seq1 = pF1KSDA0269.tfa, 1677 bp
seq2 = pF1KSDA0269/gi568815592r_110000525.tfa (gi568815592r:110000525_110227601), 227077 bp

>pF1KSDA0269 1677
>gi568815592r:110000525_110227601 (Chr6)

(complement)

1-133  (100001-100133)   100% ->
134-268  (114142-114276)   100% ->
269-422  (118921-119074)   100% ->
423-540  (120408-120525)   100% ->
541-713  (122023-122195)   100% ->
714-893  (124045-124224)   100% ->
894-1522  (125386-126014)   100% ->
1523-1677  (126923-127077)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTAGTGAAAAGAAACATCGATCCTAGGCACTTGTGCCACACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCTAGTGAAAAGAAACATCGATCCTAGGCACTTGTGCCACACAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTGCCTAGAGGCATTAAGAATGAACTGGAATGTGTAACCAATATTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTGCCTAGAGGCATTAAGAATGAACTGGAATGTGTAACCAATATTTCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCAAATATAATTAGACAACTAAGTAGCCTAA         GTAAATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100101 TGGCAAATATAATTAGACAACTAAGTAGCCTAAGTA...TAGGTAAATAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGAAGATATATTTGGAGAATTATTCAATGAAGCACATAGTTTTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114150 GCTGAAGATATATTTGGAGAATTATTCAATGAAGCACATAGTTTTTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGAGTCAACTCATTGCAAGAACGTGTGGACCGTTTATCTGTTAGTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114200 CAGAGTCAACTCATTGCAAGAACGTGTGGACCGTTTATCTGTTAGTGTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACAGCTTGATCCAAAGGAAGAAGAAT         TGTCTTTGCAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114250 CACAGCTTGATCCAAAGGAAGAAGAATGTA...TAGTGTCTTTGCAAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATAACAATGAGGAAAGCTTTCCGAAGTTCTACAATTCAAGACCAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118935 ATAACAATGAGGAAAGCTTTCCGAAGTTCTACAATTCAAGACCAGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTCGATCGCAAGACTTTGCCTATTCCATTACAGGAGACGTACGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118985 TTTCGATCGCAAGACTTTGCCTATTCCATTACAGGAGACGTACGATGTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGAACAGCCTCCACCTCTCAATATACTCACTCCTTATAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 119035 GTGAACAGCCTCCACCTCTCAATATACTCACTCCTTATAGGTA...CAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGATGGTAAAGAAGGTCTGAAGTTTTATACCAATCCTTCGTATTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120409 GATGATGGTAAAGAAGGTCTGAAGTTTTATACCAATCCTTCGTATTTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATCTATGGAAAGAAAAAATGTTGCAAGATACAGAGGATAAGAGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120459 TGATCTATGGAAAGAAAAAATGTTGCAAGATACAGAGGATAAGAGGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAAAGAGGAAGCAGAAG         CAGAAAAATCTAGATCGTCCTCAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 120509 AAAAGAGGAAGCAGAAGGTA...TAGCAGAAAAATCTAGATCGTCCTCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAACCAGAAAAAGTGCCAAGAGCACCTCATGACAGGCGGCGAGAATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122047 GAACCAGAAAAAGTGCCAAGAGCACCTCATGACAGGCGGCGAGAATGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAAGCTGGCCCAAGGTCCAGAGCTGGCTGAAGATGATGCTAATCTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122097 GAAGCTGGCCCAAGGTCCAGAGCTGGCTGAAGATGATGCTAATCTCTTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATAAGCATATTGAAGTTGCTAATGGCCCAGCCTCTCATTTTGAAACAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 122147 ATAAGCATATTGAAGTTGCTAATGGCCCAGCCTCTCATTTTGAAACAAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    714         ACCTCAGACATACGTGGATCATATGGATGGATCTTACTCACT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122197 TT...TAGACCTCAGACATACGTGGATCATATGGATGGATCTTACTCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTCTGCCTTGCCATTTAGTCAGATGAGTGAGCTTCTGACTAGAGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124087 