seq1 = pF1KSDA0235.tfa, 3192 bp
seq2 = pF1KSDA0235/gi568815596r_20151588.tfa (gi568815596r:20151588_20427360), 275773 bp
>pF1KSDA0235 3192
>gi568815596r:20151588_20427360 (Chr2)
(complement)
1-51 (100001-100051) 100% ->
52-160 (108716-108824) 100% ->
161-348 (114938-115125) 100% ->
349-518 (115698-115867) 99% ->
519-789 (118777-119047) 100% ->
790-883 (119290-119383) 100% ->
884-1009 (129683-129808) 100% ->
1010-1152 (132843-132985) 100% ->
1153-1291 (136571-136709) 100% ->
1292-1435 (143875-144018) 100% ->
1436-1720 (144130-144414) 100% ->
1721-1957 (148542-148778) 100% ->
1958-2225 (163901-164168) 100% ->
2226-2355 (166895-167024) 100% ->
2356-2484 (168990-169118) 100% ->
2485-2622 (171191-171328) 100% ->
2623-2748 (172020-172145) 100% ->
2749-2870 (172377-172498) 100% ->
2871-3063 (173347-173539) 100% ->
3064-3192 (175645-175773) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAATCATGATTTTCAAGCTCTTGCATTAGAATCTCGGGGAATGGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAATCATGATTTTCAAGCTCTTGCATTAGAATCTCGGGGAATGGGAGA
50 . : . : . : . : . :
51 G CTTTTGCCTACCAAAAAGTTTTGGGAACCTGATGATTCAA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGTA...TAGCTTTTGCCTACCAAAAAGTTTTGGGAACCTGATGATTCAA
100 . : . : . : . : . :
92 CAAAAGATGGACAAAAAGGCATATTTCTTGGGGATGATGAATGGAGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108756 CAAAAGATGGACAAAAAGGCATATTTCTTGGGGATGATGAATGGAGAGAG
150 . : . : . : . : . :
142 ACTGCATGGGGAGCTTCTC ACCATTCAATGTCCCAGCCTAT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
108806 ACTGCATGGGGAGCTTCTCGTA...CAGACCATTCAATGTCCCAGCCTAT
200 . : . : . : . : . :
183 TATGGTACAGAGAAGATCTGGACAGGGTTTTCATGGAAACAGTGAAGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114960 TATGGTACAGAGAAGATCTGGACAGGGTTTTCATGGAAACAGTGAAGTAA
250 . : . : . : . : . :
233 ATGCAATACTGTCTCCGCGATCAGAAAGTGGAGGCCTTGGTGTGAGCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115010 ATGCAATACTGTCTCCGCGATCAGAAAGTGGAGGCCTTGGTGTGAGCATG
300 . : . : . : . : . :
283 GTAGAATATGTATTAAGTTCTTCTCCTGCTGATAAATTGGATTCTCGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115060 GTAGAATATGTATTAAGTTCTTCTCCTGCTGATAAATTGGATTCTCGATT
350 . : . : . : . : . :
333 TAGGAAGGGAAATTTT GGCACTAGAGATGCTGAAACAGATG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
115110 TAGGAAGGGAAATTTTGTA...CAGGGCACTAGAGATGCTGAAACAGATG
400 . : . : . : . : . :
374 GACCTGAGAAAGGAGATCAAAAAGGCAAGGCTTCTCCATTTGAGGAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115723 GACCTGAGAAAGGAGATCAAAAAGGCAAGGCTTCTCCATTTGAGGAGGAC
450 . : . : . : . : . :
424 CAAAACAGAGACCTTAAACAAGGAGATGATGATGATTCTAAAATAAATGG
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115773 CAAAACAGAGATCTTAAACAAGGAGATGATGATGATTCTAAAATAAATGG
500 . : . : . : . : . :
