seq1 = pF1KSDA0319.tfa, 3216 bp
seq2 = pF1KSDA0319/gi568815592r_24447168.tfa (gi568815592r:24447168_24701103), 253936 bp
>pF1KSDA0319 3216
>gi568815592r:24447168_24701103 (Chr6)
(complement)
1-55 (100001-100055) 100% ->
56-801 (104486-105231) 99% ->
802-994 (112319-112511) 100% ->
995-1093 (117402-117500) 100% ->
1094-1191 (118758-118855) 100% ->
1192-1279 (120091-120178) 100% ->
1280-1372 (121154-121246) 100% ->
1373-1505 (122862-122994) 100% ->
1506-1738 (124508-124740) 99% ->
1739-1858 (128410-128529) 99% ->
1859-1991 (131069-131201) 100% ->
1992-2140 (132175-132323) 100% ->
2141-2292 (134356-134507) 100% ->
2293-2431 (136764-136902) 100% ->
2432-2591 (137586-137745) 100% ->
2592-2734 (141949-142091) 100% ->
2735-2857 (144375-144497) 100% ->
2858-2948 (146473-146563) 100% ->
2949-3040 (149579-149670) 100% ->
3041-3216 (153761-153936) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCTGCTGCTGGTGACAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGCCCCCCACAGGTGTGCTCTCTTCATTGCTGCTGCTGGTGACAAT
50 . : . : . : . : . :
51 TGCAG GTTGTGCCCGTAAGCAGTGCAGCGAGGGGAGGACAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGCAGGTA...AAGGTTGTGCCCGTAAGCAGTGCAGCGAGGGGAGGACAT
100 . : . : . : . : . :
92 ATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104522 ATTCCAATGCAGTCATTTCACCTAACTTGGAAACCACCAGAATCATGCGG
150 . : . : . : . : . :
142 GTGTCTCACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104572 GTGTCTCACACCTTCCCTGTCGTAGACTGCACGGCCGCTTGCTGTGACCT
200 . : . : . : . : . :
192 GTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTGGTTCGAGGGCCGCTGCTACCTGGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104622 GTCCAGCTGTGACCTGGCCTGGTGGTTCGAGGGCCGCTGCTACCTGGTGA
250 . : . : . : . : . :
242 GCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104672 GCTGCCCCCACAAAGAGAACTGTGAGCCCAAGAAGATGGGCCCCATCAGG
300 . : . : . : . : . :
292 TCTTATCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104722 TCTTATCTCACTTTTGTGCTCCGGCCTGTTCAGAGGCCTGCACAGCTGCT
350 . : . : . : . : . :
342 GGACTATGGGGACATGATGCTGAACAGGGGCTCCCCCTCGGGGATCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104772 GGACTATGGGGACATGATGCTGAACAGGGGCTCCCCCTCGGGGATCTGGG
400 . : . : . : . : . :
392 GGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGCCCTTTCTAGGCAAAGAT
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
104822 GGGACTCACCTGAGGATATCAGAAAGGACTTGACCTTTCTAGGCAAAGAT
450 . : . : . : . : . :
442 TGGGGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACGCAGATGACTACCGGGAGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
104872 TGGGGCCTAGAGGAGATGTCTGAGTACTCAGATGACTACCGGGAGCTGGA
500 . : . : . : . : . :
492 GAAGGACCTCTTGCAACCCAGTGGCAAGCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104922 GAAGGACCTCTTGCAACCCAGTGGCAAGCAGGAGCCCAGAGGGAGTGCCG
550 . : . : . : . : . :
542 AGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTCAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104972 AGTACACGGACTGGGGCCTACTGCCGGGCAGCGAGGGGGCCTTCAACTCC
600 . : . : . : . : . :
592 TCTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105022 TCTGTTGGAGACAGTCCTGCGGTGCCAGCGGAGACGCAGCAGGACCCTGA
650 . : . : . : . : . :
642 GCTCCATTACCTGAATGAGTCGGCTTCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105072 GCTCCATTACCTGAATGAGTCGGCTTCAACCCCTGCCCCAAAACTCCCTG
700 . : . : . : . : . :
692 AGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAGGAGAGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105122 AGAGAAGTGTGTTGCTTCCCTTGCCGACTACTCCATCTTCAGGAGAGGTG
750 . : . : . : . : . :
742 TTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105172 TTGGAGAAAGAAAAGGCTTCTCAGCTCCAGGAACAATCCAGCAACAGCTC
800 . : . : . : . : . :
792 TGGAAAAGAG GTTCTAATGCCTTCCCATAGTCTTCCTCCGG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
105222 TGGAAAAGAGGTG...TAGGTTCTAATGCCTTCCCATAGTCTTCCTCCGG
850 . : . : . : . : . :
833 CAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112350 CAAGCCTGGAGCTCAGCTCAGTCACCGTGGAGAAAAGCCCAGTGCTCACA
900 . : . : . : . : . :
883 GTCACCCCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112400 GTCACCCCGGGGAGTACAGAGCACAGCATCCCAACACCTCCCACTAGCGC
950 . : . : . : . : . :
933 AGCCCCCTCTGAGTCCACCCCATCTGAGCTACCCATATCTCCTACCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112450 AGCCCCCTCTGAGTCCACCCCATCTGAGCTACCCATATCTCCTACCACTG
