Result of SIM4 for
pF1KF0267
seq1 = pF1KF0267.tfa, 3303 bp
seq2 = pF1KF0267/gi568815597r_160947718.tfa (gi568815597r:160947718_161169624), 221907 bp
>pF1KF0267 3303
>gi568815597r:160947718_161169624 (Chr1)
(complement)
1-97 (100001-100097) 100% ->
98-200 (109909-110011) 100% ->
201-345 (113093-113237) 100% ->
346-428 (114920-115002) 100% ->
429-536 (115152-115259) 100% ->
537-664 (116240-116367) 100% ->
665-836 (116828-116999) 99% ->
837-940 (117082-117185) 100% ->
941-1018 (117262-117339) 100% ->
1019-1420 (117910-118311) 100% ->
1421-1686 (119936-120201) 100% ->
1687-3303 (120291-121907) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAGTCTCGGCAGAAAGGAAAGAAGAAGGGCAGCGCAAAGGAGCGGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAAGTCTCGGCAGAAAGGAAAGAAGAAGGGCAGCGCAAAGGAGCGGGT
50 . : . : . : . : . :
51 TTTTGGGTGCGACTTGCAGGAGCACCTGCAGCACTCAGGCCAGGAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
100051 TTTTGGGTGCGACTTGCAGGAGCACCTGCAGCACTCAGGCCAGGAGGGTA
100 . : . : . : . : . :
98 TGCCCCAGGTGCTAAAGAGCTGTGCAGAATTTGTGGAGGAGTAT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ...CAGTGCCCCAGGTGCTAAAGAGCTGTGCAGAATTTGTGGAGGAGTAT
150 . : . : . : . : . :
142 GGAGTGGTGGATGGGATCTACCGCCTCTCAGGGGTCTCCTCCAACATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109953 GGAGTGGTGGATGGGATCTACCGCCTCTCAGGGGTCTCCTCCAACATCCA
200 . : . : . : . : . :
192 GAAGCTTCG GCAGGAATTTGAGTCAGAGCGGAAGCCAGACC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
110003 GAAGCTTCGGTG...CAGGCAGGAATTTGAGTCAGAGCGGAAGCCAGACC
250 . : . : . : . : . :
233 TGCGTCGGGATGTTTACCTCCAAGACATTCACTGCGTCTCCTCCCTGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113125 TGCGTCGGGATGTTTACCTCCAAGACATTCACTGCGTCTCCTCCCTGTGC
300 . : . : . : . : . :
283 AAGGCCTATTTCAGAGAACTGCCGGATCCCCTGCTCACTTACCGGCTCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113175 AAGGCCTATTTCAGAGAACTGCCGGATCCCCTGCTCACTTACCGGCTCTA
350 . : . : . : . : . :
333 TGACAAGTTTGCT GAGGCTGTAGGAGTGCAATTGGAACCTG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
113225 TGACAAGTTTGCTGTG...CAGGAGGCTGTAGGAGTGCAATTGGAACCTG
400 . : . : . : . : . :
374 AGCGCTTGGTCAAGATCCTAGAGGTGCTTCGGGAACTCCCTGTCCCAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114948 AGCGCTTGGTCAAGATCCTAGAGGTGCTTCGGGAACTCCCTGTCCCAAAC
450 . : . : . : . : . :
424 TACAG GACCCTGGAGTTCCTCATGAGGCACTTGGTACACAT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114998 TACAGGTA...CAGGACCCTGGAGTTCCTCATGAGGCACTTGGTACACAT
500 . : . : . : . : . :
465 GGCCTCATTCAGTGCCCAGACCAACATGCATGCTCGCAACCTGGCCATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115188 GGCCTCATTCAGTGCCCAGACCAACATGCATGCTCGCAACCTGGCCATCG
550 . : . : . : . : . :
