seq1 = pF1KSDA0086.tfa, 3120 bp
seq2 = pF1KSDA0086/gi568815588r_113735155.tfa (gi568815588r:113735155_113953182), 218028 bp

>pF1KSDA0086 3120
>gi568815588r:113735155_113953182 (Chr10)

(complement)

1-460  (100001-100460)   100% ->
461-2125  (102539-104203)   100% ->
2126-2259  (105848-105981)   100% ->
2260-2378  (107380-107498)   100% ->
2379-2519  (108939-109079)   100% ->
2520-2665  (110695-110840)   100% ->
2666-2820  (111623-111777)   100% ->
2821-2962  (115980-116121)   100% ->
2963-3120  (117871-118028)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAGAAGACATTTCCGAAGAAGACATTTGGGAATACAAATCTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAGAAGACATTTCCGAAGAAGACATTTGGGAATACAAATCTAAAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAAACCAAAACGAGTTGATCCAAATAATGGCTCTAAAAATATTCTAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAAACCAAAACGAGTTGATCCAAATAATGGCTCTAAAAATATTCTAAAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTTGAAAAAGCAACAGATGGAAAATACCAGTCAAAACGGAGTAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTTGAAAAAGCAACAGATGGAAAATACCAGTCAAAACGGAGTAGAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAAAAAGAGCCGCAGAAGCTAAAGAGGTGAAGGACCATGAAGTGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAAAAAGAGCCGCAGAAGCTAAAGAGGTGAAGGACCATGAAGTGCCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGAAATGCAGGTTGTCAGACTTCTGTTGCTTCTAGTCAGAATTCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGAAATGCAGGTTGTCAGACTTCTGTTGCTTCTAGTCAGAATTCAAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGGAGATGGTATTCAGCAGACCCAAGACAAGGAAACTACTCCAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGGAGATGGTATTCAGCAGACCCAAGACAAGGAAACTACTCCAGGAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTGTAGAACTCAAAAAAGCCAACACGTGTCCCCAAAGATACGTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTGTAGAACTCAAAAAAGCCAACACGTGTCCCCAAAGATACGTCCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTATGATGGATACTGTCCAAATTGCCAGATGCCTTTTTCCTCATTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTATGATGGATACTGTCCAAATTGCCAGATGCCTTTTTCCTCATTGATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCAGACACCTCGATGGCATGTTTTTGAATGTTTGGATTCTCCACCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCAGACACCTCGATGGCATGTTTTTGAATGTTTGGATTCTCCACCACGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCTGAAACAG         AGTGTCCTGATGGTCTTCTGTGTACCTCAAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCTGAAACAGGTA...CAGAGTGTCCTGATGGTCTTCTGTGTACCTCAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATTCCTTTTCATTACAAGAGATACACTCACTTCCTGCTAGCTCAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102570 CATTCCTTTTCATTACAAGAGATACACTCACTTCCTGCTAGCTCAAAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGGCTGGTGATCATCCTTTTAGCAGCCCATCACCTGCGTCAGGTGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102620 GGGCTGGTGATCATCCTTTTAGCAGCCCATCACCTGCGTCAGGTGGCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TTCAGTGAGACTAAGTCAGGCGTCCTTTGTAGCCTTGAGGAAAGATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102670 TTCAGTGAGACTAAGTCAGGCGTCCTTTGTAGCCTTGAGGAAAGATGGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TTCGTATCAGAACCAAACTGATAACTCGGTTTCAAATGATCCCTTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102720 TTCGTATCAGAACCAAACTGATAACTCGGTTTCAAATGATCCCTTATTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGACACAGTATTTTAAAAAGTCTCCGTCTCTGACTGAAGCCAGTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102770 TGACACAGTATTTTAAAAAGTCTCCGTCTCTGACTGAAGCCAGTGAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATTTCTACTCATATCCAAACATCCCAACAAGCTCTACAATTTACAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102820 ATTTCTACTCATATCCAAACATCCCAACAAGCTCTACAATTTACAGATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGTTGAGAATGACAAACTAGTGGGAGTTGCTTTGCGTCTTGCAAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102870 TGTTGAGAATGACAAACTAGTGGGAGTTGCTTTGCGTCTTGCAAACAACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CAGAACACATAAATTTGCCATTGCCAGAAAATGACTTCAGTGACTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102920 CAGAACACATAAATTTGCCATTGCCAGAAAATGACTTCAGTGACTGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATCTCCTATTCTCCACTTCAAAGTGATGAAGACACTCATGATATCGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102970 ATCTCCTATTCTCCACTTCAAAGTGATGAAGACACTCATGATATCGATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AAAACCGGATGATTCACAAGAACAACTGTTTTTTACCGAAAGCTCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103020 AAAACCGGATGATTCACAAGAACAACTGTTTTTTACCGAAAGCTCAAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ATGGCAGCCTCGAAGAAGATGATGACAGCTGTGGTTTTTTTAAAAAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103070 