seq1 = pF1KSDA0186.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KSDA0186/gi568815578f_25307821.tfa (gi568815578f:25307821_25545988), 238168 bp

>pF1KSDA0186 588
>gi568815578f:25307821_25545988 (Chr20)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-140  (105970-106034)   100% ->
141-239  (109284-109382)   100% ->
240-330  (110285-110375)   100% ->
331-447  (117391-117507)   100% ->
448-522  (133882-133956)   100% ->
523-588  (138103-138168)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTGCGAAAAAGCCATGGAACTGATCCGCGAGCTGCATCGCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTGCGAAAAAGCCATGGAACTGATCCGCGAGCTGCATCGCGCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAGGGCAACTGCCTGCCTTCAAC         GAGGATGGACTCAGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 CGAAGGGCAACTGCCTGCCTTCAACGTG...TAGGAGGATGGACTCAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGTTCTGGAGGAGATGAAAGCTTTGTATGAACAAAACCAGTCTGATGT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105986 AAGTTCTGGAGGAGATGAAAGCTTTGTATGAACAAAACCAGTCTGATGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141         GAATGAAGCAAAGTCAGGTGGACGAAGTGATTTGATACCAAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106036 TA...CAGGAATGAAGCAAAGTCAGGTGGACGAAGTGATTTGATACCAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TATCAAATTTCGACACTGTTCTCTGTTAAGAAATCGACGCTGCACTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109326 TATCAAATTTCGACACTGTTCTCTGTTAAGAAATCGACGCTGCACTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATACCT         GTATGACCGCTTGCTTCGGATCAGAGCACTCAGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109376 CATACCTGTA...TAGGTATGACCGCTTGCTTCGGATCAGAGCACTCAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGGGAATATGGTAGCGTCTTGCCAAATGCATTACGATTTCACATGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110319 TGGGAATATGGTAGCGTCTTGCCAAATGCATTACGATTTCACATGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAAGAA         ATGGAGTGGTTTAATAATTATAAAAGATCTCTTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110369 TGAAGAAGTG...CAGATGGAGTGGTTTAATAATTATAAAAGATCTCTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTACTTATATGAGGTCACTGGGAGGAGATGAAGGTTTGGACATTACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117425 CTACTTATATGAGGTCACTGGGAGGAGATGAAGGTTTGGACATTACACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GATATGAAACCACCAAAAAGCCTATATATTGAA         GTCCGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 117475 GATATGAAACCACCAAAAAGCCTATATATTGAAGTA...CAGGTCCGGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TCTAAAAGACTATGGAGAATTTGAAGTTGATGATGGCACTTCAGTCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133890 TCTAAAAGACTATGGAGAATTTGAAGTTGATGATGGCACTTCAGTCCTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TAAAAAAAAATAGCCAG         CACTTTTTACCTCGATGGAAATGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 133940 TAAAAAAAAATAGCCAGGTA...CAGCACTTTTTACCTCGATGGAAATGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GAGCAGCTGATCAGACAAGGAGTCCTGGAGCACATCCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138127 GAGCAGCTGATCAGACAAGGAGTCCTGGAGCACATCCTGTCA