seq1 = pF1KSDA0289.tfa, 3882 bp
seq2 = pF1KSDA0289/gi568815597r_176764287.tfa (gi568815597r:176764287_177264676), 500390 bp

>pF1KSDA0289 3882
>gi568815597r:176764287_177264676 (Chr1)

(complement)

1-283  (100001-100283)   100% ->
284-471  (203412-203599)   100% ->
472-865  (231828-232221)   100% ->
866-1012  (233725-233871)   100% ->
1013-1120  (234936-235043)   100% ->
1121-1270  (239945-240094)   100% ->
1271-1438  (241106-241273)   100% ->
1439-1523  (249802-249886)   100% ->
1524-1598  (299440-299514)   100% ->
1599-1736  (306195-306332)   100% ->
1737-1887  (306849-306999)   100% ->
1888-2054  (315326-315492)   100% ->
2055-2249  (318557-318751)   100% ->
2250-2377  (320659-320786)   100% ->
2378-2482  (328307-328411)   100% ->
2483-2671  (330337-330525)   100% ->
2672-2940  (369847-370115)   98% ->
2941-3074  (376473-376606)   100% ->
3075-3226  (380187-380338)   100% ->
3227-3362  (381683-381818)   100% ->
3363-3463  (388040-388140)   100% ->
3464-3647  (395650-395833)   100% ->
3648-3882  (400156-400390)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTTAGCCGGGCTCTGCGCCCTGCTCGCCTGCTGCTGGGGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTTAGCCGGGCTCTGCGCCCTGCTCGCCTGCTGCTGGGGGCCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGTGCTGGCCACGGCCGCCGGCGACGTGGATCCATCCAAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGTGCTGGCCACGGCCGCCGGCGACGTGGATCCATCCAAGGAGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGCAAGCTCAAAAGCATCACGGTGTCGGCACTGCCCTTCCTGCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGCAAGCTCAAAAGCATCACGGTGTCGGCACTGCCCTTCCTGCGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACGACCTGAGCATCATGCACAGCCCCTCGGCCTCGGAGCCCAAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACGACCTGAGCATCATGCACAGCCCCTCGGCCTCGGAGCCCAAGCTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTCGGTGCGCAACGACTTCCCGGGAGAAATGGTCGTGGTGGACGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTCGGTGCGCAACGACTTCCCGGGAGAAATGGTCGTGGTGGACGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAGAACACGGAGCTGCCCTACTTCGTGCTGG         AGATCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100251 TGGAGAACACGGAGCTGCCCTACTTCGTGCTGGGTG...TAGAGATCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGGAACACAGAGGATATCCCTTTGGTGCGCTGGAGGCAGCAGTGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203420 GGGAACACAGAGGATATCCCTTTGGTGCGCTGGAGGCAGCAGTGGCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAATGGCACTTTGCTTTTTCACATTCATCACCAAGATGGTGCCCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203470 GAATGGCACTTTGCTTTTTCACATTCATCACCAAGATGGTGCCCCAAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTCCTGGACAAGACCCCACTGAAGAACCCCAACATGAGTCGGCAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203520 TTCCTGGACAAGACCCCACTGAAGAACCCCAACATGAGTCGGCAGAAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGCTGAGGATCCTCCACATCTCAGTCATG         GGTGGCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 203570 GAGCTGAGGATCCTCCACATCTCAGTCATGGTA...TAGGGTGGCATGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGCTCTGCTGCTGTCCATCTTGTGCCTGGTGATGATCCTGTATACTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231839 CGCTCTGCTGCTGTCCATCTTGTGCCTGGTGATGATCCTGTATACTCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGCGCTGGTGCAAACGCCGCCGGGTCCCGCAGCCCCAGAAGAGTGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231889 GGCGCTGGTGCAAACGCCGCCGGGTCCCGCAGCCCCAGAAGAGTGCCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCTGAGGCAGCCAATGAGATTCACTACATTCCTTCTGTGCTGATCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231939 GCTGAGGCAGCCAATGAGATTCACTACATTCCTTCTGTGCTGATCGGCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCACGGACGGGAGAGCCTGCGCAATGCCCGCGTGCAGGGCCACAACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231989 