TTCTGCCTTGCCATTTAGTCAGATGAGTGAGCTTCTGACTAGAGCTGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAAGGGTATTAGTCAGACCACATGAACCACCTCCACCTCCACCAATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124137 AAAGGGTATTAGTCAGACCACATGAACCACCTCCACCTCCACCAATGCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGAGCAGGAGATGCAAAACCGATACCCACCTGTATCAG         TTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 124187 GGAGCAGGAGATGCAAAACCGATACCCACCTGTATCAGGTA...CAGTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCTACAGGTTTGATAGAAAATCGCCCTCAGTCACCAGCTACAGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125389 TGCTACAGGTTTGATAGAAAATCGCCCTCAGTCACCAGCTACAGGCAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CACCTGTGTTTGTGAGCCCCACTCCCCCACCTCCTCCACCACCTCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125439 CACCTGTGTTTGTGAGCCCCACTCCCCCACCTCCTCCACCACCTCTTCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCTGCCTTGTCAACTTCCTCATTAAGAGCTTCAATGACTTCAACTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125489 TCTGCCTTGTCAACTTCCTCATTAAGAGCTTCAATGACTTCAACTCCTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCCTCCAGTACCTCCCCCACCTCCACCTCCAGCCACTGCTTTGCAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125539 CCCTCCAGTACCTCCCCCACCTCCACCTCCAGCCACTGCTTTGCAAGCTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CAGCAGTACCACCACCTCCAGCTCCTCTTCAGATTGCCCCTGGAGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125589 CAGCAGTACCACCACCTCCAGCTCCTCTTCAGATTGCCCCTGGAGTTCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CACCCAGCTCCTCCTCCAATTGCACCTCCTCTAGTACAGCCCTCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125639 CACCCAGCTCCTCCTCCAATTGCACCTCCTCTAGTACAGCCCTCTCCACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AGTAGCTAGAGCTGCCCCAGTATGTGAGACTGTACCAGTTCATCCACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125689 AGTAGCTAGAGCTGCCCCAGTATGTGAGACTGTACCAGTTCATCCACTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CACAAGGTGAAGTTCAGGGGCTGCCTCCACCCCCACCACCGCCTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125739 CACAAGGTGAAGTTCAGGGGCTGCCTCCACCCCCACCACCGCCTCCTCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCTCCACCTGGCATTCGACCATCATCACCTGTCACAGTTACAGCTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125789 CCTCCACCTGGCATTCGACCATCATCACCTGTCACAGTTACAGCTCTTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TCATCCTCCCTCTGGGCTACATCCAACTCCATCTACTGCCCCAGGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125839 TCATCCTCCCTCTGGGCTACATCCAACTCCATCTACTGCCCCAGGTCCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ATGTTCCATTAATGCCTCCATCTCCTCCATCACAAGTTATACCTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125889 ATGTTCCATTAATGCCTCCATCTCCTCCATCACAAGTTATACCTGCTTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GAGCCAAAGCGCCATCCATCAACCCTACCTGTAATCAGTGATGCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125939 GAGCCAAAGCGCCATCCATCAACCCTACCTGTAATCAGTGATGCCAGGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TGTGCTACTGGAAGCAATACGAAAAG         GTATTCAGCTACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 125989 TGTGCTACTGGAAGCAATACGAAAAGGTA...CAGGTATTCAGCTACGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 AAGTAGAAGAGCAGCGTGAACAGGAAGCTAAGCATGAACGCATTGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126938 AAGTAGAAGAGCAGCGTGAACAGGAAGCTAAGCATGAACGCATTGAAAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GATGTTGCCACCATCCTGTCTCGCCGTATTGCTGTTGAATATAGTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126988 GATGTTGCCACCATCCTGTCTCGCCGTATTGCTGTTGAATATAGTGATTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GGAAGATGATTCAGAATTTGATGAAGTAGATTGGTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127038 GGAAGATGATTCAGAATTTGATGAAGTAGATTGGTTGGAG