seq1 = pF1KSDA0132.tfa, 1872 bp
seq2 = pF1KSDA0132/gi568815579r_10386655.tfa (gi568815579r:10386655_10600033), 213379 bp

>pF1KSDA0132 1872
>gi568815579r:10386655_10600033 (Chr19)

(complement)

1-639  (100001-100639)   99% ->
640-1325  (107772-108457)   100% ->
1326-1531  (110181-110386)   99% ->
1532-1708  (110666-110842)   100% ->
1709-1872  (113216-113379)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCCAGATCCCAGGCCTAGCGGGGCTGGGGCCTGCTGCCGATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCCAGATCCCAGGCCTAGCGGGGCTGGGGCCTGCTGCCGATTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCCTGCAGTCACAGTGCCCTGAGGGGGCAGGGGACGCGGTGATGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCCTGCAGTCACAGTGCCCTGAGGGGGCAGGGGACGCGGTGATGTACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCCACTGAGTGCAAGGCGGAGGTGACGCCCTCCCAGCATGGCAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCCACTGAGTGCAAGGCGGAGGTGACGCCCTCCCAGCATGGCAACCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCTTCAGCTACACCCTGGAGGATCATACCAAGCAGGCCTTTGGCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCTTCAGCTACACCCTGGAGGATCATACCAAGCAGGCCTTTGGCATCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACGAGCTGCGGCTCAGCCAGCAGCTGTGTGACGTCACACTGCAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACGAGCTGCGGCTCAGCCAGCAGCTGTGTGACGTCACACTGCAGGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGTACCAGGATGCACCGGCCGCCCAGTTCATGGCCCACAAGGTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGTACCAGGATGCACCGGCCGCCCAGTTCATGGCCCACAAGGTGGTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCTCATCCAGCCCTGTCTTCAAGGCCATGTTCACCAACGGGCTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCTCATCCAGCCCTGTCTTCAAGGCCATGTTCACCAACGGGCTGCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGGGCATGGAGGTGGTGTCCATTGAGGGTATCCACCCCAAGGTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGGGCATGGAGGTGGTGTCCATTGAGGGTATCCACCCCAAGGTCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCGCCTCATTGAATTCGCCTACACGGCCTCCATCTCCATGGGCGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCGCCTCATTGAATTCGCCTACACGGCCTCCATCTCCATGGGCGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTGTCCTCCACGTCATGAACGGCGCTGTCATGTACCAGATCGACAGCGT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTGTCCTCCACGTCATGAACGGTGCTGTCATGTACCAGATCGACAGCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCCGTGCCTGCAGTGACTTCCTGGTGCAGCAGCTGGACCCCAGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGTCCGTGCCTGCAGTGACTTCCTGGTGCAGCAGCTGGACCCCAGCAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCATCGGCATCGCCAACTTCGCTGAGCAGATTGGCTGTGTGGAGTTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCATCGGCATCGCCAACTTCGCTGAGCAGATTGGCTGTGTGGAGTTGCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGCGTGCCCGGGAGTACATCTACATGCATTTTGGGGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100601 CAGCGTGCCCGGGAGTACATCTACATGCATTTTGGGGAGGTG...CAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGCCAAGCAAGAGGAGTTCTTCAACCTGTCCCACTGCCAACTGGTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107774 GGCCAAGCAAGAGGAGTTCTTCAACCTGTCCCACTGCCAACTGGTGACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCATCAGCCGGGACGACCTGAACGTGCGCTGCGAGTCCGAGGTCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107824 TCATCAGCCGGGACGACCTGAACGTGCGCTGCGAGTCCGAGGTCTTCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCCTGCATCAACTGGGTCAAGTACGACTGCGAACAGCGACGGTTCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107874 GCCTGCATCAACTGGGTCAAGTACGACTGCGAACAGCGACGGTTCTACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCAGGCGCTGCTGCGGGCCGTGCGCTGCCACTCGTTGACGCCGAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107924 CCAGGCGCTGCTGCGGGCCGTGCGCTGCCACTCGTTGACGCCGAACTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGCAGATGCAGCTGCAGAAGTGCGAGATCCTGCAGTCCGACTCCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107974 TGCAGATGCAGCTGCAGAAGTGCGAGATCCTGCAGTCCGACTCCCGCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAGGACTACCTGGTCAAGATCTTCGAGGAGCTCACCCTGCACAAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108024 