAAGACTGAAGAACATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TGGCTTATGGCATAGAGAACAACAGTACTTTGCTGGAATGTACCCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363140 TGGCTTATGGCATAGAGAACAACAGTACTTTGCTGGAATGTACCCCACGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 TCTTTACAAGCGAAAGTTATCTGGTTTGTACAGAAAGGACGTGAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 363190 TCTTTACAAGCGAAAGTTATCTGGTTTGTACAGAAAGGACGTGAGACAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 AAAAGAGGAG         GTGAAGACAGATGACAGAGTGGTTAAGATGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 363240 AAAAGAGGAGGTA...CAGGTGAAGACAGATGACAGAGTGGTTAAGATGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ACCTTGGTTTACTCTTCCTAAGGTTACACAAATCAGATGCTGGGACCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380536 ACCTTGGTTTACTCTTCCTAAGGTTACACAAATCAGATGCTGGGACCTAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 TTTTGCCAGACAGTAGAGCATAGCTTTGTCCATACGGTCCGTAAAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380586 TTTTGCCAGACAGTAGAGCATAGCTTTGTCCATACGGTCCGTAAAATCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CTTGGAGGTAGTGGAAGAGGAGAAAGTCGAGGATATGTTTAACAAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380636 CTTGGAGGTAGTGGAAGAGGAGAAAGTCGAGGATATGTTTAACAAGGACG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 ATGAGGAGGACAGGCATCACAGGATGCCTTGTCCTGCTCAGAGTAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380686 ATGAGGAGGACAGGCATCACAGGATGCCTTGTCCTGCTCAGAGTAGCATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 TCGCAGGGAGCAAAACCATGGTACAAGGAATTCTTGCAGCTGATCGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380736 TCGCAGGGAGCAAAACCATGGTACAAGGAATTCTTGCAGCTGATCGGTTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TAGCAACTTCCAGAGAGTGGAAGAATACTGCGAGAAAGTATGGTGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380786 TAGCAACTTCCAGAGAGTGGAAGAATACTGCGAGAAAGTATGGTGCACAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ATAGAAAGAGGAAAAAGCTTAAAATGTCACCCTCCAAGTGGAAGTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380836 ATAGAAAGAGGAAAAAGCTTAAAATGTCACCCTCCAAGTGGAAGTATGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AACCCTCAGGAAAAGAAGCTCCGTTCCAAACCTGAGCATTACCGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380886 AACCCTCAGGAAAAGAAGCTCCGTTCCAAACCTGAGCATTACCGCCTGCC

   2450     .    :    .
   2307 CAGGCACACGCTGGACTCC
        |||||||||||||||||||
 380936 CAGGCACACGCTGGACTCC