ATGGCAGCCTCGAAGAAGATGATGACAGCTGTGGTTTTTTTAAAAAACGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CATGGTCCCTTACTGAAGGACCAGGATGAGAGCTGCCCCAAAGTGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103120 CATGGTCCCTTACTGAAGGACCAGGATGAGAGCTGCCCCAAAGTGAACAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CTTCTTAACTCGGGATAAGTATGATGAAGGATTGTATAGATTCAATAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103170 CTTCTTAACTCGGGATAAGTATGATGAAGGATTGTATAGATTCAATAGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TAAATGATTTGTCTCAACCTATTTCTCAAAATAATGAGAGTACTTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103220 TAAATGATTTGTCTCAACCTATTTCTCAAAATAATGAGAGTACTTTGCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TATGATCTGGCATGTACTGGTGGTGATTTTGTGTTGTTTCCACCTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103270 TATGATCTGGCATGTACTGGTGGTGATTTTGTGTTGTTTCCACCTGCATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GGCAGGGAAGCTTGCTGCTTCTGTTCATCAGGCAACTAAAGCAAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103320 GGCAGGGAAGCTTGCTGCTTCTGTTCATCAGGCAACTAAAGCAAAACCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ATGAGCCAGAATTTCACTCAGCTCAATCAAATAAACAGAAACAGGTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103370 ATGAGCCAGAATTTCACTCAGCTCAATCAAATAAACAGAAACAGGTAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GAAGAATCATCTGTTTACAATCAAGTTTCTCTTCCGTTAGTTAAGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103420 GAAGAATCATCTGTTTACAATCAAGTTTCTCTTCCGTTAGTTAAGAGTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AATGTTGAAACCTTTTGAAAGTCAGGTAGAAGGGTATCTTTCTTCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103470 AATGTTGAAACCTTTTGAAAGTCAGGTAGAAGGGTATCTTTCTTCCCAAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 CAACCCAAAATACAATTAGAAAATTATCAAGTGAGAACTTGAATGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103520 CAACCCAAAATACAATTAGAAAATTATCAAGTGAGAACTTGAATGCTAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 AATAATACTAACTCAGCATGTTTCTGCAGAAAGGCATTAGAGGGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103570 AATAATACTAACTCAGCATGTTTCTGCAGAAAGGCATTAGAGGGTGTGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 AGTTGGTAAAGCTACAATTTTAAATACAGAAAACTTGTCTAGTACACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103620 AGTTGGTAAAGCTACAATTTTAAATACAGAAAACTTGTCTAGTACACCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CTCCGAAGTATTTGAAAATATTGCCTTCTGGTCTTAAGTATAATGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103670 CTCCGAAGTATTTGAAAATATTGCCTTCTGGTCTTAAGTATAATGCAAGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CATCCTTCTACCAAGGTAATGAAGCAAATGGATATAGGTGTGTATTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103720 CATCCTTCTACCAAGGTAATGAAGCAAATGGATATAGGTGTGTATTTTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 ACTACCTCCCAAAAGAAAGGAAGAGAAATTGCTAGGGGAAAGTGCATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103770 ACTACCTCCCAAAAGAAAGGAAGAGAAATTGCTAGGGGAAAGTGCATTAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 AAGGGATAAACTTAAATCCAGTTCCAAGTCCTAATCAAAAGAGGTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103820 AAGGGATAAACTTAAATCCAGTTCCAAGTCCTAATCAAAAGAGGTCCTCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 CAGTGCAAGAGGAAAGCAGAAAAATCTTTAAGTGATTTAGAATTTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103870 CAGTGCAAGAGGAAAGCAGAAAAATCTTTAAGTGATTTAGAATTTGATGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 AAGTACTTTACATGAGAGTCAGCTTTCTGTGGAACTTTCTAGTGAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103920 AAGTACTTTACATGAGAGTCAGCTTTCTGTGGAACTTTCTAGTGAGAGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 CACAGCGTCAAAAAAAGAGATGTAGAAAGTCAAATTCACTGCAGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103970 CACAGCGTCAAAAAAAGAGATGTAGAAAGTCAAATTCACTGCAGGAAGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 GCGTGTCAGAAGAGATCAGATCACCTTATTAATACAGAATCTGAAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104020 GCGTGTCAGAAGAGATCAGATCACCTTATTAATACAGAATCTGAAGCAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 CAATTTAAGTAAAGTCAAAGTCTTCACAAAATCAGCTCATGGTGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104070 CAATTTAAGTAAAGTCAAAGTCTTCACAAAATCAGCTCATGGTGGGCTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 AAAGGGGCAACAAGAAAATCCCAGAGTCATCTAATGTAGGAGGATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104120 AAAGGGGCAACAAGAAAATCCCAGAGTCATCTAATGTAGGAGGATCAAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 AAAAAGACATGTCCATTCTATAAGAAAATACCTG         GAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104170 AAAAAGACATGTCCATTCTATAAGAAAATACCTGGTA...CAGGAACCGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2133 CTTTACAGTTGATGCCTTTCAGTATGGCGTGGTTGAAGGTTGCACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105855 CTTTACAGTTGATGCCTTTCAGTATGGCGTGGTTGAAGGTTGCACAGCCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2183 ATTTTCTCACACATTTTCATTCTGATCATTATGCTGGATTGTCTAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105905 ATTTTCTCACACATTTTCATTCTGATCATTATGCTGGATTGTCTAAACAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2233 TTCACATTTCCAGTTTATTGTAGTGAG         ATAACTGGCAATTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105955 TTCACATTTCCAGTTTATTGTAGTGAGGTA...CAGATAACTGGCAATTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2274 GTTGAAGAACAAGCTTCATGTGCAAGAACAATATATTCACCCATTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107394 GTTGAAGAACAAGCTTCATGTGCAAGAACAATATATTCACCCATTGCCAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2324 TGGACACTGAATGTATTGTGAATGGTGTCAAAGTTGTTTTGCTTGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107444 TGGACACTGAATGTATTGTGAATGGTGTCAAAGTTGTTTTGCTTGATGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2374 AATCA         CTGTCCAGGTGCTGTCATGATCCTCTTTTATCTTCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107494 AATCAGTA...CAGCTGTCCAGGTGCTGTCATGATCCTCTTTTATCTTCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2415 TAATGGTACTGTCATATTACACACGGGAGACTTCAGAGCAGATCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108975 TAATGGTACTGTCATATTACACACGGGAGACTTCAGAGCAGATCCCAGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2465 TGGAACGTTCTCTTCTTGCGGACCAGAAAGTCCATATGCTGTACTTAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109025 TGGAACGTTCTCTTCTTGCGGACCAGAAAGTCCATATGCTGTACTTAGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2515 ACCAC         ATATTGTAGCCCAGAATACACCTTTCCATCTCAGCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109075 ACCACGTA...CAGATATTGTAGCCCAGAATACACCTTTCCATCTCAGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2556 AGAGGTTATCCGGTTTGCCATCAACACTGCCTTTGAGGCTGTAACTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110731 AGAGGTTATCCGGTTTGCCATCAACACTGCCTTTGAGGCTGTAACTCTAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2606 ACCCACATGCTCTTGTTGTCTGTGGCACTTACTCTATTGGAAAAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110781 ACCCACATGCTCTTGTTGTCTGTGGCACTTACTCTATTGGAAAAGAGAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2656 GTCTTCCTAG         CCATTGCTGATGTTTTAGGTTCAAAAGTGGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110831 GTCTTCCTAGGTG...TAGCCATTGCTGATGTTTTAGGTTCAAAAGTGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2697 CATGTCCCAGGAAAAATATAAAACTCTACAGTGCCTCAATATACCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111654 CATGTCCCAGGAAAAATATAAAACTCTACAGTGCCTCAATATACCAGAAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2747 TTAATTCACTCATCACTACCGACATGTGCAGTTCATTGGTTCACCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111704 TTAATTCACTCATCACTACCGACATGTGCAGTTCATTGGTTCACCTTCTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2797 CCAATGATGCAAATTAATTTTAAG         GGCTTACAGAGTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 111754 CCAATGATGCAAATTAATTTTAAGGTA...CAGGGCTTACAGAGTCATTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2838 GAAGAAGTGTGGTGGGAAATACAATCAGATTTTGGCATTTCGACCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115997 GAAGAAGTGTGGTGGGAAATACAATCAGATTTTGGCATTTCGACCTACAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2888 GATGGACACACTCTAACAAGTTCACTAGAATAGCAGATGTTATTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116047 GATGGACACACTCTAACAAGTTCACTAGAATAGCAGATGTTATTCCCCAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2938 ACCAAAGGAAACATTTCAATATATG         GAATTCCTTACAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116097 ACCAAAGGAAACATTTCAATATATGGTA...CAGGAATTCCTTACAGTGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2979 ACACAGCAGCTACCTAGAAATGAAGCGCTTTGTCCAGTGGCTGAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117887 ACACAGCAGCTACCTAGAAATGAAGCGCTTTGTCCAGTGGCTGAAGCCCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3029 AGAAAATCATACCTACTGTAAATGTGGGCACCTGGAAATCTAGGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117937 AGAAAATCATACCTACTGTAAATGTGGGCACCTGGAAATCTAGGAGCACA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :
   3079 ATGGAGAAATATTTTAGAGAGTGGAAATTGGAAGCTGGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117987 ATGGAGAAATATTTTAGAGAGTGGAAATTGGAAGCTGGATAT