seq1 = pF1KSDA0193.tfa, 1242 bp
seq2 = pF1KSDA0193/gi568815591r_29823960.tfa (gi568815591r:29823960_30069067), 245108 bp

>pF1KSDA0193 1242
>gi568815591r:29823960_30069067 (Chr7)

(complement)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-341  (113708-113889)   100% ->
342-544  (124889-125091)   100% ->
545-739  (128192-128386)   100% ->
740-905  (132347-132512)   100% ->
906-1086  (142436-142616)   100% ->
1087-1242  (144953-145108)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAGCTCCTCCAAGTTACTGTTTTGTTGCCTTCCCTCCACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAGCTCCTCCAAGTTACTGTTTTGTTGCCTTCCCTCCACGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAAGGATGGTCTGGTGGTATTTGGGAAAAATTCAGCCCGGCCCAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAAGGATGGTCTGGTGGTATTTGGGAAAAATTCAGCCCGGCCCAGAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGTGCAAGAGGTTGTGTATTTCTCGGCTGCTGATCACGAACCGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGTGCAAGAGGTTGTGTATTTCTCGGCTGCTGATCACGAACCGGAGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGTTGAG         TGCACTTACATTTCAATCGACCAAGTTCCAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGTTGAGGTA...CAGTGCACTTACATTTCAATCGACCAAGTTCCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACCTATGCCATAATGATAAGCAGACCCGCCTGGCTCTGGGGAGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113740 GACCTATGCCATAATGATAAGCAGACCCGCCTGGCTCTGGGGAGCAGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGGAGCCAATGAACATGGAGTGTGCATAGCCAATGAAGCCATCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113790 TGGGAGCCAATGAACATGGAGTGTGCATAGCCAATGAAGCCATCAACACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGAGAGCCAGCTGCCGAGATAGAAGCCTTGCTGGGGATGGATCTGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113840 AGAGAGCCAGCTGCCGAGATAGAAGCCTTGCTGGGGATGGATCTGGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342          GCTTGGTTTAGAAAGAGGGGAAACAGCTAAAGAAGCCTTAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113890 GTA...CAGGCTTGGTTTAGAAAGAGGGGAAACAGCTAAAGAAGCCTTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTCATTGTCTCCTTGTTGGAAGAACATGGACAAGGTGGGAATTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124930 ATGTCATTGTCTCCTTGTTGGAAGAACATGGACAAGGTGGGAATTACTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGATGCAAACTCCTGCCACAGCTTCCAAAGTGCATATCTGATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124980 GAAGATGCAAACTCCTGCCACAGCTTCCAAAGTGCATATCTGATTGTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCGTGATGAAGCCTGGGTGCTCGAGACCATAGGGAAGTACTGGGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125030 TCGTGATGAAGCCTGGGTGCTCGAGACCATAGGGAAGTACTGGGCTGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAAAGTCACAG         AGGGAGTGAGGTGCATTTGCAGTCAGCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 125080 AGAAAGTCACAGGTG...CAGAGGGAGTGAGGTGCATTTGCAGTCAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCGCTCACCACTAAGATGGATGCAGAGCATCCGGAACTCAGGAGTTACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128221 TCGCTCACCACTAAGATGGATGCAGAGCATCCGGAACTCAGGAGTTACGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCAGAGCCAAGGTTGGTGGACGGGAGAGGGCGAGTTCAATTTTTCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128271 TCAGAGCCAAGGTTGGTGGACGGGAGAGGGCGAGTTCAATTTTTCCGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCTTTTCTCCAGTTGAGGATCATCTAGACTGCGGTGCTGGCAAAGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128321 TCTTTTCTCCAGTTGAGGATCATCTAGACTGCGGTGCTGGCAAAGACAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTAGAAAAACAAGAAG         AAAGCATCACAGTGCAGACTATGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 128371 TTAGAAAAACAAGAAGGTG...CAGAAAGCATCACAGTGCAGACTATGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAACACCTTACGGGACAAAGCCAGCGGAGTGTGCATAGACTCTGAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132372 GAACACCTTACGGGACAAAGCCAGCGGAGTGTGCATAGACTCTGAGTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCCTCACCACAGCCAGTGGAGTGTCTGTCCTGCCGCAGAATAGAAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132422 TCCTCACCACAGCCAGTGGAGTGTCTGTCCTGCCGCAGAATAGAAGCTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCGTGCATTCACTACTTCACTGGAACCCCTGATCCTTCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 132472 CCGTGCATTCACTACTTCACTGGAACCCCTGATCCTTCCAGGTT...CAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GTCCATATTCAAGCCTTTCATCTTTGTTGATGACGTAAAACTTGTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142436 GTCCATATTCAAGCCTTTCATCTTTGTTGATGACGTAAAACTTGTCCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AAACACAGTCTCCCTGTTTTGGGGATGACGACCCTGCCAAAAAGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142486 AAACACAGTCTCCCTGTTTTGGGGATGACGACCCTGCCAAAAAGGAGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CGGTTCCAGGAGAAACCAGACCGCCGGCATGAGCTGTACAAAGCCCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142536 CGGTTCCAGGAGAAACCAGACCGCCGGCATGAGCTGTACAAAGCCCACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTGGGCACGTGCCATCATCGAAAGTGACCAG         GAGCAAGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 142586 GTGGGCACGTGCCATCATCGAAAGTGACCAGGTG...CAGGAGCAAGGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCAAGCTGAGGAGCACCATGCTGGAGCTGGAGAAGCAAGGCCTGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144963 GCAAGCTGAGGAGCACCATGCTGGAGCTGGAGAAGCAAGGCCTGGAAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATGGAAGAAATCCTGACCAGCTCCGAGCCACTGGACCCTGCGGAAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145013 ATGGAAGAAATCCTGACCAGCTCCGAGCCACTGGACCCTGCGGAAGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1197 GGACCTTTTCTATGACTGTGTTGACACGGAGATTAAGTTCTTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145063 GGACCTTTTCTATGACTGTGTTGACACGGAGATTAAGTTCTTTAAG