seq1 = pF1KSDA0207.tfa, 1764 bp
seq2 = pF1KSDA0207/gi568815591r_50492955.tfa (gi568815591r:50492955_50803910), 310956 bp

>pF1KSDA0207 1764
>gi568815591r:50492955_50803910 (Chr7)

(complement)

1-33  (93004-93036)   100% ->
34-121  (100003-100090)   100% ->
122-344  (129253-129475)   100% ->
345-486  (134048-134189)   99% ->
487-643  (176933-177089)   100% ->
644-759  (184626-184741)   100% ->
760-828  (185772-185840)   100% ->
829-966  (187564-187701)   100% ->
967-1077  (189031-189141)   100% ->
1078-1176  (191072-191170)   100% ->
1177-1254  (197497-197574)   100% ->
1255-1371  (198505-198621)   99% ->
1372-1438  (199534-199600)   100% ->
1439-1526  (199826-199913)   100% ->
1527-1620  (208381-208474)   100% ->
1621-1764  (210813-210956)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAGCTGCCGGCCCTCTGTTCCGTAGTAAG         GACAAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  93004 ATGCAAGCTGCCGGCCCTCTGTTCCGTAGTAAGGTC...TAGGACAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGAGCAGACACCTCGCAGTCAACAAGACCCGGCAGGACCAGGACTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 GGAGCAGACACCTCGCAGTCAACAAGACCCGGCAGGACCAGGACTCCCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACAGTCTGACCGACTTGCGAATCACCAGG         AGGATGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100061 CACAGTCTGACCGACTTGCGAATCACCAGGGTA...CAGAGGATGATGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GACCTGGAAGCCCTGGTGAACGATATGAATGCATCCCTGGAGAGCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129264 GACCTGGAAGCCCTGGTGAACGATATGAATGCATCCCTGGAGAGCCTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTCGGCCTGCAGCATGCAGTCAGACACGGTGCCCCTCCTGCAGAATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129314 CTCGGCCTGCAGCATGCAGTCAGACACGGTGCCCCTCCTGCAGAATGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCATGCCCGCAGCCAGCCTCGGGCTTCAGGCCCTCCTCGGTCCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129364 AGCATGCCCGCAGCCAGCCTCGGGCTTCAGGCCCTCCTCGGTCCATCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCACAGGTGTCCCCGAGGCAGAGGGTGCAGCGCTCCCAGCCTGTGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129414 CCACAGGTGTCCCCGAGGCAGAGGGTGCAGCGCTCCCAGCCTGTGCACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCGCTGTCAG         GCGCCTTCAGGAGGAAGACCAGCAGTTTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 129464 CCTCGCTGTCAGGTA...CAGGCGCCTTCAGGAGGAAGACCAGCAGTTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAACCTCATCTCTGCCGGCCATCCCCAATCCTTTTCCTGAACTCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134077 GAACCTCATCTCTGCCGGCCATCCCCAATCCTTTTCCTGAACTCTGTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTGGGAGCCCCGCTGTGCTCACGCCGGGTTCTTTACCTCCGAGCCAGGC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134127 CCTGGGAGCCCCCCTGTGCTCACGCCGGGTTCTTTACCTCCGAGCCAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGCCGCAAAGCAG         GATGTTAAAGTCTTTAGTGAAGATGGGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 134177 CGCCGCAAAGCAGGTG...CAGGATGTTAAAGTCTTTAGTGAAGATGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAGCAAAGTGGTGGAGATTCTAGCAGACATGACAGCCAGAGACCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176961 CAAGCAAAGTGGTGGAGATTCTAGCAGACATGACAGCCAGAGACCTGTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAATTGCTGGTTTACAAAAGTCACTGTGTGGATGACAACAGCTGGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177011 CAATTGCTGGTTTACAAAAGTCACTGTGTGGATGACAACAGCTGGACACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGTGGAGCACCACCCGCACCTAGGATTAG         AGAGGTGCTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 177061 AGTGGAGCACCACCCGCACCTAGGATTAGGTA...CAGAGAGGTGCTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGACCATGAGCTGGTGGTCCAGGTGGAGAGTACCATGGCCAGTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184638 AAGACCATGAGCTGGTGGTCCAGGTGGAGAGTACCATGGCCAGTGAGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAATTTCTATTCAGGAAGAATTACGCAAAATACGAGTTCTTTAAAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184688 AAATTTCTATTCAGGAAGAATTACGCAAAATACGAGTTCTTTAAAAATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATG         AATTTCTTCCCAGAACAGATGGTTACTTGGTGCCAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184738 CATGGTG...TAGAATTTCTTCCCAGAACAGATGGTTACTTGGTGCCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGTCAAATGGCAGTCAAACCCAGCTTTTGCAG         AATTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 185809 AGTCAAATGGCAGTCAAACCCAGCTTTTGCAGGTA...CAGAATTTTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AACTCCAGTAGTTGTCCTGAAATTCAAGGGTTTTTGCATGTGAAAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187573 AACTCCAGTAGTTGTCCTGAAATTCAAGGGTTTTTGCATGTGAAAGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGGAAAGAAATCATGGAAAAAGCTGTATGTGTGTTTGCGGAGATCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187623 GGGAAAGAAATCATGGAAAAAGCTGTATGTGTGTTTGCGGAGATCTGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTTATTGCTCCACCAAGGGAACTTCAAAG         GAACCCAGACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 187673 TTTATTGCTCCACCAAGGGAACTTCAAAGGTG...CAGGAACCCAGACAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTGCAGCTGCTGGCCGACCTGGAGGACAGCAACATCTTCTCCCTGATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189043 CTGCAGCTGCTGGCCGACCTGGAGGACAGCAACATCTTCTCCCTGATCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGGCAGGAAGCAGTACAACGCCCCTACAGACCACGGGCTCTGCATAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 189093 TGGCAGGAAGCAGTACAACGCCCCTACAGACCACGGGCTCTGCATAAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1078         CCAAACAAAGTCAGGAATGAAACTAAAGAGCTGAGGTTGCTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189143 TA...TAGCCAAACAAAGTCAGGAATGAAACTAAAGAGCTGAGGTTGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TGTGCAGAGGACGAGCAAACCAGGACGTGCTGGATGACAGCGTTCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191114 TGTGCAGAGGACGAGCAAACCAGGACGTGCTGGATGACAGCGTTCAGACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTCAAG         TATGGAATGCTCCTTTACCAGAATTACCGAATCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191164 CCTCAAGGTA...CAGTATGGAATGCTCCTTTACCAGAATTACCGAATCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTCAGCAGAGGAAGGCCTTGCTGTCCCCGTTCTCGACGCCAGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 197531 CTCAGCAGAGGAAGGCCTTGCTGTCCCCGTTCTCGACGCCAGTGGTA...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1255    CGCAGTGTCTCCGAGAACTCCCTCGTGGCAATGGATTTTTCTGGGCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198502 CAGCGCAGTGTCTCCGAGAACTCCCTCGTGGCAATGGATTTTTCTGGGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 AACAGGACGCGTGATAGAGAATCCGGCGGAGGCCCAGAGCGCAGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 198552 AACAGGACGCGTGATAGAGAATCCGGCAGAGGCCCAGAGCGCAGCCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGGAGGGCCACGCCTGGAGG         AAGCGAAGCACACGGATGAAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 198602 AGGAGGGCCACGCCTGGAGGGTA...CAGAAGCGAAGCACACGGATGAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ATCCTAGGTAGCCAAAGTCCCCTCCACCCTTCTACCCTAAGTACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 199555 ATCCTAGGTAGCCAAAGTCCCCTCCACCCTTCTACCCTAAGTACAGGTA.

