seq1 = pF1KSDA0250.tfa, 3273 bp
seq2 = pF1KSDA0250/gi568815597f_183415871.tfa (gi568815597f:183415871_183651928), 236058 bp

>pF1KSDA0250 3273
>gi568815597f:183415871_183651928 (Chr1)

1-29  (56751-56779)   100% ->
30-61  (96967-96998)   100% ->
62-179  (100004-100121)   100% ->
180-312  (101818-101950)   99% ->
313-484  (110726-110897)   100% ->
485-556  (112086-112157)   100% ->
557-707  (113022-113172)   100% ->
708-843  (113528-113663)   100% ->
844-1006  (117294-117456)   100% ->
1007-1163  (117806-117962)   100% ->
1164-1234  (121275-121345)   100% ->
1235-1295  (122510-122570)   100% ->
1296-1415  (125114-125233)   100% ->
1416-1704  (126206-126494)   100% ->
1705-1849  (128483-128627)   100% ->
1850-2232  (129060-129442)   100% ->
2233-2604  (130096-130467)   99% ->
2605-2685  (133338-133418)   100% ->
2686-2845  (133894-134053)   100% ->
2846-3016  (134881-135051)   100% ->
3017-3162  (135175-135320)   100% ->
3163-3273  (135948-136058)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCTGCAGAGCGCGCAGTACCTCCG         GCAGGCAGAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  56751 ATGAGCCTGCAGAGCGCGCAGTACCTCCGGTG...TAGGCAGGCAGAAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTGAAGGCTGACATGACAG         ATTCTAAGCTGGGTCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  96979 CCTGAAGGCTGACATGACAGGTA...CAGATTCTAAGCTGGGTCCAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 AAGTCTGGACATCCAGGCAGGCTCTGCAGGACCTGTACCAGAAAATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100025 AAGTCTGGACATCCAGGCAGGCTCTGCAGGACCTGTACCAGAAAATGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTTACCGATTTGGAATACGCTTTAGACAAGAAAGTAGAACAGGATCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100075 GTTACCGATTTGGAATACGCTTTAGACAAGAAAGTAGAACAGGATCTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    180       CTGGAATCACGCCTTTAAGAATCAGATCACAACACTACAAGGCC
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100125 ...CAGCTGGAATCACGCCTTTAAGAATCAGATCACAACACTGCAAGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGGCAAAGAATCGAGCAAATCCGAATCGGAGTGAAGTTCAGGCAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101862 AGGCAAAGAATCGAGCAAATCCGAATCGGAGTGAAGTTCAGGCAAACCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCTCTGTTCCTAGAGGCAGCTAGTGGCTTCTATACTCAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101912 TCTCTGTTCCTAGAGGCAGCTAGTGGCTTCTATACTCAGGTG...TAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ATTACAAGAACTGTGTACAGTATTTAATGTAGATTTACCATGCCGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110728 ATTACAAGAACTGTGTACAGTATTTAATGTAGATTTACCATGCCGTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGTCTTCCCAATTGGGAATTATCAGCAATAAACAGACGCATACCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110778 AGTCTTCCCAATTGGGAATTATCAGCAATAAACAGACGCATACCAGCGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATAGTGAAGCCACAGTCTAGCTCCTGTTCCTATATCTGCCAGCACTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110828 ATAGTGAAGCCACAGTCTAGCTCCTGTTCCTATATCTGCCAGCACTGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGTCCACCTTGGAGACATTG         CTCGATACAGAAACCAGACCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 110878 CGTCCACCTTGGAGACATTGGTG...TAGCTCGATACAGAAACCAGACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCCAGGCAGAGTCCTACTATAGGCATGCAGCTCAGCTTGTCCCCTCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112107 