seq1 = pF1KSDA0140.tfa, 1266 bp
seq2 = pF1KSDA0140/gi568815588r_124523245.tfa (gi568815588r:124523245_124806713), 283469 bp

>pF1KSDA0140 1266
>gi568815588r:124523245_124806713 (Chr10)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-133  (110502-110556)   100% ->
134-906  (124335-125107)   100% ->
907-1266  (183110-183469)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGATGGTCCTAAGTGAAAGCCTCAGCACCCGGGGAGCTGACTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGATGGTCCTAAGTGAAAGCCTCAGCACCCGGGGAGCTGACTCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCATGTGGGACCTTCAGCCGTGAACTG         CACACGCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 TGCATGTGGGACCTTCAGCCGTGAACTGGTG...CAGCACACGCCAAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATGAGTCAAGGACCTACACTTTTCTCTTGTGGAATTATGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 110515 AGATGAGTCAAGGACCTACACTTTTCTCTTGTGGAATTATGGGTA...CA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    134  AAAATGACAGATGGCGAGACCTGGACAGGAAATGCCCTCTTCAGATTGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124334 GAAAATGACAGATGGCGAGACCTGGACAGGAAATGCCCTCTTCAGATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAACCGAGCACCAGCATCTGGGAATGCCTGCCTGAAAAGGACAGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124384 CCAACCGAGCACCAGCATCTGGGAATGCCTGCCTGAAAAGGACAGCTCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TATGGCACCGGGAGGCAGTGACCGCCTGCGCTGTGACCAGTCTGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124434 TATGGCACCGGGAGGCAGTGACCGCCTGCGCTGTGACCAGTCTGATCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCTCAGCATCAGCGACCACAACGGGAACCCCTCAGCACCCCCTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124484 GACCTCAGCATCAGCGACCACAACGGGAACCCCTCAGCACCCCCTAGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCGCCAGTGCCGCTCACTGTCCTTCTCCGATGAGATGTCCAGTTGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124534 GCGCCAGTGCCGCTCACTGTCCTTCTCCGATGAGATGTCCAGTTGCCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CATCATGGAGGCCCTTGGGCTCCAAAGTCTGGACTCCCGTGGAAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124584 CATCATGGAGGCCCTTGGGCTCCAAAGTCTGGACTCCCGTGGAAAAGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGCTGCTACAGCGGGGGCAGCGTCCAGCGCTATTCCAACGGCTTCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124634 CGCTGCTACAGCGGGGGCAGCGTCCAGCGCTATTCCAACGGCTTCAGCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATGCAGAGGAGTTCCAGCTTCAGCCTCCCTTCCCGGGCCAACGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124684 CATGCAGAGGAGTTCCAGCTTCAGCCTCCCTTCCCGGGCCAACGTGCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTCACCCTGCGACCAGGCAGGACTCCACCACCGATTTGGAGGGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124734 CCTCACCCTGCGACCAGGCAGGACTCCACCACCGATTTGGAGGGCAGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TGCCAAGGGGTGCCAGGCTCAGCCCCGTGTGGACAGGCAGGTGACACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124784 TGCCAAGGGGTGCCAGGCTCAGCCCCGTGTGGACAGGCAGGTGACACCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAGCCCTGACCTGCACCCCGTGGGAGGAGGCCGGCTGGACCTGCAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124834 GAGCCCTGACCTGCACCCCGTGGGAGGAGGCCGGCTGGACCTGCAGCGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCCTCTCTTGCTCACATGAGCAGTTTTCCTTTGTGGAATACTGTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124884 CCCTCTCTTGCTCACATGAGCAGTTTTCCTTTGTGGAATACTGTCCTCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCAGCCAACAGCACACCTGCCTCAACACCAGAGCTGGCGAGACGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124934 TCAGCCAACAGCACACCTGCCTCAACACCAGAGCTGGCGAGACGCTCCAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CGGCCTTTCCCGCAGCCGCTCCCAGCCGTGTGTCCTTAACGACAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124984 CGGCCTTTCCCGCAGCCGCTCCCAGCCGTGTGTCCTTAACGACAAGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCGGTGTTAAAAGGCGGCGCCCTGAAGAAGTGCAAGAGCAGAGGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125034 TCGGTGTTAAAAGGCGGCGCCCTGAAGAAGTGCAAGAGCAGAGGCCTTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CTAGACCTTGCCAAGATGGCACAG         AACTGTCAGACCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 125084 CTAGACCTTGCCAAGATGGCACAGGTA...CAGAACTGTCAGACCTTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CAGCCTCAGCTGCCTGAGCGCAGGGACAGAGGACTGCGGTCCCCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183127 CAGCCTCAGCTGCCTGAGCGCAGGGACAGAGGACTGCGGTCCCCAGAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCTTCGCCCGCCACGTCAGCAACACCAGGGCCTGGACCGCCCTGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183177 CCTTCGCCCGCCACGTCAGCAACACCAGGGCCTGGACCGCCCTGCTCTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GCCTCCGGCCCAGGGGGCAGGACCCCCGCTGGGACCCCGGTCCCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183227 GCCTCCGGCCCAGGGGGCAGGACCCCCGCTGGGACCCCGGTCCCTGAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TCTTCCCCCTTCCTTCGACGACCACCTCGTCTGCCAGGAGGACCTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 183277 TCTTCCCCCTTCCTTCGACGACCACCTCGCCTGCCAGGAGGACCTGTCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GTGAGGAGTCAGACAGCTGCGCCCTGGACGAGGATTGTGGCAGGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183327 GTGAGGAGTCAGACAGCTGCGCCCTGGACGAGGATTGTGGCAGGAGAGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGCCGGCTGCAGCCTGGCGGGACCGCGGGGCCCCTGGGAACAGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183377 GAGCCGGCTGCAGCCTGGCGGGACCGCGGGGCCCCTGGGAACAGCCTCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTCCCTGGACGGCGAGTTGGACATTGAGCAGATAGAGAAGAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183427 CTCCCTGGACGGCGAGTTGGACATTGAGCAGATAGAGAAGAAC