seq1 = pF1KF0165.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KF0165/gi568815576r_42285164.tfa (gi568815576r:42285164_42532357), 247194 bp

>pF1KF0165 810
>gi568815576r:42285164_42532357 (Chr22)

(complement)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-451  (120622-120951)   100% ->
452-564  (122811-122923)   100% ->
565-663  (134402-134500)   100% ->
664-753  (145280-145369)   100% ->
754-810  (147138-147194)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAACCAGCCTGTGAGGTGGCGGGCCCTGCCAGGCCTCCCACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAACCAGCCTGTGAGGTGGCGGGCCCTGCCAGGCCTCCCACGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTGGGCTCCCCGCAGCCCCCTGGCTCCTCCTTGGCGTGCTGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTGGGCTCCCCGCAGCCCCCTGGCTCCTCCTTGGCGTGCTGCTGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGGGACCCTGCGACTGGCAG         GAGGACAGTCAGTGACCCAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 CCGGGACCCTGCGACTGGCAGGTA...CAGGAGGACAGTCAGTGACCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCGGCCTGCCCATCATGGCCTCCCTGGCCAACACAGCTATCTCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120642 ACCGGCCTGCCCATCATGGCCTCCCTGGCCAACACAGCTATCTCCTTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCAGGATCACCTATCCATACACTCCCCAATTCAAGGTTTTCACAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120692 CTGCAGGATCACCTATCCATACACTCCCCAATTCAAGGTTTTCACAGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTACTTTCATGAAGATCTCCAGGGACAGAGGAGCCCTAAGAAGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120742 GCTACTTTCATGAAGATCTCCAGGGACAGAGGAGCCCTAAGAAGCCAACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACTGCCACCCTGGACTGGGCACAGAGAACCAGAGCCACACCCTGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120792 AACTGCCACCCTGGACTGGGCACAGAGAACCAGAGCCACACCCTGGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAGGTCACCCTTGTGCTGCCGGGAGCATCGGCCACTGGCACCTACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120842 CCAGGTCACCCTTGTGCTGCCGGGAGCATCGGCCACTGGCACCTACTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCTCTGTCCACTGGCCACACTCCACGGTGAGAGGCAGCGGCACCTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120892 GCTCTGTCCACTGGCCACACTCCACGGTGAGAGGCAGCGGCACCTTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGGTCAGAG         ACGCAGGGTACCGAGAGCCCCCGCAGAGTCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 120942 CTGGTCAGAGGTA...TAGACGCAGGGTACCGAGAGCCCCCGCAGAGTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACAGAAGCTCCTGCTCTTTGGCTTCACCGGCCTCCTGAGTGTCCTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122842 ACAGAAGCTCCTGCTCTTTGGCTTCACCGGCCTCCTGAGTGTCCTGAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TAGTGGGCACGGCCCTGCTGCTCTGGAACAAG         AAGCGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 122892 TAGTGGGCACGGCCCTGCTGCTCTGGAACAAGGTA...CAGAAGCGGATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGGGGTCCAGGGAAGGACCCCACCAGGAAGTGCCCAGATCCAAGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134411 CGGGGTCCAGGGAAGGACCCCACCAGGAAGTGCCCAGATCCAAGATCTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGCAGCCCCAAGCAGCATCCTTCAGAATCTGTCTACACA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 134461 CAGCAGCCCCAAGCAGCATCCTTCAGAATCTGTCTACACAGTG...TAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTCTGCAGCGCCGCGAGACCGAGGTCTATGCCTGCATCGAGAATGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145281 CTCTGCAGCGCCGCGAGACCGAGGTCTATGCCTGCATCGAGAATGAGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGCAGCTCACCCACCGCCAAGCAGAGCCCCCTCTCCCAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 145331 GGCAGCTCACCCACCGCCAAGCAGAGCCCCCTCTCCCAGGTA...CAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAGACCGCATAGATTCGAAGATGATGGCGAACTTAACCTGGTCTATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147140 GAGACCGCATAGATTCGAAGATGATGGCGAACTTAACCTGGTCTATGAAA

    850     .
    806 ATCTC
        |||||
 147190 ATCTC