seq1 = pF1KSDA0108.tfa, 699 bp
seq2 = pF1KSDA0108/gi568815596r_19933208.tfa (gi568815596r:19933208_20151520), 218313 bp

>pF1KSDA0108 699
>gi568815596r:19933208_20151520 (Chr2)

(complement)

1-111  (100001-100111)   100% ->
112-232  (110510-110630)   100% ->
233-309  (113907-113983)   100% ->
310-432  (114083-114205)   100% ->
433-528  (116459-116554)   100% ->
529-627  (117106-117204)   100% ->
628-699  (118242-118313)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTCCATGAGTTTCAAGCGGAACCGCAGTGACCGGTTCTACAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGTCCATGAGTTTCAAGCGGAACCGCAGTGACCGGTTCTACAGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGTGCTGCGGCTGTTGCCATGTCCGCACCGGGACGATCATCCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGTGCTGCGGCTGTTGCCATGTCCGCACCGGGACGATCATCCTGGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGGTACATG         GTAGTAAACCTATTGATGGCAATTTTGCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGGTACATGGTA...CAGGTAGTAAACCTATTGATGGCAATTTTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACTGTGGAAGTGACTCATCCAAACTCCATGCCAGCTGTCAACATTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110540 ACTGTGGAAGTGACTCATCCAAACTCCATGCCAGCTGTCAACATTCAGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAGTCATCGGTAATTACTATTCGTCTGAGAGAATGGCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 110590 TGAAGTCATCGGTAATTACTATTCGTCTGAGAGAATGGCTGGTA...TAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATAATGCCTGTGTTCTTTTTGCCGTCTCTGTTCTTATGTTTATAATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113907 ATAATGCCTGTGTTCTTTTTGCCGTCTCTGTTCTTATGTTTATAATCAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCAATGCTGGTTTATGGAGCAATTTCT         TATCAAGTGGGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 113957 TCAATGCTGGTTTATGGAGCAATTTCTGTA...CAGTATCAAGTGGGTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCTGATTCCATTCTTCTGTTACCGACTTTTTGACTTCGTCCTCAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114097 GCTGATTCCATTCTTCTGTTACCGACTTTTTGACTTCGTCCTCAGTTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGTTGCTATTAGTTCTCTCACCTATTTGCCAAGAATCAAAGAATATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114147 TGGTTGCTATTAGTTCTCTCACCTATTTGCCAAGAATCAAAGAATATCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATCAACTA         CCTGATTTTCCCTACAAAGATGACCTCCTGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 114197 GATCAACTAGTA...TAGCCTGATTTTCCCTACAAAGATGACCTCCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTGGACTCCAGCTGCCTCCTGTTCATTGTTCTTGTGTTCTTTGCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116491 CTTGGACTCCAGCTGCCTCCTGTTCATTGTTCTTGTGTTCTTTGCCTTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCATCATTTTTAAG         GCTTATCTAATTAACTGTGTTTGGAAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 116541 TCATCATTTTTAAGGTA...CAGGCTTATCTAATTAACTGTGTTTGGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGCTATAAATACATCAACAACCGAAACGTGCCGGAGATTGCTGTGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117133 TGCTATAAATACATCAACAACCGAAACGTGCCGGAGATTGCTGTGTACCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCCTTTGAAGCACCTCCTCAG         TACGTTTTGCCAACCTATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 117183 TGCCTTTGAAGCACCTCCTCAGGTT...TAGTACGTTTTGCCAACCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AAATGGCCGTGAAAATGCCTGAAAAAGAACCACCACCTCCTTACTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118261 AAATGGCCGTGAAAATGCCTGAAAAAGAACCACCACCTCCTTACTTACCT

    750 
    697 GCC
        |||
 118311 GCC