seq1 = pF1KE9665.tfa, 2016 bp
seq2 = pF1KE9665/gi568815582r_46481732.tfa (gi568815582r:46481732_46721359), 239628 bp

>pF1KE9665 2016
>gi568815582r:46481732_46721359 (Chr16)

(complement)

1-103  (100001-100103)   99% ->
104-271  (102988-103155)   100% ->
272-387  (103611-103726)   100% ->
388-596  (105206-105414)   100% ->
597-689  (112971-113063)   100% ->
690-923  (116899-117132)   100% ->
924-1092  (117217-117385)   100% ->
1093-1213  (117701-117821)   100% ->
1214-1345  (121398-121529)   100% ->
1346-1464  (125690-125808)   100% ->
1465-1551  (137271-137357)   100% ->
1552-1693  (137703-137844)   99% ->
1694-2016  (139306-139628)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACGGGTCGCTGACGGGCGGCGGTCTGGAGGCAGCGGCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGACGGGTCGCTGACGGGCGGCGGTCTGGAGGCAGCGGCCATGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGAGCGCACGGGCTGGGCGGTGGAGCAGGAGCTGGCGTCTCTGGAGA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGGAGCGCATGGGCTGGGCGGTGGAGCAGGAGCTGGCGTCTCTGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAG         GTTTGTTCCAAGATGAAGATTCATGCAGTGATTGTAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGTG...TAGGTTTGTTCCAAGATGAAGATTCATGCAGTGATTGTAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCGTGATAAACCAGGTTCTAGTTTACAAAGTTTTATGCCAGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103026 TACCGTGATAAACCAGGTTCTAGTTTACAAAGTTTTATGCCAGAAGGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AACCTTTTTCCCAGAAATTTTCCAAACAAATCAACTTTTGTTCTATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103076 AACCTTTTTCCCAGAAATTTTCCAAACAAATCAACTTTTGTTCTATGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATTCAGAGCCTATCAAGATTACATTTTAG         CTGACTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103126 GATTCAGAGCCTATCAAGATTACATTTTAGGTG...TAGCTGACTGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCTCTGAGGTACAGGAATTCACAGCTGAGTTCTTGGAGAAGGTCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103622 GCCTCTGAGGTACAGGAATTCACAGCTGAGTTCTTGGAGAAGGTCCTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCCATCTGGATGGCGGGCAGTCTGGCACACTAATGTGTTCAAGGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103672 GCCATCTGGATGGCGGGCAGTCTGGCACACTAATGTGTTCAAGGTGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGAG         ATCACAGATGTGGACTTTGCAGCCTTGAAGGCAGTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103722 TTGAGGTA...CAGATCACAGATGTGGACTTTGCAGCCTTGAAGGCAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGAGGCTTGCTGAACCATACCTCTGTGACTCTCAAGTGAGCACTTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105242 GTGAGGCTTGCTGAACCATACCTCTGTGACTCTCAAGTGAGCACTTTTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATGGAGTGCATGAAGGAGCTCCTTGATCTGAAGGAGCATCGGTTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105292 CATGGAGTGCATGAAGGAGCTCCTTGATCTGAAGGAGCATCGGTTGCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGCAGGAGCTGTGGGTGGTGTTTGATGATTCAGGAGTGTTTGACCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105342 TGCAGGAGCTGTGGGTGGTGTTTGATGATTCAGGAGTGTTTGACCAGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCCTTGCAATTGAGCATGTCAG         ATTTTTCTACCAAAACAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105392 GCCCTTGCAATTGAGCATGTCAGGTA...CAGATTTTTCTACCAAAACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTGGAGGAGTTGGGATGAAGAAGAGGAGGATGAATACGATTATTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112989 TTGGAGGAGTTGGGATGAAGAAGAGGAGGATGAATACGATTATTTTGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GATGTGTTGAACCTCGATTAAGATT         GCATTATGACATTCTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113039 GATGTGTTGAACCTCGATTAAGATTGTA...CAGGCATTATGACATTCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAGACCGAGTTCCATCAGGACTTATTGTTGACTACCACAATCTGTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116915 GAAGACCGAGTTCCATCAGGACTTATTGTTGACTACCACAATCTGTTGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCAATGTGAGGAGAGTTACAGGAAATTTTTAAATCTGAGAAGCAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116965 TCAATGTGAGGAGAGTTACAGGAAATTTTTAAATCTGAGAAGCAGTTTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAAATTGTAACTCTGATTCCGAGCAGGAAAATATCTCCATGGTGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117015 CAAATTGTAACTCTGATTCCGAGCAGGAAAATATCTCCATGGTGGAAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTAAAATTGTATTCGGAGATGGAACAGTTGAAACAAAAGCTGAAACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117065 TTAAAATTGTATTCGGAGATGGAACAGTTGAAACAAAAGCTGAAACTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGAGAATCCTTTGTTGAG         GTATGTGTTTGGTTATCAGAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 117115 TGAGAATCCTTTGTTGAGGTA...AAGGTATGTGTTTGGTTATCAGAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATTCTAACATCCAAGCAAAGGGTGTCCGTTCCAGCGGTCAGAAGATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117240 ATTCTAACATCCAAGCAAAGGGTGTCCGTTCCAGCGGTCAGAAGATCACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CATGTGGTCTCCTCCACCATGATGGCTGGTCTCCTGCGGTCCCTGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117290 CATGTGGTCTCCTCCACCATGATGGCTGGTCTCCTGCGGTCCCTGCTTAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGACAGGCTTTGCCAGGAGCCTGGTGAGGAAGAAAGAGAAATTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 117340 GGACAGGCTTTGCCAGGAGCCTGGTGAGGAAGAAAGAGAAATTCAGGTA.

