seq1 = pF1KE9575.tfa, 1077 bp
seq2 = pF1KE9575/gi568815575r_1365482.tfa (gi568815575r:1365482_1566558), 201077 bp

>pF1KE9575 1077
>gi568815575r:1365482_1566558 (ChrX)

(complement)

1-1077  (100001-101077)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGTCCCGAACAGCACCGGCCCGGACAACGCGACGCTGCAGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGTCCCGAACAGCACCGGCCCGGACAACGCGACGCTGCAGATGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGAACCCGGCTATCGCGGTGGCCCTGCCCGTGGTGTACTCGCTGGTGG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGAACCCGGCGATCGCGGTGGCCCTGCCCGTGGTGTACTCGCTGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCGGTCAGCATCCCGGGCAACCTCTTCTCTCTGTGGGTGCTGTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGCGGTCAGCATCCCGGGCAACCTCTTCTCTCTGTGGGTGCTGTGCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCATGGGGCCCAGATCCCCGTCGGTCATCTTCATGATCAACCTGAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCATGGGGCCCAGATCCCCGTCGGTCATCTTCATGATCAACCTGAGCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACGGACCTGATGCTGGCCAGCGTGTTGCCTTTCCAAATCTACTACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACGGACCTGATGCTGGCCAGCGTGTTGCCTTTCCAAATCTACTACCATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAACCGCCACCACTGGGTATTCGGGGTGCTGCTTTGCAACGTGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAACCGCCACCACTGGGTATTCGGGGTGCTGCTTTGCAACGTGGTGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGCCTTTTACGCAAACATGTATTCCAGCATCCTCACCATGACCTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGCCTTTTACGCAAACATGTATTCCAGCATCCTCACCATGACCTGTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCGTGGAGCGCTTCCTGGGGGTCCTGTACCCGCTCAGCTCCAAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCGTGGAGCGCTTCCTGGGGGTCCTGTACCCGCTCAGCTCCAAGCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCGCCGCCGTCGTTACGCGGTGGCCGCGTGTGCAGGGACCTGGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCGCCGCCGTCGTTACGCGGTGGCCGCGTGTGCAGGGACCTGGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCCTGACCGCCCTGTCCCCGCTGGCGCGCACCGATCTCACCTACCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCCTGACCGCCCTGTCCCCGCTGGCGCGCACCGATCTCACCTACCCGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCACGCCCTGGGCATCATCACCTGCTTCGACGTCCTCAAGTGGACGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCACGCCCTGGGCATCATCACCTGCTTCGACGTCCTCAAGTGGACGATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCCCAGCGTGGCCATGTGGGCCGTGTTCCTCTTCACCATCTTCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCCCAGCGTGGCCATGTGGGCCGTGTTCCTCTTCACCATCTTCATCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTTCCTCATCCCGTTCGTGATCACCGTGGCTTGTTACACGGCCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGTTCCTCATCCCGTTCGTGATCACCGTGGCTTGTTACACGGCCACCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCAAGCTGTTGCGCACGGAGGAGGCGCACGGCCGGGAGCAGCGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCAAGCTGTTGCGCACGGAGGAGGCGCACGGCCGGGAGCAGCGGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCGCGGTGGGCCTGGCCGCGGTGGTCTTGCTGGCCTTTGTCACCTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCGCGGTGGGCCTGGCCGCGGTGGTCTTGCTGGCCTTTGTCACCTGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCCCCAACAACTTCGTGCTCCTGGCGCACATCGTGAGCCGCCTGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCCCCAACAACTTCGTGCTCCTGGCGCACATCGTGAGCCGCCTGTTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGGCAAGAGCTACTACCACGTGTACAAGCTCACGCTGTGTCTCAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGGCAAGAGCTACTACCACGTGTACAAGCTCACGCTGTGTCTCAGCTGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAACAACTGTCTGGACCCGTTTGTTTATTACTTTGCGTCCCGGGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAACAACTGTCTGGACCCGTTTGTTTATTACTTTGCGTCCCGGGAATTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGCTGCGCCTGCGGGAATATTTGGGCTGCCGCCGGGTGCCCAGAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGCTGCGCCTGCGGGAATATTTGGGCTGCCGCCGGGTGCCCAGAGACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTGGACACGCGCCGCGAGAGCCTCTTCTCCGCCAGGACCACGTCCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTGGACACGCGCCGCGAGAGCCTCTTCTCCGCCAGGACCACGTCCGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCTCCGAGGCCGGTGCGCACCCTGAAGGGATGGAGGGAGCCACCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCTCCGAGGCCGGTGCGCACCCTGAAGGGATGGAGGGAGCCACCAGGCCC

   1050     .    :    .    :    .
   1051 GGCCTCCAGAGGCAGGAGAGTGTGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCCTCCAGAGGCAGGAGAGTGTGTTC