seq1 = pF1KSDA0271.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KSDA0271/gi568815584f_23207768.tfa (gi568815584f:23207768_23408962), 201195 bp

>pF1KSDA0271 579
>gi568815584f:23207768_23408962 (Chr14)

1-432  (100001-100432)   99% ->
433-579  (101049-101195)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCCCAGCCTCGGCCCCAGACACACGGGCTCTGGTGGCAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACCCCAGCCTCGGCCCCAGACACACGGGCTCTGGTGGCAGACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTAGGTTATAAGCTGAGGCAGAAGGGTTATGTCTGTGGAGCTGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTAGGTTATAAGCTGAGGCAGAAGGGTTATGTCTGTGGAGCTGGCCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGAGGGCCCAGCAGCTGACCCGCTGCACCAAGCCATGCGGGCAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGAGGGCCCAGCAGCTGACCCGCTGCACCAAGCCATGCGGGCAGCTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGAGTTCGAGACCCGCTTCCGGCGCACCTTCTCTGATCTGGCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGAGTTCGAGACCCGCTTCCGGCGCACCTTCTCTGATCTGGCGGCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCATGTGACCCCAGGCTCAGCCCAACAACGCTTCACCCAGGTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCATGTGACCCCAGGCTCAGCCCAACAACGCTTCACCCAGGTCTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGAACTTTTTCAAGGGGGCCCCAACTGGGGCCGCCTTGTAGCCTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGAACTTTTTCAAGGGGGCCCCAACTGGGGCCGCCTTGTAGCCTTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCTTTGGGGCTGCACTGTGTGCTGAGAGTGTCAACAAGGAGATGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCTTTGGGGCTGCACTGTGTGCTGAGAGTGTCAACAAGGAGATGGAACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTGGTGGGACAAGTGCAGGAGTGGATGGTGGCCTACCTGGAGACGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100351 ACTGGTGGGACAAGTGCAGGAGTGGATGGTGGCCTACCTGGAGACGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCTGACTGGATCCACAGCAGTGGGGGCTGG         GCGGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100401 TGGCTGACTGGATCCACAGCAGTGGGGGCTGGGTA...CAGGCGGAGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACAGCTCTATACGGGGACGGGGCCCTGGAGGAGGCGCGGCGTCTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101058 ACAGCTCTATACGGGGACGGGGCCCTGGAGGAGGCGCGGCGTCTGCGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGGAACTGGGCATCAGTGAGGACAGTGCTGACGGGGGCCGTGGCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101108 GGGGAACTGGGCATCAGTGAGGACAGTGCTGACGGGGGCCGTGGCACTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .
    542 GGGCCCTGGTAACTGTAGGGGCCTTTTTTGCTAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101158 GGGCCCTGGTAACTGTAGGGGCCTTTTTTGCTAGCAAG