seq1 = pF1KSDA0037.tfa, 3240 bp
seq2 = pF1KSDA0037/gi568815582f_50188180.tfa (gi568815582f:50188180_50415502), 227323 bp

>pF1KSDA0037 3240
>gi568815582f:50188180_50415502 (Chr16)

1-171  (100001-100171)   100% ->
172-375  (102278-102481)   100% ->
376-537  (103557-103718)   100% ->
538-687  (104497-104646)   99% ->
688-836  (105175-105323)   100% ->
837-948  (106461-106572)   100% ->
949-1076  (110725-110852)   100% ->
1077-1235  (112536-112694)   100% ->
1236-1368  (112903-113035)   100% ->
1369-1560  (116181-116372)   100% ->
1561-1595  (116746-116780)   100% ->
1596-1679  (117324-117407)   100% ->
1680-1752  (117598-117670)   100% ->
1753-1850  (118871-118968)   100% ->
1851-1935  (120148-120232)   100% ->
1936-2061  (120488-120613)   100% ->
2062-2160  (121369-121467)   100% ->
2161-2354  (122508-122701)   100% ->
2355-2448  (123514-123607)   100% ->
2449-2604  (123857-124012)   100% ->
2605-2751  (124711-124857)   100% ->
2752-2856  (125779-125883)   100% ->
2857-2971  (126113-126227)   100% ->
2972-3096  (126835-126959)   100% ->
3097-3240  (127180-127323)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGCCAAGGGGCGCTACTTCCTCAACGAGGGCGAGGAGGGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGCCAAGGGGCGCTACTTCCTCAACGAGGGCGAGGAGGGCCCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAAGATGCGCTCTACGAGAAGTACCAGCTCACCAGCCAGCATGGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAAGATGCGCTCTACGAGAAGTACCAGCTCACCAGCCAGCATGGGCCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGCTCACGCTCCTGCTGGTGGCCGCCACTGCCTGCGTGGCCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGCTCACGCTCCTGCTGGTGGCCGCCACTGCCTGCGTGGCCCTCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCATTGCCTTCAGCCAGGGG         GACCCCTCCAGACACCAGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 ATCATTGCCTTCAGCCAGGGGGTG...CAGGACCCCTCCAGACACCAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTCTGGGCATGGCGTTCCTGGTGCTGGCGGTGTTTGCGGCCCTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102298 CATTCTGGGCATGGCGTTCCTGGTGCTGGCGGTGTTTGCGGCCCTCTCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTGATGTACGTCGAGTGTCTCCTGCGGCGCTGGCTCAGGGCCTTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102348 TGCTGATGTACGTCGAGTGTCTCCTGCGGCGCTGGCTCAGGGCCTTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCTCACCTGGGCCTGCTTGGTGGCGCTGGGCTATGTGCTGGTGTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102398 CTGCTCACCTGGGCCTGCTTGGTGGCGCTGGGCTATGTGCTGGTGTTCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCATGGACAAAGGCGGCCTGTGCGTGGGAGCAG         GTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102448 CGCATGGACAAAGGCGGCCTGTGCGTGGGAGCAGGTA...CAGGTGCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCTTCCTGTTCATTGTCTTCGTGGTGTACACACTACTGCCCTTCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103564 TCTTCCTGTTCATTGTCTTCGTGGTGTACACACTACTGCCCTTCAGCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGGGGCGCTGTCGCCGTTGGGGCCGTCTCCACTGCCTCCCACCTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103614 CGGGGCGCTGTCGCCGTTGGGGCCGTCTCCACTGCCTCCCACCTCCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTCGGTTCTTTGATGGGAGGCTTCACGACACCCAGTGTCCGGGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103664 GCTCGGTTCTTTGATGGGAGGCTTCACGACACCCAGTGTCCGGGTGGGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCAG         CTGCTGGCCAACGCAGTCATCTTCCTGTGTGGGAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103714 TGCAGGTG...CAGCTGCTGGCCAACGCAGTCATCTTCCTGTGTGGGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGACAGGCGCCTTCCACAAGCACCAAATGCAGGATGCGTCCCGGGACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 104533 CTGACAGGCGCCTTCCACAAGCACCAAATGCAGGATGCATCCCGGGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTCACCTACACTGTGAAGTGCATCCAGATCCGCCGGAAGCTGCGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104583 