474 CAGAGGTTTGCCAAATGGAATGGATGCCGATTGCAAAGATTTTAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
115823 CAGAGGTTTGCCAAATGGAATGGATGCCGATTGCAAAGATTTTAAGTA..
550 . : . : . : . : . :
519 TCGTACTCCTGGAAGTCGTCAAGCCTCTCCAACTGAAGTAGTTGAG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115873 .TAGTCGTACTCCTGGAAGTCGTCAAGCCTCTCCAACTGAAGTAGTTGAG
600 . : . : . : . : . :
565 CGCTTGGGCCCCAATACTAATCCCTCAGAAGGACTGGGGCCTCTTCCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118823 CGCTTGGGCCCCAATACTAATCCCTCAGAAGGACTGGGGCCTCTTCCTAA
650 . : . : . : . : . :
615 TCCTACAGCTAATAAACCACTTGTTGAAGAATTTTCAAATCCTGAAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118873 TCCTACAGCTAATAAACCACTTGTTGAAGAATTTTCAAATCCTGAAACTC
700 . : . : . : . : . :
665 AGAATCTGGATGCCATGGAACAAGTTGGTCTGGAATCCTTACAGTTTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118923 AGAATCTGGATGCCATGGAACAAGTTGGTCTGGAATCCTTACAGTTTGAC
750 . : . : . : . : . :
715 TATCCTGGTAATCAGGTACCAATGGACTCTTCAGGAGCTACTGTAGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118973 TATCCTGGTAATCAGGTACCAATGGACTCTTCAGGAGCTACTGTAGGCCT
800 . : . : . : . : . :
765 TTTTGACTACAATTCCCAGCAGCAG CTCTTTCAGAGGACTA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
119023 TTTTGACTACAATTCCCAGCAGCAGGTA...TAGCTCTTTCAGAGGACTA
850 . : . : . : . : . :
806 ATGCACTAACAGTTCAACAGTTAACTGCAGCTCAACAGCAGCAATATGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119306 ATGCACTAACAGTTCAACAGTTAACTGCAGCTCAACAGCAGCAATATGCA
900 . : . : . : . : . :
856 TTAGCAGCAGCTCAGCAGCCACATATAG CTGGTGTATTCTC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
119356 TTAGCAGCAGCTCAGCAGCCACATATAGGTG...TAGCTGGTGTATTCTC
950 . : . : . : . : . :
897 AGCAGGCCTTGCTCCAGCTGCATTTGTGCCAAATCCATACATTATTAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129696 AGCAGGCCTTGCTCCAGCTGCATTTGTGCCAAATCCATACATTATTAGTG
1000 . : . : . : . : . :
947 CTGCTCCTCCAGGGACCGATCCGTATACTGCAGCAGGATTGGCTGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129746 CTGCTCCTCCAGGGACCGATCCGTATACTGCAGCAGGATTGGCTGCAGCA
1050 . : . : . : . : . :
997 GCTACATTAGCAG GTCCAGCAGTGGTTCCACCTCAGTATTA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
129796 GCTACATTAGCAGGTA...TAGGTCCAGCAGTGGTTCCACCTCAGTATTA
1100 . : . : . : . : . :
1038 CGGCGTTCCATGGGGGGTGTATCCAGCCAACTTATTTCAGCAGCAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132871 CGGCGTTCCATGGGGGGTGTATCCAGCCAACTTATTTCAGCAGCAAGCTG
1150 . : . : . : . : . :
1088 CAGCTGCGGCAAATAACACAGCCAGTCAGCAAGCAGCATCACAAGCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132921 CAGCTGCGGCAAATAACACAGCCAGTCAGCAAGCAGCATCACAAGCTCAG
1200 . : . : . : . : . :
1138 CCTGGACAGCAACAG GTTCTCCGTGCTGGAGCAGGTCAGCG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
132971 CCTGGACAGCAACAGGTA...TAGGTTCTCCGTGCTGGAGCAGGTCAGCG
1250 . : . : . : . : . :
1179 TCCTCTTACTCCCAATCAGGGTCAGCAAGGGCAGCAAGCAGAATCACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136597 TCCTCTTACTCCCAATCAGGGTCAGCAAGGGCAGCAAGCAGAATCACTTG
1300 . : . : . : . : . :
1229 CGGCAGCTGCAGCAGCAAATCCAACATTGGCTTTTGGTCAGGGTCTTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136647 CGGCAGCTGCAGCAGCAAATCCAACATTGGCTTTTGGTCAGGGTCTTGCT
1350 . : . : . : . : . :
1279 ACTGGCATGCCAG GCTATCAAGTACTAGCTCCAACTGCCTA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
136697 ACTGGCATGCCAGGTA...TAGGCTATCAAGTACTAGCTCCAACTGCCTA
1400 . : . : . : . : . :
1320 TTATGATCAGACTGGTGCCTTAGTGGTTGGCCCTGGAGCAAGGACTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143903 TTATGATCAGACTGGTGCCTTAGTGGTTGGCCCTGGAGCAAGGACTGGCC
1450 . : . : . : . : . :
