seq1 = pF1KSDA0026.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KSDA0026/gi568815575r_103576164.tfa (gi568815575r:103576164_103777027), 200864 bp

>pF1KSDA0026 864
>gi568815575r:103576164_103777027 (ChrX)

(complement)

1-864  (100001-100864)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTCCAGAAAGCAGGGTTCTCAACCTCGTGGACAGCAATCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTCCAGAAAGCAGGGTTCTCAACCTCGTGGACAGCAATCTGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAGAGAACTTCAAAAAACCAACTAGAAGCAACATGCAGAGAAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAAGAGAACTTCAAAAAACCAACTAGAAGCAACATGCAGAGAAGTAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAGAGGGGCCTCCTCAGGAAAGAAGACAGCTGGTCCACAGCAGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAGAGGGGCCTCCTCAGGAAAGAAGACAGCTGGTCCACAGCAGAAAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTGAACCAGCTCTCCCAGGAAGATGGGGTGGTCGCTCTGCAGAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTGAACCAGCTCTCCCAGGAAGATGGGGTGGTCGCTCTGCAGAGAACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCTTCAGGATCCGTGAGGAAGACCAGAAAGAACAAGCAGAAGACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCTTCAGGATCCGTGAGGAAGACCAGAAAGAACAAGCAGAAGACTCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAAACGGAGATGGTGGCAGTACCAGCGAAGCACCTCAGCCCCCTCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAAACGGAGATGGTGGCAGTACCAGCGAAGCACCTCAGCCCCCTCGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAAGGGCCCGGGCAGACCCCACTGTTGAAAGTGAGGAGGCGTTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAAGGGCCCGGGCAGACCCCACTGTTGAAAGTGAGGAGGCGTTTAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAGAATGGAGGTTAAAGTGAAGATTCCTGAAGAATTAAAACCATGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAGAATGGAGGTTAAAGTGAAGATTCCTGAAGAATTAAAACCATGGCTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGAGGACTGGGACTTAGTTACCAGGCAGAAGCAGCTGTTTCAACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGAGGACTGGGACTTAGTTACCAGGCAGAAGCAGCTGTTTCAACTCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAAGAAAAATGTAGATGCAATTCTGGAGGAGTATGCAAATTGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCAAGAAAAATGTAGATGCAATTCTGGAGGAGTATGCAAATTGCAAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATCGCAGGGAAATGTTGATAATAAGGAATATGCGGTTAATGAAGTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATCGCAGGGAAATGTTGATAATAAGGAATATGCGGTTAATGAAGTTGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGGAATAAAAGAATATTTCAATGTGATGTTGGGCACTCAGCTGCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGGAATAAAAGAATATTTCAATGTGATGTTGGGCACTCAGCTGCTCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAATTTGAGAGGCCCCAGTATGCTGAAATCCTCTTGGCTCACCCTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAATTTGAGAGGCCCCAGTATGCTGAAATCCTCTTGGCTCACCCTGATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCAATGTCCCAGGTTTATGGAGCACCACACCTACTGAGATTATTTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCAATGTCCCAGGTTTATGGAGCACCACACCTACTGAGATTATTTGTAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAATTGGAGCAATGTTGGCCTATACGCCCCTTGATGAGAAAAGCCTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAATTGGAGCAATGTTGGCCTATACGCCCCTTGATGAGAAAAGCCTTGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTATTGTTGGGCTATTTGCATGATTTCCTAAAATATCTGGCAAAGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTATTGTTGGGCTATTTGCATGATTTCCTAAAATATCTGGCAAAGAATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCATCTCTCTTTACTGCCAGTGATTACAAAGTGGCTTCTGCTGAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCATCTCTCTTTACTGCCAGTGATTACAAAGTGGCTTCTGCTGAGTACC

    850     .    :
    851 ACCGCAAAGCCCTG
        ||||||||||||||
 100851 ACCGCAAAGCCCTG