1000 . : . : . : . : . :
983 CTCCCAGGACAG TGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGAT
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
112500 CTCCCAGGACAGGTA...TAGTGAAAGAACTTACGGTATCGGCTGGAGAT
1050 . : . : . : . : . :
1024 AACCTAATTATAACTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117431 AACCTAATTATAACTTTACCCGACAATGAAGTTGAACTGAAGGCCTTTGT
1100 . : . : . : . : . :
1074 TGCGCCAGCGCCACCTGTAG AAACAACCTACAACTATGAAT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
117481 TGCGCCAGCGCCACCTGTAGGTG...CAGAAACAACCTACAACTATGAAT
1150 . : . : . : . : . :
1115 GGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118779 GGAATTTAATAAGCCACCCCACAGACTACCAAGGTGAAATAAAACAAGGA
1200 . : . : . : . : . :
1165 CACAAGCAAACTCTTAACCTCTCTCAA TTGTCCGTCGGACT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
118829 CACAAGCAAACTCTTAACCTCTCTCAAGTA...CAGTTGTCCGTCGGACT
1250 . : . : . : . : . :
1206 TTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAAGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120105 TTATGTCTTCAAAGTCACTGTTTCTAGTGAAAACGCCTTTGGAGAAGGAT
1300 . : . : . : . : . :
1256 TTGTCAATGTCACTGTTAAGCCTG CCAGAAGAGTCAACCTG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
120155 TTGTCAATGTCACTGTTAAGCCTGGTA...CAGCCAGAAGAGTCAACCTG
1350 . : . : . : . : . :
1297 CCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACTGCAAGAGCTCACTTTGCCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121171 CCACCTGTAGCAGTTGTTTCTCCCCAACTGCAAGAGCTCACTTTGCCTTT
1400 . : . : . : . : . :
1347 GACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCC AAAGTACAGATGATA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
121221 GACGTCAGCCCTCATTGATGGCAGCCGTG...TAGAAAGTACAGATGATA
1450 . : . : . : . : . :
1388 CTGAAATAGTGAGTTATCATTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122877 CTGAAATAGTGAGTTATCATTGGGAAGAAATAAACGGGCCCTTCATAGAA
1500 . : . : . : . : . :
1438 GAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTGTCTAACCTTGATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122927 GAGAAGACTTCAGTTGACTCTCCCGTCTTACGCTTGTCTAACCTTGATCC
1550 . : . : . : . : . :
1488 TGGTAACTATAGTTTCAG GTTGACTGTTACAGACTCGGACG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
122977 TGGTAACTATAGTTTCAGGCA...TAGGTTGACTGTTACAGACTCGGACG
1600 . : . : . : . : . :
1529 GAGCCACTAACTCTACAACTGCAGCCCTAATAGTGAACAATGCTGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124531 GAGCCACTAACTCTACAACTGCAGCCCTAATAGTGAACAATGCTGTGGAC
1650 . : . : . : . : . :
1579 TACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTTTGCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124581 TACCCACCAGTTGCTAATGCAGGACCAAATCACACCATAACTTTGCCCCA
1700 . : . : . : . : . :
1629 AAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124631 AAACTCCATCACTTTGAATGGAAACCAGAGCAGTGACGATCACCAGATTG
1750 . : . : . : . : . :
1679 TCCTCTATGAGTGGTCCCTGGGTCCTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124681 TCCTCTATGAGTGGTCCCTGGGTCCTGGGAGTGAGGGCAAACATGTGGTC
1800 . : . : . : . : . :
1729 ATGCAGGGAG TACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAAT
||||||| | >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
124731 ATGCAGGCAAGTT...GAGTACAGACGCCATACCTTCATTTATCTGCAAT
1850 . : . : . : . : . :
1770 GCAGGAAGGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128441 GCAGGAAGGAGATTATACATTTCAGCTGAAGGTGACAGATTCTTCAAGGC
1900 . : . : . : . : . :
1820 AACAGTCTACTGCTGTAGTGACTGTGATTGTCCAGCCTG AA
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
128491 AACAGTCTACTGCTGTGGTGACTGTGATTGTCCAGCCTGGTA...CAGAA
1950 . : . : . : . : . :
1861 AACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131071 AACAATAGACCTCCAGTGGCTGTGGCCGGCCCTGATAAAGAGCTGATCTT
2000 . : . : . : . : . :
1911 CCCAGTGGAAAGTGCTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131121 CCCAGTGGAAAGTGCTACCCTGGATGGGAGCAGCAGCAGCGATGACCACG
2050 . : . : . : . : . :
1961 GCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAG AGGCCCCAGT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
131171 GCATTGTCTTCTACCACTGGGAGCACGTCAGGTA...TAGAGGCCCCAGT
2100 . : . : . : . : . :
2002 GCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132185 GCAGTGGAGATGGAAAATATTGACAAAGCAATAGCCACTGTGACTGGTCT
2150 . : . : . : . : . :
2052 CCAGGTGGGGACCTACCACTTCCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132235 CCAGGTGGGGACCTACCACTTCCGTTTGACAGTGAAAGACCAGCAGGGAC