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093      TTCCATAGTGATCCATTGTCTGCTATAAATGCCTGCTTCGAAGGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117390 ..TAGTTCCATAGTGATCCATTGTCTGCTATAAATGCCTGCTTCGAAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GACACTGTTATTGTTTGTCCTGGCCATTATGTGGTACATGGCACTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117746 GACACTGTTATTGTTTGTCCTGGCCATTATGTGGTACATGGCACTTTCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CATTGCTGACTCCATTGAGTTGGAAG         GATATGGCCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 117796 CATTGCTGACTCCATTGAGTTGGAAGGTG...TAGGATATGGCCTACCAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATGACATTGTGATAGAAAAGAGGGGCAAAGGCGACACTTTTGTGGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121413 ATGACATTGTGATAGAAAAGAGGGGCAAAGGCGACACTTTTGTGGACTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACTGGTGCTGATATTAAAATCTCAGGCATAAAATTTGTTCAGCATGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121463 ACTGGTGCTGATATTAAAATCTCAGGCATAAAATTTGTTCAGCATGATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGTAGAGGGAATCTTAA         TTGTTCACCGTGGTAAGACTACGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121513 TGTAGAGGGAATCTTAAGTA...CAGTTGTTCACCGTGGTAAGACTACGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGGAAAACTGTGTGCTGCAGTGTGAGACGACCGGAGTCACAGTGCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125714 TGGAAAACTGTGTGCTGCAGTGTGAGACGACCGGAGTCACAGTGCGGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TCAGCAGAGTTTCTAATGAAGAACTCGGATTTATATGGCGCCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 125764 TCAGCAGAGTTTCTAATGAAGAACTCGGATTTATATGGCGCCAAGGTA..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465     GGTGCTGGTATAGAAATCTACCCTGGGAGTCAGTGCACCCTGAGTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125814 .CAGGGTGCTGGTATAGAAATCTACCCTGGGAGTCAGTGCACCCTGAGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACAATGGGATCCATCACTGCAAGGAAGGGATCCTCATTAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 137317 ACAATGGGATCCATCACTGCAAGGAAGGGATCCTCATTAAGGTG...CAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GACTTCTTAGATGAACATTATGACATTCCCAAGATATCCATGGTGAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137703 GACTTCTTAGATGAACATTATGACATTCCCAAGATATCCATGGTGAATAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TATAATACATAATAATGAAGGTTATGGTGTTGTCTTGGTGAAACCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137753 TATAATACATAATAATGAAGGTTATGGTGTTGTCTTGGTGAAACCTACAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 TCTTCTCTGACCTGCAAGAAAGTGCTGAAGATGGAACTGAAG        
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||>>>...>>
 137803 TCTTCTCTGACCTGCAAGAAAATGCTGAAGATGGAACTGAAGGTA...CA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1694  AAAATAAAGCGCTTAAAATTCAGACAAGTGGAGAGCCAGATGTGGCTGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139305 GAAAATAAAGCGCTTAAAATTCAGACAAGTGGAGAGCCAGATGTGGCTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AAGAGTGGATCTAGAAGAGCTGATTGAGTGTGCAACTGGTAAAATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139355 AAGAGTGGATCTAGAAGAGCTGATTGAGTGTGCAACTGGTAAAATGGAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TTTGTGCAAGAACTGACCCTTCTGAGCAAGTCGAGGGAAATTGTGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139405 TTTGTGCAAGAACTGACCCTTCTGAGCAAGTCGAGGGAAATTGTGAAATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GTAAATGAACTAATTGCTGCCTCCACACAGAAAGGCCAGATAAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139455 GTAAATGAACTAATTGCTGCCTCCACACAGAAAGGCCAGATAAAGAAGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 AAGGTTGAGTGAACTGGGGATCACGCAAGCTGATGACAACTTAATGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139505 AAGGTTGAGTGAACTGGGGATCACGCAAGCTGATGACAACTTAATGTCAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGGAGATGTTTGTTGGGATTGTGGGGAACCAGTTCAAGTGGAATGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139555 AGGAGATGTTTGTTGGGATTGTGGGGAACCAGTTCAAGTGGAATGGGAAA

   2100     .    :    .    :
   1993 GGTAGTTTTGGCACATTTCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||
 139605 GGTAGTTTTGGCACATTTCTTTTC