seq1 = pF1KE9577.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KE9577/gi568815579r_6630315.tfa (gi568815579r:6630315_6837576), 207262 bp

>pF1KE9577 1629
>gi568815579r:6630315_6837576 (Chr19)

(complement)

1-120  (100001-100120)   98% ->
121-240  (100866-100985)   100% ->
241-291  (101619-101669)   100% ->
292-374  (101873-101955)   100% ->
375-499  (103270-103394)   100% ->
500-549  (103523-103572)   100% ->
550-618  (103664-103732)   100% ->
619-723  (103903-104007)   100% ->
724-857  (104276-104409)   100% ->
858-933  (104515-104590)   100% ->
934-1007  (105028-105101)   100% ->
1008-1125  (105197-105314)   100% ->
1126-1256  (105422-105552)   100% ->
1257-1300  (105643-105686)   100% ->
1301-1350  (106055-106104)   100% ->
1351-1434  (106295-106378)   100% ->
1435-1559  (106466-106590)   99% ->
1560-1629  (107193-107262)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTGAGCGAGAGGAGGGGGCTCGGCCGCGGGAGCCCCGCGGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGTGAGCGAGAGGAGGGGGCTCGGCCGCGGGAGCCCCGCGGAGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGCAGCGGCTACTTCTGGTGCTGCTGTTGGGTGGCTGCTCCGGGCGCA
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 100051 GGGGCAGCGGCTACTTCTGGTGCTGCTGCTGGGTGGCTGCTCCGGGCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCACCGGCTGGCGCTGACG         GGGGAGAAGCGAGCGGACATC
        |||||| |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 TCCACCAGCTGGCGCTGACGGTG...CAGGGGGAGAAGCGAGCGGACATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCTGAACAGCTTCGGTTTCTACACCAATGGCTCTCTGGAGGTGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100887 CAGCTGAACAGCTTCGGTTTCTACACCAATGGCTCTCTGGAGGTGGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCGTCCTGCGGCTGGGCCTCCGGGAGGCAGAAGAGAAGTCCCTGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100937 GAGCGTCCTGCGGCTGGGCCTCCGGGAGGCAGAAGAGAAGTCCCTGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         GTGGGGTTCAGTCTCAGCCGGGTTCGGTCTGGCAGAGTTCGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100987 TG...CAGGTGGGGTTCAGTCTCAGCCGGGTTCGGTCTGGCAGAGTTCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCTATTCA         ACCCGGGATTTCCAGGACTGCCCTCTCCAGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101661 TCCTATTCAGTG...CAGACCCGGGATTTCCAGGACTGCCCTCTCCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAACAGTAGCAGTTTCCTGGTCCTGTTCCTCATCAACACCAAGGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101905 AAACAGTAGCAGTTTCCTGGTCCTGTTCCTCATCAACACCAAGGATCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 A         GGTCCAGGTGCGGAAGTATGGAGAGCAGAAGACGTTGTTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101955 AGTG...CAGGGTCCAGGTGCGGAAGTATGGAGAGCAGAAGACGTTGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCTTTCCCGGGCTCCTCCCGGAAGCACCCTCCAAACCAGGGCTCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103310 ATCTTTCCCGGGCTCCTCCCGGAAGCACCCTCCAAACCAGGGCTCCCGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCCACAGGCCACAGTCCCCCGCAAGGTGGATGGCG         GAGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103360 GCCACAGGCCACAGTCCCCCGCAAGGTGGATGGCGGTG...CAGGAGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCTCTGCAGCCAGCAAGCCCAAGTCAACACCCGCAGTGATTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103529 CCTCTGCAGCCAGCAAGCCCAAGTCAACACCCGCAGTGATTCAGGTT...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    550    GGTCCTAGTGGGAAGGACAAGGACCTGGTGTTGGGCCTGAGCCACCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103661 CAGGGTCCTAGTGGGAAGGACAAGGACCTGGTGTTGGGCCTGAGCCACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CAACAACTCCTACAACTTCAGT         TTCCACGTGGTGATCGGCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103711 CAACAACTCCTACAACTTCAGTGTG...CAGTTCCACGTGGTGATCGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CTCAGGCGGAAGAAGGCCAGTACAGCCTGAACTTCCACAACTGCAACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103922 CTCAGGCGGAAGAAGGCCAGTACAGCCTGAACTTCCACAACTGCAACAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TCAGTGCCAGGAAAGGAGCATCCATTCGACATCACG         GTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 103972 