CTTCACCTACACTGTGAAGTGCATCCAGATCCGCCGGAAGCTGCGCATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGAAGCGCCAGCAG         GAGAACCTGCTGCTGTCAGTGCTTCCG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104633 AGAAGCGCCAGCAGGTG...CAGGAGAACCTGCTGCTGTCAGTGCTTCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCCACATCTCCATGGGCATGAAGCTGGCCATCATCGAACGGCTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105202 GCCCACATCTCCATGGGCATGAAGCTGGCCATCATCGAACGGCTCAAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCATGGTGACCGTCGCTGCATGCCTGACAACAACTTCCACAGCCTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105252 GCATGGTGACCGTCGCTGCATGCCTGACAACAACTTCCACAGCCTCTACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCAAGAGGCACCAGAATGTCAG         CATCCTCTATGCGGACATC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105302 TCAAGAGGCACCAGAATGTCAGGTG...CAGCATCCTCTATGCGGACATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGGGCTTCACGCAGCTGGCCAGCGACTGTTCTCCCAAGGAGCTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106480 GTGGGCTTCACGCAGCTGGCCAGCGACTGTTCTCCCAAGGAGCTGGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGTGCTGAATGAGCTCTTTGGCAAGTTCGACCAGATCGCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106530 GGTGCTGAATGAGCTCTTTGGCAAGTTCGACCAGATCGCCAAGGTG...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    949   GCCAACGAGTGCATGCGAATCAAGATCCTCGGCGACTGCTACTACTGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110723 AGGCCAACGAGTGCATGCGAATCAAGATCCTCGGCGACTGCTACTACTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTATCGGGCCTGCCCGTGTCGCTGCCTACCCACGCCCGGAACTGCGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110773 GTATCGGGCCTGCCCGTGTCGCTGCCTACCCACGCCCGGAACTGCGTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GATGGGGCTGGACATGTGCCAGGCCATCAA         GCAGGTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110823 GATGGGGCTGGACATGTGCCAGGCCATCAAGTA...CAGGCAGGTGCGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGCCACGGGCGTGGACATCAACATGCGTGTGGGCATACACTCGGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112547 AGGCCACGGGCGTGGACATCAACATGCGTGTGGGCATACACTCGGGGAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTGCTGTGCGGGGTCATCGGGCTGCGCAAGTGGCAGTATGACGTGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112597 GTGCTGTGCGGGGTCATCGGGCTGCGCAAGTGGCAGTATGACGTGTGGTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCACGACGTGTCCCTGGCCAACCGGATGGAGGCAGCCGGAGTACCCGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 112647 CCACGACGTGTCCCTGGCCAACCGGATGGAGGCAGCCGGAGTACCCGGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1236        CCGGGTGCACATCACGGAGGCCACGCTAAAGCACCTGGACAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112697 G...TAGCCGGGTGCACATCACGGAGGCCACGCTAAAGCACCTGGACAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCGTACGAGGTGGAGGATGGGCACGGGCAGCAGCGGGACCCCTACCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112946 GCGTACGAGGTGGAGGATGGGCACGGGCAGCAGCGGGACCCCTACCTCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGAGATGAACATCCGCACCTACCTGGTCATCGACCCCCGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112996 GGAGATGAACATCCGCACCTACCTGGTCATCGACCCCCGGGTA...CAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GCCAGCAGCCACCCCCGCCCAGCCAACACCTCCCCAGGCCCAAGGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116182 GCCAGCAGCCACCCCCGCCCAGCCAACACCTCCCCAGGCCCAAGGGGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GCGGCCCTGAAGATGCGGGCGTCAGTGCGCATGACCCGGTACCTCGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116232 GCGGCCCTGAAGATGCGGGCGTCAGTGCGCATGACCCGGTACCTCGAGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CTGGGGGGCGGCACGGCCCTTTGCACATCTCAACCACCGTGAGAGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116282 CTGGGGGGCGGCACGGCCCTTTGCACATCTCAACCACCGTGAGAGCGTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GCAGTGGTGAGACCCACGTCCCCAACGGGCGGAGGCCTAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 