seq1 = pF1KSDA0275.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KSDA0275/gi568815588r_71962860.tfa (gi568815588r:71962860_72188328), 225469 bp

>pF1KSDA0275 1272
>gi568815588r:71962860_72188328 (Chr10)

(complement)

1-198  (100001-100193)   97% ->
199-244  (115781-115826)   100% ->
245-359  (116071-116185)   100% ->
360-474  (117903-118017)   100% ->
475-589  (120028-120142)   100% ->
590-709  (120597-120716)   100% ->
710-928  (121209-121427)   100% ->
929-991  (124089-124151)   100% ->
992-1129  (125167-125304)   100% ->
1130-1272  (125424-125566)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCGCCCCGGGCTGCGGGCGGCTGGTGCTGCCGCTGCTGCTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCGCCCCGGGCTGCGGGCGGCTGGTGCTGCCGCTGCTGCTCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGCAGCCCTGGCCGAAGGCGACGCCAAGGGGCTCAAGGAGGGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGGCAGCCCTGGCCGAAGGCGACGCCAAGGGGCTCAAGGAGGGCGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCCGGCAATTTCATGGAGGACGAGCAATGGCTGTCGTCCATCTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCCGGCAATTTCATGGAGGACGAGCAATGGCTGTCGTCCATCTCGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACAGCGGCAAGATCAAGCACTGGAACCGCTTCCGAGACGAAGTGGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---||-|->>
 100151 TACAGCGGCAAGATCAAGCACTGGAACCGCTTCCGAGACG   TG A GT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        GATGACTATATCAAGAGCTGGGAGGACAATCAGCAAGGAGATG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100196 C...TAGGATGACTATATCAAGAGCTGGGAGGACAATCAGCAAGGAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAG         CCCTGGATACCACCAAGGACCCCTGCCAGAAGGTGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115824 AAGGTA...CAGCCCTGGATACCACCAAGGACCCCTGCCAGAAGGTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCAGCCGCCACAAGGTGTGCATTGCCCAGGGCTACCAGCGGGCCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116109 TGCAGCCGCCACAAGGTGTGCATTGCCCAGGGCTACCAGCGGGCCATGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCAGTCGCAAGAAGCTGGAGCACAG         GATCAAGCAGCCGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116159 CATCAGTCGCAAGAAGCTGGAGCACAGGTG...TAGGATCAAGCAGCCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCGTGAAACTCCATGGAAACAAAGACTCCATCTGCAAGCCCTGCCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117917 CCGTGAAACTCCATGGAAACAAAGACTCCATCTGCAAGCCCTGCCACATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCCAGCTTGCCTCTGTCTGCGGCTCAGATGGCCACACTTACAGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117967 GCCCAGCTTGCCTCTGTCTGCGGCTCAGATGGCCACACTTACAGCTCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 G         TGTAAGCTGGAGCAACAGGCGTGCCTGAGCAGCAAGCAGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118017 GGTG...CAGTGTAAGCTGGAGCAACAGGCGTGCCTGAGCAGCAAGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCGGTGCGATGCGAGGGCCCCTGCCCCTGCCCCACGGAGCAGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120068 TGGCGGTGCGATGCGAGGGCCCCTGCCCCTGCCCCACGGAGCAGGCTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCTCCACCGCCGATGGCAAACCAG         AGACTTGCACCGGTCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 120118 ACCTCCACCGCCGATGGCAAACCAGGTG...CAGAGACTTGCACCGGTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGACCTGGCTGACCTGGGAGATCGGCTGCGGGACTGGTTCCAGCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120613 GGACCTGGCTGACCTGGGAGATCGGCTGCGGGACTGGTTCCAGCTCCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGAGAACTCCAAGCAGAATGGCTCAGCCAGCAGTGTAGCCGGCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120663 ATGAGAACTCCAAGCAGAATGGCTCAGCCAGCAGTGTAGCCGGCCCGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCG         GGCTGGACAAGAGCCTGGGGGCCAGCTGCAAGGACTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120713 AGCGGTA...CAGGGCTGGACAAGAGCCTGGGGGCCAGCTGCAAGGACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CATTGGCTGGATGTTCTCCAAGCTGGACACCAGTGCTGACCTCTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121246 CATTGGCTGGATGTTCTCCAAGCTGGACACCAGTGCTGACCTCTTCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCAGACGGAGCTGGCCGCCATCAACCTGGACAAGTACGAGGTCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121296 ACCAGACGGAGCTGGCCGCCATCAACCTGGACAAGTACGAGGTCTGCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGTCCCTTCTTCAACTCCTGTGACACCTACAAGGATGGCCGGGTCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121346 CGTCCCTTCTTCAACTCCTGTGACACCTACAAGGATGGCCGGGTCTCTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCTGAGTGGTGCTTCTGCTTCTGGAGGGAGA         AGCCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121396 TGCTGAGTGGTGCTTCTGCTTCTGGAGGGAGAGTG...CAGAGCCCCCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCCTGGCAGAGCTGGAGCGCATCCAGATCCAGGAGGCCGCCAAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124098 GCCTGGCAGAGCTGGAGCGCATCCAGATCCAGGAGGCCGCCAAGAAGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCAG         GCATCTTCATCCCGAGCTGCGACGAGGATGGCTACTA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124148 CCAGGTG...CAGGCATCTTCATCCCGAGCTGCGACGAGGATGGCTACTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCGGAAGATGCAGTGTGACCAGAGCAGCGGTGACTGCTGGTGTGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125204 CCGGAAGATGCAGTGTGACCAGAGCAGCGGTGACTGCTGGTGTGTGGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGCTGGGCCTGGAGCTGACTGGCACGCGCACGCATGGGAGCCCCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125254 AGCTGGGCCTGGAGCTGACTGGCACGCGCACGCATGGGAGCCCCGACTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 G         ATGACATCGTGGGCTTCTCGGGGGACTTTGGAAGCGGTGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125304 GGTA...CAGATGACATCGTGGGCTTCTCGGGGGACTTTGGAAGCGGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CGGCTGGGAGGATGAGGAGGAGAAGGAGACGGAGGAAGCAGGCGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125464 CGGCTGGGAGGATGAGGAGGAGAAGGAGACGGAGGAAGCAGGCGAGGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCGAGGAGGAGGAGGGCGAGGCAGGCGAGGCTGACGACGGGGGCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125514 CCGAGGAGGAGGAGGGCGAGGCAGGCGAGGCTGACGACGGGGGCTACATC

   1350 
   1270 TGG
        |||
 125564 TGG