seq1 = pF1KE9628.tfa, 2646 bp
seq2 = pF1KE9628/gi568815576r_24619475.tfa (gi568815576r:24619475_24862499), 243025 bp

>pF1KE9628 2646
>gi568815576r:24619475_24862499 (Chr22)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-223  (102511-102631)   100% ->
224-355  (104461-104592)   100% ->
356-570  (105795-106009)   100% ->
571-692  (106595-106716)   100% ->
693-773  (107636-107716)   100% ->
774-977  (108283-108486)   100% ->
978-1089  (111002-111113)   100% ->
1090-1216  (112681-112807)   100% ->
1217-1334  (112979-113096)   100% ->
1335-1449  (113479-113593)   100% ->
1450-1634  (126608-126792)   100% ->
1635-1707  (128344-128416)   100% ->
1708-1932  (134099-134323)   100% ->
1933-2036  (134447-134550)   100% ->
2037-2107  (136985-137055)   100% ->
2108-2258  (137463-137613)   100% ->
2259-2384  (139245-139370)   100% ->
2385-2532  (142605-142752)   100% ->
2533-2646  (142912-143025)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGGTAGGGCAAGGACTCGCGCCCGAGGCAGAGCCCGCCGCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGGTAGGGCAAGGACTCGCGCCCGAGGCAGAGCCCGCCGCAGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTACCAACAAGAGGCACCTGGGGGACCCAGAGCACCTGGATCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTACCAACAAGAGGCACCTGGGGGACCCAGAGCACCTGGATCAGCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CA         ACCCAGGAGCCCCCTCAGTTGCAGTCGACACCCCGGCCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGTG...CAGACCCAGGAGCCCCCTCAGTTGCAGTCGACACCCCGGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCAGGAGGAAGTCCCAGTGGTTAGACCTCTGCAGCCAAGAGCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102550 CTGCAGGAGGAAGTCCCAGTGGTTAGACCTCTGCAGCCAAGAGCAGCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGAGGAGCAGGAGGAGGAGCACAGTCTCAAG         GGGTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102600 AGGAGGAGCAGGAGGAGGAGCACAGTCTCAAGGTG...CAGGGGTGAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACCTGGACCTGAGGCTGGGTTGCATACAGCGCCCTTGCAGGAGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104470 AACCTGGACCTGAGGCTGGGTTGCATACAGCGCCCTTGCAGGAGAGAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTGGTGGAGTTTTTCAAGACCTGGTGGTGAACACCAGGCAAGATATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104520 ATTGGTGGAGTTTTTCAAGACCTGGTGGTGAACACCAGGCAAGATATGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCATGTTAAAGACTCAAAAACAG         GTTCAGAGGGTACAGTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104570 GCATGTTAAAGACTCAAAAACAGGTA...CAGGTTCAGAGGGTACAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TACAGCTACTCGCCAACCACTTCCGAGTGATATCTCGTCCTCAGTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105813 TACAGCTACTCGCCAACCACTTCCGAGTGATATCTCGTCCTCAGTGGGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCATATAAATACAACGTTGACTACAAACCAGACATAGAAGATGGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105863 GCATATAAATACAACGTTGACTACAAACCAGACATAGAAGATGGAAATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGTACAATTTTACTTGATCAACATAGAAGGAAATTTGGAGAGCGCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105913 CCGTACAATTTTACTTGATCAACATAGAAGGAAATTTGGAGAGCGCCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TATTTGATGGAAACTCTTTATTATTATCTCGGCCACTAAAAGAGCGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105963 TATTTGATGGAAACTCTTTATTATTATCTCGGCCACTAAAAGAGCGGGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    571       AGAGTGGAATGGTTGAGCACAACCAAAGACAAAAACATCGTGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106013 ...CAGAGAGTGGAATGGTTGAGCACAACCAAAGACAAAAACATCGTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GATTACAGTTGAGTTTTCCAAAGAACTCACGCCCACGTCGCCAGATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106639 GATTACAGTTGAGTTTTCCAAAGAACTCACGCCCACGTCGCCAGATTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TACGCTATTACAACATTCTCTTTAGAAG         AACTTTCAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106689 TACGCTATTACAACATTCTCTTTAGAAGGTA...CAGAACTTTCAAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGATTTTGAACAAGTTGGTCGCAACTATTATACCAAAAAGAAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107649 CTGGATTTTGAACAAGTTGGTCGCAACTATTATACCAAAAAGAAGGCCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCAGTTATACCGTCATGG         TACCAGTTTGGAAATCTGGCTTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 107699 TCAGTTATACCGTCATGGGTT...TAGTACCAGTTTGGAAATCTGGCTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTTATGTTACTTCTGTTCTTCAATACGAAAACAGCATTACCCTCTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108306 GTTATGTTACTTCTGTTCTTCAATACGAAAACAGCATTACCCTCTGTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GATGTGAGCCACAAACTGCTCCGAATAGAAACTGCTTATGATTTCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108356 GATGTGAGCCACAAACTGCTCCGAATAGAAACTGCTTATGATTTCATAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAGAACATCTGCCCAGGCCCAGACAGGAAACATCCGAGAGGAAGTAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108406 GAGAACATCTGCCCAGGCCCAGACAGGAAACATCCGAGAGGAAGTAACTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ATAAATTAATTGGATCAATTGTTCTGACAAA         ATACAACAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 108456 ATAAATTAATTGGATCAATTGTTCTGACAAAGTA...CAGATACAACAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAAACCTACAGAGTAGATGATATTGATTGGAAGCAGAATCCTGAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111012 AAAACCTACAGAGTAGATGATATTGATTGGAAGCAGAATCCTGAAGACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ATTTAACAAATCAGATGGCAGCAAAATCACCTATATAGACTACTACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111062 ATTTAACAAATCAGATGGCAGCAAAATCACCTATATAGACTACTACAGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AG         CAACATAAAGAAATTGTCACAGTGAAGAAACAGCCACTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111112 AGGTA...CAGCAACATAAAGAAATTGTCACAGTGAAGAAACAGCCACTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TTGGTCAGCCAGGGCAGATGGAAAAAGGGCCTAACGGGTACACAACGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112720 TTGGTCAGCCAGGGCAGATGGAAAAAGGGCCTAACGGGTACACAACGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACCTATCCTGCTGATTCCTCAGCTGTGCCACATGACAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112770 ACCTATCCTGCTGATTCCTCAGCTGTGCCACATGACAGGTA...AAGGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TAACAGATGAAATATGTAAAGATTATAGCATTGTGAAAGAATTGGCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112982 TAACAGATGAAATATGTAAAGATTATAGCATTGTGAAAGAATTGGCTAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CATACAAGATTGAGTCCAAGAAGAAGGCATCATACATTAAAAGAATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113032 CATACAAGATTGAGTCCAAGAAGAAGGCATCATACATTAAAAGAATTCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CAATACTCTACAAGA         TAATAAAAAAGTACGAGAGTTACTTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 113082 CAATACTCTACAAGAGTA...CAGTAATAAAAAAGTACGAGAGTTACTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AACTCTGGGATTTGAAATTTGATACCAATTTTTTGTCCGTCCCGGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113505 AACTCTGGGATTTGAAATTTGATACCAATTTTTTGTCCGTCCCGGGAAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GTTTTGAAAAACGCAAACATCGTGCAAGGCAGAAGAATG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 113555 GTTTTGAAAAACGCAAACATCGTGCAAGGCAGAAGAATGGTA...CAGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TAAAGCCAATTCACAAGGAGACTGGTCAAGAGAAATAAGAGAATTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126610 TAAAGCCAATTCACAAGGAGACTGGTCAAGAGAAATAAGAGAATTACCCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TACTTAATGCAATGCCACTACATAGTTGGCTCATACTCTATAGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126660 TACTTAATGCAATGCCACTACATAGTTGGCTCATACTCTATAGCAGGAGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AGTCACAGAGAAGCCATGTCCTTAAAGGGTCATCTACAGAGTGTCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126710 AGTCACAGAGAAGCCATGTCCTTAAAGGGTCATCTACAGAGTGTCACAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CCCCATGGGCATAACTATGAAACCAGCAGAAAT         GATTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 126760 CCCCATGGGCATAACTATGAAACCAGCAGAAATGTA...TAGGATTGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TAGATGGTGATGCTAACTCCTATATAGACACATTACGGAAATATACTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128352 TAGATGGTGATGCTAACTCCTATATAGACACATTACGGAAATATACTAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CCAACACTGCAGATG         