1370 TTGGAGCTCCAGTTCGGTTAATGGCTCCAACACCTGTTTTAATTAGTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143953 TTGGAGCTCCAGTTCGGTTAATGGCTCCAACACCTGTTTTAATTAGTTCA
1500 . : . : . : . : . :
1420 GCAGCAGCACAAGCTG CAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGGAAC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
144003 GCAGCAGCACAAGCTGGTA...CAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGGAGGAAC
1550 . : . : . : . : . :
1461 TGCAAGTAGCCTTACAGGCAGCACAAATGGTCTGTTTCGGCCAATTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144155 TGCAAGTAGCCTTACAGGCAGCACAAATGGTCTGTTTCGGCCAATTGGCA
1600 . : . : . : . : . :
1511 CTCAGCCACCACAGCAGCAGCAACAGCAGCCAAGCACTAATCTGCAATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144205 CTCAGCCACCACAGCAGCAGCAACAGCAGCCAAGCACTAATCTGCAATCT
1650 . : . : . : . : . :
1561 AATTCATTTTATGGAAGCAGTTCTTTGACTAATAGCTCCCAGAGTAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144255 AATTCATTTTATGGAAGCAGTTCTTTGACTAATAGCTCCCAGAGTAGTTC
1700 . : . : . : . : . :
1611 TTTATTTTCTCATGGACCTGGTCAACCTGGAAGTACATCTCTTGGCTTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144305 TTTATTTTCTCATGGACCTGGTCAACCTGGAAGTACATCTCTTGGCTTTG
1750 . : . : . : . : . :
1661 GAAGTGGTAACTCTTTGGGTGCTGCTATAGGCTCAGCCCTCAGTGGATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144355 GAAGTGGTAACTCTTTGGGTGCTGCTATAGGCTCAGCCCTCAGTGGATTT
1800 . : . : . : . : . :
1711 GGTTCATCAG TTGGCAGTTCTGCAAGTAGTAGTGCCACAAG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
144405 GGTTCATCAGGTA...CAGTTGGCAGTTCTGCAAGTAGTAGTGCCACAAG
1850 . : . : . : . : . :
1752 GAGAGAGTCTCTATCTACTAGCTCTGACTTGTACAAAAGATCTAGTAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148573 GAGAGAGTCTCTATCTACTAGCTCTGACTTGTACAAAAGATCTAGTAGCA
1900 . : . : . : . : . :
1802 GCCTAGCACCCATAGGGCAACCATTTTACAATAGTCTGGGATTTTCCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148623 GCCTAGCACCCATAGGGCAACCATTTTACAATAGTCTGGGATTTTCCTCC
1950 . : . : . : . : . :
1852 TCTCCAAGTCCAATAGGCATGCCTCTGCCAAGCCAAACTCCAGGACATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148673 TCTCCAAGTCCAATAGGCATGCCTCTGCCAAGCCAAACTCCAGGACATTC
2000 . : . : . : . : . :
1902 ACTTACGCCACCGCCATCACTTTCATCACATGGATCCTCATCCAGTTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148723 ACTTACGCCACCGCCATCACTTTCATCACATGGATCCTCATCCAGTTTGC
2050 . : . : . : . : . :
1952 ATTTAG GAGGACTGACAAATGGTAGTGGTCGATATATCTCT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
148773 ATTTAGGTA...TAGGAGGACTGACAAATGGTAGTGGTCGATATATCTCT
2100 . : . : . : . : . :
1993 GCAGCACCTGGAGCAGAAGCAAAATATCGAAGTGCTTCAAGCACTTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163936 GCAGCACCTGGAGCAGAAGCAAAATATCGAAGTGCTTCAAGCACTTCCAG
2150 . : . : . : . : . :
2043 TCTATTTAGCTCCAGCAGCCAGCTCTTTCCTCCTTCCCGGCTTCGGTATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
163986 TCTATTTAGCTCCAGCAGCCAGCTCTTTCCTCCTTCCCGGCTTCGGTATA
2200 . : . : . : . : . :
2093 ATAGGTCTGATATTATGCCTTCTGGCCGCAGTAGATTATTGGAAGATTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164036 ATAGGTCTGATATTATGCCTTCTGGCCGCAGTAGATTATTGGAAGATTTC
2250 . : . : . : . : . :
2143 AGAAACAACCGCTTCCCAAACCTTCAGCTTAGAGACTTGATTGGACATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
164086 AGAAACAACCGCTTCCCAAACCTTCAGCTTAGAGACTTGATTGGACATAT
2300 . : . : . : . : . :
2193 AGTTGAGTTTTCTCAAGACCAGCATGGTTCTAG ATTCATAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
164136 AGTTGAGTTTTCTCAAGACCAGCATGGTTCTAGGTA...TAGATTCATAC
2350 . : . : . : . : . :
2234 AGCAAAAACTAGAGAGAGCTACTCCAGCTGAGCGACAGATGGTATTTAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166903 AGCAAAAACTAGAGAGAGCTACTCCAGCTGAGCGACAGATGGTATTTAAT
