Result of SIM4 for
pF1KSDA0150
seq1 = pF1KSDA0150.tfa, 2844 bp
seq2 = pF1KSDA0150/gi568815590r_143340040.tfa (gi568815590r:143340040_143641421), 301382 bp
>pF1KSDA0150 2844
>gi568815590r:143340040_143641421 (Chr8)
(complement)
1-46 (100001-100046) 100% ->
47-1364 (102102-103419) 99% ->
1365-1561 (104969-105165) 100% ->
1562-1715 (133523-133676) 100% ->
1716-1903 (165837-166024) 100% ->
1904-1946 (172763-172805) 100% ->
1947-2105 (172882-173040) 100% ->
2106-2175 (173144-173213) 100% ->
2176-2307 (175574-175705) 100% ->
2308-2492 (200302-200486) 100% ->
2493-2815 (201059-201381) 100% ->
2816-2844 (203335-203363) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGGAAAAGGAGATATTACGGCGGCAGATCCGCCTACTGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
100001 ATGGAGGAAAAGGAGATATTACGGCGGCAGATCCGCCTACTGCAGGGTA.
50 . : . : . : . : . :
47 GTCTGATTGATGACTACAAAACCCTCCACGGCAATGCCCCGGCCC
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ..CAGGTCTGATTGATGACTACAAAACCCTCCACGGCAATGCCCCGGCCC
100 . : . : . : . : . :
92 CTGGTACCCCAGCAGCTTCTGGGTGGCAGCCACCCACTTACCACAGTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102147 CTGGTACCCCAGCAGCTTCTGGGTGGCAGCCACCCACTTACCACAGTGGC
150 . : . : . : . : . :
142 AGAGCCTTTAGTGCCCGCTACCCTCGTCCAAGCCGGAGGGGCTACTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102197 AGAGCCTTTAGTGCCCGCTACCCTCGTCCAAGCCGGAGGGGCTACTCTTC
200 . : . : . : . : . :
192 CCACCATGGGCCTTCGTGGCGCAAGAAATACTCCCTCGTGAATCGGCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102247 CCACCATGGGCCTTCGTGGCGCAAGAAATACTCCCTCGTGAATCGGCCCC
250 . : . : . : . : . :
242 CGGGACCCTCAGACCCTCCTGCCGACCATGCTGTGCGGCCGTTGCACGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102297 CGGGACCCTCAGACCCTCCTGCCGACCATGCTGTGCGGCCGTTGCACGGG
300 . : . : . : . : . :
292 GCCCGGGGGGGCCAGCCTCCTGTCCCGCAGCAGCATGTCCTTGAGAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102347 GCCCGGGGGGGCCAGCCTCCTGTCCCGCAGCAGCATGTCCTTGAGAGACA
350 . : . : . : . : . :
342 GGTCCAGCTCAGTCAGGGTCAGAACGTGGTCATCAAAGTTAAACCGCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102397 GGTCCAGCTCAGTCAGGGTCAGAACGTGGTCATCAAAGTTAAACCGCCAT
400 . : . : . : . : . :
392 CAAAGTCTGGCTCTGCCAGTGCCTCAGGGGCCCAGCGGGGCTCTTTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102447 CAAAGTCTGGCTCTGCCAGTGCCTCAGGGGCCCAGCGGGGCTCTTTGGAA
450 . : . : . : . : . :
442 GAATTTGAGGACACCCCCTGGAGTGACCAAAGGCCCCGGGAAGGTGAAGG
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102497 GAATTTGAGGAAACCCCCTGGAGTGACCAAAGGCCCCGGGAAGGTGAAGG
500 . : . : . : . : . :
492 TGAGCCCCCTCGGGGACAGCTGCAGCCCTCGAGGCCAACAAGAGCCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102547 TGAGCCCCCTCGGGGACAGCTGCAGCCCTCGAGGCCAACAAGAGCCAGGG
550 . : . : . : . : . :
542 GGACCTGCAGTGTGGAAGATCCTCTTCTGGTCTGCCAGAAGGAGCCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102597 GGACCTGCAGTGTGGAAGATCCTCTTCTGGTCTGCCAGAAGGAGCCTGGT
600 . : . : . : . : . :
