seq1 = pF1KF0386.tfa, 2022 bp
seq2 = pF1KF0386/gi568815576f_20407679.tfa (gi568815576f:20407679_20686701), 279023 bp

>pF1KF0386 2022
>gi568815576f:20407679_20686701 (Chr22)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-156  (129439-129526)   100% ->
157-208  (143758-143809)   100% ->
209-238  (145467-145496)   100% ->
239-468  (156772-157010)   96% ->
469-819  (158789-159139)   100% ->
820-930  (160843-160953)   100% ->
931-1067  (174933-175069)   100% ->
1068-1195  (175162-175289)   100% ->
1196-1330  (175435-175569)   100% ->
1331-1394  (175652-175715)   100% ->
1395-1461  (176681-176747)   100% ->
1462-1622  (177177-177337)   100% ->
1623-1789  (177423-177589)   100% ->
1790-1888  (178050-178148)   100% ->
1889-2022  (178890-179023)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTTTCCGGGCAAGAGACCGACTGGCGGAGCACCGCCTTCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTTTCCGGGCAAGAGACCGACTGGCGGAGCACCGCCTTCCGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCTGGTCAGTCAAAT         CGAGGATGCCATGAGGAAAGCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 GAAGCTGGTCAGTCAAATGTG...CAGCGAGGATGCCATGAGGAAAGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGTGGCACACAGTAAATCCAGCAAGGATATGGAGAGCCATGTTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129462 GTGTGGCACACAGTAAATCCAGCAAGGATATGGAGAGCCATGTTTTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGCCAAGACCCGG         GACGAATACCTTTCTCTCGTGGCCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 129512 AAGGCCAAGACCCGGGTA...TAGGACGAATACCTTTCTCTCGTGGCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTCATTATCCATTTTCGAGACATTC         ATAACAAGAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 143784 GCTCATTATCCATTTTCGAGACATTCGTA...TAGATAACAAGAAATCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAGCTTCCGTCAGTG         CCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGTGGCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 145482 AAGCTTCCGTCAGTGGTA...CAGCCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CTGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGTTCCAGCAGCAGCAGCAGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156798 CTGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGTTCCAGCAGCAGCAGCAGGCGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GCT     A CAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGTTCCAGGCTCAGC
        |||-----|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156848 GCTACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGTTCCAGGCTCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    359 AGAGTGCCATGCAGCAGCAGTTCCAAGCAGTAGTGCAGCAGCAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156898 AGAGTGCCATGCAGCAGCAGTTCCAAGCAGTAGTGCAGCAGCAGCAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    409 CTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA   TCTAATTAAATTGCATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||---|||||||||||||||||||||
 156948 CTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCTAATTAAATTGCATCATCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAATCAGCAACAG         ATACAGCAGCAGCAACAGCAGCTGCAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 156998 AAATCAGCAACAGGTA...TAGATACAGCAGCAGCAACAGCAGCTGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GAATAGCACAGCTGCAGCTCCAACAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158817 GAATAGCACAGCTGCAGCTCCAACAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CAGCAGCAGCAGCAGCAGGCTTTGCAGGCCCAGCCACCAATTCAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158867 CAGCAGCAGCAGCAGCAGGCTTTGCAGGCCCAGCCACCAATTCAGCAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACCGATGCAGCAGCCACAGCCTCCGCCCTCCCAGGCTCTGCCCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158917 ACCGATGCAGCAGCCACAGCCTCCGCCCTCCCAGGCTCTGCCCCAGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGCAGCAGATGCATCACACACAGCACCACCAGCCGCCACCACAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158967 TGCAGCAGATGCATCACACACAGCACCACCAGCCGCCACCACAGCCCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGCCTCCAGTTGCTCAGAACCAACCATCACAACTCCCGCCACAGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159017 CAGCCTCCAGTTGCTCAGAACCAACCATCACAACTCCCGCCACAGTCGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GACCCAGCCTTTGGTGTCACAGGCGCAAGCTCTCCCTGGACAAATGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159067 GACCCAGCCTTTGGTGTCACAGGCGCAAGCTCTCCCTGGACAAATGTTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ATACCCAACCACCACTGAAATTT         GTCCGAGCTCCGATGGTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 159117 ATACCCAACCACCACTGAAATTTGTG...AAGGTCCGAGCTCCGATGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTGCAGCAGCCCCCAGTGCAGCCCCAGGTGCAGCAGCAGCAGACAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160861 GTGCAGCAGCCCCCAGTGCAGCCCCAGGTGCAGCAGCAGCAGACAGCAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ACAGACAGCTCAGGCTGCCCAGATGGTGGCTCCCGGAGTCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 160911 ACAGACAGCTCAGGCTGCCCAGATGGTGGCTCCCGGAGTCCAGGTG...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    931   GTCAGCCAGAGCAGCCTCCCCATGCTGTCCTCGCCGTCACCGGGCCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174931 AGGTCAGCCAGAGCAGCCTCCCCATGCTGTCCTCGCCGTCACCGGGCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CAGGTGCAGACCCCGCAGTCGATGCCCCCTCCCCCCCAGCCGTCCCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174981 CAGGTGCAGACCCCGCAGTCGATGCCCCCTCCCCCCCAGCCGTCCCCGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCCCGGCCAGCCCAGCTCACAGCCCAACTCCAACGTCAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 175031 GCCCGGCCAGCCCAGCTCACAGCCCAACTCCAACGTCAGGTA...CAGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTGGCCCTGCCCCATCTCCCAGTAGCTTCCTGCCCAGCCCCTCACCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175164 CTGGCCCTGCCCCATCTCCCAGTAGCTTCCTGCCCAGCCCCTCACCGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CCCTCCCAGAGCCCAGTGACGGCGCGGACCCCACAGAACTTCAGTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175214 CCCTCCCAGAGCCCAGTGACGGCGCGGACCCCACAGAACTTCAGTGTCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTCACCTGGACCTTTAAACACACCTG         TGAACCCCAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 175264 CTCACCTGGACCTTTAAACACACCTGGTA...CAGTGAACCCCAGCTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TCATGAGCCCAGCTGGCTCCAGCCAGGCTGAGGAGCAGCAGTACCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175450 TCATGAGCCCAGCTGGCTCCAGCCAGGCTGAGGAGCAGCAGTACCTGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAGCTGAAGCAGCTGTCGAAGTACATCGAGCCCCTGCGCCGCATGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175500 AAGCTGAAGCAGCTGTCGAAGTACATCGAGCCCCTGCGCCGCATGATCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAAGATCGACAAGAACGAAG         ACAGAAAAAAGGACCTGAGTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 175550 CAAGATCGACAAGAACGAAGGTA...CAGACAGAAAAAAGGACCTGAGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 AGATGAAGAGCCTTCTGGACATTCTGACAGACCCCTCGAAGCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 175673 AGATGAAGAGCCTTCTGGACATTCTGACAGACCCCTCGAAGCGGTG...C

