seq1 = pF1KE9603.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KE9603/gi568815592r_26007473.tfa (gi568815592r:26007473_26208093), 200621 bp

>pF1KE9603 621
>gi568815592r:26007473_26208093 (Chr6)

(complement)

1-621  (100001-100621)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGAAACCGTGCCTGCAGCTTCTGCCAGTGCTGGTCTAGCCGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100001 ATGTCTGAAACCGTGCCTGCAGCTTCTGCCAGTGCTGGTGTAGCCGCTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGAAACTTCCAACCAAGAAGCGAGGGAGGAAGCCGGCTGGCTTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGAAACTTCCAACCAAGAAGCGAGGGAGGAAGCCGGCTGGCTTGATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGCAAGTCGCAAAGTGCCGAACCTCTCTGTGTCCAAGTTGATCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGCAAGTCGCAAAGTGCCGAACCTCTCTGTGTCCAAGTTGATCACCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCTTTCAGTGTCACAGGAACGAGTAGGTATGTCTTTGGTTGCGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCTTTCAGTGTCACAGGAACGAGTAGGTATGTCTTTGGTTGCGCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGGCATTGGCCGCTGCTGGCTACGACGTAGAGAAGAATAACAGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGGCATTGGCCGCTGCTGGCTACGACGTAGAGAAGAATAACAGCCGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAACTGTCCCTCAAGAGCTTAGTGAACAAGGGAATCCTGGTGCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAACTGTCCCTCAAGAGCTTAGTGAACAAGGGAATCCTGGTGCAAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGGGTACTGGTGCTTCCGGTTCCTTTAAGCTTAGTAAGAAGGTGATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGGGTACTGGTGCTTCCGGTTCCTTTAAGCTTAGTAAGAAGGTGATTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAATCTACCAGAAGCAAGGCTAAAAAGTCAGTTTCTGCCAAGACCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAATCTACCAGAAGCAAGGCTAAAAAGTCAGTTTCTGCCAAGACCAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTGGTTTTATCCAGGGACTCCAAGTCACCAAAGACTGCTAAAACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTGGTTTTATCCAGGGACTCCAAGTCACCAAAGACTGCTAAAACCAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGAGAGCCAAGAAGCCGAGAGCGACAACTCCTAAAACTGTTAGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGAGAGCCAAGAAGCCGAGAGCGACAACTCCTAAAACTGTTAGGAGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGAAAGGCTAAAGGAGCCAAGGGTAAGCAAAAGCAGAAGAGCCCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100501 GAGAAAGGCTAAAGGAGCCAAGGGTAAGCAACAGCAGAAGAGCCCAGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGCAAGGGCTTCGAAGTCAAAATTGACCCAACATCATGAAGTTAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGCAAGGGCTTCGAAGTCAAAATTGACCCAACATCATGAAGTTAATGTT

    600     .    :    .    :
    601 AGAAAGGCCACATCTAAGAAG
        |||||||||||||||||||||
 100601 AGAAAGGCCACATCTAAGAAG