TCAGTGCCAGGAAAGGAGCATCCATTCGACATCACGGTG...CAGGTGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GATCCGGGAGAAGAACCCCGATGGCTTCCTGTCGGCAGCGGAGATGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104281 GATCCGGGAGAAGAACCCCGATGGCTTCCTGTCGGCAGCGGAGATGCCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTTTCAAGCTCTACATGGTCATGTCCGCCTGCTTCCTGGCCGCTGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104331 TTTTCAAGCTCTACATGGTCATGTCCGCCTGCTTCCTGGCCGCTGGCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTCTGGGTGTCCATCCTCTGCAGGAACAC         GTACAGCGTCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104381 TTCTGGGTGTCCATCCTCTGCAGGAACACGTA...CAGGTACAGCGTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CAAGATCCACTGGCTCATGGCGGCCTTGGCCTTCACCAAGAGCATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104527 CAAGATCCACTGGCTCATGGCGGCCTTGGCCTTCACCAAGAGCATCTCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCCTCTTCCACAGC         ATCAACTACTACTTCATCAACAGCCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104577 TCCTCTTCCACAGCGTG...CAGATCAACTACTACTTCATCAACAGCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GGCCACCCCATCGAAGGCCTTGCCGTCATGTACTACATCGCACACCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105055 GGCCACCCCATCGAAGGCCTTGCCGTCATGTACTACATCGCACACCTGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1008       GCTGAAGGGCGCCCTCCTCTTCATCACCATCGCCCTGATTGGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105105 ...CAGGCTGAAGGGCGCCCTCCTCTTCATCACCATCGCCCTGATTGGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 CAGGCTGGGCCTTCATCAAGTACGTCCTGTCGGATAAGGAGAAGAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105241 CAGGCTGGGCCTTCATCAAGTACGTCCTGTCGGATAAGGAGAAGAAGGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TTTGGGATCGTGATCCCCATGCAG         GTCCTGGCCAACGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105291 TTTGGGATCGTGATCCCCATGCAGGTG...CAGGTCCTGGCCAACGTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CTACATCATCATCGAGTCCCGCGAGGAAGGCGCCAGCGACTACGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105439 CTACATCATCATCGAGTCCCGCGAGGAAGGCGCCAGCGACTACGTGCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 GGAAGGAGATTTTGTTCCTGGTGGACCTCATCTGCTGTGGTGCCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105489 GGAAGGAGATTTTGTTCCTGGTGGACCTCATCTGCTGTGGTGCCATCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TTCCCCGTAGTCTG         GTCCATCCGGCATCTCCAGGATGCGTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105539 TTCCCCGTAGTCTGGTG...CAGGTCCATCCGGCATCTCCAGGATGCGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TGGCACAGACGGGAAGG         TGGCAGTGAACCTGGCCAAGCTGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105670 TGGCACAGACGGGAAGGGTG...CAGTGGCAGTGAACCTGGCCAAGCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 AGCTGTTCCGGCATTACTATGTCATG         GTCATCTGCTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106079 AGCTGTTCCGGCATTACTATGTCATGGTA...CAGGTCATCTGCTACGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 TACTTCACCCGCATCATCGCCATCCTGCTGCAGGTGGCTGTGCCCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106310 TACTTCACCCGCATCATCGCCATCCTGCTGCAGGTGGCTGTGCCCTTTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 GTGGCAGTGGCTGTACCAG         CTCTTGGTGGAGGGCTCCACCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106360 GTGGCAGTGGCTGTACCAGGTG...CAGCTCTTGGTGGAGGGCTCCACCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 TGGCCTTCTTCGTGCTCACGGGCTACAAGTTCCAGCCCACAGGGAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 106488 TGGCCTTCTTCGTGCTCACGGGCTACAAGTTCCAGCCCACAGGAAACAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 CCGTACCTGCAGCTGCCCCAGGAGGACGAGGAGGATGTTCAGATGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106538 CCGTACCTGCAGCTGCCCCAGGAGGACGAGGAGGATGTTCAGATGGAGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 AGT         AATGACGGACTCTGGGTTCCGGGAAGGCCTCTCCAAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106588 AGTGTG...CAGAATGACGGACTCTGGGTTCCGGGAAGGCCTCTCCAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :
   1598 TCAACAAAACAGCCAGCGGGCGGGAACTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 107231 TCAACAAAACAGCCAGCGGGCGGGAACTGTTA