seq1 = pF1KE9692.tfa, 1911 bp
seq2 = pF1KE9692/gi568815579r_13782805.tfa (gi568815579r:13782805_13995549), 212745 bp

>pF1KE9692 1911
>gi568815579r:13782805_13995549 (Chr19)

(complement)

1-31  (90658-90688)   100% ->
32-206  (100004-100178)   100% ->
207-288  (102327-102408)   100% ->
289-393  (102660-102764)   100% ->
394-1668  (105088-106362)   99% ->
1669-1763  (109495-109589)   100% ->
1764-1911  (112598-112745)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTAAGAGGAAGAAGCTGCGGACCTCAG         GAGAGGGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  90658 ATGACTAAGAGGAAGAAGCTGCGGACCTCAGGTA...CAGGAGAGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTGTCCTCCAAAACCCCTAAAGAACCCAAGGCTAGGAGACTTCTATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 CTGTCCTCCAAAACCCCTAAAGAACCCAAGGCTAGGAGACTTCTATGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCCCCAGAGTTCCATGTTGGGCTGTTTACATCACCCTGAGGAGCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100064 ACCCCCAGAGTTCCATGTTGGGCTGTTTACATCACCCTGAGGAGCCAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAAATTGGGACCTGTTCCCTCTACACAGCAGCACGGGGAGGAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100114 GGCAAATTGGGACCTGTTCCCTCTACACAGCAGCACGGGGAGGAACCAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAGGCCGTCTCCAG         CTCCCCTGATGAGGAAACAGGATCTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100164 AAAGGCCGTCTCCAGGTA...TAGCTCCCCTGATGAGGAAACAGGATCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCTGCCGGCTCCTCCGTCAACCAGAAAAGGAGCCAGCTCCCCTTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102353 CCTGCCGGCTCCTCCGTCAACCAGAAAAGGAGCCAGCTCCCCTTCCTCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCCAG         AACTCATTCGGGAGGTTTGTTCCCCAGTTTGCAAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102403 TCCCAGGTG...CAGAACTCATTCGGGAGGTTTGTTCCCCAGTTTGCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATCCAGGAAGACAGTGACAAGAAAAGAAGAGATGAAGGATGAGGACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 ATCCAGGAAGACAGTGACAAGAAAAGAAGAGATGAAGGATGAGGACCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGAGTGGGGCCTTTAGCCTG         GAAACAATCGCAGAGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102745 GGAGTGGGGCCTTTAGCCTGGTA...CAGGAAACAATCGCAGAGTCCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCCAGAGTCCAGGATGCCAGCTGCTAGTGGAGACCCTGGGGGTCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105109 GCCCAGAGTCCAGGATGCCAGCTGCTAGTGGAGACCCTGGGGGTCCCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAGGAGGCCACGGAGCTGGGGGACCCAACGCAGGCAGACAGTGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105159 CCAGGAGGCCACGGAGCTGGGGGACCCAACGCAGGCAGACAGTGCCCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTGAGCAGAGCAGCCAGAGCCCTGTGCAGGCGGTGCCCGGCAGTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105209 CTGAGCAGAGCAGCCAGAGCCCTGTGCAGGCGGTGCCCGGCAGTGGGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCTCAGCCTGATGACCCTCCAGACAGGGGGACGGGGTTGTCCGCCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105259 TCTCAGCCTGATGACCCTCCAGACAGGGGGACGGGGTTGTCCGCCTCACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAGGGCCAGCCAAGACCACCTGTCAGAACAAGGGGCCGATGACAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105309 GAGGGCCAGCCAAGACCACCTGTCAGAACAAGGGGCCGATGACAGCAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGAGACAGACAGGGTTCCAGGTGACGGTGGCCAAAAGGAACACCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105359 CTGAGACAGACAGGGTTCCAGGTGACGGTGGCCAAAAGGAACACCTACCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGCATTGATTCTGAAGGGGAGAAGCCAGACAGAGGAGCCCCCCAGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105409 AGCATTGATTCTGAAGGGGAGAAGCCAGACAGAGGAGCCCCCCAGGAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGGGGCCCAAAGGACAGCAGGGGCTGGCCTGCCTGGAGGGCCCCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105459 AGGGGCCCAAAGGACAGCAGGGGCTGGCCTGCCTGGAGGGCCCCAGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGGGAGACGGTGTCCCCTGTACCCCAGCATCAGCTCCTACCTCAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105509 AGGGAGACGGTGTCCCCTGTACCCCAGCATCAGCTCCTACCTCAGGCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCTCCAGGACTGGGCCCTGCCTCTTGGTGCCTGGAACCCGGGTCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105559 