2400 . : . : . : . : . :
2284 GAAATTCTGCAAGCAGCCTATCAATTAATGACTGATGTTTTTGGCAACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166953 GAAATTCTGCAAGCAGCCTATCAATTAATGACTGATGTTTTTGGCAACTA
2450 . : . : . : . : . :
2334 TGTTATACAGAAGTTTTTTGAG TTTGGGAGTCTGGATCAAA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
167003 TGTTATACAGAAGTTTTTTGAGGTA...CAGTTTGGGAGTCTGGATCAAA
2500 . : . : . : . : . :
2375 AATTAGCCCTGGCTACTCGTATTCGTGGTCATGTTCTACCCTTAGCCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169009 AATTAGCCCTGGCTACTCGTATTCGTGGTCATGTTCTACCCTTAGCCTTG
2550 . : . : . : . : . :
2425 CAGATGTATGGCTGCCGCGTTATTCAGAAAGCATTAGAATCTATTTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169059 CAGATGTATGGCTGCCGCGTTATTCAGAAAGCATTAGAATCTATTTCTTC
2600 . : . : . : . : . :
2475 TGACCAGCAG AGTGAAATGGTAAAGGAGCTGGATGGTCATG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
169109 TGACCAGCAGGTA...CAGAGTGAAATGGTAAAGGAGCTGGATGGTCATG
2650 . : . : . : . : . :
2516 TGCTCAAATGTGTGAAAGATCAGAATGGAAACCATGTTGTACAAAAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171222 TGCTCAAATGTGTGAAAGATCAGAATGGAAACCATGTTGTACAAAAATGT
2700 . : . : . : . : . :
2566 ATCGAATGTGTTCAGCCACAGTCACTACAGTTCATCATTGATGCTTTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171272 ATCGAATGTGTTCAGCCACAGTCACTACAGTTCATCATTGATGCTTTCAA
2750 . : . : . : . : . :
2616 GGGACAA GTATTTGTGCTTTCAACTCATCCTTATGGCTGCA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
171322 GGGACAAGTA...CAGGTATTTGTGCTTTCAACTCATCCTTATGGCTGCA
2800 . : . : . : . : . :
2657 GAGTAATTCAGCGCATCCTAGAGCATTGCACTGCAGAACAGACCTTACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172054 GAGTAATTCAGCGCATCCTAGAGCATTGCACTGCAGAACAGACCTTACCT
2850 . : . : . : . : . :
2707 ATCTTAGAAGAACTCCACCAACATACAGAGCAGTTGGTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
172104 ATCTTAGAAGAACTCCACCAACATACAGAGCAGTTGGTACAGGTA...TA
2900 . : . : . : . : . :
2749 GATCAGTATGGCAATTATGTTATTCAGCATGTACTGGAACACGGTCGAC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172376 GGATCAGTATGGCAATTATGTTATTCAGCATGTACTGGAACACGGTCGAC
2950 . : . : . : . : . :
2798 CTGAAGACAAGAGCAAAATTGTTTCCGAAATCAGGGGAAAGGTTTTAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172426 CTGAAGACAAGAGCAAAATTGTTTCCGAAATCAGGGGAAAGGTTTTAGCC
3000 . : . : . : . : . :
2848 CTGAGTCAACACAAATTTGCCAG CAATGTAGTAGAAAAGTG
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
172476 CTGAGTCAACACAAATTTGCCAGGTA...TAGCAATGTAGTAGAAAAGTG
3050 . : . : . : . : . :
2889 TGTTACTCATGCCTCCCGTGCTGAGAGAGCTTTACTGATTGACGAGGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173365 TGTTACTCATGCCTCCCGTGCTGAGAGAGCTTTACTGATTGACGAGGTTT
3100 . : . : . : . : . :
2939 GCTGCCAGAATGATGGTCCTCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173415 GCTGCCAGAATGATGGTCCTCACAGTGCCTTATACACCATGATGAAGGAC
3150 . : . : . : . : . :
2989 CAGTATGCCAATTACGTGGTTCAAAAGATGATTGATATGGCTGAACCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173465 CAGTATGCCAATTACGTGGTTCAAAAGATGATTGATATGGCTGAACCTGC
3200 . : . : . : . : . :
3039 TCAGAGAAAGATAATCATGCACAAG ATTCGACCTCACATTA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
173515 TCAGAGAAAGATAATCATGCACAAGGTA...CAGATTCGACCTCACATTA
3250 . : . : . : . : . :
3080 CTACTTTGCGCAAATACACATACGGGAAGCATATACTGGCCAAGTTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175661 CTACTTTGCGCAAATACACATACGGGAAGCATATACTGGCCAAGTTGGAA
3300 . : . : . : . : . :
3130 AAGTATTATTTGAAGAATAGCCCGGACCTAGGACCTATTGGAGGACCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175711 AAGTATTATTTGAAGAATAGCCCGGACCTAGGACCTATTGGAGGACCACC
3350 . :
3180 AAATGGAATGCTG
|||||||||||||
175761 AAATGGAATGCTG