seq1 = pF1KSDA0065.tfa, 2430 bp
seq2 = pF1KSDA0065/gi568815588f_37916869.tfa (gi568815588f:37916869_38156557), 239689 bp

>pF1KSDA0065 2430
>gi568815588f:37916869_38156557 (Chr10)

1-154  (99994-100147)   97% ->
155-250  (100423-100518)   100% ->
251-2430  (137510-139689)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATG AACAAGGTAGAACAGAAGTCCCAGGAGTCAGTATCATTTAAAGATG
        |||-  ||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 ATGTTTCA GGTAGAACAGAAGTCCCAGGAGTCAGTATCATTTAAAGATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 TGACTGTGGGCTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCACCTGGACCCTAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100043 TGACTGTGGGCTTCACCCAGGAGGAGTGGCAGCACCTGGACCCTAGTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 AGGGCTCTGTATAGAGATGTGATGCTGGAGAACTACAGCAACCTTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100093 AGGGCTCTGTATAGAGATGTGATGCTGGAGAACTACAGCAACCTTGTCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    150 AGTGG         GGTATTGTGTTCACAAACCAGAGGTGATCTTCAGGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100143 AGTGGGTA...CAGGGTATTGTGTTCACAAACCAGAGGTGATCTTCAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 TGCAACAAGGAGAAGAGCCATGGAAACAGGAGGAAGAATTCCCAAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100459 TGCAACAAGGAGAAGAGCCATGGAAACAGGAGGAAGAATTCCCAAGCCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 AGCTTTCCAG         TCTGGACAGCTGATCACCTGAAAGAGAGGAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100509 AGCTTTCCAGGTG...AAGTCTGGACAGCTGATCACCTGAAAGAGAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 CCAAGAAAACCAATCTAAACATTTGTGGGAAGTTGTATTCATCAATAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137541 CCAAGAAAACCAATCTAAACATTTGTGGGAAGTTGTATTCATCAATAATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332 AAATGCTGACTAAGGAACAAGGTGATGTAATAGGAATACCATTTAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137591 AAATGCTGACTAAGGAACAAGGTGATGTAATAGGAATACCATTTAATGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382 GATGTAAGTTCTTTTCCTTCCAGAAAAATGTTCTGTCAGTGTGATTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137641 GATGTAAGTTCTTTTCCTTCCAGAAAAATGTTCTGTCAGTGTGATTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432 TGGAATGAGTTTCAACACTGTTTCAGAATTGGTTATCAGTAAGATAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137691 TGGAATGAGTTTCAACACTGTTTCAGAATTGGTTATCAGTAAGATAAACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482 ATTTAGGAAAAAAGTCTGATGAATTTAATGCCTGTGGGAAATTGTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137741 ATTTAGGAAAAAAGTCTGATGAATTTAATGCCTGTGGGAAATTGTTACTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532 AATATTAAGCATGATGAAACTCATACTCAAGAGAAAAATGAAGTTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137791 AATATTAAGCATGATGAAACTCATACTCAAGAGAAAAATGAAGTTTTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    582 AAATAGGAACACACTGAGTCATCATGAGGAGACTTTGCAGCATGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137841 AAATAGGAACACACTGAGTCATCATGAGGAGACTTTGCAGCATGAGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    632 TTCAAACTTTAGAGCACAATTTTGAATACAGTATATGTCAGGAAACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137891 TTCAAACTTTAGAGCACAATTTTGAATACAGTATATGTCAGGAAACCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682 CTTGAAAAGGCAGTATTCAATACACAGAAGAGAGAGAACGCAGAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137941 CTTGAAAAGGCAGTATTCAATACACAGAAGAGAGAGAACGCAGAAGAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732 TAACTGTGATTATAATGAATTTGGGAGAACTTTGTGTGATAGTTCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137991 TAACTGTGATTATAATGAATTTGGGAGAACTTTGTGTGATAGTTCATCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    782 TCTTGTTCCATCAGATATCTCCGTCAAGGGACAATCACTATGAATTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138041 TCTTGTTCCATCAGATATCTCCGTCAAGGGACAATCACTATGAATTTAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832 GATTGTGAGAAGTTCTTATGTGTGAAGTCCACCCTTTCTAAACCTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138091 GATTGTGAGAAGTTCTTATGTGTGAAGTCCACCCTTTCTAAACCTCATGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    882 GGTATCTATGAAACACTATGATTGTGGTGAAAGTGGGAATAATTTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138141 GGTATCTATGAAACACTATGATTGTGGTGAAAGTGGGAATAATTTCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    932 GGAAATTGTGTCTGTCACACCTTCAGAAAGGTGATAAAGGAGAGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138191 GGAAATTGTGTCTGTCACACCTTCAGAAAGGTGATAAAGGAGAGAAACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    982 TTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCTGGGAGAAGTCACATCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138241 TTTGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCTTTCTGGGAGAAGTCACATCTCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032 TCGACATCAGAGGGTGCACACAGGACAGAAACCCTTTCAATGTAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138291 TCGACATCAGAGGGTGCACACAGGACAGAAACCCTTTCAATGTAATGAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1082 GTGAAAAAGCTTTCTGGGATAAGTCAAACCTCACTAAACATCAAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138341 GTGAAAAAGCTTTCTGGGATAAGTCAAACCTCACTAAACATCAAAGATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132 CACACAGGGGAGAAACCTTTTGAATGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138391 