GCTCCAGGACTGGGCCCTGCCTCTTGGTGCCTGGAACCCGGGTCTGTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCAGGGCTCCCCTGACCCCCAGCAGACCCCCAGCAGGATGGGTAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105609 CCAGGGCTCCCCTGACCCCCAGCAGACCCCCAGCAGGATGGGTAGGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GGGAAGGGACTCATAGCAGCCTGGGATGCTCCTCCCTCGGGATGGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105659 GGGAAGGGACTCATAGCAGCCTGGGATGCTCCTCCCTCGGGATGGTTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ATCGCAGACCTGAGCACAGACCCCACTGAGCTGGAAGAGAGGGCTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105709 ATCGCAGACCTGAGCACAGACCCCACTGAGCTGGAAGAGAGGGCTCTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGTGGCTGGGCCCGATGGGCAGGCCAGTGCCATATCACCTGCCTCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105759 GGTGGCTGGGCCCGATGGGCAGGCCAGTGCCATATCACCTGCCTCTCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GGAGGAAGGCCGCTGATGGAGGCCACAGGAGGGCCTTGCCAGGCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105809 GGAGGAAGGCCGCTGATGGAGGCCACAGGAGGGCCTTGCCAGGCTGCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TCGCTCACTGGGGAAACCACAGGAGAAAGTGGGGAGGCAGGGCAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105859 TCGCTCACTGGGGAAACCACAGGAGAAAGTGGGGAGGCAGGGCAGGATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CAAGCCCCCCGGCGATGTCCTAGTGGGCCCTACAGCCTCCCTGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105909 CAAGCCCCCCGGCGATGTCCTAGTGGGCCCTACAGCCTCCCTGGCTCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CACCTGGGAGCGGAGAGTCCATGATGGGTGCTGGAGATTCCGGTCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105959 CACCTGGGAGCGGAGAGTCCATGATGGGTGCTGGAGATTCCGGTCATGCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 TCCCCGGACACAGGTCCATGTGTCAATCAGAAGCAGGAGCCAGGTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106009 TCCCCGGACACAGGTCCATGTGTCAATCAGAAGCAGGAGCCAGGTCCTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 TCAAGAGGAAGCCGAGTTAGGTGGCCAGAACCTCGAACGAGACCTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106059 TCAAGAGGAAGCCGAGTTAGGTGGCCAGAACCTCGAACGAGACCTCGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 GGTTCCGTGTGTCCCCGCAAGCCTCTGTTGTGCTGGAACACAGAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106109 GGTTCCGTGTGTCCCCGCAAGCCTCTGTTGTGCTGGAACACAGAGAAATA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GCAGACGAACCTCTCCAGGAGCCCGGGGCTCAGCAGGGCATTCCAGACAC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106159 GCAGACGACCCTCTCCAGGAGCCCGGGGCTCAGCAGGGCATTCCAGACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 CACCTCAGAGCTGGCAGGGCAGCGAGACCACCTGCCTCATTCTGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106209 CACCTCAGAGCTGGCAGGGCAGCGAGACCACCTGCCTCATTCTGCAGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 AGGGCACCTGGGCAGACTCTTTAGCTGTGGAACTCGACTTCCTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106259 AGGGCACCTGGGCAGACTCTTTAGCTGTGGAACTCGACTTCCTGCTGGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AGCCAGATACAGGATGCCCTGGACGCCTCTGACTTCGAAGCCCCACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106309 AGCCAGATACAGGATGCCCTGGACGCCTCTGACTTCGAAGCCCCACCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 GCAG         CTCTTTCCTTCGGGGAACAAGCCGGGCCCTTGCTGGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106359 GCAGGTG...CAGCTCTTTCCTTCGGGGAACAAGCCGGGCCCTTGCTGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 CGGGCCCCAGCTCACATGCCAATGGAGACCCTGTTGCAGTGGCCAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109532 CGGGCCCCAGCTCACATGCCAATGGAGACCCTGTTGCAGTGGCCAAGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 CAGCCGAG         CCGGCTGATCATGGGCACCCACCGGGACCTGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109582 CAGCCGAGGTA...CAGCCGGCTGATCATGGGCACCCACCGGGACCTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 AGCTTTCAAGCGCCTTAACTACCGGAAGACAAAGCTGGGAGGCAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112631 AGCTTTCAAGCGCCTTAACTACCGGAAGACAAAGCTGGGAGGCAAAGCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1847 CCCTGCCTTACCCTTCCAAGGGGCCTGGGAATATCCCTCGAGGGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112681 CCCTGCCTTACCCTTCCAAGGGGCCTGGGAATATCCCTCGAGGGGACCCA

   1950     .    :    .
   1897 CCCTGGAGGGAGTTG
        |||||||||||||||
 112731 CCCTGGAGGGAGTTG