592 AAGCCCAGGATGGTGAAGTCAGTGGGCAGTGTGGGCGACAGCCCCCGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102647 AAGCCCAGGATGGTGAAGTCAGTGGGCAGTGTGGGCGACAGCCCCCGGGA
650 . : . : . : . : . :
642 GCCCCGCCGGACAGTCAGTGAGAGTGTGATTGCCGTCAAGGCGAGCTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102697 GCCCCGCCGGACAGTCAGTGAGAGTGTGATTGCCGTCAAGGCGAGCTTCC
700 . : . : . : . : . :
692 CATCCTCCGCTCTGCCCCCACGCACTGGCGTGGCCCTGGGCCGGAAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102747 CATCCTCCGCTCTGCCCCCACGCACTGGCGTGGCCCTGGGCCGGAAGCTG
750 . : . : . : . : . :
742 GGTTCTCATTCCGTGGCCAGCTGTGCTCCACAGCTCCTTGGGGACAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102797 GGTTCTCATTCCGTGGCCAGCTGTGCTCCACAGCTCCTTGGGGACAGGAG
800 . : . : . : . : . :
792 AGTAGATGCTGGCCACACAGATCAGCCAGTTCCGTCTGGCTCAGTGGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102847 AGTAGATGCTGGCCACACAGATCAGCCAGTTCCGTCTGGCTCAGTGGGGG
850 . : . : . : . : . :
842 GCCCCGCCAGACCGGCCTCAGGACCCAGGCAGGCCCGGGAGGCCTCGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102897 GCCCCGCCAGACCGGCCTCAGGACCCAGGCAGGCCCGGGAGGCCTCGCTG
900 . : . : . : . : . :
892 GTTGTGACCTGTCGAACTAACAAGTTCCGGAAAAACAACTACAAATGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102947 GTTGTGACCTGTCGAACTAACAAGTTCCGGAAAAACAACTACAAATGGGT
950 . : . : . : . : . :
942 GGCTGCCTCCTCGAAGAGTCCCCGGGTTGCTCGGAGGGCCCTCAGTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102997 GGCTGCCTCCTCGAAGAGTCCCCGGGTTGCTCGGAGGGCCCTCAGTCCCA
1000 . : . : . : . : . :
992 GAGTGGCTGCAGAGAATGTGTGCAAGGCCTCTGCTGGCATGGCAAACAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103047 GAGTGGCTGCAGAGAATGTGTGCAAGGCCTCTGCTGGCATGGCAAACAAG
1050 . : . : . : . : . :
1042 GTGGAGAAGCCGCAGCTCATAGCTGACCCAGAGCCCAAGCCCAGGAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103097 GTGGAGAAGCCGCAGCTCATAGCTGACCCAGAGCCCAAGCCCAGGAAGCC
1100 . : . : . : . : . :
1092 AGCCACGTCCTCCAAGCCAGGGTCTGCCCCCAGCAAGTACAAGTGGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103147 AGCCACGTCCTCCAAGCCAGGGTCTGCCCCCAGCAAGTACAAGTGGAAGG
1150 . : . : . : . : . :
1142 CCTCCAGCCCCTCTGCCTCCTCCTCTTCCTCCTTCCGTTGGCAGTCGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103197 CCTCCAGCCCCTCTGCCTCCTCCTCTTCCTCCTTCCGTTGGCAGTCGGAG
1200 . : . : . : . : . :
1192 GCCGGCAGCAAGGACCATGCCTCCCAGCTCTCCCCAGTCCTGTCTAGGTC
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103247 GCCAGCAGCAAGGACCATGCCTCCCAGCTCTCCCCAGTCCTGTCTAGGTC
1250 . : . : . : . : . :
1242 CCCGTCGGGGGACAGACCAGCAGTAGGACACAGTGGCTTGAAGCCCCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103297 CCCGTCGGGGGACAGACCAGCAGTAGGACACAGTGGCTTGAAGCCCCTCT
1300 . : . : . : . : . :
1292 CTGGGGAGACCCCGCTCTCGGCTTACAAAGTGAAGAGCCGCACCAAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103347 CTGGGGAGACCCCGCTCTCGGCTTACAAAGTGAAGAGCCGCACCAAGATC
1350 . : . : . : . : . :
1342 ATCCGGAGACGCGGCAGCACAAG CCTTCCTGGAGACAAGAA
|||||||||||| ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
103397 ATCCGGAGACGCAGCAGCACAAGGTG...CAGCCTTCCTGGAGACAAGAA
