seq1 = pF1KSDA0024.tfa, 1419 bp
seq2 = pF1KSDA0024/gi568815590f_96162041.tfa (gi568815590f:96162041_96433563), 271523 bp

>pF1KSDA0024 1419
>gi568815590f:96162041_96433563 (Chr8)

1-179  (100001-100179)   100% ->
180-271  (111259-111350)   100% ->
272-316  (122069-122113)   100% ->
317-441  (124982-125106)   100% ->
442-600  (133058-133216)   100% ->
601-752  (137654-137805)   100% ->
753-894  (142000-142141)   100% ->
895-1007  (144404-144516)   100% ->
1008-1073  (147517-147582)   100% ->
1074-1173  (158206-158305)   100% ->
1174-1242  (168173-168241)   100% ->
1243-1312  (168986-169055)   100% ->
1313-1419  (171417-171523)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCTGCGTGGGGAGCCGGACCCTAAGCAAGGATGATGTGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCTGCGTGGGGAGCCGGACCCTAAGCAAGGATGATGTGAACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAATGCATTTCCGGATGATCAACGAGCAGCAAGTGGAGGACATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAAATGCATTTCCGGATGATCAACGAGCAGCAAGTGGAGGACATCACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGACTTCTTCTACCGGCCGCATACCATCACCCTGCTCAGCTTCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGACTTCTTCTACCGGCCGCATACCATCACCCTGCTCAGCTTCACCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGCCTCATGTACTTCGCCTTTACCAG         GGATGACTCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100151 GTCAGCCTCATGTACTTCGCCTTTACCAGGTG...CAGGGATGACTCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCAGAAGACAACATCTGGAGAGGCATCCTCTCTGTTATTTTCTTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111271 TCCAGAAGACAACATCTGGAGAGGCATCCTCTCTGTTATTTTCTTCTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTATCATCAGTGTGTTAGCTTTCCCCAATG         GTCCGTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111321 TTATCATCAGTGTGTTAGCTTTCCCCAATGGTA...CAGGTCCGTTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGACCTCATCCAGCCTTATGGCGAATGGTTTTTG         GACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 122080 CGACCTCATCCAGCCTTATGGCGAATGGTTTTTGGTG...CAGGACTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGTGCTCTACTTCCTGTTCCTGGTATTCCTACTCTTCCTGAATTTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124989 TGTGCTCTACTTCCTGTTCCTGGTATTCCTACTCTTCCTGAATTTCGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGTTAAATCTCTAATGTATTGGCTAGATCCAAATCTTCGATACGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125039 AGGTTAAATCTCTAATGTATTGGCTAGATCCAAATCTTCGATACGCCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGGGAAGCAGATGTCATG         GAGTATGCTGTGAACTGCCATGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 125089 AGGGAAGCAGATGTCATGGTA...TAGGAGTATGCTGTGAACTGCCATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GATCACCTGGGAGAGGATTATCAGCCACTTTGATATTTTTGCATTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133081 GATCACCTGGGAGAGGATTATCAGCCACTTTGATATTTTTGCATTTGGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATTTCTGGGGCTGGGCCATGAAGGCCTTGCTGATCCGTAGTTACGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133131 ATTTCTGGGGCTGGGCCATGAAGGCCTTGCTGATCCGTAGTTACGGTCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGCTGGACAATCAGTATTACCTGGGAGCTGACTGAG         CTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 133181 TGCTGGACAATCAGTATTACCTGGGAGCTGACTGAGGTA...CAGCTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTTCATGCATCTCCTCCCCAATTTTGCCGAGTGCTGGTGGGATCAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137659 CTTCATGCATCTCCTCCCCAATTTTGCCGAGTGCTGGTGGGATCAAGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCTGGACATCCTGTTGTGCAATGGCGGTGGCATTTGGCTGGGCATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137709 TTCTGGACATCCTGTTGTGCAATGGCGGTGGCATTTGGCTGGGCATGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTTTGCCGGTTTTTAGAGATGAGGACTTACCACTGGGCAAGCTTCAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 137759 GTTTGCCGGTTTTTAGAGATGAGGACTTACCACTGGGCAAGCTTCAAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    753       GGACATTCATACCACCACCGGGAAGATCAAGAGAGCTGTTCTGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137809 ...CAGGGACATTCATACCACCACCGGGAAGATCAAGAGAGCTGTTCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGTTCACTCCTGCTAGCTGGACCTATGTTCGATGGTTTGACCCCAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142044 AGTTCACTCCTGCTAGCTGGACCTATGTTCGATGGTTTGACCCCAAATCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCTTTTCAGAGAGTAGCTGGAGTGTACCTTTTCATGATCATCTGGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 142094 TCTTTTCAGAGAGTAGCTGGAGTGTACCTTTTCATGATCATCTGGCAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895        CTGACTGAGTTGAATACCTTCTTCTTGAAGCATATCTTTGTGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142144 A...CAGCTGACTGAGTTGAATACCTTCTTCTTGAAGCATATCTTTGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCCAAGCCAGTCATCCATTAAGTTGGGGTAGAATTCTCTTTATTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144447 TCCAAGCCAGTCATCCATTAAGTTGGGGTAGAATTCTCTTTATTGGTGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCACAGCTCCCACAGTGAG         ACAGTACTACGCTTACCTCAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 144497 ATCACAGCTCCCACAGTGAGGTA...CAGACAGTACTACGCTTACCTCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CGACACACAGTGCAAGCGCGTAGGAACACAATGCTGGGTGTTTGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 147538 CGACACACAGTGCAAGCGCGTAGGAACACAATGCTGGGTGTTTGGGTG..

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074     GGTCATTGGTTTCCTGGAGGCCATTGTTTGCATAAAATTTGGACAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147588 .TAGGGTCATTGGTTTCCTGGAGGCCATTGTTTGCATAAAATTTGGACAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GATCTCTTCTCTAAGACCCAAATACTCTATGTTGTGCTTTGGCTTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158252 GATCTCTTCTCTAAGACCCAAATACTCTATGTTGTGCTTTGGCTTCTTTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CGTG         GCTTTCACCACTTTCCTCTGTCTGTACGGCATGATTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158302 CGTGGTA...CAGGCTTTCACCACTTTCCTCTGTCTGTACGGCATGATTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GGTATGCAGAACACTATGGTCACCGAGAAAAG         ACCTACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 168210 GGTATGCAGAACACTATGGTCACCGAGAAAAGGTA...TAGACCTACTCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GAGTGTGAAGATGGCACCTACAGTCCAGAGATCTCCTGGCATCACAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168995 GAGTGTGAAGATGGCACCTACAGTCCAGAGATCTCCTGGCATCACAGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 AGGGACAAAAG         GTTCTGAAGACAGCCCACCCAAGCATGCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 169045 AGGGACAAAAGGTA...CAGGTTCTGAAGACAGCCCACCCAAGCATGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 GCAACAACGAAAGCCATTCTTCCAGGAGAAGGAATCGGCATTCCAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171447 GCAACAACGAAAGCCATTCTTCCAGGAGAAGGAATCGGCATTCCAAGTCA

   1500     .    :    .    :    .
   1393 AAAGTCACCAATGGCGTTGGAAAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||
 171497 AAAGTCACCAATGGCGTTGGAAAGAAA