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1439      TGATTCACAGGACACAGCACTGGTTTCACGGGAGGATCTCCAGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199605 ..CAGTGATTCACAGGACACAGCACTGGTTTCACGGGAGGATCTCCAGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 AGGAATCCCACAGGATCATTAAACAGCAAGGGCTCGTGGATGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 199871 AGGAATCCCACAGGATCATTAAACAGCAAGGGCTCGTGGATGGGTA...C

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1527   GCTTTTTCTCCTCCGTGACAGCCAGAGTAATCCAAAGGCATTTGTACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208379 AGGCTTTTTCTCCTCCGTGACAGCCAGAGTAATCCAAAGGCATTTGTACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CACACTGTGTCATCACCAGAAAATTAAAAATTTCCAGATCTTACCT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 208429 CACACTGTGTCATCACCAGAAAATTAAAAATTTCCAGATCTTACCTGTA.

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1621      TGCGAGGACGACGGGCAGACGTTCTTCAGCCTAGATGACGGGAAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208479 ..CAGTGCGAGGACGACGGGCAGACGTTCTTCAGCCTAGATGACGGGAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 ACCAAATTCTCTGACCTGATCCAGCTGGTTGACTTTTACCAGCTGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210858 ACCAAATTCTCTGACCTGATCCAGCTGGTTGACTTTTACCAGCTGAACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1716 AGGAGTCCTGCCTTGCAAACTCAAGCACCACTGCATCCGAGTGGCCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210908 AGGAGTCCTGCCTTGCAAACTCAAGCACCACTGCATCCGAGTGGCCTTA