seq1 = pF1KSDA0083.tfa, 3180 bp
seq2 = pF1KSDA0083/gi568815588r_68315042.tfa (gi568815588r:68315042_68571864), 256823 bp

>pF1KSDA0083 3180
>gi568815588r:68315042_68571864 (Chr10)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-257  (101702-101884)   100% ->
258-441  (103559-103742)   100% ->
442-587  (106053-106198)   100% ->
588-719  (112630-112761)   100% ->
720-939  (121618-121837)   100% ->
940-1057  (125452-125569)   100% ->
1058-1220  (126782-126944)   100% ->
1221-1415  (128754-128948)   100% ->
1416-1646  (134624-134854)   100% ->
1647-1763  (139355-139471)   100% ->
1764-1873  (139550-139659)   100% ->
1874-1983  (139894-140003)   100% ->
1984-2208  (141205-141429)   100% ->
2209-2402  (148975-149168)   100% ->
2403-2492  (149261-149350)   100% ->
2493-2697  (149436-149640)   100% ->
2698-2787  (151973-152062)   100% ->
2788-2967  (152652-152831)   100% ->
2968-3116  (155010-155158)   100% ->
3117-3180  (156760-156823)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCAGCTGAACGAACTGGAGCTGCTGATGGAGAAGAGTTTTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCAGCTGAACGAACTGGAGCTGCTGATGGAGAAGAGTTTTTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGCGGAGCTGCCGGCGGAGCT         ATTTCAGAAGAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 GGAGGCGGAGCTGCCGGCGGAGCTGTG...TAGATTTCAGAAGAAAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAGCTTCCTTTCCAAGAACAGTTCTGAGCACAGGAATGGATAACCGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101719 TAGCTTCCTTTCCAAGAACAGTTCTGAGCACAGGAATGGATAACCGGTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGTGTTGGCAGTCAATACTGTACAGAACAAAGAGGGAAACTGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101769 CTGGTGTTGGCAGTCAATACTGTACAGAACAAAGAGGGAAACTGTGAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGCCTGGTCATCACTGCTTCACAGTCACTAGAAAATAAAGAACTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101819 GCGCCTGGTCATCACTGCTTCACAGTCACTAGAAAATAAAGAACTATGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTTAGGAATGACTG         GTGTTCTGTTCCAGTAGAGCCAGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101869 TCCTTAGGAATGACTGGTA...CAGGTGTTCTGTTCCAGTAGAGCCAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATATCATTCATTTGGAGGGAGACTGCACATCTGACACTTGGATAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103584 GATATCATTCATTTGGAGGGAGACTGCACATCTGACACTTGGATAATAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TAAAGATTTTGGATATTTGATTCTGTATCCAGACATGCTGATTTCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103634 TAAAGATTTTGGATATTTGATTCTGTATCCAGACATGCTGATTTCTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGCATAGCCAGTAGTATTCGATGTATGAGAAGAGCTGTCCTGAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103684 CCAGCATAGCCAGTAGTATTCGATGTATGAGAAGAGCTGTCCTGAGTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ACTTTTAGG         AGCTCTGATCCAGCCACACGCCAAATGCTAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103734 ACTTTTAGGGTA...TAGAGCTCTGATCCAGCCACACGCCAAATGCTAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGTACGGTTCTCCATGAGGTGTTTCAAAAAGCCATAAATAATAGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106085 TGGTACGGTTCTCCATGAGGTGTTTCAAAAAGCCATAAATAATAGCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCCAGAAAAGCTACAAGAACTTGCTTTTCAAACAATTCAAGAAATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106135 CCCCAGAAAAGCTACAAGAACTTGCTTTTCAAACAATTCAAGAAATAAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CATTTGAAGGAAAT         GTACCGCTTAAATCTAAGTCAAGATGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106185 CATTTGAAGGAAATGTA...CAGGTACCGCTTAAATCTAAGTCAAGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AATAAAACAAGAAGTAGAGGACTATCTTCCTTCGTTTTGTAAATGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112657 