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1395   GTGTCCCCTGAAGACCTTGCAAAAGTGTGAGATCGCCCTGGAGAAACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176679 AGGTGTCCCCTGAAGACCTTGCAAAAGTGTGAGATCGCCCTGGAGAAACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CAAGAATGACATGGCGGTG         CCCACTCCCCCACCGCCCCCGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 176729 CAAGAATGACATGGCGGTGGTG...CAGCCCACTCCCCCACCGCCCCCGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TGCCACCGACCAAACAGCAGTACCTATGCCAGCCGCTCCTGGATGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177199 TGCCACCGACCAAACAGCAGTACCTATGCCAGCCGCTCCTGGATGCCGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CTGGCCAACATCCGCTCACCTGTCTTCAACCATTCCCTGTACCGCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177249 CTGGCCAACATCCGCTCACCTGTCTTCAACCATTCCCTGTACCGCACATT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 CGTTCCAGCCATGACCGCCATTCACGGCCCACCCATCAC         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 177299 CGTTCCAGCCATGACCGCCATTCACGGCCCACCCATCACGTA...CAGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CCCCAGTGGTGTGCACCCGGAAGCGCAGGCTTGAGGATGATGAGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177425 CCCCAGTGGTGTGCACCCGGAAGCGCAGGCTTGAGGATGATGAGCGGCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 AGCATCCCCAGTGTGCTCCAGGGTGAGGTGGCCAGGCTGGACCCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177475 AGCATCCCCAGTGTGCTCCAGGGTGAGGTGGCCAGGCTGGACCCCAAGTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 CCTGGTAAACCTGGACCCTTCTCACTGCAGCAACAATGGCACTGTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177525 CCTGGTAAACCTGGACCCTTCTCACTGCAGCAACAATGGCACTGTCCACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGATCTGCAAGCTGG         ATGACAAGGACCTCCCAAGTGTGCCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 177575 TGATCTGCAAGCTGGGTG...CAGATGACAAGGACCTCCCAAGTGTGCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CCACTGGAGCTCAGTGTGCCCGCTGACTATCCTGCCCAAAGCCCGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178076 CCACTGGAGCTCAGTGTGCCCGCTGACTATCCTGCCCAAAGCCCGCTGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GATAGACCGGCAGTGGCAGTACG         ACGCCAACCCCTTCCTCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 178126 GATAGACCGGCAGTGGCAGTACGGTA...CAGACGCCAACCCCTTCCTCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 AGTCGGTGCACCGCTGCATGACCTCCAGGCTGCTGCAGCTCCCGGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178908 AGTCGGTGCACCGCTGCATGACCTCCAGGCTGCTGCAGCTCCCGGACAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 CACTCGGTCACCGCCTTGCTCAACACCTGGGCCCAGAGCGTCCACCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178958 CACTCGGTCACCGCCTTGCTCAACACCTGGGCCCAGAGCGTCCACCAGGC

   2150     .    :    .
   2007 CTGCCTCTCAGCCGCC
        ||||||||||||||||
 179008 CTGCCTCTCAGCCGCC