GCCAGGCAGAGTCCTACTATAGGCATGCAGCTCAGCTTGTCCCCTCCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 G         GTCAGCCTTATAATCAGTTGGCTATCTTAGCTTCTTCCAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112157 GGTG...TAGGTCAGCCTTATAATCAGTTGGCTATCTTAGCTTCTTCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGGAGACCATCTGACCACAATTTTCTACTACTGCAGAAGCATTGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113062 AGGAGACCATCTGACCACAATTTTCTACTACTGCAGAAGCATTGCTGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTTCCCTTTCCCAGCTGCCTCCACTAATCTGCAAAAAGCACTTTCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113112 AGTTCCCTTTCCCAGCTGCCTCCACTAATCTGCAAAAAGCACTTTCTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCACTGGAAAG         CCGAGATGAGGTGAAAACCAAGTGGGGTGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 113162 GCACTGGAAAGGTA...CAGCCGAGATGAGGTGAAAACCAAGTGGGGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTCTGACTTCATCAAGGCCTTTATTAAATTCCACGGTCATGTGTACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113558 TTCTGACTTCATCAAGGCCTTTATTAAATTCCACGGTCATGTGTACCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GTAAGAGCTTGGAAAAGTTGAGCCCTCTTCGAGAGAAATTGGAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113608 GTAAGAGCTTGGAAAAGTTGAGCCCTCTTCGAGAGAAATTGGAAGAACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTTAAG         AGGCTGCTATTCCAAAAAGCTTTCAACTCTCAGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113658 TTTAAGGTT...CAGAGGCTGCTATTCCAAAAAGCTTTCAACTCTCAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GTTAGTTCATGTCACTGTCATTAACCTGTTTCAACTTCATCACCTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117329 GTTAGTTCATGTCACTGTCATTAACCTGTTTCAACTTCATCACCTTCGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACTTTAGCAATGAAACCGAGCAGCACACTTATAGCCAAGATGAGCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117379 ACTTTAGCAATGAAACCGAGCAGCACACTTATAGCCAAGATGAGCAGCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGTTGGACACAGTTGCTGGCCCTCTTTA         TGTCTTTTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 117429 TGTTGGACACAGTTGCTGGCCCTCTTTAGTG...AAGTGTCTTTTCTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CATCCTGTGCAAGTGTCCTCTACAGAATGAGTCTCAGGAGGAGTCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117819 CATCCTGTGCAAGTGTCCTCTACAGAATGAGTCTCAGGAGGAGTCCTACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGCCTATCCTCTTCCAGCAGTCAAGGTCTCCATGGACTGGCTAAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117869 ATGCCTATCCTCTTCCAGCAGTCAAGGTCTCCATGGACTGGCTAAGACTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGACCCAGGGTCTTTCAGGAGGCAGTGGTGGATGAAAGACAGTA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 117919 AGACCCAGGGTCTTTCAGGAGGCAGTGGTGGATGAAAGACAGTAGTA...

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1164    CATTTGGCCCTGGTTGATTTCTCTTCTGAATAGTTTCCATCCCCATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121272 CAGCATTTGGCCCTGGTTGATTTCTCTTCTGAATAGTTTCCATCCCCATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAGAGGACCTCTCAAGTATTAGTG         CGACACCACTTCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 121322 AAGAGGACCTCTCAAGTATTAGTGGTA...TAGCGACACCACTTCCAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GAGTTTGAATTACAAGGATTTTTGGCATTGAGACCTTCTTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 122527 GAGTTTGAATTACAAGGATTTTTGGCATTGAGACCTTCTTTCAGGTA...