515 TGTGGGCTCCCAACCTGCTGAG GTCTAAGGACATAGAGGCC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
115238 TGTGGGCTCCCAACCTGCTGAGGTA...CAGGTCTAAGGACATAGAGGCC
600 . : . : . : . : . :
556 TCAGGCTTCAATGGGACAGCGGCCTTCATGGAGGTGCGGGTACAATCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116259 TCAGGCTTCAATGGGACAGCGGCCTTCATGGAGGTGCGGGTACAATCCAT
650 . : . : . : . : . :
606 CGTCGTGGAGTTCATCCTCACACACGTGGACCAGCTCTTTGGGGGTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116309 CGTCGTGGAGTTCATCCTCACACACGTGGACCAGCTCTTTGGGGGTGCTG
700 . : . : . : . : . :
656 CCCTCTCTG GTGGTGAGGTGGAGAGTGGGTGGCGATCACTT
|||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| |||
116359 CCCTCTCTGGTC...CAGGTGGTGAGGTGGAGAGTGGGTGGCGATCGCTT
750 . : . : . : . : . :
697 CCAGGGACCCGGGCATCAGGCAGCCCCGAGGACCTTATGCCCAGGCCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116860 CCAGGGACCCGGGCATCAGGCAGCCCCGAGGACCTTATGCCCAGGCCACT
800 . : . : . : . : . :
747 GCCTTATCACCTGCCTAGCATACTGCAGGCTGGCGATGGACCCCCACAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116910 GCCTTATCACCTGCCTAGCATACTGCAGGCTGGCGATGGACCCCCACAGA
850 . : . : . : . : . :
797 TGCGGCCCTACCATACTATCATCGAGATTGCAGAGCACAA G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
116960 TGCGGCCCTACCATACTATCATCGAGATTGCAGAGCACAAGTA...TAGG
900 . : . : . : . : . :
838 AGGAAGGGGTCTTTGAAGGTCAGGAAGTGGAGGTCTATCTTCAATTTAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117083 AGGAAGGGGTCTTTGAAGGTCAGGAAGTGGAGGTCTATCTTCAATTTAGG
950 . : . : . : . : . :
888 TCGCTCTGGCCATGAGACTAAGCGTAAACTTCCACGGGGGGCTGAGGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117133 TCGCTCTGGCCATGAGACTAAGCGTAAACTTCCACGGGGGGCTGAGGACA
1000 . : . : . : . : . :
938 GGG AGGATAAATCCAACAAGGGGACACTGCGGCCAGCCAAA
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117183 GGGGTA...CAGAGGATAAATCCAACAAGGGGACACTGCGGCCAGCCAAA
1050 . : . : . : . : . :
979 AGCATGGACTCACTGAGTGCTGCAGCTGGGGCCAGTGATG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
117300 AGCATGGACTCACTGAGTGCTGCAGCTGGGGCCAGTGATGGTG...CAGA
1100 . : . : . : . : . :
1020 GCCAGAGGGGCTGGTGGGGCCCAGCAGCCCCCGGCCAAGCCCATTGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117911 GCCAGAGGGGCTGGTGGGGCCCAGCAGCCCCCGGCCAAGCCCATTGCTGC
1150 . : . : . : . : . :
1070 CTGAGAGCTTGGAGAACGATTCTATAGAGGCAGCAGAGGGTGAACAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117961 CTGAGAGCTTGGAGAACGATTCTATAGAGGCAGCAGAGGGTGAACAGGAG
1200 . : . : . : . : . :
1120 CCTGAGGCAGAAGCACTGGGTGGCACAAACTCTGAACCAGGCACACCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118011 CCTGAGGCAGAAGCACTGGGTGGCACAAACTCTGAACCAGGCACACCACG
1250 . : . : . : . : . :