GCACGGACGGGAGAGCCTGCGCAATGCCCGCGTGCAGGGCCACAACTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTGGCACCCTGAGCATCCGGGAGACACCTATCCTGGACGGCTATGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232039 GTGGCACCCTGAGCATCCGGGAGACACCTATCCTGGACGGCTATGAGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GACATCACTGATCTGCGCCACCATCTGCAGAGGGAGTGCATGAACGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232089 GACATCACTGATCTGCGCCACCATCTGCAGAGGGAGTGCATGAACGGAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGAGGACTTTGCCAGCCAGGTCACGCGCACCCTCGACTCCCTGCAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232139 GGAGGACTTTGCCAGCCAGGTCACGCGCACCCTCGACTCCCTGCAGGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCAATGAAAAGTCGGGGATGGACCTCACACCAG         GAAGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 232189 GCAATGAAAAGTCGGGGATGGACCTCACACCAGGTG...CAGGAAGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AATGCCAAGCTGTCACTGATGAACAAGTATAAAGATAATATTATAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233733 AATGCCAAGCTGTCACTGATGAACAAGTATAAAGATAATATTATAGCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TAGCCCTGTGGACTCCAACCACCAGCAAGCCACCCTTCTCTCTCACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233783 TAGCCCTGTGGACTCCAACCACCAGCAAGCCACCCTTCTCTCTCACACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCAGCAGCCAGAGAAAGCGGATCAACAACAAAGCAAGAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 233833 CCAGCAGCCAGAGAAAGCGGATCAACAACAAAGCAAGAGGTA...CAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGTTCCGCCTTCTTGAACCCTGAAGGGGATTCTGGCACAGAGGCAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234938 GGTTCCGCCTTCTTGAACCCTGAAGGGGATTCTGGCACAGAGGCAGAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CGACCCCCAGCTGACCTTTTACACGGATCCTTCAAGGAGCAGGAGGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234988 CGACCCCCAGCTGACCTTTTACACGGATCCTTCAAGGAGCAGGAGGCGTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GTAGAG         TGGGTTCTCCCCGAAGTCCTGTGAATAAGACCACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 235038 GTAGAGGTA...CAGTGGGTTCTCCCCGAAGTCCTGTGAATAAGACCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TTGACCCTGATCAGCATCACCAGCTGTGTGATTGGCCTCGTGTGCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239980 TTGACCCTGATCAGCATCACCAGCTGTGTGATTGGCCTCGTGTGCTCCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCACGTCAACTGCCCTCTCGTTGTCAAGATCACCCTGCATGTCCCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240030 TCACGTCAACTGCCCTCTCGTTGTCAAGATCACCCTGCATGTCCCTGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACCTGATTGCTGATG         GGAGCCGCTTCATCTTGCTGGAGGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 240080 ACCTGATTGCTGATGGTG...CAGGGAGCCGCTTCATCTTGCTGGAGGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AGCCAGCTGGATGCCAGTGACTGGCTGAACCCTGCCCAAGTGGTTCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241132 AGCCAGCTGGATGCCAGTGACTGGCTGAACCCTGCCCAAGTGGTTCTCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CTCTCAGCAGAACTCCAGCGGACCCTGGGCCATGGACCTCTGTGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241182 CTCTCAGCAGAACTCCAGCGGACCCTGGGCCATGGACCTCTGTGCCCGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 GGCTCCTGGACCCCTGTGAACACCAATGTGACCCCGAAACTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 241232 GGCTCCTGGACCCCTGTGAACACCAATGTGACCCCGAAACTGGTA...AA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1439  GGGAATGCCTCTGCTATGAAGGCTACATGAAGGATCCAGTACATAAGCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249801 GGGGAATGCCTCTGCTATGAAGGCTACATGAAGGATCCAGTACATAAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CCTTTGCATTCGGAACGAATGGGGGACAAACCAGGG         GCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 249851 