seq1 = pF1KSDA0273.tfa, 990 bp
seq2 = pF1KSDA0273/gi568815590r_22121356.tfa (gi568815590r:22121356_22328357), 207002 bp

>pF1KSDA0273 990
>gi568815590r:22121356_22328357 (Chr8)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-340  (101333-101507)   99% ->
341-458  (104015-104132)   100% ->
459-990  (106471-107002)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGCTGTCCACGCCCCACAGCATTGAGATCAACAACATCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGCTGTCCACGCCCCACAGCATTGAGATCAACAACATCACCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACTCCTTCCGCATCTCCTGGGCCATGGAGGACAGTGACCTGGAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACTCCTTCCGCATCTCCTGGGCCATGGAGGACAGTGACCTGGAGAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCATTACTTCATTGACCTTAACAAGAAGGAGAATAAGAATTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCCATTACTTCATTGACCTTAACAAGAAGGAGAATAAGAATTCCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGTTCAAGCACCGG         GACGTCCCCACCAAGCTCGTGGCCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGTTCAAGCACCGGGTG...CAGGACGTCCCCACCAAGCTCGTGGCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCAGTGCCACTGCCCATGACGGTGAGAGGCCACTGGTTCCTGAGCCCCC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101359 GGCAGTGCCGCTGCCCATGACGGTGAGAGGCCACTGGTTCCTGAGCCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCACGGAGTACAGTGTGGCCGTGCAGACGGCAGTGAAGCAGAGCGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101409 GCACGGAGTACAGTGTGGCCGTGCAGACGGCAGTGAAGCAGAGCGATGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGTACCTGGTGTCCGGCTGGAGCGAGACGGTGGAGTTCTGCACTGGGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101459 GAGTACCTGGTGTCCGGCTGGAGCGAGACGGTGGAGTTCTGCACTGGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341         ATTATGCCAAGGAGCACCTGGCTCAGCTTCAGGAGAAAGCTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101509 TG...CAGATTATGCCAAGGAGCACCTGGCTCAGCTTCAGGAGAAAGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCAGATCGCAGGCCGCATGCTCCGCTTCTCCGTCTTCTACCGCAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104057 AGCAGATCGCAGGCCGCATGCTCCGCTTCTCCGTCTTCTACCGCAACCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACAAGGAGTACTTCCAGCATGCCAG         GACCCACTGCGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 104107 CACAAGGAGTACTTCCAGCATGCCAGGTA...CAGGACCCACTGCGGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATGCTGCAGCCTTACCTGAAGGACAACAGCGGCAGCCACGGCTCCCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 106486 CATGCTGCAGCCTTACCTGAAGGACAACAGTGGCAGCCACGGCTCCCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCAGCGGTATGCTCCACGGGGTCTTCTTCAGCTGCAACACGGAGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106536 CCAGCGGTATGCTCCACGGGGTCTTCTTCAGCTGCAACACGGAGTTCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACGGGCCAGCCCCCGCAGGACTCCCCCTACGGCCGCTGGCGCTTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106586 ACGGGCCAGCCCCCGCAGGACTCCCCCTACGGCCGCTGGCGCTTCCAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCCAGCTCAGCGCCTCTTCAATCCCAGCACCAACCTCTACTTTGCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106636 CCCAGCTCAGCGCCTCTTCAATCCCAGCACCAACCTCTACTTTGCGGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCTACTGCATGTACACGGCCTACCACTACGCCATCCTGGTGCTGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106686 TCTACTGCATGTACACGGCCTACCACTACGCCATCCTGGTGCTGGCGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAAGGCTCCCTGGGGGACCGCTTCTGCCGCGACCGCCTGCCCCTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106736 AAAGGCTCCCTGGGGGACCGCTTCTGCCGCGACCGCCTGCCCCTCCTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CATTGCTTGCAACAAGTTCCTGACCTGCAGCGTGGAGGATGGGGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106786 CATTGCTTGCAACAAGTTCCTGACCTGCAGCGTGGAGGATGGGGAGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTTCCGCCACGCCCAGGACCTCATCCTGGAGATCATCTACACTGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106836 TCTTCCGCCACGCCCAGGACCTCATCCTGGAGATCATCTACACTGAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GTCGACCTGTCCCTGGGCACCCTGGGGGAGATCAGTGGGCACCAGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106886 GTCGACCTGTCCCTGGGCACCCTGGGGGAGATCAGTGGGCACCAGCTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GAGTCTGTCTACTGCCGATGCCAAGAAGGACCCCAGCTGCAAGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106936 GAGTCTGTCTACTGCCGATGCCAAGAAGGACCCCAGCTGCAAGACCTGCA

   1000     .    :    .
    974 ACATCAGCGTGGGCCGC
        |||||||||||||||||
 106986 ACATCAGCGTGGGCCGC