1170 AGCTGGGCGGTCAGCCATCCGGGCTGGGGGCAGCAGCCGTGCAGAACGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118061 AGCTGGGCGGTCAGCCATCCGGGCTGGGGGCAGCAGCCGTGCAGAACGCT
1300 . : . : . : . : . :
1220 GTGCTGGTGTCCACATCTCAGACCCCTACAATGTCAACCTCCCGCTACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118111 GTGCTGGTGTCCACATCTCAGACCCCTACAATGTCAACCTCCCGCTACAC
1350 . : . : . : . : . :
1270 ATCACCTCTATCCTCAGTGTGCCCCCGAACATCATCTCTAACGTTTCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118161 ATCACCTCTATCCTCAGTGTGCCCCCGAACATCATCTCTAACGTTTCCTT
1400 . : . : . : . : . :
1320 GGCCAGGCTCACCCGTGGCCTTGAGTGCCCTGCTCTACAGCACCGGCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118211 GGCCAGGCTCACCCGTGGCCTTGAGTGCCCTGCTCTACAGCACCGGCCAA
1450 . : . : . : . : . :
1370 GCCCTGCCTCTGGCCCTGGCCCTGGCCCTGGCCTTGGCCCTGGCCCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118261 GCCCTGCCTCTGGCCCTGGCCCTGGCCCTGGCCTTGGCCCTGGCCCCCCA
1500 . : . : . : . : . :
1420 G ATGAAAAGTTGGAAGCAAGTCCAGCCTCAAGTCCCCTGGC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118311 GGTG...CAGATGAAAAGTTGGAAGCAAGTCCAGCCTCAAGTCCCCTGGC
1550 . : . : . : . : . :
1461 AGACTCAGGCCCAGACGACTTGGCTCCTGCCCTGGAGGACTCGCTGTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119976 AGACTCAGGCCCAGACGACTTGGCTCCTGCCCTGGAGGACTCGCTGTCCC
1600 . : . : . : . : . :
1511 AGGAGGTGCAGGACTCCTTCTCCTTCCTAGAGGACTCAAGCAGCTCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120026 AGGAGGTGCAGGACTCCTTCTCCTTCCTAGAGGACTCAAGCAGCTCAGAA
1650 . : . : . : . : . :
1561 CCTGAGTGGGTGGGGGCAGAGGATGGGGAGGTGGCCCAGGCAGAAGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120076 CCTGAGTGGGTGGGGGCAGAGGATGGGGAGGTGGCCCAGGCAGAAGCAGC
1700 . : . : . : . : . :
1611 AGGAGCAGCCTTCTCCCCTGGGGAGGACGACCCTGGGATGGGCTACCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120126 AGGAGCAGCCTTCTCCCCTGGGGAGGACGACCCTGGGATGGGCTACCTGG
1750 . : . : . : . : . :
1661 AGGAGCTCCTGGGAGTTGGGCCTCAG GTGGAGGAGTTCTCT
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
120176 AGGAGCTCCTGGGAGTTGGGCCTCAGGTA...CAGGTGGAGGAGTTCTCT
1800 . : . : . : . : . :
1702 GTGGAGCCACCCCTGGATGACCTGTCTCTGGATGAGGCACAGTTTGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120306 GTGGAGCCACCCCTGGATGACCTGTCTCTGGATGAGGCACAGTTTGTCTT
1850 . : . : . : . : . :
1752 GGCCCCCAGCTGCTGTTCCGTGGACTCCGCTGGCCCCAGGCCTGAAGTTG
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
120356 GGCCCCCAGCTGCTGTTCCCTGGACTCCGCTGGCCCCAGGCCTGAAGTTG
1900 . : . : . : . : . :
1802 AGGAGGAAAATGGGGAGGAAGTTTTCCTGAGTGCCTATGATGACCTAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120406 AGGAGGAAAATGGGGAGGAAGTTTTCCTGAGTGCCTATGATGACCTAAGT
1950 . : . : . : . : . :
1852 CCCCTTCTGGGACCTAAACCCCCAATCTGGAAGGGTTCAGGGAGTCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120456 CCCCTTCTGGGACCTAAACCCCCAATCTGGAAGGGTTCAGGGAGTCTGGA
