seq1 = pF1KE9605.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KE9605/gi568815592r_26134271.tfa (gi568815592r:26134271_26334933), 200663 bp

>pF1KE9605 663
>gi568815592r:26134271_26334933 (Chr6)

(complement)

1-663  (100001-100663)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGAGACTGCTCCACTTGCTCCTACCATTCCTGCACCCGCAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGAGACTGCTCCACTTGCTCCTACCATTCCTGCACCCGCAGAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACACCTGTGAAGAAAAAGGCGAAGAAGGCAGGCGCAACTGCTGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACACCTGTGAAGAAAAAGGCGAAGAAGGCAGGCGCAACTGCTGGGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAAGCATCCGGACCCCCAGTATCTGAGCTTATCACCAAGGCAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAAGCATCCGGACCCCCAGTATCTGAGCTTATCACCAAGGCAGTGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTTCTAAGGAGCGCAGCGGCGTTTCTCTGGCCGCGCTTAAGAAAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTCTAAGGAGCGCAGCGGCGTTTCTCTGGCCGCGCTTAAGAAAGCGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCGGCTGCTGGCTACGATGTAGAAAAAAACAACAGCCGTATCAAGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCGGCTGCTGGCTACGATGTAGAAAAAAACAACAGCCGTATCAAGCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTCAAGAGCTTGGTGAGCAAAGGTACTCTGGTGCAGACCAAAGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTCAAGAGCTTGGTGAGCAAAGGTACTCTGGTGCAGACCAAAGGTACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGCTTCTGGCTCCTTCAAACTCAACAAGAAAGCGGCTTCCGGGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGCTTCTGGCTCCTTCAAACTCAACAAGAAAGCGGCTTCCGGGGAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAAACCCAAGGCCAAAAAGGCTGGCGCAGCCAAGCCTAGGAAGCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAACCCAAGGCCAAAAAGGCTGGCGCAGCCAAGCCTAGGAAGCCTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGCAGCCAAGAAGCCCAAGAAGGTGGCTGGCGCCGCTACCCCGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGCAGCCAAGAAGCCCAAGAAGGTGGCTGGCGCCGCTACCCCGAAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCATCAAAAAGACTCCTAAGAAGGTAAAGAAGCCAGCAACCGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCATCAAAAAGACTCCTAAGAAGGTAAAGAAGCCAGCAACCGCTGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACCAAGAAAGTGGCCAAGAGTGCGAAAAAGGTGAAAACACCTCAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GACCAAGAAAGTGGCCAAGAGTGCGAAAAAGGTGAAAACACCTCAGCCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAAAAGCTGCCAAGAGTCCAGCTAAGGCCAAAGCCCCTAAGCCCAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAAAAGCTGCCAAGAGTCCAGCTAAGGCCAAAGCCCCTAAGCCCAAGGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCAAGCCTAAGTCGGGGAAGCCGAAGGTTACAAAGGCAAAGAAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCAAGCCTAAGTCGGGGAAGCCGAAGGTTACAAAGGCAAAGAAGGCAGC

    650     .    :
    651 TCCGAAGAAAAAG
        |||||||||||||
 100651 TCCGAAGAAAAAG