AATAAAACAAGAAGTAGAGGACTATCTTCCTTCGTTTTGTAAATGGGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAGATTTCATGCATAAAAACACTTCGACTGACTTCCCTCAGATGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112707 GAGATTTCATGCATAAAAACACTTCGACTGACTTCCCTCAGATGCAGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCTCT         GCCAAGTGATAATAGTAAGGATAATTCAACATGTAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112757 TCTCTGTA...CAGGCCAAGTGATAATAGTAAGGATAATTCAACATGTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CATTGAAGTCGTGAAACCAATGGATATTGAAGAAAGCATTTGGTCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121654 CATTGAAGTCGTGAAACCAATGGATATTGAAGAAAGCATTTGGTCCCCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGTTTGGATTGAAAGGCAAAATAGATGTTACAGTTGGTGTGAAAATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121704 GGTTTGGATTGAAAGGCAAAATAGATGTTACAGTTGGTGTGAAAATACAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CGAGGGTATAAAACAAAATACAAGATAATGCCGCTGGAACTTAAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121754 CGAGGGTATAAAACAAAATACAAGATAATGCCGCTGGAACTTAAAACTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CAAAGAATCAAATTCTATTGAACACCGTAGTCAG         GTTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 121804 CAAAGAATCAAATTCTATTGAACACCGTAGTCAGGTA...CAGGTTGTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGTACACTCTACTAAGCCAAGAGAGAAGAGCTGATCCAGAGGCTGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125459 TGTACACTCTACTAAGCCAAGAGAGAAGAGCTGATCCAGAGGCTGGCTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTTCTCTACCTCAAGACTGGTCAGATGTACCCTGTGCCTGCCAACCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125509 CTTCTCTACCTCAAGACTGGTCAGATGTACCCTGTGCCTGCCAACCATCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGATAAAAGAG         AATTATTAAAGCTAAGAAACCAGATGGCAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 125559 AGATAAAAGAGGTT...TAGAATTATTAAAGCTAAGAAACCAGATGGCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCTCATTGTTTCACCGTATTAGCAAATCTGCTACTAGACAGAAGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126812 TCTCATTGTTTCACCGTATTAGCAAATCTGCTACTAGACAGAAGACACAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTTGCTTCTTTGCCACAAATAATTGAGGAAGAGAAAACTTGTAAATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126862 CTTGCTTCTTTGCCACAAATAATTGAGGAAGAGAAAACTTGTAAATATTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TTCACAAATTGGCAATTGTGCTCTTTATAGCAG         AGCAGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126912 TTCACAAATTGGCAATTGTGCTCTTTATAGCAGGTA...TAGAGCAGTTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AACAACAGATGGATTGTAGTTCAGTCCCAATTGTGATGCTGCCCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128762 AACAACAGATGGATTGTAGTTCAGTCCCAATTGTGATGCTGCCCAAAATA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAAGAAGAAACCCAGCATCTGAAGCAAACACACTTAGAATATTTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128812 GAAGAAGAAACCCAGCATCTGAAGCAAACACACTTAGAATATTTCAGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TTGGTGTCTAATGTTAACCCTGGAGTCACAATCGAAGGATAATAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128862 TTGGTGTCTAATGTTAACCCTGGAGTCACAATCGAAGGATAATAAAAAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ATCACCAAAATATCTGGCTAATGCCTGCTTCGGAAAT         GGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 128912 ATCACCAAAATATCTGGCTAATGCCTGCTTCGGAAATGTA...TAGGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AAGAGTGGCAGTTGCATTGGAAACCTGATTAGAATGGAACATGTAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134628 AAGAGTGGCAGTTGCATTGGAAACCTGATTAGAATGGAACATGTAAAGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AGTTTGTGATGGGCAATATTTACATAATTTCCAATGTAAACATGGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134678 