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1296    GAACTTGGATTTTTCCAAAGGTCACCAGGGTATTACAGGGGACAAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125111 TAGGAACTTGGATTTTTCCAAAGGTCACCAGGGTATTACAGGGGACAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AAGGCCAGCAACGACGAATACGACAGCAACGCTTGATCTCTATAGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125161 AAGGCCAGCAACGACGAATACGACAGCAACGCTTGATCTCTATAGGCAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TGGATTGCTGATAATCAGCCAAG         GCTGATTCAGTGTGAAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 125211 TGGATTGCTGATAATCAGCCAAGGTA...TAGGCTGATTCAGTGTGAAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 TGAGGTAGGGAAATTGTTGTTTATCACAGAAATCCCAGAATTAATACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126224 TGAGGTAGGGAAATTGTTGTTTATCACAGAAATCCCAGAATTAATACTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AAGACCCCAGTGAAGCCAAAGAGAACCTCATTCTGCAAGAAACATCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126274 AAGACCCCAGTGAAGCCAAAGAGAACCTCATTCTGCAAGAAACATCTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 ATAGAGTCGCTGGCTGCAGATGGGAGCCCAGGGCTAAAATCAGTGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126324 ATAGAGTCGCTGGCTGCAGATGGGAGCCCAGGGCTAAAATCAGTGCTATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TACAAGCCGAAATTTAAGCAACAACTGTGACACAGGAGAGAAGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126374 TACAAGCCGAAATTTAAGCAACAACTGTGACACAGGAGAGAAGCCAGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TTACCTTCAAAGAAAACATTAAGACACGAGAAGTGAACAGAGACCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126424 TTACCTTCAAAGAAAACATTAAGACACGAGAAGTGAACAGAGACCAAGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AGAAGTTTTCCTCCCAAAGAG         GTAAAATCCCAGACAGAACT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 126474 AGAAGTTTTCCTCCCAAAGAGGTG...CAGGTAAAATCCCAGACAGAACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 AAGAAAGACTCCAGTGTCTGAAGCCAGAAAAACACCTGTAACTCAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128503 AAGAAAGACTCCAGTGTCTGAAGCCAGAAAAACACCTGTAACTCAAACCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CAACTCAAGCAAGTAACTCCCAGTTCATCCCCATTCATCACCCTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128553 CAACTCAAGCAAGTAACTCCCAGTTCATCCCCATTCATCACCCTGGAGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TTCCCTCCTCTTCCCAGCAGGCCAG         GGTTTCCGCCCCCAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 128603 TTCCCTCCTCTTCCCAGCAGGCCAGGTA...AAGGGTTTCCGCCCCCAAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 ATATGTTATCCCCCCGCCTGTGGCATTTTCTATGGGCTCAGGTTACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129076 ATATGTTATCCCCCCGCCTGTGGCATTTTCTATGGGCTCAGGTTACACCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TCCCAGCTGGTGTTTCTGTCCCAGGAACCTTTCTTCAGCCTACAGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129126 TCCCAGCTGGTGTTTCTGTCCCAGGAACCTTTCTTCAGCCTACAGCTCAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TCTCCAGCAGGAAACCAGGTGCAAGCTGGGAAACAGTCCCACATTCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129176 TCTCCAGCAGGAAACCAGGTGCAAGCTGGGAAACAGTCCCACATTCCTTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CAGCCAGCAACGGCCCTCTGGACCAGGGCCAATGAACCAGGGACCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129226 CAGCCAGCAACGGCCCTCTGGACCAGGGCCAATGAACCAGGGACCTCAAC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AATCACAGCCACCTTCCCAGCAACCCCTTACATCTTTACCAGCTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129276 AATCACAGCCACCTTCCCAGCAACCCCTTACATCTTTACCAGCTCAGCCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 ACAGCACAGTCTACAAGCCAGCTGCAGGTTCAAGCTCTAACTCAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129326 ACAGCACAGTCTACAAGCCAGCTGCAGGTTCAAGCTCTAACTCAGCAACA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 ACAATCCCCTACAAAAGCTGTGCCGGCTTTGGGGAAAAGCCCGCCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129376 ACAATCCCCTACAAAAGCTGTGCCGGCTTTGGGGAAAAGCCCGCCTCACC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ACTCTGGATTCCAGCAG         TATCAACAGGCAGATGCCTCCAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 129426 ACTCTGGATTCCAGCAGGTA...TAGTATCAACAGGCAGATGCCTCCAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 CAGCTGTGGAATCCCCCTCAGGTTCAAGGCCCATTAGGGAAAATTATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130120 