2000 . : . : . : . : . :
1902 GGGAGAGGCAGCAGGATGTGGAAGGCAGGCTCTGGGACAGGGTGGGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120506 GGGAGAGGCAGCAGGATGTGGAAGGCAGGCTCTGGGACAGGGTGGGGAAG
2050 . : . : . : . : . :
1952 AGCAGGCATGCTGGGAAGTTGGGGAGGACAAGCAGGCTGAGCCTGGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120556 AGCAGGCATGCTGGGAAGTTGGGGAGGACAAGCAGGCTGAGCCTGGAGGC
2100 . : . : . : . : . :
2002 AGGCTAGACATCAGGGAAGAGGCAGAGGGAAGTCCAGAGACCAAGGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120606 AGGCTAGACATCAGGGAAGAGGCAGAGGGAAGTCCAGAGACCAAGGTGGA
2150 . : . : . : . : . :
2052 GGCTGGAAAGGCCAGTGAGGATAGAGGGGAGGCTGGGGGAAGCCAAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120656 GGCTGGAAAGGCCAGTGAGGATAGAGGGGAGGCTGGGGGAAGCCAAGAGA
2200 . : . : . : . : . :
2102 CAAAAGTCAGATTGAGAGAAGGGAGTAGGGAAGAGACAGAGGCCAAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120706 CAAAAGTCAGATTGAGAGAAGGGAGTAGGGAAGAGACAGAGGCCAAGGAA
2250 . : . : . : . : . :
2152 GAGAAGTCCAAAGGTCAGAAGAAGGCTGACAGTATGGAGGCTAAAGGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120756 GAGAAGTCCAAAGGTCAGAAGAAGGCTGACAGTATGGAGGCTAAAGGTGT
2300 . : . : . : . : . :
2202 GGAGGAACCAGGAGGAGATGAGTATACAGATGAGAAGGAAAAAGAAATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120806 GGAGGAACCAGGAGGAGATGAGTATACAGATGAGAAGGAAAAAGAAATTG
2350 . : . : . : . : . :
2252 AGAGAGAAGAGGATGAACAAAGAGAGGAAGCCCAGGTAGAAGCTGGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120856 AGAGAGAAGAGGATGAACAAAGAGAGGAAGCCCAGGTAGAAGCTGGAAGG
2400 . : . : . : . : . :
2302 GACCTAGAGCAAGGGGCCCAGGAAGATCAAGTTGCTGAGGAGAAATGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120906 GACCTAGAGCAAGGGGCCCAGGAAGATCAAGTTGCTGAGGAGAAATGGGA
2450 . : . : . : . : . :
2352 AGTTGTACAGAAACAAGAGGCTGAGGGAGTCAGAGAGGATGAGGACAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120956 AGTTGTACAGAAACAAGAGGCTGAGGGAGTCAGAGAGGATGAGGACAAAG
2500 . : . : . : . : . :
2402 GACAGAGGGAGAAGGGGTACCATGAAGCAAGAAAAGACCAAGGAGATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121006 GACAGAGGGAGAAGGGGTACCATGAAGCAAGAAAAGACCAAGGAGATGGT
2550 . : . : . : . : . :
2452 GAAGACAGCAGAAGCCCAGAAGCAGCAACTGAAGGAGGAGCAGGGGAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121056 GAAGACAGCAGAAGCCCAGAAGCAGCAACTGAAGGAGGAGCAGGGGAGGT
2600 . : . : . : . : . :
2502 CAGCAAGGAACGGGAGAGTGGGGATGGAGAGGCTGAGGGAGACCAGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121106 CAGCAAGGAACGGGAGAGTGGGGATGGAGAGGCTGAGGGAGACCAGAGGG
2650 . : . : . : . : . :
2552 CTGGAGGGTACTATTTAGAAGAGGACACCCTCTCTGAAGGTTCAGGTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121156 CTGGAGGGTACTATTTAGAAGAGGACACCCTCTCTGAAGGTTCAGGTGTA