1400 . : . : . : . : . :
1383 AAGCGGCACCTCACCTGCCGCCACCGCCAAGAGCCACCTCAGCCTCCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104987 AAGCGGCACCTCACCTGCCGCCACCGCCAAGAGCCACCTCAGCCTCCGGC
1450 . : . : . : . : . :
1433 GGAGACAGGCCCTCAGGGGGAAGAGCAGCCCTGTCCTGAAGAAGACCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105037 GGAGACAGGCCCTCAGGGGGAAGAGCAGCCCTGTCCTGAAGAAGACCCCC
1500 . : . : . : . : . :
1483 AACAAGGGCCTGGTACAGGTCACCACGCACCGACTATGTCGCCTGCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105087 AACAAGGGCCTGGTACAGGTCACCACGCACCGACTATGTCGCCTGCCACC
1550 . : . : . : . : . :
1533 GAGCCGGGCCCACCTCCCCACCAAGGAAG CGTCCAGCCTGC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
105137 GAGCCGGGCCCACCTCCCCACCAAGGAAGGTA...CAGCGTCCAGCCTGC
1600 . : . : . : . : . :
1574 ATGCCGTGCGGACTGCACCCACCAGCAAGGTGATCAAGACCCGCTACCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133535 ATGCCGTGCGGACTGCACCCACCAGCAAGGTGATCAAGACCCGCTACCGC
1650 . : . : . : . : . :
1624 ATTGTCAAGAAGACGCCGGCCTCGCCTCTCAGCGCCCCGCCCTTCCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133585 ATTGTCAAGAAGACGCCGGCCTCGCCTCTCAGCGCCCCGCCCTTCCCCCT
1700 . : . : . : . : . :
1674 GTCTCTGCCCTCCTGGCGGGCCCGGCGGCTCTCACTATCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
133635 GTCTCTGCCCTCCTGGCGGGCCCGGCGGCTCTCACTATCCAGGTA...CA
1750 . : . : . : . : . :
1716 GTCCCTGGTGCTGAACCGCCTGCGTCCAGTTGCCAGCGGGGGTGGGAAA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165836 GGTCCCTGGTGCTGAACCGCCTGCGTCCAGTTGCCAGCGGGGGTGGGAAA
1800 . : . : . : . : . :
1765 GCCCAACCGGGCTCCCCTTGGTGGCGGAGCAAAGGCTACCGCTGCATCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165886 GCCCAACCGGGCTCCCCTTGGTGGCGGAGCAAAGGCTACCGCTGCATCGG
1850 . : . : . : . : . :
1815 AGGGGTCCTCTACAAAGTATCTGCCAACAAGCTCTCCAAGACCTCCGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165936 AGGGGTCCTCTACAAAGTATCTGCCAACAAGCTCTCCAAGACCTCCGGCC
1900 . : . : . : . : . :
1865 AGCCCAGTGATGCGGGCAGCAGGCCCCTCCTGCGCACAG GC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
165986 AGCCCAGTGATGCGGGCAGCAGGCCCCTCCTGCGCACAGGTG...CAGGC
1950 . : . : . : . : . :
1906 CGGCTGGATCCTGCAGGCAGCTGTAGCCGTTCCCTGGCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
172765 CGGCTGGATCCTGCAGGCAGCTGTAGCCGTTCCCTGGCCAGGTA...CAG
2000 . : . : . : . : . :
1947 CCGGGCAGTGCAGCGCAGCCTGGCCATCATCCGGCAGGCGCGGCAGCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172882 CCGGGCAGTGCAGCGCAGCCTGGCCATCATCCGGCAGGCGCGGCAGCGCA
2050 . : . : . : . : . :
1997 GGGAGAAGAGGAAGGAGTACTGCATGTACTACAACCGCTTCGGCAGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172932 GGGAGAAGAGGAAGGAGTACTGCATGTACTACAACCGCTTCGGCAGGTGC
2100 . : . : . : . : . :
2047 AACCGTGGCGAGCGCTGCCCCTACATCCACGATCCCGAGAAGGTGGCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172982 AACCGTGGCGAGCGCTGCCCCTACATCCACGATCCCGAGAAGGTGGCCGT
2150 . : . : . : . : . :
2097 GTGCACCAG GTTTGTCCGGGGCACCTGCAAGAAAACGGATG
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