CAGCTGTGGAATCCCCCTCAGGTTCAAGGCCCATTAGGGAAAATTATGCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TGTGAAACAGCCCTACTACCTTCAGACCCAAGACCCCATAAAACTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130170 TGTGAAACAGCCCTACTACCTTCAGACCCAAGACCCCATAAAACTGTTTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 AGCCGTCATTGCAACCTCCTGTAATGCAGCAGCAGCCTCTAGAAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130220 AGCCGTCATTGCAACCTCCTGTAATGCAGCAGCAGCCTCTAGAAAAAAAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 ATGAAGCCTTTTCCCATGGAGCCATATAACCATAATCCCTCAGAAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130270 ATGAAGCCTTTTCCCATGGAGCCATATAACCATAATCCCTCAGAAGTCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GGTCCCAGAATTCTACTGGGATTCTTCCTACAGCATGGCTGATAACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130320 GGTCCCAGAATTCTACTGGGATTCTTCCTACAGCATGGCTGATAACAGAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CTGTAATGGCACAGCAAGCAAACATAGACCGCAGGGGCAAACGGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130370 CTGTAATGGCACAGCAAGCAAACATAGACCGCAGGGGCAAACGGTCACCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 GGAATCTTCCGTCCAGAGCAGGATCCTGTACCCAGAATGCCGTTTGAG  
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 130420 GGAGTCTTCCGTCCAGAGCAGGATCCTGTACCCAGAATGCCGTTTGAGGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2605        AAATCCTTATTGGAGAAGCCCTCAGAGCTCATGTCACATTCAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130470 G...AAGAAATCCTTATTGGAGAAGCCCTCAGAGCTCATGTCACATTCAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CCTCTTTCCTGTCCCTCACCGGATTCTCTCTCAATCAG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 133381 CCTCTTTCCTGTCCCTCACCGGATTCTCTCTCAATCAGGTA...CAGGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 AGATACCCAAATAATAGTATGTTCAATGAGGTATATGGGAAAAACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133897 AGATACCCAAATAATAGTATGTTCAATGAGGTATATGGGAAAAACCTGAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 ATCCAGCTCCAAAGCAGAACTCAGTCCCTCAATGGCCCCCCAGGAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133947 ATCCAGCTCCAAAGCAGAACTCAGTCCCTCAATGGCCCCCCAGGAAACAT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 CTCTGTATTCCCTTTTTGAAGGGACTCCGTGGTCTCCATCACTTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133997 CTCTGTATTCCCTTTTTGAAGGGACTCCGTGGTCTCCATCACTTCCTGCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 AGTTCAG         ATCATTCAACACCAGCCAGCCAGTCTCCTCATTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134047 AGTTCAGGTA...TAGATCATTCAACACCAGCCAGCCAGTCTCCTCATTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 CTCTAACCCAAGCAGCCTACCCAGCTCTCCTCCAACACACAACCATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134915 CTCTAACCCAAGCAGCCTACCCAGCTCTCCTCCAACACACAACCATAATT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 CTGTTCCATTCTCCAATTTTGGACCCATTGGGACTCCAGATAACAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134965 CTGTTCCATTCTCCAATTTTGGACCCATTGGGACTCCAGATAACAGGGAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 AGAAGGACTGCAGATCGGTGGAAAACTGATAAGCCAG         CCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 135015 AGAAGGACTGCAGATCGGTGGAAAACTGATAAGCCAGGTG...TAGCCAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 GGGTGGGTTTGGCATTGATTATCTCTCAGCAACGTCATCCTCTGAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135179 GGGTGGGTTTGGCATTGATTATCTCTCAGCAACGTCATCCTCTGAGAGCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 GTTGGCATCAGGCCAGCACTCCGAGTGGCACCTGGACAGGCCATGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135229 GTTGGCATCAGGCCAGCACTCCGAGTGGCACCTGGACAGGCCATGGCCCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 TCCATGGAGGATTCCTCTGCTGTCCTCATGGAAAGCCTAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 135279 TCCATGGAGGATTCCTCTGCTGTCCTCATGGAAAGCCTAAAGGTG...CA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3163  TCTATCTGGTCCAGTTCCATGATGCATCCTGGACCTTCTGCTCTGGAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135947 GTCTATCTGGTCCAGTTCCATGATGCATCCTGGACCTTCTGCTCTGGAGC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3212 AGCTGTTAATGCAGCAGAAGCAGAAACAGCAACGGGGACAAGGCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135997 AGCTGTTAATGCAGCAGAAGCAGAAACAGCAACGGGGACAAGGCACCATG

   3450     .    :
   3262 AACCCTCCACAC
        ||||||||||||
 136047 AACCCTCCACAC