AGTTTGTGATGGGCAATATTTACATAATTTCCAATGTAAACATGGTGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TACCTGTCACAAATCTAATGGCAGGTGACAGAGTTATTGTAAGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134728 TACCTGTCACAAATCTAATGGCAGGTGACAGAGTTATTGTAAGTGGAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GAAAGGTCACTGTTTGCTTTGTCTAGAGGATATGTGAAGGAGATTAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134778 GAAAGGTCACTGTTTGCTTTGTCTAGAGGATATGTGAAGGAGATTAACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GACAACAGTAACTTGTTTATTAGACAG         AAACTTGTCGGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 134828 GACAACAGTAACTTGTTTATTAGACAGGTA...TAGAAACTTGTCGGTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 TTCCAGAATCAACTTTGTTCAGATTAGACCAAGAAGAAAAAAATTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139369 TTCCAGAATCAACTTTGTTCAGATTAGACCAAGAAGAAAAAAATTGTGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ATAGATACCCCATTAGGAAATCTTTCCAAATTGATGGAAAACACGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139419 ATAGATACCCCATTAGGAAATCTTTCCAAATTGATGGAAAACACGTTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CAG         CAAAAAACTTCGAGATTTAATTATTGACTTTCGTGAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139469 CAGGTT...CAGCAAAAAACTTCGAGATTTAATTATTGACTTTCGTGAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CTCAGTTTATATCCTACCTTAGTTCTGTTCTTCCACATGATGCAAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139588 CTCAGTTTATATCCTACCTTAGTTCTGTTCTTCCACATGATGCAAAGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 ACAGTTGCCTGCATTCTAAAGG         GTTTGAATAAGCCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 139638 ACAGTTGCCTGCATTCTAAAGGGTA...TAGGTTTGAATAAGCCTCAGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 GCAAGCGATGAAAAAGGTACTTCTTTCAAAAGACTACACACTCATCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139913 GCAAGCGATGAAAAAGGTACTTCTTTCAAAAGACTACACACTCATCGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GTATGCCTGGGACAGGAAAAACAACTACGATATGTACTCTC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 139963 GTATGCCTGGGACAGGAAAAACAACTACGATATGTACTCTCGTA...TAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 GTAAGAATTCTCTACGCCTGTGGTTTTAGCGTTTTGTTGACCAGCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141205 GTAAGAATTCTCTACGCCTGTGGTTTTAGCGTTTTGTTGACCAGCTATAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 ACACTCTGCTGTTGACAATATTCTTTTGAAGTTAGCCAAGTTTAAAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141255 ACACTCTGCTGTTGACAATATTCTTTTGAAGTTAGCCAAGTTTAAAATAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GATTTTTGCGTTTGGGTCAGATTCAGAAGGTTCATCCAGCTATCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141305 GATTTTTGCGTTTGGGTCAGATTCAGAAGGTTCATCCAGCTATCCAGCAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 TTTACAGAGCAAGAAATTTGCAGATCAAAGTCCATTAAATCCTTAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141355 TTTACAGAGCAAGAAATTTGCAGATCAAAGTCCATTAAATCCTTAGCTCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TCTAGAAGAACTCTACAATAGTCAA         CTTATAGTTGCAACAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 141405 TCTAGAAGAACTCTACAATAGTCAAGTA...TAGCTTATAGTTGCAACAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CATGTATGGGAATAAACCATCCAATATTTTCCCGTAAAATTTTTGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148991 CATGTATGGGAATAAACCATCCAATATTTTCCCGTAAAATTTTTGATTTT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 TGTATTGTGGATGAAGCCTCTCAAATTAGCCAACCAATTTGTCTGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149041 TGTATTGTGGATGAAGCCTCTCAAATTAGCCAACCAATTTGTCTGGGCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CCTTTTTTTTTCACGGAGATTTGTGTTAGTGGGGGACCATCAGCAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149091 