seq1 = pF1KSDA0149.tfa, 2490 bp
seq2 = pF1KSDA0149/gi568815581r_1534761.tfa (gi568815581r:1534761_1745640), 210880 bp

>pF1KSDA0149 2490
>gi568815581r:1534761_1745640 (Chr17)

(complement)

1-101  (99944-100044)   100% ->
102-163  (100402-100463)   100% ->
164-265  (100706-100807)   100% ->
266-791  (101674-102199)   100% ->
792-1010  (104975-105193)   100% ->
1011-1139  (105601-105729)   100% ->
1140-1243  (105899-106002)   100% ->
1244-1364  (106715-106835)   99% ->
1365-1486  (108579-108700)   100% ->
1487-1633  (108786-108932)   100% ->
1634-2490  (110024-110880)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTGGGGCTGCTGCTCCCGCTGCTGCTGCTCTGGACTCGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99944 ATGGGGCTGGGGCTGCTGCTCCCGCTGCTGCTGCTCTGGACTCGGGGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCAGGGGTCCGAGCTGGACCCCAAAGGGCAGCACGTCTGTGTGGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 TCAGGGGTCCGAGCTGGACCCCAAAGGGCAGCACGTCTGTGTGGCCAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         CCCCTCTGCTGAGCTGCAGTGCTGCGCAGGCTGGAGGCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 GGTG...CAGCCCCTCTGCTGAGCTGCAGTGCTGCGCAGGCTGGAGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGATCAAGAATGCACCATCC         CCATCTGTGAGGGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100442 AAGGATCAAGAATGCACCATCCGTG...CAGCCATCTGTGAGGGGCCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGCCTGCCAGAAAGACGAGGTGTGTGTGAAGCCGGGCCTCTGTCGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100725 CGCCTGCCAGAAAGACGAGGTGTGTGTGAAGCCGGGCCTCTGTCGATGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCCTGGATTCTTTGGGGCCCACTGCAGCTCCC         GCTGCCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100775 AGCCTGGATTCTTTGGGGCCCACTGCAGCTCCCGTG...CAGGCTGCCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGCCAGTACTGGGGCCCCGACTGCCGTGAGAGCTGCCCCTGCCACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101682 GGCCAGTACTGGGGCCCCGACTGCCGTGAGAGCTGCCCCTGCCACCCGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGGCCAGTGCGAGCCAGCCACGGGCGCGTGCCAGTGCCAGGCCGACCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101732 CGGCCAGTGCGAGCCAGCCACGGGCGCGTGCCAGTGCCAGGCCGACCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGGAGCCCGCTGCGAGTTCCCGTGCGCCTGCGGCCCCCACGGGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101782 GGGGAGCCCGCTGCGAGTTCCCGTGCGCCTGCGGCCCCCACGGGCGCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACCCCGCGACCGGCGTGTGCCACTGCGAACCCGGCTGGTGGTCGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101832 GACCCCGCGACCGGCGTGTGCCACTGCGAACCCGGCTGGTGGTCGTCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGCCGCCGCCCGTGCCAGTGCAACACCGCGGCGGCGCGCTGCGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101882 GTGCCGCCGCCCGTGCCAGTGCAACACCGCGGCGGCGCGCTGCGAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCACGGGCGCCTGCGTGTGCAAGCCGGGCTGGTGGGGGCGCCGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101932 CCACGGGCGCCTGCGTGTGCAAGCCGGGCTGGTGGGGGCGCCGCTGCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCCGCTGCAACTGCCACGGCTCCCCGTGCGAGCAGGACTCCGGCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101982 TTCCGCTGCAACTGCCACGGCTCCCCGTGCGAGCAGGACTCCGGCCGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CGCCTGCCGGCCGGGCTGGTGGGGTCCCGAATGCCAGCAGCAGTGCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102032 CGCCTGCCGGCCGGGCTGGTGGGGTCCCGAATGCCAGCAGCAGTGCGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTGTGCGGGGCCGCTGCAGCGCCGCCTCCGGCGAGTGCACCTGCCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102082 GTGTGCGGGGCCGCTGCAGCGCCGCCTCCGGCGAGTGCACCTGCCCGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGCTTCCGCGGAGCGCGCTGCGAGCTGCCCTGCCCGGCAGGCAGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102132 GGCTTCCGCGGAGCGCGCTGCGAGCTGCCCTGCCCGGCAGGCAGCCACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGTGCAGTGCGCACACAG         CTGTGGCCGCTGCAAACACAATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102182 GGTGCAGTGCGCACACAGGTG...CAGCTGTGGCCGCTGCAAACACAATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGCCGTGCTCTCCAGACACAGGCAGCTGTGAGTCCTGCGAGCCGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104998 AGCCGTGCTCTCCAGACACAGGCAGCTGTGAGTCCTGCGAGCCGGGCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AACGGGACCCAGTGCCAGCAGCCCTGCCTGCCTGGCACCTTTGGCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105048 AACGGGACCCAGTGCCAGCAGCCCTGCCTGCCTGGCACCTTTGGCGAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTGCGAACAGCAGTGCCCTCACTGCCGACATGGGGAGGCCTGTGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105098 CTGCGAACAGCAGTGCCCTCACTGCCGACATGGGGAGGCCTGTGAGCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ATACTGGCCACTGTCAGCGCTGTGACCCTGGCTGGCTGGGGCCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 105148 ATACTGGCCACTGTCAGCGCTGTGACCCTGGCTGGCTGGGGCCCAGGTG.

