seq1 = pF1KSDA0205.tfa, 1110 bp
seq2 = pF1KSDA0205/gi568815597r_211649902.tfa (gi568815597r:211649902_211929296), 279395 bp

>pF1KSDA0205 1110
>gi568815597r:211649902_211929296 (Chr1)

(complement)

1-238  (100001-100238)   100% ->
239-357  (136107-136225)   100% ->
358-453  (141570-141665)   100% ->
454-727  (145795-146068)   100% ->
728-854  (150253-150379)   100% ->
855-961  (178230-178336)   100% ->
962-1110  (179247-179395)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTATAACTTTGGAAGAAGCTCCGTGGCTGGGCTGGCTCTTGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTATAACTTTGGAAGAAGCTCCGTGGCTGGGCTGGCTCTTGGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCACTGATGAGGTTTGCCTTCATGGTCGTCAACAACCTGGTTGCTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCACTGATGAGGTTTGCCTTCATGGTCGTCAACAACCTGGTTGCTATTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATCCTACATCTGCTATGTAATTATACTTCAGCCCCTTCGAGTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATCCTACATCTGCTATGTAATTATACTTCAGCCCCTTCGAGTGCTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTAAGCGGTTCTGGTATATCGAAGGAATCATGTATAAATGGCTTTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGTAAGCGGTTCTGGTATATCGAAGGAATCATGTATAAATGGCTTTTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATGGTAGCTTCCTGGGGATGGTATGCTGGATATACAG         TGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100201 AATGGTAGCTTCCTGGGGATGGTATGCTGGATATACAGGTA...CAGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAATGGGGAGAAGATATTAAAGCAGTTTCAAAAGATGAAGCAGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136110 TGGAATGGGGAGAAGATATTAAAGCAGTTTCAAAAGATGAAGCAGTGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTGGTGAATCATCAGGCAACAGGAGATGTGTGCACACTGATGATGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136160 TTGGTGAATCATCAGGCAACAGGAGATGTGTGCACACTGATGATGTGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAGGACAAAGGACTG         GTTGTTGCTCAGATGATGTGGTTGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 136210 CCAGGACAAAGGACTGGTA...TAGGTTGTTGCTCAGATGATGTGGTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGATCATATTTTTAAGTACACAAACTTTGGAATTGTTTCTCTAGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141595 TGGATCATATTTTTAAGTACACAAACTTTGGAATTGTTTCTCTAGTTCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAGACTTCTTTATAAGACAG         GGAAGATCTTATCGTGACCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 141645 GGAGACTTCTTTATAAGACAGGTA...TAGGGAAGATCTTATCGTGACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACAGCTGCTGCTTCTCAAGAAGCACTTAGAAAATAATTACAGGAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145815 ACAGCTGCTGCTTCTCAAGAAGCACTTAGAAAATAATTACAGGAGCAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCGAAAATGGATTGTTTTGTTTCCAGAAGGGGGCTTCCTCAGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145865 ATCGAAAATGGATTGTTTTGTTTCCAGAAGGGGGCTTCCTCAGGAAGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGAGAAACAAGTCAGGCATTTGCCAAGAAAAATAACTTGCCATTTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145915 CGAGAAACAAGTCAGGCATTTGCCAAGAAAAATAACTTGCCATTTCTTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAATGTTACTCTGCCAAGGTCTGGGGCAACAAAAATTATTTTGAATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145965 AAATGTTACTCTGCCAAGGTCTGGGGCAACAAAAATTATTTTGAATGCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTGTAGCACAACAGAAAAATGGAAGTCCAGCAGGAGGAGATGCTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146015 TTGTAGCACAACAGAAAAATGGAAGTCCAGCAGGAGGAGATGCTAAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTAG         ACAGCAAATCAAAAGGCCTCCAGTGGATAATAGATAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146065 TTAGGTA...CAGACAGCAAATCAAAAGGCCTCCAGTGGATAATAGATAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AACGATAGCTTATCCCAAAGCTGAACCTATAGATATTCAAACCTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150290 AACGATAGCTTATCCCAAAGCTGAACCTATAGATATTCAAACCTGGATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TTGGATACAGGAAACCAACAGTCACACATGTACATTACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 150340 TTGGATACAGGAAACCAACAGTCACACATGTACATTACAGGTA...TAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATCTTTCCAATTAAAGATGTACCCCTGGAGACTGATGACCTTACCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178231 ATCTTTCCAATTAAAGATGTACCCCTGGAGACTGATGACCTTACCACTTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCTCTATCAGCGGTTTGTTGAAAAAGAAGACCTCTTATCACATTTTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178281 GCTCTATCAGCGGTTTGTTGAAAAAGAAGACCTCTTATCACATTTTTATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAACAG         GAGCTTTTCCACCTTCCAAGGGCCATAAGGAAGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178331 AAACAGGTA...TAGGAGCTTTTCCACCTTCCAAGGGCCATAAGGAAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTTTCCAGGGAGATGACCCTCAGCAACTTGTGGATATTTCTCATACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179282 GTTTCCAGGGAGATGACCCTCAGCAACTTGTGGATATTTCTCATACAGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TTTTGCATTTTTGTCAGGCTATATGTGGTACAACATCATTCAGTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179332 TTTTGCATTTTTGTCAGGCTATATGTGGTACAACATCATTCAGTATTTTT

   1150     .    :
   1097 ACCATTGCCTGTTT
        ||||||||||||||
 179382 ACCATTGCCTGTTT