GGAATGTCATGTTTGCTGGTTTTCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 128402 CCAACACTGCAGATGGTA...TAGGGAATGTCATGTTTGCTGGTTTTCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGTGATTTGTATCCTGCCCAATGATGACAAACGTAGATATGACAGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134125 GGTGATTTGTATCCTGCCCAATGATGACAAACGTAGATATGACAGCATAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 AAAGATACCTATGTACCAAATGCCCAATTCCAAGCCAGTGTGTGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134175 AAAGATACCTATGTACCAAATGCCCAATTCCAAGCCAGTGTGTGGTGAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AAGACCTTAGAAAAAGTCCAGGCAAGGACCATCGTCACCAAGATTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134225 AAGACCTTAGAAAAAGTCCAGGCAAGGACCATCGTCACCAAGATTGCCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GCAGATGAATTGCAAGATGGGAGGAGCCCTCTGGAAGGTGGAGACAGAC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 134275 GCAGATGAATTGCAAGATGGGAGGAGCCCTCTGGAAGGTGGAGACAGACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933         GTACAAAGAACAATGTTCGTTGGCATTGATTGTTTCCACGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134325 TA...AAGGTACAAAGAACAATGTTCGTTGGCATTGATTGTTTCCACGAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 ATCGTAAATCGACAGAAATCAATAGCAGGATTTGTTGCAAGTACCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134489 ATCGTAAATCGACAGAAATCAATAGCAGGATTTGTTGCAAGTACCAATGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TGAATTAACAAA         GTGGTACTCTCAATGTGTCATCCAGAAAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 134539 TGAATTAACAAAGTA...CAGGTGGTACTCTCAATGTGTCATCCAGAAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 CAGGAGAAGAGCTTGTGAAAGAGCTGGAGATCTGCTTGAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 137014 CAGGAGAAGAGCTTGTGAAAGAGCTGGAGATCTGCTTGAAAGGTC...TA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2108  CTGCCCTGGATGTCTGGTGTAAAAACGAATCATCGATGCCACATTCTGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137462 GCTGCCCTGGATGTCTGGTGTAAAAACGAATCATCGATGCCACATTCTGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TATTGTGTATCGGGATGGAGTGGGAGATGGTCAGCTTCAAGCATTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137512 TATTGTGTATCGGGATGGAGTGGGAGATGGTCAGCTTCAAGCATTGCTTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 ACCATGAAGCGAAAAAGATGTCGACCTACTTAAAAACCATCTCTCCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137562 ACCATGAAGCGAAAAAGATGTCGACCTACTTAAAAACCATCTCTCCTAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AA         TTTCACTCTAGCTTTCATTGTGGTGAAGAAACGAATAAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137612 AAGTA...AAGTTTCACTCTAGCTTTCATTGTGGTGAAGAAACGAATAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CACTAGATTTTTTCTTAAACATGGAAGCAATTTTCAAAATCCACCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139284 CACTAGATTTTTTCTTAAACATGGAAGCAATTTTCAAAATCCACCTCCAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 GAACAGTTATTGATGTAGAGTTGACTAGGAATGAATG         GTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 139334 GAACAGTTATTGATGTAGAGTTGACTAGGAATGAATGGTA...CAGGTAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GACTTTTTTATTGTGAGTCAGTCTGTGCAAGATGGGACTGTTACCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142609 GACTTTTTTATTGTGAGTCAGTCTGTGCAAGATGGGACTGTTACCCCCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 TCATTATAACGTCATCTATGACACGATTGGCTTGAGCCCAGATACAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142659 TCATTATAACGTCATCTATGACACGATTGGCTTGAGCCCAGATACAGTAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 AGCGTTTAACATATTGTCTATGCCACATGTATTATAATTTGCCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 142709 AGCGTTTAACATATTGTCTATGCCACATGTATTATAATTTGCCAGTA...

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2533    GGCATCATCCGAGTTCCAGCGCCTTGCCACTATGCCCACAAGCTGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142909 AAGGGCATCATCCGAGTTCCAGCGCCTTGCCACTATGCCCACAAGCTGGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 TTACCTCGTGGGGCAGTCCATTCACCAGGAACCGAATCGTTCCTTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142959 TTACCTCGTGGGGCAGTCCATTCACCAGGAACCGAATCGTTCCTTGTCAA

   2800     .    :    .
   2630 CTCGTCTCTTTTACCTT
        |||||||||||||||||
 143009 CTCGTCTCTTTTACCTT