CCTTTGCATTCGGAACGAATGGGGGACAAACCAGGGGTA...TAGGCCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GGCCTTACACAATATTTCAGCGAGGCTTTGACCTGGTTTTGGGAGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 299445 GGCCTTACACAATATTTCAGCGAGGCTTTGACCTGGTTTTGGGAGAGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CCCTCTGATAAAATATTTAG         ATTCACCTACACTCTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 299495 CCCTCTGATAAAATATTTAGGTA...CAGATTCACCTACACTCTTGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GGGCATGTGGTTGCCCCTCAGCAAGAGCTTTGTGATTCCACCAGCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 306216 GGGCATGTGGTTGCCCCTCAGCAAGAGCTTTGTGATTCCACCAGCCGAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TGGCCATCAATCCATCAGCAAAGTGCAAGACGGACATGACTGTGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 306266 TGGCCATCAATCCATCAGCAAAGTGCAAGACGGACATGACTGTGATGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 GATGCTGTGGAGGTCAG         AGAGGAGCTGATGACTTCATCCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 306316 GATGCTGTGGAGGTCAGGTG...CAGAGAGGAGCTGATGACTTCATCCTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CTTCGACAGCCTGGAGGTTCTCTTAGATTCCTTTGGGCCGGTGCGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 306873 CTTCGACAGCCTGGAGGTTCTCTTAGATTCCTTTGGGCCGGTGCGCGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GCAGCAAAGATAACGGGGGCTGCAGTAAGAATTTCCGCTGTATTTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 306923 GCAGCAAAGATAACGGGGGCTGCAGTAAGAATTTCCGCTGTATTTCAGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CGCAAGCTGGACTCCACTGGTTGCGTG         TGCCCATCTGGACT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 306973 CGCAAGCTGGACTCCACTGGTTGCGTGGTA...CAGTGCCCATCTGGACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CAGTCCCATGAAGGACAGCTCTGGCTGCTATGACCGCCACATCGGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 315340 CAGTCCCATGAAGGACAGCTCTGGCTGCTATGACCGCCACATCGGGGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 ACTGTTCCGACGGCTTCAACGGCGGCTGTGAGCAGCTGTGCCTCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 315390 ACTGTTCCGACGGCTTCAACGGCGGCTGTGAGCAGCTGTGCCTCCAGCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 ATGGCGCCCTTCCCGGACGACCCCACCTTGTATAACATCCTCATGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 315440 ATGGCGCCCTTCCCGGACGACCCCACCTTGTATAACATCCTCATGTTCTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 TGG         GTGCATCGAGGACTACAAGCTTGGTGTGGATGGACGCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 315490 TGGGTG...TAGGTGCATCGAGGACTACAAGCTTGGTGTGGATGGACGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CTTGCCAACTCATCACGGAGACCTGTCCAGAGGGAAGTGACTGTGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318595 CTTGCCAACTCATCACGGAGACCTGTCCAGAGGGAAGTGACTGTGGGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 AGCAGGGAGCTTCCCATGAACCAGACCCTCTTTGGGGAGATGTTCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318645 AGCAGGGAGCTTCCCATGAACCAGACCCTCTTTGGGGAGATGTTCTTTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 TTACAACAACCATTCCAAGGAAGTGGCTGCCGGACAGGTGCTGAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318695 TTACAACAACCATTCCAAGGAAGTGGCTGCCGGACAGGTGCTGAAAGGAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 CATTCAG         GCAAAACAACTTTGCTCGTGGTTTAGACCAGCAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318745 CATTCAGGTA...TAGGCAAAACAACTTTGCTCGTGGTTTAGACCAGCAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 CTGCCAGATGGTCTTGTGGTGGCCACTGTGCCCCTGGAGAATCAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 320693 CTGCCAGATGGTCTTGTGGTGGCCACTGTGCCCCTGGAGAATCAATGCCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 AGAGGAGATCTCGGAGCCCACCCCTGACCCTGACTTCCTGACTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 320743 AGAGGAGATCTCGGAGCCCACCCCTGACCCTGACTTCCTGACTGGTG...

