seq1 = pF1KSDA0217.tfa, 2214 bp
seq2 = pF1KSDA0217/gi568815588r_712929.tfa (gi568815588r:712929_985721), 272793 bp

>pF1KSDA0217 2214
>gi568815588r:712929_985721 (Chr10)

(complement)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-141  (101216-101275)   100% ->
142-289  (121452-121599)   100% ->
290-430  (121839-121979)   100% ->
431-509  (140667-140745)   100% ->
510-646  (142654-142790)   100% ->
647-750  (149216-149319)   100% ->
751-861  (154745-154855)   100% ->
862-915  (155988-156041)   100% ->
916-1125  (156128-156337)   100% ->
1126-1232  (159852-159958)   100% ->
1233-1484  (160406-160657)   100% ->
1485-1530  (164877-164922)   100% ->
1531-1695  (167833-167997)   100% ->
1696-1820  (170652-170776)   100% ->
1821-1929  (170872-170980)   100% ->
1930-2214  (172509-172793)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTCTGATCAGGACGCTAAGGTTGTGGCTGAACCGCAGACGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTCTGATCAGGACGCTAAGGTTGTGGCTGAACCGCAGACGCAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCCAGGAGGGCAAGGACAGCGCTCATCTG         ATGAATGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 AGTCCAGGAGGGCAAGGACAGCGCTCATCTGGTG...CAGATGAATGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTATATCTCAAACCACTTCTCAGACAAGTTCCATCCCACCTTTGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101226 CTATATCTCAAACCACTTCTCAGACAAGTTCCATCCCACCTTTGAGTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          GTACCAGCAACTAAGGTTTCAGAGCTGAACCCTAATGCAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101276 GTA...TAGGTACCAGCAACTAAGGTTTCAGAGCTGAACCCTAATGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGTGTGGGGGGCTCCTGTGTTACATCTGGAAGCAAGCAGTGCTGCTGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121493 AGTGTGGGGGGCTCCTGTGTTACATCTGGAAGCAAGCAGTGCTGCTGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGTGAGTGCTGCATGGGAGGAGGTGGCTGGCCACCACGCAGACCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121543 GTGTGAGTGCTGCATGGGAGGAGGTGGCTGGCCACCACGCAGACCGTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCGCAGG         GATCGGATGCCAATGGTGATGGTGACCAGGGCCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121593 CCGCAGGGTA...TAGGATCGGATGCCAATGGTGATGGTGACCAGGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGAATGCCGCATTGCCAGACCCGCAGGAGTCGGACCCAGCAGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121873 TGAGAATGCCGCATTGCCAGACCCGCAGGAGTCGGACCCAGCAGACATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGCTCTCGCTCTGGGTCCCTCAGAATATGACTCTCTGCCTGAAAATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121923 ACGCTCTCGCTCTGGGTCCCTCAGAATATGACTCTCTGCCTGAAAATAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGACAG         GAGGAAATGAGTCTCAACCAGACAGCCAGGAAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121973 GAGACAGGTA...TAGGAGGAAATGAGTCTCAACCAGACAGCCAGGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCCCCGAGAAGTACTTAAAAAAACATTGGAATTCTGCTTATCTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 140701 CCCCCGAGAAGTACTTAAAAAAACATTGGAATTCTGCTTATCTAGGTA..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    510     GGAGAACCTTGCTAGTGACATGTATCTTATATCACAGATGGATAGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140751 .CAGGGAGAACCTTGCTAGTGACATGTATCTTATATCACAGATGGATAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACCAGTATGTGCCAATCACAACGGTGGCTAACCTCGACCACATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142700 GACCAGTATGTGCCAATCACAACGGTGGCTAACCTCGACCACATCAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCTCAGCACTGATGTGGACTTGATTGTGGAAGTGCTAAGAT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 142750 GCTCAGCACTGATGTGGACTTGATTGTGGAAGTGCTAAGATGTA...TAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTTTACCTTTAGTCCAAGTGGATGAAAAGGGAGAAAAAGTAAGGCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149216 CTTTACCTTTAGTCCAAGTGGATGAAAAGGGAGAAAAAGTAAGGCCAAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAAAATCGCTGCATAGTAATATTGCGTGAAATATCTGAATCTACCCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149266 CAAAATCGCTGCATAGTAATATTGCGTGAAATATCTGAATCTACCCCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGAA         GAAGTAGAAGCACTATTTAAAGGAGATAATTTACCAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149316 GGAAGTA...TAGGAAGTAGAAGCACTATTTAAAGGAGATAATTTACCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AATTTATAAACTGTGAATTTGCATATAATGATAATTGGTTTATTACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154782 AATTTATAAACTGTGAATTTGCATATAATGATAATTGGTTTATTACATTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAAACAGAAGCTGATGCACAACAG         GCTTACAAATACCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 154832 GAAACAGAAGCTGATGCACAACAGGTA...TAGGCTTACAAATACCTTCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGAAGAAGTCAAAACTTTTCAAGGAAAACCAATTAAG         GCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 156005 AGAAGAAGTCAAAACTTTTCAAGGAAAACCAATTAAGGTA...CAGGCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GGATAAAAGCAAAGGCAATAGCTATAAACACATTTTTGCCAAAGAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156132 GGATAAAAGCAAAGGCAATAGCTATAAACACATTTTTGCCAAAGAATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTTAGACCCCTGGACGTGAGCCTGTATGCCCAGCAGCGCTACGCGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156182 TTTAGACCCCTGGACGTGAGCCTGTATGCCCAGCAGCGCTACGCGACGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTTCTACTTCCCTCCCATGTACAGCCCCCAGCAGCAGTTCCCCCTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156232 GTTCTACTTCCCTCCCATGTACAGCCCCCAGCAGCAGTTCCCCCTGTACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCCTGATCACTCCCCAGACGTGGTCAGCAACGCACAGCTATCTTGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156282 GCCTGATCACTCCCCAGACGTGGTCAGCAACGCACAGCTATCTTGACCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CCCTTG         GTAACTCCATTTCCAAATACTGGATTTATAAATGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156332 CCCTTGGTA...TAGGTAACTCCATTTCCAAATACTGGATTTATAAATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GTTTACGTCTCCAGCGTTCAAGCCTGCGGCGTCTCCTCTGACTTCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159887 GTTTACGTCTCCAGCGTTCAAGCCTGCGGCGTCTCCTCTGACTTCTCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GACAGTATCCTCCTCGAAGCAG         GAATCCTAGTAAATCTCAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 159937 GACAGTATCCTCCTCGAAGCAGGCA...CAGGAATCCTAGTAAATCTCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CTGCGGCATGCGATTCCTAGTGCAGAGAGGGGACCTGGGTTATTAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160425 CTGCGGCATGCGATTCCTAGTGCAGAGAGGGGACCTGGGTTATTAGAAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TCCTTCAATATTTAACTTCACTGCAGATCGATTAATTAATGGTGTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160475 TCCTTCAATATTTAACTTCACTGCAGATCGATTAATTAATGGTGTCCGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GTCCACAAACAAGGCAAGCAGGTCAAACTAGAACACGGATTCAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160525 GTCCACAAACAAGGCAAGCAGGTCAAACTAGAACACGGATTCAAAACCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TCAGCATATGCCAAGAGAGAGGCTGGGCCTGGGCGTGTGGAGCCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160575 TCAGCATATGCCAAGAGAGAGGCTGGGCCTGGGCGTGTGGAGCCAGGCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TCTCGAATCCTCTCCTGGTTTAGGGAGGGGAAG         GAAGAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 160625 TCTCGAATCCTCTCCTGGTTTAGGGAGGGGAAGGTG...TAGGAAGAATT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCTTTGGCTACCGGAAGAAAAGGGAGGAGAAGTTTACA         AGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 164885 CCTTTGGCTACCGGAAGAAAAGGGAGGAGAAGTTTACAGTG...CAGAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AGCCAGACACAGTCTCCAACGCCACCAAAGCCTCCGTCGCCAAGCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167836 AGCCAGACACAGTCTCCAACGCCACCAAAGCCTCCGTCGCCAAGCTTCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GCTGGGGCTGTCCAGCTTCCCTCCATTACCTGGAGCTGCCGGCAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167886 GCTGGGGCTGTCCAGCTTCCCTCCATTACCTGGAGCTGCCGGCAATTTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AGACAGAGGACTTGTTTGAAAACAGGCTATCTAGCTTGATAATAGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167936 AGACAGAGGACTTGTTTGAAAACAGGCTATCTAGCTTGATAATAGGACCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TCCAAAGAAAGG         ACCCTCAGTGCAGACGCAAGCGTGAACAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 167986 TCCAAAGAAAGGGTA...CAGACCCTCAGTGCAGACGCAAGCGTGAACAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CCTTCCTGTAGTGGTCTCCAGAGAGCCCTCGGTGCCGGCTTCTTGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170681 CCTTCCTGTAGTGGTCTCCAGAGAGCCCTCGGTGCCGGCTTCTTGTGCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TATCAGCAACGTACGAGCGATCCCCCTCCCCAGCTCATTTACCCGA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 170731 TATCAGCAACGTACGAGCGATCCCCCTCCCCAGCTCATTTACCCGAGTG.

