seq1 = pF1KSDA0081.tfa, 702 bp
seq2 = pF1KSDA0081/gi568815583r_80879222.tfa (gi568815583r:80879222_81089791), 210570 bp

>pF1KSDA0081 702
>gi568815583r:80879222_81089791 (Chr15)

(complement)

1-213  (100001-100213)   100% ->
214-446  (107610-107842)   100% ->
447-702  (110315-110570)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTTCCAGGTGGGCGCGCAAGGCCGTGGTCCTGCTTTGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTTCCAGGTGGGCGCGCAAGGCCGTGGTCCTGCTTTGTGCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACCTGCTGCTGCTGCTGCTACTGCTACCACCGCCTGGGTCCTGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACCTGCTGCTGCTGCTGCTACTGCTACCACCGCCTGGGTCCTGCGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAAGGCTCGCCCGGGACGCCCGACGAGTCTACCCCACCTCCCCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAAGGCTCGCCCGGGACGCCCGACGAGTCTACCCCACCTCCCCGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAGAAGGATATTCGCGATTACAATGATGCAGACATGGCGCGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGAAGAAGGATATTCGCGATTACAATGATGCAGACATGGCGCGTCTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGCAATGGGAG         AAAGATGATGACATTGAAGAAGGAGATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGCAATGGGAGGTC...TAGAAAGATGATGACATTGAAGAAGGAGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCCAGAGCACAAGAGACCTTCAGCACCTGTCGACTTCTCAAAGATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107638 TTCCAGAGCACAAGAGACCTTCAGCACCTGTCGACTTCTCAAAGATAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAAGCAAGCCTGAAAGCATATTGAAAATGACGAAAAAAGGGAAGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107688 CCAAGCAAGCCTGAAAGCATATTGAAAATGACGAAAAAAGGGAAGACTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGATGTTTGTCACTGTATCAGGAAGCCCTACTGAGAAGGAGACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107738 CATGATGTTTGTCACTGTATCAGGAAGCCCTACTGAGAAGGAGACAGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAATTACGAGCCTCTGGCAGGGCAGCCTTTTCAATGCCAACTATGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107788 AAATTACGAGCCTCTGGCAGGGCAGCCTTTTCAATGCCAACTATGACGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGAG         GTTCATTGTGGGATCAGACCGTGCTATCTTCATGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107838 CAGAGGTA...AAGGTTCATTGTGGGATCAGACCGTGCTATCTTCATGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TCGCGATGGGAGCTACGCCTGGGAGATCAAGGACTTTTTGGTCGGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110351 TCGCGATGGGAGCTACGCCTGGGAGATCAAGGACTTTTTGGTCGGTCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACAGGTGTGCTGATGTAACTCTGGAGGGCCAGGTGTACCCCGGCAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110401 ACAGGTGTGCTGATGTAACTCTGGAGGGCCAGGTGTACCCCGGCAAAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGAGGAAGCAAAGAGAAAAATAAAACAAAGCAAGACAAGGGCAAAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110451 GGAGGAAGCAAAGAGAAAAATAAAACAAAGCAAGACAAGGGCAAAAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAAGGAAGGAGATCTGAAATCTCGGTCTTCCAAGGAAGAAAATCGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110501 GAAGGAAGGAGATCTGAAATCTCGGTCTTCCAAGGAAGAAAATCGAGCTG

    700     .    :    .    :
    683 GGAATAAAAGAGAAGACCTG
        ||||||||||||||||||||
 110551 GGAATAAAAGAGAAGACCTG