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2378    GGATGGTGAACTTCAGTGAAGTGTCTGGGTACCCTGTGCTGCAGCAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 328304 TAGGGATGGTGAACTTCAGTGAAGTGTCTGGGTACCCTGTGCTGCAGCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 TGGAAGGTCCGGTCTGTGATGTACCACATCAAACTCAACCAAGTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 328354 TGGAAGGTCCGGTCTGTGATGTACCACATCAAACTCAACCAAGTGGCCAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 CTCTCAGG         CCCTCAGCAATGCTCTCCACTCGCTGGATGGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 328404 CTCTCAGGGTG...TAGCCCTCAGCAATGCTCTCCACTCGCTGGATGGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 CTACATCTCGTGCAGATTTTGTGGCGCTGTTGGACCAGTTCGGCAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330370 CTACATCTCGTGCAGATTTTGTGGCGCTGTTGGACCAGTTCGGCAACCAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 TACATCCAGGAAGCTATCTACGGCTTTGAGGAGTCCTGTTCTATCTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330420 TACATCCAGGAAGCTATCTACGGCTTTGAGGAGTCCTGTTCTATCTGGTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 CCCAAACAAGCAGGTCCAGCGGCGACTCTGGCTGGAGTATGAAGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330470 CCCAAACAAGCAGGTCCAGCGGCGACTCTGGCTGGAGTATGAAGACATCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2666 GTAAAG         GCAACTCCCCATCAGATGAGTCTGAGGAGCGGGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330520 GTAAAGGTG...CAGGCAACTCCCCATCAGATGAGTCTGAGGAGCGGGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 AGAGACCCTAAGGTGCTGACATTCCCAGAATACATCACCAGCTTGTCAGA
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 369882 AGAGACCCCAAGGTGCTGACATTCCCAGAATACATCACCAGCTTGTCAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 CTCCGGCACCAAGCGCATGGCGGCTGGAGTCCGCATGGAGTGCCAGAGCA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 369932 CTCCGGCACCAAGCACATGGCGGCTGGAGTCCGCATGGAGTGCCACAGCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2807 AGGGACGATGCCCCTCGTCCTGCCCCCTGTGTCATGTGACATCCAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 369982 AGGGACGATGCCCCTCGTCCTGCCCCCTGTGTCATGTGACATCCAGCCCT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857 GACACCCCTGCTGAGCCGGTTCTGCTGGAGGTGACCAAAGCAGCCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 370032 GACACCCCTGCTGAGCCGGTTCTGCTGGAGGTGACCAAAGCAGCCCCCAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 CTATGAACTAGTGACCAACAACCAGACCCAGAGG         CTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 370082 CTATGAACTAGTGACCAACAACCAGACCCAGAGGGTA...CAGCTCTTGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 AGGAGGCTACCATGAGCTCTCTCTGGTGCTCAGGGACTGGAGATGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 376480 AGGAGGCTACCATGAGCTCTCTCTGGTGCTCAGGGACTGGAGATGTCATC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 GAGGACTGGTGTCGATGTGACTCCACTGCTTTTGGAGCTGATGGACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 376530 GAGGACTGGTGTCGATGTGACTCCACTGCTTTTGGAGCTGATGGACTCCC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 CACCTGTGCGCCTCTCCCACAGCCTGT         GCTGAGACTCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 376580 CACCTGTGCGCCTCTCCCACAGCCTGTGTA...CAGGCTGAGACTCTCCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3089 CGGTTCACGAGCCCAGCAGCACTCTTGTGGTCCTGGAGTGGGAACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380201 CGGTTCACGAGCCCAGCAGCACTCTTGTGGTCCTGGAGTGGGAACACTCA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3139 GAGCCACCAATCGGGGTGCAGATTGTAGATTACCTCCTCCGTCAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 380251 GAGCCACCAATCGGGGTGCAGATTGTAGATTACCTCCTCCGTCAAGAGAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3189 AGTCACTGACAGGATGGACCACTCCAAAGTGGAGACAG         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 380301 AGTCACTGACAGGATGGACCACTCCAAAGTGGAGACAGGTG...CAGAAA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3230 CAGTGCTGAGCTTTGTGGACGACATCATCTCTGGAGCAAAGTCTCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 381686 CAGTGCTGAGCTTTGTGGACGACATCATCTCTGGAGCAAAGTCTCCTTGT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3280 GCAATGCCATCTCAGGTGCCGGACAAGCAGCTCACCACCATCTCTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 381736 GCAATGCCATCTCAGGTGCCGGACAAGCAGCTCACCACCATCTCTCTGAT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3330 CATACGATGCCTGGAACCTGACACCATTTACAT         GTTCACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 381786 CATACGATGCCTGGAACCTGACACCATTTACATGTG...CAGGTTCACGC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3371 TGTGGGGAGTGGACAACACAGGACGGCGCTCCAGGCCAAGCGACGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 388048 TGTGGGGAGTGGACAACACAGGACGGCGCTCCAGGCCAAGCGACGTGATC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3421 GTGAAGACCCCATGCCCCGTGGTGGATGATGTCAAGGCTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 388098 GTGAAGACCCCATGCCCCGTGGTGGATGATGTCAAGGCTCAAGGTA...C