2700 . : . : . : . : . :
2602 GCGTCCCTGGAGGTTGACTGTGCCAAAGAGGGCAATCCTCACTCTTCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121206 GCGTCCCTGGAGGTTGACTGTGCCAAAGAGGGCAATCCTCACTCTTCTGA
2750 . : . : . : . : . :
2652 GATGGAAGAGGTAGCCCCACAGCCACCTCAGCCAGAGGAGATGGAGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121256 GATGGAAGAGGTAGCCCCACAGCCACCTCAGCCAGAGGAGATGGAGCCTG
2800 . : . : . : . : . :
2702 AGGGGCAGCCCAGTCCAGACGGCTGTCTATGCCCCTGTTCTCTTGGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121306 AGGGGCAGCCCAGTCCAGACGGCTGTCTATGCCCCTGTTCTCTTGGCCTG
2850 . : . : . : . : . :
2752 GGTGGCGTGGGCATGCGTCTAGCTTCCACTCTGGTTCAGGTCCAACAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121356 GGTGGCGTGGGCATGCGTCTAGCTTCCACTCTGGTTCAGGTCCAACAGGT
2900 . : . : . : . : . :
2802 CCGCTCTGTGCCTGTGGTGCCCCCCAAGCCACAGTTTGCCAAGATGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121406 CCGCTCTGTGCCTGTGGTGCCCCCCAAGCCACAGTTTGCCAAGATGCCCA
2950 . : . : . : . : . :
2852 GTGCAATGTGTAGCAAGATTCATGTGGCACCTGCAAATCCATGCCCGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121456 GTGCAATGTGTAGCAAGATTCATGTGGCACCTGCAAATCCATGCCCGAGG
3000 . : . : . : . : . :
2902 CCTGGCCGGCTTGATGGGACTCCTGGAGAAAGGGCTTGGGGGTCCCGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121506 CCTGGCCGGCTTGATGGGACTCCTGGAGAAAGGGCTTGGGGGTCCCGAGC
3050 . : . : . : . : . :
2952 TTCTCGATCCTCTTGGAGGAATGGGGGTAGTCTTTCCTTTGATGCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121556 TTCTCGATCCTCTTGGAGGAATGGGGGTAGTCTTTCCTTTGATGCTGCTG
3100 . : . : . : . : . :
3002 TGGCCCTAGCCCGGGACCGCCAAAGGACTGAGGCTCAAGGAGTTCGGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121606 TGGCCCTAGCCCGGGACCGCCAAAGGACTGAGGCTCAAGGAGTTCGGCGA
3150 . : . : . : . : . :
3052 ACCCAGACCTGTACTGAGGGTGGGGATTACTGCCTCATCCCCAGAACCCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
121656 ACCCAGACCTGTACTGAGGGTGGGGATTACTGCCTCATCCCCAGAACCTC
3200 . : . : . : . : . :
3102 CCCTTGTAGCATGATCTCTGCCCATTCTCCTCGGCCCCTTAGCTGCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121706 CCCTTGTAGCATGATCTCTGCCCATTCTCCTCGGCCCCTTAGCTGCCTGG
3250 . : . : . : . : . :
3152 AGCTCCCATCTGAAGGTGCAGAAGGGTCTGGATCCCGGAGTCGTCTTAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121756 AGCTCCCATCTGAAGGTGCAGAAGGGTCTGGATCCCGGAGTCGTCTTAGT
3300 . : . : . : . : . :
3202 CTGCCCCCCAGAGAACCCCAGGTTCCTGACCCCCTGTTGTCCTCTCAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121806 CTGCCCCCCAGAGAACCCCAGGTTCCTGACCCCCTGTTGTCCTCTCAGCG
3350 . : . : . : . : . :
3252 CAGGTCATATGCATTTGAAACACAGGCTAACCCTGGGAAAGGTGAAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121856 CAGGTCATATGCATTTGAAACACAGGCTAACCCTGGGAAAGGTGAAGGAC
3400
3302 TG
||
121906 TG