116332 GCAGTGGTGAGACCCACGTCCCCAACGGGCGGAGGCCTAAGGTA...CAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AGCGTTCCCCAGCGCCACCGCCGGACCCCAGACAG         AAGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 116746 AGCGTTCCCCAGCGCCACCGCCGGACCCCAGACAGGTG...CAGAAGCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GTCCCCCAAGGGGCGGTCGGAGGATGACTCGTACGATGACGAGATGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117330 GTCCCCCAAGGGGCGGTCGGAGGATGACTCGTACGATGACGAGATGCTGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CAGCCATTGAGGGGCTCAGCTCCACGAG         GCCCTGCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 117380 CAGCCATTGAGGGGCTCAGCTCCACGAGGTG...CAGGCCCTGCTGCTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AAGTCCGATGACTTCTACACCTTTGGGTCCATCTTCCTGGAGAAGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117611 AAGTCCGATGACTTCTACACCTTTGGGTCCATCTTCCTGGAGAAGGGCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TGAGCGCGAG         TACCGCCTGGCACCCATCCCCCGGGCCCGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 117661 TGAGCGCGAGGTG...CAGTACCGCCTGGCACCCATCCCCCGGGCCCGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ACGACTTTGCCTGCGCCAGCCTGATCTTCGTCTGCATCCTGCTCGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118902 ACGACTTTGCCTGCGCCAGCCTGATCTTCGTCTGCATCCTGCTCGTCCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTCCTGCTCATGCCCAG         GACGGCGGCACTGGGTGTGTCCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118952 GTCCTGCTCATGCCCAGGTC...CAGGACGGCGGCACTGGGTGTGTCCTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CGGGCTGGTGGCCTGTGTACTGGGGCTGGTGCTGGGCCTGTGCTTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120172 CGGGCTGGTGGCCTGTGTACTGGGGCTGGTGCTGGGCCTGTGCTTTGCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCAAGTTCTCG         AGGTGCTGCCCAGCTCGGGGGACGCTCTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 120222 CCAAGTTCTCGGTA...CAGAGGTGCTGCCCAGCTCGGGGGACGCTCTGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 ACTATCTCTGAGAGGGTGGAGACACAGCCCCTGCTGAGGCTGACCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120518 ACTATCTCTGAGAGGGTGGAGACACAGCCCCTGCTGAGGCTGACCCTGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CGTCCTGACCATCGGCAGCCTGCTCACTGTGGCCATCATCAACCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 120568 CGTCCTGACCATCGGCAGCCTGCTCACTGTGGCCATCATCAACCTGGTG.

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2062      CCCCTGATGCCTTTCCAAGTTCCAGAGCTGCCTGTTGGCAATGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120618 ..CAGCCCCTGATGCCTTTCCAAGTTCCAGAGCTGCCTGTTGGCAATGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 ACAGGCCTACTGGCCGCGAGCAGCAAGACAAGAGCCCTGTGTGAGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121414 ACAGGCCTACTGGCCGCGAGCAGCAAGACAAGAGCCCTGTGTGAGCCCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CCCG         TACTACACCTGCAGCTGTGTCCTGGGCTTCATCGCCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121464 CCCGGTG...CAGTACTACACCTGCAGCTGTGTCCTGGGCTTCATCGCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 GCTCGGTCTTCCTGAGGATGAGCCTGGAGCCAAAGGTTGTGCTGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122545 GCTCGGTCTTCCTGAGGATGAGCCTGGAGCCAAAGGTTGTGCTGCTGACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GTGGCCCTGGTGGCCTACCTGGTGCTCTTCAACCTCTCCCCATGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122595 GTGGCCCTGGTGGCCTACCTGGTGCTCTTCAACCTCTCCCCATGCTGGCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GTGGGACTGCTGCGGCCAAGGCCTGGGCAACCTCACCAAGCCCAACGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122645 GTGGGACTGCTGCGGCCAAGGCCTGGGCAACCTCACCAAGCCCAACGGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 CCACCAG         TGGCACCCCTAGCTGTTCCTGGAAGGACCTGAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122695 