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1821      TGATCCCAAGGTGGCGGAGAAACAGAGGGAAACCCACAGTGTGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170781 ..CAGTGATCCCAAGGTGGCGGAGAAACAGAGGGAAACCCACAGTGTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CAGACTTCCTTCCGCCCTCACTGCGACCGCGTGTAAATCGGTGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170917 CAGACTTCCTTCCGCCCTCACTGCGACCGCGTGTAAATCGGTGCAGGTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ACGGAGCCGCCACG         GAATTGCGAAAGCCCAGCTACGCAGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 170967 ACGGAGCCGCCACGGTA...CAGGAATTGCGAAAGCCCAGCTACGCAGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 ATTTGTCAGAGAACGAGTAAAGAGCCTCCTTCTTCCCCATTGCAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172536 ATTTGTCAGAGAACGAGTAAAGAGCCTCCTTCTTCCCCATTGCAACCCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 AAAAGAACAAAAGCCAAACACTGTTGGTTGTGGGAAGGAGGAAAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172586 AAAAGAACAAAAGCCAAACACTGTTGGTTGTGGGAAGGAGGAAAAGAAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGGCAGAGCCCGCAGAGAGATACCGGGAGCCCCCAGCCCTCAAGTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172636 TGGCAGAGCCCGCAGAGAGATACCGGGAGCCCCCAGCCCTCAAGTCCACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 CCTGGAGCCCCCAGAGACCAGAGGCGGCCGGCGGGGGGCCGGCCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172686 CCTGGAGCCCCCAGAGACCAGAGGCGGCCGGCGGGGGGCCGGCCCTCGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CTCGGCCATGGGGAAGCGTCTCAGCCGAGAGCAGAGCACTCCCCCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172736 CTCGGCCATGGGGAAGCGTCTCAGCCGAGAGCAGAGCACTCCCCCCAAGT

   2350     .
   2207 CTCCTCAG
        ||||||||
 172786 CTCCTCAG