173032 GTGCACCAGGTG...CAGGTTTGTCCGGGGCACCTGCAAGAAAACGGATG
2200 . : . : . : . : . :
2138 GGACCTGCCCCTTCTCCCACCATGTGTCCAAGGAGAAG ATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
173176 GGACCTGCCCCTTCTCCCACCATGTGTCCAAGGAGAAGGTG...CAGATG
2250 . : . : . : . : . :
2179 CCGGTGTGCTCCTACTTCCTGAAGGGCATCTGCAGCAACAGCAACTGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175577 CCGGTGTGCTCCTACTTCCTGAAGGGCATCTGCAGCAACAGCAACTGTCC
2300 . : . : . : . : . :
2229 CTATAGCCACGTGTACGTGTCCCGCAAGGCCGAGGTCTGCAGCGACTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175627 CTATAGCCACGTGTACGTGTCCCGCAAGGCCGAGGTCTGCAGCGACTTCC
2350 . : . : . : . : . :
2279 TCAAAGGCTACTGCCCCCTGGGTGCAAAG TGCAAGAAGAAA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
175677 TCAAAGGCTACTGCCCCCTGGGTGCAAAGGTG...CAGTGCAAGAAGAAA
2400 . : . : . : . : . :
2320 CACACGCTGCTGTGCCCCGACTTTGCCCGCAGGGGGGCGTGTCCCCGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200314 CACACGCTGCTGTGCCCCGACTTTGCCCGCAGGGGGGCGTGTCCCCGCGG
2450 . : . : . : . : . :
2370 CGCCCAGTGCCAGCTGCTCCACCGTACCCAGAAACGCCACAGTCGGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200364 CGCCCAGTGCCAGCTGCTCCACCGTACCCAGAAACGCCACAGTCGGCGGG
2500 . : . : . : . : . :
2420 CAGCCACGTCCCCCGCCCCAGGGCCCAGCGACGCAACCGCCAGGAGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200414 CAGCCACGTCCCCCGCCCCAGGGCCCAGCGACGCAACCGCCAGGAGCAGG
2550 . : . : . : . : . :
2470 GTCTCGGCCAGCCACGGGCCCAG GAAGCCTTCAGCATCCCA
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
200464 GTCTCGGCCAGCCACGGGCCCAGGTG...CAGGAAGCCTTCAGCATCCCA
2600 . : . : . : . : . :
2511 GCGCCCCACCAGGCAGACGCCCAGCTCGGCTGCCCTCACTGCGGCTGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201077 GCGCCCCACCAGGCAGACGCCCAGCTCGGCTGCCCTCACTGCGGCTGCCG
2650 . : . : . : . : . :
2561 TGGCTGCACCTCCCCACTGCCCAGGGGGGTCAGCCTCTCCCTCATCCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201127 TGGCTGCACCTCCCCACTGCCCAGGGGGGTCAGCCTCTCCCTCATCCTCG
2700 . : . : . : . : . :
2611 AAGGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATCCCCTCCCGCTTCCTTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201177 AAGGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATCCCCTCCCGCTTCCTTGGA
2750 . : . : . : . : . :
2661 CCACGAGGCACCATCTCTCCAGGAGGCTGCCTTAGCAGCAGCGTGCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201227 CCACGAGGCACCATCTCTCCAGGAGGCTGCCTTAGCAGCAGCGTGCTCCA
2800 . : . : . : . : . :
2711 ACAGGCTCTGCAAGCTGCCTTCCTTCATCTCCCTGCAGTCCTCGCCGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201277 ACAGGCTCTGCAAGCTGCCTTCCTTCATCTCCCTGCAGTCCTCGCCGAGC
2850 . : . : . : . : . :
2761 CCAGGAGCCCAGCCCAGGGTCCGGGCCCCTAGGGCCCCCCTCACCAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
201327 CCAGGAGCCCAGCCCAGGGTCCGGGCCCCTAGGGCCCCCCTCACCAAGGA
2900 . : . : . : . :
2811 CTCAG GGAAGCCTCTGCACATCAAACCACGTCTG
|||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
201377 CTCAGGTA...TAGGGAAGCCTCTGCACATCAAACCACGTCTG