CACACAGGGGAGAAACCTTTTGAATGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1182 CCATAAGTCAGCCCTCACATTACACCAGAGAACACATACAGGGGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138441 CCATAAGTCAGCCCTCACATTACACCAGAGAACACATACAGGGGAGAAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1232 CCTATCAATGTAATGCGTGTGGGAAAACTTTTTGCCAGAAATCTGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138491 CCTATCAATGTAATGCGTGTGGGAAAACTTTTTGCCAGAAATCTGACCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282 ACTAAACATCAGAGAACACACACAGGGCTGAAACCCTATGAATGTTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138541 ACTAAACATCAGAGAACACACACAGGGCTGAAACCCTATGAATGTTATGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1332 ATGTGGAAAATCCTTCCGTGTGACTTCGCACCTTAAAGTACACCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138591 ATGTGGAAAATCCTTCCGTGTGACTTCGCACCTTAAAGTACACCAGAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1382 CTCACACAGGTGAGAAACCTTTTGAATGTCTTGAGTGTGGGAAATCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138641 CTCACACAGGTGAGAAACCTTTTGAATGTCTTGAGTGTGGGAAATCCTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1432 AGTGAAAAGTCAAATCTTACACAGCATCAGAGAATTCACATAGGAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138691 AGTGAAAAGTCAAATCTTACACAGCATCAGAGAATTCACATAGGAGATAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1482 ATCTTATGAATGTAATGCATGTGGGAAAACTTTCTACCACAAGTCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138741 ATCTTATGAATGTAATGCATGTGGGAAAACTTTCTACCACAAGTCATTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1532 TCACCAGGCATCAGATAATTCATACAGGGTGGAAACCTTATGAATGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138791 TCACCAGGCATCAGATAATTCATACAGGGTGGAAACCTTATGAATGTTAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1582 GAATGTGGGAAAACCTTCTGCTTGAAGTCAGACCTCACAGTACATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138841 GAATGTGGGAAAACCTTCTGCTTGAAGTCAGACCTCACAGTACATCAGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1632 AACACACACAGGGCAGAAACCCTTTGCATGTCCCGAATGTGGGAAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138891 AACACACACAGGGCAGAAACCCTTTGCATGTCCCGAATGTGGGAAATTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1682 TTAGCCATAAGTCAACCCTCTCTCAACATTATAGAACACACACAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138941 TTAGCCATAAGTCAACCCTCTCTCAACATTATAGAACACACACAGGGGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1732 AAACCCTACGAATGTCATGAATGTGGAAAAATCTTTTACAATAAATCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138991 AAACCCTACGAATGTCATGAATGTGGAAAAATCTTTTACAATAAATCATA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1782 CCTAACTAAACATAATAGAACACATACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139041 CCTAACTAAACATAATAGAACACATACAGGGGAGAAACCCTATGAATGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1832 ATGAATGTGGAAAAGCCTTCTACCAGAAGTCACAACTCACTCAGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139091 ATGAATGTGGAAAAGCCTTCTACCAGAAGTCACAACTCACTCAGCATCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1882 AGAATTCACATAGGGGAGAAACCCTATAAATGTAATGAGTGTGGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139141 AGAATTCACATAGGGGAGAAACCCTATAAATGTAATGAGTGTGGAAAAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1932 TTTCTGCCATAAGTCAGCTCTAATTGTACATCAGAGAACCCATACACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139191 TTTCTGCCATAAGTCAGCTCTAATTGTACATCAGAGAACCCATACACAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1982 AAAAGCCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAAATCTTTCTGTGTAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139241 AAAAGCCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAAATCTTTCTGTGTAAAATCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2032 GGACTTATTTTCCATGAGAGAAAGCACACGGGGGAGAAACCCTATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139291 GGACTTATTTTCCATGAGAGAAAGCACACGGGGGAGAAACCCTATGAATG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2082 CAATGAATGTGGGAAATTCTTCAGGCACAAATCATCACTCACAGTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139341 CAATGAATGTGGGAAATTCTTCAGGCACAAATCATCACTCACAGTACATC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2132 ACAGGGCTCACACAGGAGAGAAATCTTGTCAATGTAATGAATGTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139391 ACAGGGCTCACACAGGAGAGAAATCTTGTCAATGTAATGAATGTGGAAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2182 ATCTTTTACCGTAAATCGGAACTTGCTCAACATCAGAGATCACATACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139441 ATCTTTTACCGTAAATCGGAACTTGCTCAACATCAGAGATCACATACAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2232 GGAAAAGCCCTATGAATGTAACACATGCAGGAAAACTTTCTCTCAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139491 GGAAAAGCCCTATGAATGTAACACATGCAGGAAAACTTTCTCTCAAAAGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2282 CAAATCTCATTGTACATCAGAGAAGACATATAGGAGAAAACCTTATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139541 CAAATCTCATTGTACATCAGAGAAGACATATAGGAGAAAACCTTATGAAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2332 GAAATGGATATTAGAAATTTCCAGCCACAAGTCAGCCTCCATAATGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139591 GAAATGGATATTAGAAATTTCCAGCCACAAGTCAGCCTCCATAATGCCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2382 AGAGTATTCACACTGTGGAGAAAGCCCTGATGACATCCTGAATGTTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139641 AGAGTATTCACACTGTGGAGAAAGCCCTGATGACATCCTGAATGTTCAG