CCTTTTTTTTTCACGGAGATTTGTGTTAGTGGGGGACCATCAGCAGCTTC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 CTCCCCTGGTGCTAAACCGTGAAGCAAG         AGCTCTTGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 149141 CTCCCCTGGTGCTAAACCGTGAAGCAAGGTA...CAGAGCTCTTGGCATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 AGTGAAAGCTTATTCAAGAGGCTGGAGCAGAATAAGAGTGCTGTTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149274 AGTGAAAGCTTATTCAAGAGGCTGGAGCAGAATAAGAGTGCTGTTGTACA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 GTTAACCGTGCAGTACAGAATGAACAG         TAAAATTATGTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 149324 GTTAACCGTGCAGTACAGAATGAACAGGTA...TAGTAAAATTATGTCCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TAAGTAATAAGCTGACCTATGAGGGCAAGCTGGAGTGTGGATCAGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149450 TAAGTAATAAGCTGACCTATGAGGGCAAGCTGGAGTGTGGATCAGACAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 GTGGCCAATGCAGTGATAAACCTACGTCACTTTAAAGATGTGAAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149500 GTGGCCAATGCAGTGATAAACCTACGTCACTTTAAAGATGTGAAGCTGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 ACTGGAATTTTATGCTGACTATTCTGATAATCCTTGGTTGATGGGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149550 ACTGGAATTTTATGCTGACTATTCTGATAATCCTTGGTTGATGGGAGTAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 TTGAACCCAACAATCCTGTTTGTTTCCTTAATACAGACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 149600 TTGAACCCAACAATCCTGTTTGTTTCCTTAATACAGACAAGGTA...TAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GTTCCAGCGCCAGAACAAGTTGAAAAAGGTGGTGTGAGCAATGTAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151973 GTTCCAGCGCCAGAACAAGTTGAAAAAGGTGGTGTGAGCAATGTAACAGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 AGCCAAACTCATAGTTTTCCTAACCTCCATTTTTGTTAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 152023 AGCCAAACTCATAGTTTTCCTAACCTCCATTTTTGTTAAGGTA...TAGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 CTGGATGCAGTCCCTCTGATATTGGTATTATTGCACCGTACAGGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152653 CTGGATGCAGTCCCTCTGATATTGGTATTATTGCACCGTACAGGCAGCAA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 TTAAAGATCATCAATGATTTATTGGCACGTTCTATTGGGATGGTCGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152703 TTAAAGATCATCAATGATTTATTGGCACGTTCTATTGGGATGGTCGAAGT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 TAATACAGTAGACAAATACCAAGGAAGGGACAAAAGTATTGTCCTAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152753 TAATACAGTAGACAAATACCAAGGAAGGGACAAAAGTATTGTCCTAGTAT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2939 CTTTTGTTAGAAGTAATAAGGATGGAACT         GTTGGTGAACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 152803 CTTTTGTTAGAAGTAATAAGGATGGAACTGTG...CAGGTTGGTGAACTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 TTGAAAGATTGGCGACGTCTTAATGTTGCTATAACCAGAGCCAAACATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155022 TTGAAAGATTGGCGACGTCTTAATGTTGCTATAACCAGAGCCAAACATAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 ACTGATTCTTCTGGGGTGTGTGCCCTCACTAAATTGCTATCCTCCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155072 ACTGATTCTTCTGGGGTGTGTGCCCTCACTAAATTGCTATCCTCCTTTGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 AGAAGCTGCTTAATCATTTAAACTCAGAAAAATTAAT         CATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 155122 AGAAGCTGCTTAATCATTTAAACTCAGAAAAATTAATATC...CATCATT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3121 GATCTTCCATCAAGAGAACATGAAAGTCTTTGCCACATACTGGGTGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 156764 GATCTTCCATCAAGAGAACATGAAAGTCTTTGCCACATATTGGGTGACTT

   3350     .    :
   3171 TCAAAGAGAA
        ||||||||||
 156814 TCAAAGAGAA