AAGGACTACCTGGTCAAGATCTTCGAGGAGCTCACCCTGCACAAGCCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCAGGTGATGCCCTGCCGGGCGCCCAAGGTGGGCCGCCTGATCTACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108074 GCAGGTGATGCCCTGCCGGGCGCCCAAGGTGGGCCGCCTGATCTACACCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CGGGCGGCTACTTCCGACAGTCGCTCAGCTACCTGGAGGCTTACAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108124 CGGGCGGCTACTTCCGACAGTCGCTCAGCTACCTGGAGGCTTACAACCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AGTGACGGCACCTGGCTCCGGTTGGCGGACCTGCAGGTGCCGCGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108174 AGTGACGGCACCTGGCTCCGGTTGGCGGACCTGCAGGTGCCGCGGAGCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CCTGGCCGGCTGCGTGGTGGGCGGGCTGTTGTACGCCGTGGGCGGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108224 CCTGGCCGGCTGCGTGGTGGGCGGGCTGTTGTACGCCGTGGGCGGCAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 ACAACTCGCCCGACGGCAACACCGACTCCAGCGCCCTGGACTGTTACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108274 ACAACTCGCCCGACGGCAACACCGACTCCAGCGCCCTGGACTGTTACAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CCCATGACCAATCAGTGGTCGCCCTGCGCCCCCATGAGCGTGCCCCGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108324 CCCATGACCAATCAGTGGTCGCCCTGCGCCCCCATGAGCGTGCCCCGTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CCGCATCGGGGTGGGGGTCATCGATGGCCACATCTATGCCGTCGGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108374 CCGCATCGGGGTGGGGGTCATCGATGGCCACATCTATGCCGTCGGCGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CCCACGGCTGCATCCACCACAACAGTGTGGAGAG         GTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 108424 CCCACGGCTGCATCCACCACAACAGTGTGGAGAGGTG...CAGGTATGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CCAGAGCGGGATGAGTGGCACTTGGTGGCCCCAATGCTGACACGAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110188 CCAGAGCGGGATGAGTGGCACTTGGTGGCCCCAATGCTGACACGAAGGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CGGGGTGGGCGTGGCTGTCCTCAATCGTCTGCTTTATGCCGTGGGGGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 110238 CGGGGTGGGCGTGGCTGTCCTCAATCGTCTCCTTTATGCCGTGGGGGGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 TTGACGGGACAAACCGCCTTAATTCAGCTGAGTGTTACTACCCAGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110288 TTGACGGGACAAACCGCCTTAATTCAGCTGAGTGTTACTACCCAGAGAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AACGAGTGGCGAATGATCACAGCAATGAACACCATCCGAAGCGGGGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 110338 AACGAGTGGCGAATGATCACAGCAATGAACACCATCCGAAGCGGGGCAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1532         GCGTCTGCGTCCTGCACAACTGTATCTATGCTGCTGGGGGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110388 TG...TAGGCGTCTGCGTCCTGCACAACTGTATCTATGCTGCTGGGGGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ATGATGGTCAGGACCAGCTGAACAGCGTGGAGCGCTACGATGTGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110708 ATGATGGTCAGGACCAGCTGAACAGCGTGGAGCGCTACGATGTGGAAACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GAGACGTGGACTTTCGTAGCCCCCATGAAGCACCGGCGAAGTGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110758 GAGACGTGGACTTTCGTAGCCCCCATGAAGCACCGGCGAAGTGCCCTGGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 GATCACTGTCCACCAGGGGAGAATCTACGTCCTTG         GAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110808 GATCACTGTCCACCAGGGGAGAATCTACGTCCTTGGTG...CAGGAGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 ATGATGGTCACACGTTCCTGGACAGTGTGGAGTGTTACGACCCAGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113222 ATGATGGTCACACGTTCCTGGACAGTGTGGAGTGTTACGACCCAGATACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GACACCTGGAGCGAGGTGACCCGAATGACATCGGGCCGGAGTGGGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113272 GACACCTGGAGCGAGGTGACCCGAATGACATCGGGCCGGAGTGGGGTGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 CGTGGCTGTCACCATGGAGCCCTGCCGGAAGCAGATTGACCAGCAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113322 CGTGGCTGTCACCATGGAGCCCTGCCGGAAGCAGATTGACCAGCAGAACT

   1900     .
   1865 GTACCTGT
        ||||||||
 113372 GTACCTGT