2200 . : . : . : . : . :
2102 TGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAGG AA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
132285 TGAGCAGCACGTCCACCCTCACTGTGGCTGTGAAGAAGGGTG...TAGAA
2250 . : . : . : . : . :
2143 AATAATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134358 AATAATAGTCCTCCCAGAGCCCGGGCTGGTGGCAGACATGTTCTTGTGCT
2300 . : . : . : . : . :
2193 TCCCAATAATTCCATTACTTTGGATGGTTCAAGGTCTACTGATGACCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134408 TCCCAATAATTCCATTACTTTGGATGGTTCAAGGTCTACTGATGACCAAA
2350 . : . : . : . : . :
2243 GAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAGCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134458 GAATTGTGTCCTATCTGTGGATCCGGGATGGCCAGAGTCCAGCAGCTGGA
2400 . : . : . : . : . :
2293 GATGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCT
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134508 GTG...CAGGATGTCATCGATGGCTCTGACCACAGTGTGGCTCTGCAGCT
2450 . : . : . : . : . :
2334 TACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACTTTCCACTTGCGAGTCACCGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136805 TACGAATCTGGTGGAGGGGGTGTACACTTTCCACTTGCGAGTCACCGACA
2500 . : . : . : . : . :
2384 GTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
136855 GTCAGGGGGCCTCGGACACAGACACTGCCACTGTGGAAGTGCAGCCAGGT
2550 . : . : . : . : . :
2432 ACCCTAGGAAGAGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136905 G...CAGACCCTAGGAAGAGTGGCCTGGTGGAGCTGACCCTGCAGGTTGG
2600 . : . : . : . : . :
2475 TGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCCTTGTGAGGCAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137629 TGTTGGGCAGCTGACAGAGCAGCGGAAGGACACCCTTGTGAGGCAGCTGG
2650 . : . : . : . : . :
2525 CTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137679 CTGTGCTGCTGAACGTGCTGGACTCGGACATTAAGGTCCAGAAGATTCGG
2700 . : . : . : . : . :
2575 GCCCACTCGGATCTCAG CACCGTGATTGTGTTTTATGTACA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
137729 GCCCACTCGGATCTCAGGTA...CAGCACCGTGATTGTGTTTTATGTACA
2750 . : . : . : . : . :
2616 GAGCAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGCCCGAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141973 GAGCAGGCCGCCTTTCAAGGTTCTCAAAGCTGCTGAAGTGGCCCGAAATC
2800 . : . : . : . : . :
2666 TGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142023 TGCACATGCGGCTCTCAAAGGAGAAGGCTGACTTCTTGCTTTTCAAGGTC
2850 . : . : . : . : . :
2716 TTGAGGGTTGATACAGCAG GTTGCCTTCTGAAGTGTTCTGG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
142073 TTGAGGGTTGATACAGCAGGTA...CAGGTTGCCTTCTGAAGTGTTCTGG
2900 . : . : . : . : . :
2757 CCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144397 CCATGGTCACTGCGACCCCCTCACAAAGCGCTGCATTTGCTCTCACTTAT
2950 . : . : . : . : . :
2807 GGATGGAGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144447 GGATGGAGAACCTTATACAGCGTTATATCTGGGATGGAGAGAGCAACTGT
3000 . : . : . : . : . :
2857 G AGTGGAGTATATTCTATGTGACAGTGTTGGCTTTTACTCT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144497 GGTG...CAGAGTGGAGTATATTCTATGTGACAGTGTTGGCTTTTACTCT
3050 . : . : . : . : . :
2898 TATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146513 TATTGTGCTAACAGGAGGTTTCACTTGGCTTTGCATCTGCTGCTGCAAAA
3100 . : . : . : . : . :
2948 G ACAAAAAAGGACTAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146563 GGTA...CAGACAAAAAAGGACTAAAATCAGGAAAAAAACAAAGTACACC
3150 . : . : . : . : . :
2989 ATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTGAGGCCCAAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149619 ATCCTGGATAACATGGATGAACAGGAAAGAATGGAACTGAGGCCCAAATA
3200 . : . : . : . : . :
3039 TG GTATCAAGCACCGAAGCACAGAGCACAACTCCAGCCTGA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
149669 TGGTA...TAGGTATCAAGCACCGAAGCACAGAGCACAACTCCAGCCTGA
3250 . : . : . : . : . :
3080 TGGTATCCGAGTCTGAGTTTGACAGTGACCAGGACACAATCTTCAGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153800 TGGTATCCGAGTCTGAGTTTGACAGTGACCAGGACACAATCTTCAGCCGA
3300 . : . : . : . : . :
3130 GAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCCATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153850 GAAAAGATGGAGAGAGGGAATCCAAAGGTTTCCATGAATGGTTCCATCAG
3350 . : . : . : .
3180 AAATGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
153900 AAATGGAGCTTCCTTCAGTTATTGCTCAAAGGACAGA