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3464   AAATAGCAGACAAGATCTACAATCTCTTCAATGGCTACACTAGTGGGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 395648 AGAAATAGCAGACAAGATCTACAATCTCTTCAATGGCTACACTAGTGGGA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3512 AGGAGCAGCAGACCGCCTACAACACCCTCCTGGATCTGGGTTCCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 395698 AGGAGCAGCAGACCGCCTACAACACCCTCCTGGATCTGGGTTCCCCCACC

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3562 TTACACCGGGTCCTCTACCACTATAACCAGCACTATGAGAGTTTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 395748 TTACACCGGGTCCTCTACCACTATAACCAGCACTATGAGAGTTTTGGGGA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3612 ATTCACCTGGCGATGTGAGGATGAGTTAGGTCCCAG         GAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 395798 ATTCACCTGGCGATGTGAGGATGAGTTAGGTCCCAGGTA...TAGGAAAG

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3653 CTGGTCTCATCCTTTCCCAGCTTGGGGACCTCAGCAGTTGGTGCAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 400161 CTGGTCTCATCCTTTCCCAGCTTGGGGACCTCAGCAGTTGGTGCAATGGA

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3703 CTCCTTCAGGAACCCAAGATAAGCTTGCGGCGCAGCTCACTCAAGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 400211 CTCCTTCAGGAACCCAAGATAAGCTTGCGGCGCAGCTCACTCAAGTACCT

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3753 GGGGTGCCGCTACAGCGAGATCAAACCCTACGGACTTGACTGGGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 400261 GGGGTGCCGCTACAGCGAGATCAAACCCTACGGACTTGACTGGGCGGAGC

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3803 TCAGCCGGGACCTCAGGAAGACGTGTGAGGAGCAGACCCTGAGTATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 400311 TCAGCCGGGACCTCAGGAAGACGTGTGAGGAGCAGACCCTGAGTATCCCC

   4050     .    :    .    :    .    :
   3853 TACAACGACTATGGGGACAGCAAAGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 400361 TACAACGACTATGGGGACAGCAAAGAGATC