seq1 = pF1KSDA0022.tfa, 696 bp
seq2 = pF1KSDA0022/gi568815596r_159671854.tfa (gi568815596r:159671854_159898198), 226345 bp

>pF1KSDA0022 696
>gi568815596r:159671854_159898198 (Chr2)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-178  (114730-114840)   100% ->
179-295  (117201-117317)   100% ->
296-469  (118021-118194)   100% ->
470-496  (120235-120261)   100% ->
497-696  (126146-126345)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCGGGCCGCGCTGCCCGCGCTCCTGCTGCCGTTGCTGGGCCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCGGGCCGCGCTGCCCGCGCTCCTGCTGCCGTTGCTGGGCCTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTGCTGCCGTCGCGG         ACTGTCCTTCATCTACTTGGATTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTGCTGCCGTCGCGGGTA...TAGACTGTCCTTCATCTACTTGGATTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCCAAGACAGTTGTTACATTTTTCTCCAAGAAGCCATCAAAGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114754 AGTTCCAAGACAGTTGTTACATTTTTCTCCAAGAAGCCATCAAAGTAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCATAGAGGATGTCAGAAATCAGTGTACTGACCATG         GAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 114804 AGCATAGAGGATGTCAGAAATCAGTGTACTGACCATGGTA...CAGGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACATGATAAGCATACATAATGAAGAAGAAAATGCTTTTATACTGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117205 GGACATGATAAGCATACATAATGAAGAAGAAAATGCTTTTATACTGGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTTGAAAAAGCAATGGAAAGGCCCAGATGATATCCTACTAGGCATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117255 CTTTGAAAAAGCAATGGAAAGGCCCAGATGATATCCTACTAGGCATGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGACACAGATG         ATGCGAGTTTCAAGTGGTTTGATAATTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 117305 TATGACACAGATGGTA...CAGATGCGAGTTTCAAGTGGTTTGATAATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAATATGACATTTGATAAGTGGACAGACCAAGATGATGATGAGGATTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118049 AAATATGACATTTGATAAGTGGACAGACCAAGATGATGATGAGGATTTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGACACCTGTGCTTTTCTGCACATCAAGACAGGTGAATGGAAAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118099 TTGACACCTGTGCTTTTCTGCACATCAAGACAGGTGAATGGAAAAAAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATTGTGAAGTTTCTTCTGTGGAAGGAACACTATGCAAAACAGCTA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 118149 AATTGTGAAGTTTCTTCTGTGGAAGGAACACTATGCAAAACAGCTAGTA.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    470      TCCCATACAAAAGGAAATATTTATCAG         ATAACCACA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118199 ..TAGTCCCATACAAAAGGAAATATTTATCAGGTA...CAGATAACCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTTTAATATCAGCATTGGTGATTGCTAGCACGGTAATTTTGACAGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126155 TTTTAATATCAGCATTGGTGATTGCTAGCACGGTAATTTTGACAGTTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGAGCAATCATTTGGTTCCTGTACAAAAAACATTCTGATTCTCGTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126205 GGAGCAATCATTTGGTTCCTGTACAAAAAACATTCTGATTCTCGTTTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CACAGTTTTTTCAACCGCACCCCAATCACCTTATAATGAAGACTGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126255 CACAGTTTTTTCAACCGCACCCCAATCACCTTATAATGAAGACTGTGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGTAGTTGGAGAAGAAAATGAATATCCTGTTCAATTTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126305 TGGTAGTTGGAGAAGAAAATGAATATCCTGTTCAATTTGAC