CCACCAGGTG...CAGTGGCACCCCTAGCTGTTCCTGGAAGGACCTGAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 ACCATGACCAATTTCTACCTGGTCCTGTTCTACATCACCCTGCTTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123548 ACCATGACCAATTTCTACCTGGTCCTGTTCTACATCACCCTGCTTACACT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 CTCCAGACAG         ATTGACTATTACTGCCGCTTGGACTGCCTAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 123598 CTCCAGACAGGTA...CAGATTGACTATTACTGCCGCTTGGACTGCCTAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 GGAAGAAGAAGTTCAAGAAGGAGCACGAGGAGTTTGAGACCATGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123888 GGAAGAAGAAGTTCAAGAAGGAGCACGAGGAGTTTGAGACCATGGAGAAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GTGAACCGCCTTCTTCTGGAGAACGTCCTGCCAGCCCACGTGGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123938 GTGAACCGCCTTCTTCTGGAGAACGTCCTGCCAGCCCACGTGGCTGCCCA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CTTTATCGGTGACAAGTTAAACGAG         GACTGGTACCATCAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 123988 CTTTATCGGTGACAAGTTAAACGAGGTG...CAGGACTGGTACCATCAGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 CCTATGACTGCGTCTGTGTCATGTTTGCCTCCGTGCCGGACTTCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124727 CCTATGACTGCGTCTGTGTCATGTTTGCCTCCGTGCCGGACTTCAAAGTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 TTCTACACAGAGTGCGATGTCAACAAAGAAGGGCTGGAGTGCCTACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124777 TTCTACACAGAGTGCGATGTCAACAAAGAAGGGCTGGAGTGCCTACGCCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GCTCAATGAGATCATTGCCGACTTCGACGAG         CTCCTACTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 124827 GCTCAATGAGATCATTGCCGACTTCGACGAGGTA...CAGCTCCTACTGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 AGCCCAAGTTCAGCGGCGTGGAGAAGATCAAGACCATCGGCAGCACGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125789 AGCCCAAGTTCAGCGGCGTGGAGAAGATCAAGACCATCGGCAGCACGTAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 ATGGCAGCTGCAGGGCTCAGCGTCGCCTCAGGGCACGAGAACCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 125839 ATGGCAGCTGCAGGGCTCAGCGTCGCCTCAGGGCACGAGAACCAGGTA..

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2857     GAGCTGGAGCGGCAGCATGCCCACATTGGTGTCATGGTGGAGTTCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125889 .CAGGAGCTGGAGCGGCAGCATGCCCACATTGGTGTCATGGTGGAGTTCA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 GCATCGCCCTGATGAGTAAGCTGGACGGCATCAACAGGCACTCCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126159 GCATCGCCCTGATGAGTAAGCTGGACGGCATCAACAGGCACTCCTTCAAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 TCCTTCCGCCTCCGCGTCG         GCATAAACCATGGGCCTGTGAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 126209 TCCTTCCGCCTCCGCGTCGGTG...CAGGCATAAACCATGGGCCTGTGAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2994 TGCTGGAGTGATTGGGGCCCGAAAACCTCAGTATGACATCTGGGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126857 TGCTGGAGTGATTGGGGCCCGAAAACCTCAGTATGACATCTGGGGAAACA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 CTGTCAATGTGGCCAGCCGAATGGAAAGCACTGGAGAACTTGGGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126907 CTGTCAATGTGGCCAGCCGAATGGAAAGCACTGGAGAACTTGGGAAAATC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 CAG         GTTACCGAGGAGACCTGCACCATCCTCCAGGGCCTCGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126957 CAGGTA...CAGGTTACCGAGGAGACCTGCACCATCCTCCAGGGCCTCGG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3135 GTACTCTTGTGAATGCCGTGGCCTGATCAACGTCAAAGGCAAAGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127218 GTACTCTTGTGAATGCCGTGGCCTGATCAACGTCAAAGGCAAAGGCGAGC

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3185 TGAGGACTTACTTTGTCTGTACGGACACTGCCAAGTTTCAGGGGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127268 TGAGGACTTACTTTGTCTGTACGGACACTGCCAAGTTTCAGGGGCTGGGG

   3450     .
   3235 CTGAAC
        ||||||
 127318 CTGAAC