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011      GTGTGAAGACCCCTGCCCCACTGGTACCTTTGGGGAAGACTGTGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105198 ..CAGGTGTGAAGACCCCTGCCCCACTGGTACCTTTGGGGAAGACTGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTCTACCTGCCCCACCTGTGTTCAGGGGTCCTGTGATACTGTGACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105646 CTCTACCTGCCCCACCTGTGTTCAGGGGTCCTGTGATACTGTGACAGGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ACTGTGTCTGCAGTGCCGGCTACTGGGGGCCCAG         CTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105696 ACTGTGTCTGCAGTGCCGGCTACTGGGGGCCCAGGTA...TAGCTGCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GCCTCCTGCCCAGCCGGTTTCCATGGAAACAACTGCTCAGTTCCTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105906 GCCTCCTGCCCAGCCGGTTTCCATGGAAACAACTGCTCAGTTCCTTGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ATGCCCAGAGGGACTCTGCCACCCTGTCTCTGGGTCCTGCCAGCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105956 ATGCCCAGAGGGACTCTGCCACCCTGTCTCTGGGTCCTGCCAGCCAGGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1244       GCTCTGGCAGTCGGGACACTGCCCTCATCGTGGGCAGCCTTGTG
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 106006 ...CAGGCTCTGGCAGTCGGGACACTGCCCTCATCGCGGGCAGCCTTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCTCTGCTGCTGCTCTTCCTGGGCCTTGCCTGCTGTGCCTGCTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106759 CCTCTGCTGCTGCTCTTCCTGGGCCTTGCCTGCTGTGCCTGCTGCTGCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GGCCCCCCGATCAGACCTCAAGGACAG         GCCAGCGAGAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106809 GGCCCCCCGATCAGACCTCAAGGACAGGTG...CAGGCCAGCGAGAGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GAGCTACCGTGTCCAGGATGAAGCTGCAGGTCTGGGGGACACTGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108593 GAGCTACCGTGTCCAGGATGAAGCTGCAGGTCTGGGGGACACTGACCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TTGGGCTCCACGCTGCCCTGCCGTTCCCTCAGCTCCCACAAGCTACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108643 TTGGGCTCCACGCTGCCCTGCCGTTCCCTCAGCTCCCACAAGCTACCCTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GGTGACAG         TCTCACATCACGACCCGGAGGTCCCCTTCAACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108693 GGTGACAGGTC...CAGTCTCACATCACGACCCGGAGGTCCCCTTCAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ACAGCTTCATCGAGCCGCCCTCTGCCGGCTGGGCCACTGATGACTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108819 ACAGCTTCATCGAGCCGCCCTCTGCCGGCTGGGCCACTGATGACTCCTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TCATCCGATCCTGAGTCTGGAGAGGCAGATGAGGTTCCTGCCTACTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108869 TCATCCGATCCTGAGTCTGGAGAGGCAGATGAGGTTCCTGCCTACTGTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GCCACCCCAAGAAG         GGATGGTCCCTGTGGCCCAGGCAGGGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108919 GCCACCCCAAGAAGGTA...CAGGGATGGTCCCTGTGGCCCAGGCAGGGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CGTCAGAGGCCAGCCTGGCTGCAGGTGCTTTCCCGCCCCCTGAGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110051 CGTCAGAGGCCAGCCTGGCTGCAGGTGCTTTCCCGCCCCCTGAGGACGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TCCACGCCATTCGCCATCCCGCGCACCTCCAGCCTAGCTCGGGCCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110101 TCCACGCCATTCGCCATCCCGCGCACCTCCAGCCTAGCTCGGGCCAAGCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GCCATCGGTCTCCTTCGCGGAAGGTACCAAGTTTGCACCACAGAGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110151 GCCATCGGTCTCCTTCGCGGAAGGTACCAAGTTTGCACCACAGAGTCGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GAAGCTCAGGGGAGCTCTCCAGCCCGCTCCGAAAGCCCAAGAGGCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110201 GAAGCTCAGGGGAGCTCTCCAGCCCGCTCCGAAAGCCCAAGAGGCTCTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 CGGGGGGCGCAGTCGGGTCCTGAGGGCCGGGAAGCCGAAGAGTCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110251 CGGGGGGCGCAGTCGGGTCCTGAGGGCCGGGAAGCCGAAGAGTCCACAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CCCAGACGAAGCAGAAGCCCCCGAGTCCTTTCCGGCGGCTGCCAGTCCCG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110301 CCCAGAGGAAGCAGAAGCCCCCGAGTCCTTTCCGGCGGCTGCCAGTCCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 GGGATTCAGCCACTGGCCACCGGTGGCCCCCACTTGGTAGCCGGACAGTG
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
 110351 GGGATTCAGCCACTGGCCACCGGCGGCCCCCACTTGGTGGCCGGACAGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GCTGAGCACGTGGAAGCCATTGAGGGCAGCGTCCAGGAGAGCTCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110401 GCTGAGCACGTGGAAGCCATTGAGGGCAGCGTCCAGGAGAGCTCGGGCCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TGTGACCACGATCTACATGCTGGCAGGGAAGCCCCGCGGATCCGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110451 TGTGACCACGATCTACATGCTGGCAGGGAAGCCCCGCGGATCCGAAGGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 CTGTCCGCTCTGTCTTCCGCCATTTTGGTAGCTTCCAGAAAGGCCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110501 CTGTCCGCTCTGTCTTCCGCCATTTTGGTAGCTTCCAGAAAGGCCAGGCG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 GAAGCCAAGGTCAAGAGGGCCATCCCTAAGCCTCCGCGCCAGGCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110551 GAAGCCAAGGTCAAGAGGGCCATCCCTAAGCCTCCGCGCCAGGCCCTGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 TCGGAAAAAGGGCAGCCCTGGCCTTGCCTCTGGCTCTGTCGGCCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110601 TCGGAAAAAGGGCAGCCCTGGCCTTGCCTCTGGCTCTGTCGGCCAGAGCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 CCAACTCAGCCCCAAAAGCTGGGCTTCCTGGGGCCACAGGGCCTATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110651 CCAACTCAGCCCCAAAAGCTGGGCTTCCTGGGGCCACAGGGCCTATGGCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 GTCAGACCAGAGGAAGCGGTCCGGGGGCTGGGGGCTGGCACCGAGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110701 GTCAGACCAGAGGAAGCGGTCCGGGGGCTGGGGGCTGGCACCGAGAGTTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 AAGGAGAGCCCAGGAGCCAGTCTCTGGCTGTGGCTCCCCAGAACAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110751 AAGGAGAGCCCAGGAGCCAGTCTCTGGCTGTGGCTCCCCAGAACAGGATC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 CCCAGAAGCAGGCTGAAGAGGAAAGGCAGGAGGAACCTGAGTATGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110801 CCCAGAAGCAGGCTGAAGAGGAAAGGCAGGAGGAACCTGAGTATGAGAAT

   2550     .    :    .    :    .    :
   2461 GTTGTACCCATCTCCAGGCCACCAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 110851 GTTGTACCCATCTCCAGGCCACCAGAACCC